时隔两年，circAtlas又更新了！2023年9月22日，中国科学院北京生命科学研究所赵方庆团队在Nucleic Acids Research（IF=14.9）发表新版本circAtlas 3.0，文章名称“circAtlas 3.0: a gateway to 3 million curated vertebrate circular RNAs based on a standardized nomenclature scheme”。circAtlas是环状RNA研究领域一款有影响力的综合数据库，最初的版本发布于2018年。

根据数据库名称我们就可以看出，作者的宗旨是打造一个囊括环状RNA全面信息的综合数据库。事实上，circAtlas也确实为我们提供了丰富的资源。特别地，它囊括了人类和多种脊椎动物不同组织的环状RNA，同时数据库也囊括了环状RNA多种特征，包括物种保守性、miRNA结合信息、RBP结合信息以及功能和疾病等内容。

那么，circAtlas 3.0又为我们带来了哪些新的内容呢？

• 物种从最初的6个拓展到了10个，组织扩充到了33个

• circRNA数量收集已超过了3百万

• 将二代测序和三代测序数据信息整合，提供了环状RNA全长信息

• 为探索癌症circRNA提供了癌症临床样品信息

• 根据环状RNA社区倡议对环状RNA进行了规范化命名

详情请查看：NCB丨陈玲玲研究员等统一环状RNA命名规范，推动环状RNA研究交流和发展

• 更新了一些环状RNA关联的内容，例如物种同源性、基因组版本切换、RNA结构预测以及功能注释等

大家可以通过以下两个网址访问：

• https://ngdc.cncb.ac.cn/circatlas/

• http://circatlas.biols.ac.cn/

写在最后~

环状RNA社区的家人们与环状RNA一路相随，肯定对circAtlas已经相当熟悉，这次circAtlas 3.0版本的更新应该也能给大家的研究项目带来新的启发。

当然也要吐槽一下，circAtlas关于环状RNA在各个组织中的统计图不见了~

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