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本期关键词:circRNA_0006420;肺癌;circNIPBL;膀胱癌(Bca);circGPATCH2L;椎间盘退变(IVDD);CircGNB1;骨关节炎(OA);hsa_circ_0057105;肾细胞癌(RCC)。
1、circGPATCH2L的N6-甲基腺苷低甲基化通过TRIM28在椎间盘退变中调节DNA损伤和细胞凋亡。
标题:N6-methyladenosine hypomethylation of circGPATCH2L regulates DNA damage and apoptosis through TRIM28 in intervertebral disc degeneration
期刊:Cell Death Differ
IF:12.4
通讯作者:王洪立、姜建元、邹飞(复旦大学附属华山医院)
发表日期:2023.08
DOI:10.1038/s41418-023-01190-5
摘要:环状RNA(circRNAs)是一类非编码RNA,已发现其参与椎间盘退变(IVDD)进程,而N6-甲基腺苷(m6A)广泛存在于circRNAs中。在这里,作者确定了一个m6A甲基化水平较低的circRNA,即circGPATCH2L,在退变性椎间盘髓核组织中表达上调。在机制上,circGPATCH2L作为三部分模体含28(TRIM28)蛋白的诱饵,在402-452区域内阻断了TRIM28的磷酸化作用,抑制了P53的降解,从而促使DNA损伤的积累和细胞凋亡,导致IVDD的进展。此外,经过m6A甲基化的circGPATCH2L被YTHDF2-RPL10-RNase P/MRP复合物识别并进行内核核酸内切裂解,以维持髓核细胞的生理状态。因此,作者的数据显示了m6A修饰在调控环状RNA丰度方面的生理重要性,并为治疗IVDD提供了潜在的有效治疗靶点。
2、ZEB1介导的circNIPBL生物发生通过Wnt/β-连环蛋白途径维持膀胱癌的转移。
标题:ZEB1-mediated biogenesis of circNIPBL sustains the metastasis of bladder cancer via Wnt/β-catenin pathway
期刊:J Exp Clin Cancer Res
IF:11.3
通讯作者:陈长昊、林天歆、黄健(中山大学孙逸仙纪念医院)
发表日期:2023.8
DOI:10.1186/s13046-023-02757-3
背景:通过pre-mRNA后剪接形成的环状RNA(circRNAs)广泛表达,影响膀胱癌(BCa)的增殖、侵袭和转移。然而,环状rna生物发生介导BCa远处转移的机制仍不清楚。
方法:利用BCa与正常邻近组织之间的RNA测序数据,鉴定差异表达的环状RNA。通过一系列的生化实验,研究了circNIPBL在BCa中的功能,并在一组较大的BCa组织中检测了circNIPBL的临床意义。
结果:在本研究中,作者发现了一种新的circRNA(hsa_circ_0001472),circNIPBL,它显著上调,并对BCa患者的不良预后有很大的影响。在功能上,circNIPBL在体内和体外促进BCa转移。在机制上,circNIPBL通过直接海绵化miR-16-2-3p上调Wnt5a的表达,激活Wnt/β-连环蛋白信号通路,导致ZEB1的上调,从而触发BCa的EMT。此外,作者还发现ZEB1与NIPBL pre-mRNA上外显子2-9的两侧内含子相互作用,触发circNIPBL的生物发生,从而形成一个正反馈回路。重要的是,在原位膀胱癌模型中,过表达circNIPBL显著促进了BCa的远处转移,而沉默ZEB1则显著阻断了circNIPBL过表达诱导的转移作用。
结论:作者的研究强调,circNIPBL诱导的Wnt信号通路激活触发ZEB1介导的circNIPBL生物发生,通过circNIPBL/miR-16-2-3p/Wnt5a/ZEB1轴形成正反馈回路,支持circNIPBL作为BCa患者新的治疗靶点和潜在的生物标志物。
3、P53响应性环状RNA_0006420通过促进HUR/PTBP1复合物的形成,加重了肺癌对放疗的耐药性。
标题:P53-response circRNA_0006420 aggravates lung cancer radiotherapy resistance by promoting formation of HUR/PTBP1 complex
期刊:J Adv Res
IF:10.7
通讯作者:张瑞雪(中南大学湘雅公共卫生学院)等
发表日期:2023.8
DOI:10.1016/j.jare.2023.07.011
背景:P53野生型肺癌细胞可能会产生放射治疗耐药性。环状RNA(circRNA)是一类具有独特结构的转录本家族。circRNA在肿瘤发生中起着重要作用,是潜在的生物标志物或治疗靶点。目前尚不清楚在p53野生型癌细胞中,放疗后circRNA的表达和功能是如何调控的。
方法:使用CRISPR/Cas9将A549或H1299细胞分为p53-wt组和p53-KO组;两组细胞均经历4 Gy的电离辐射(IR:p53-wt-IR和p53-KO-IR)。进行了RNA测序、CCK8细胞增殖实验、细胞周期实验以及其他功能和机制实验。还构建了p53基因敲除小鼠模型,以验证体外细胞实验的结果。
结果:不同组细胞中发现了不同的circRNA。circRNA_0006420(IRSense)在p53-wt细胞中上调,在辐射后与p53-KO细胞的表达水平相同,表明p53沉默阻止了其在辐射后的上调。在p53存在的情况下,辐射后上调的IRSense通过调节与DNA损伤修复(DDR)通路相关的蛋白质,诱导G2/M期阻滞。与此同时,辐射后上调的IRSense加重了放射诱导的上皮间质转化(EMT)。有趣的是,在p53存在的情况下,它促进了IRSense/HUR/PTBP1复合物的形成,从而促进了放射诱导的EMT。此外,c-Jun在放疗后调控p53转录的上调。对于这些携带p53的肺癌细胞,上调的IRSense通过与核内的HUR(ElAV样蛋白1)和PTBP1(多聚嘧啶链结合蛋白1)相互作用,加重了肺癌细胞的增殖并增加了放疗耐药性。
结论:保留p53的肺癌细胞可能会在放疗后上调circRNA_0006420(IRSense)的表达,形成IRSense/HUR/PTBP1复合物,导致放射治疗耐药性。这项研究深化了作者对circRNA在调控放射治疗效果方面作用的理解,为有效的临床肺癌治疗提供了新的治疗途径。
4、Hsa_circ_0057105调节肾细胞癌上皮-间质转化和铁死亡易感性的平衡。
标题:Hsa_circ_0057105 modulates a balance of epithelial-mesenchymal transition and ferroptosis vulnerability in renal cell carcinoma
期刊:Clin Transl Med
IF:10.6
通讯作者:黄勇、Jin Xiaohan、罗俊航(中山大学附属第一医院)
发表日期:2023.8
DOI:10.1002/ctm2.1339
摘要:肾细胞癌(Renal cell carcinoma,RCC)是起源于肾小管上皮的恶性肿瘤,占肾脏恶性肿瘤的80%~90%。环状RNA(circRNAs)在RCC发生和进展中的调节作用已经被确定,但它们的功能、分子机制和潜在的临床应用仍然知之甚少。所以明确肾细胞癌发病及转移的机制对于疾病监测和治疗发展具有重要意义。在肾细胞癌(RCC)中,作者发现hsa_circ_0057105具有双重作用调控机制。一方面,它通过激活EMT上皮间质转化促进RCC细胞的转移。另一方面,它也增加了RCC细胞的铁死亡敏感性。这表明在hsa_circ_0057105的调节下,RCC细胞需要在“攻击性”和“氧化敏感性”之间做出选择。RCC中EMT与铁死亡之间的关系提供了新的见解,并为RCC的监测和治疗提供了潜在的生物标志物。
5、CircGNB1通过诱导软骨细胞中的氧化应激,推动骨关节炎的发病机制。
标题:CircGNB1 drives osteoarthritis pathogenesis by inducing oxidative stress in chondrocytes
期刊:Clin Transl Med
IF:10.6
通讯作者:胡子昂、Shen Shuying、范顺武(浙江大学医学院附属邵逸夫医院骨科)
发表日期:2023.08
DOI:10.1002/ctm2.1358
背景:环状RNA(circRNAs)已成为重要的生物过程调控因子。本研究探讨了circGNB1是否作为竞争性内源性RNA,在年龄相关性骨关节炎(OA)的病理过程中调控氧化应激的作用。
方法:在不同年龄OA患者的软骨中确定circGNB1表达与氧化应激/OA严重程度之间的关系。通过在人类软骨细胞(HCs)中进行增强和减弱功能实验,在各种生化分析中确定circGNB1在氧化应激和OA进展中的生物学作用以及其下游靶点。还利用膝关节内半月板不稳定(DMM)小鼠模型确定circGNB1过表达和沉默的体内效应。
结果:在氧化和炎症应激下HCs中检测到circGNB1表达增加,并在年龄较大个体的软骨中表达。机制上,circGNB1吸附miR-152-3p,从而阻止其与下游mRNA靶点环指蛋白219(RNF219)的相互作用,进而通过阻止K47位点上的泛素化稳定了洞蛋白-1(CAV1)。circGNB1通过拮抗miR-152-3p介导的RNF219和CAV1抑制,抑制了IL-10信号传导。因此,circGNB1过表达通过增强体内外降解因子表达和氧化应激,以及抑制合成基因,促进了OA的进展。此外,在DMM OA小鼠模型中,circGNB1的沉默减轻了OA的严重程度,而circGNB1的过表达则产生了相反的效应。
结论:通过miR-152-3p/RNF219/CAV1轴,circGNB1调控了氧化应激和OA的进展。调节circGNB1可能是治疗OA的有效策略。