一、介绍
请看下面这张图:

图1 功能分组网络图(一)
上面这张图展示的内容尽管很详尽,但是密密麻麻的,略显庞杂,密集恐惧症患者看了都表示瑟瑟发抖,那有没有更美观的可视化展示呢?当然有,下面这张图也许能满足你的需求。
图2 功能分组网络图(二)
图2中展示的内容大体上和图1类似,所不同的是,它将功能相似的模块用不同颜色圈成了一片椭圆区域,并用概括性的文字描述每个区域功能模块的特征,更具简洁性和审美性,看起来是不是漂亮多了?
讲到这里,大家肯定想知道这两种图是用什么工具绘制的。它们依旧由enrichplot包出品,分别通过其内部函数emapplot和emapplot_cluster来实现,并且支持多种相似性计算算法。此外,该函数既能支持单组数据,又能支持多组数据。
二、图解
相似的功能通路聚集在一起形成的模块。
三、应用
好了,本期宝藏发掘完毕,感兴趣的朋友们赶紧去试试吧!
关于enrichplot的详细使用方法请戳:
