膀胱癌(BCa)是泌尿系统常见的恶性肿瘤,浸润性膀胱癌患者的预后较差。多形核骨髓源性抑制细胞(PMN-MDSCs)是一种具有免疫抑制功能较强的病理激活免疫细胞,可在许多疾病中出现。PMN-MDSCs浸润肿瘤微环境是肿瘤进展和免疫治疗效果差的主要因素之一,其存在与预后不良显著相关。受体相互作用蛋白激酶3(RIPK3)和脂肪酸转运体2(FATP2)是调节MDSCs 免疫抑制功能的重要分子。PMN-MDSCs的浸润与FATP2的表达呈正相关,与RIPK3的表达呈负相关。然而,PMN-MDSCs在肿瘤微环境中同时上调FATP2和下调RIPK3介导的抑制性免疫的机制尚不清楚。circRNA在调节各种人类恶性肿瘤的肿瘤增殖和转移中起着至关重要的作用。因此,本研究的目的是阐明在PMNMDSCs中上调FATP2表达和下调RIPK3表达的潜在分子机制,以及circRNA在其中发挥的作用,并为癌症免疫治疗提供新的思路。

2024年3月9日,南方医科大学南方医院泌尿外科谭万龙教授团队研究发现在Molecular Cancer(IF=37.3)发表文章:Bladder-cancer-derived exosomal circRNA_0013936 promotes suppressive immunity by up-regulating fatty acid transporter protein 2 and down-regulating receptor-interacting protein kinase 3 in PMNMDSCs。本研究表明在PMN-MDSCs中,BCa来源的外泌体circRNA_0013936通过
circRNA_0013936/miR-320a/JAK2通路上调FATP2,通过circRNA_0013936/ miR-301b-3p/CREB1通路下调RIPK3,从而促进抑制性免疫。这些发现有助于为人类膀胱癌的临床治疗找到新的靶点。

PMN-MDSCs浸润性膀胱肿瘤组织中FATP2和RIPK3的表达

作者采用免疫荧光法检测肿瘤组织中PMN-MDSCs的浸润情况。双阳性细胞(CD11b+/LOX-1+)被标记为PMN-MDSCs。免疫组化显示FATP2和RIPK3的表达。图1A显示肿瘤组织中存在大量的PMN-MDSCs。肿瘤组织中FATP2的表达显著上调,而RIPK3的表达显著下调(图1B-C)。统计分析结果显示,膀胱肿瘤组织中PMN-MDSCs的浸润与FATP2的表达呈正相关,与RIPK3的表达呈负相关(图1D-E)。免疫组化结果显示,LOX-1和FATP2在人膀胱肿瘤组织中的表达高于癌旁组织,而RIPK3的表达低于癌旁组织(图1F)。此外,与I/II期患者相比,III/IV期患者在肿瘤组织中FATP2高表达,RIPK3低表达(图1G)。

图1 PMN-MDSCs浸润肿瘤微环境,过表达FATP2,低表达RIPK3

BCa衍生的外泌体上调PMN-MDSCs中的FATP2,下调RIPK3

透射电镜显示,BCa衍生的外泌体具有完整的、连续的双层膜,这是外泌体的典型形态学特征(图2A)。与PMN-MDSCs共培养后,用荧光PKH67标记的BCa衍生的外泌体被PMN-MDSCs内化(图2B)。当PMN-MDSCs与BCa来源的外泌体共培养时,PMN-MDSCs中FATP2的表达显著上调,而RIPK3的表达显著下调(图2C-D)。LC-MS分析显示,BCa衍生的外泌体促进了PMN-MDSCs中脂质代谢分子(PGE2、TG、AA)的合成(图2E)。此外,ELISA分析显示,BCa衍生的外泌体促进了PMN-MDSCs中免疫抑制分子(IL-10、iNOS、Arg-1)的合成(图2F)。

图2 BCa衍生的外泌体上调PMN-MDSCs中的FATP2,下调RIPK3

circRNA_0013936在BCa衍生的外泌体中的鉴定和表征

作者采用高通量测序来鉴定BCa衍生的外泌体中差异表达的环状RNA。其中,环状RNA表达上调比下调的环状RNA更普遍(图3A)。作者选择了10个上调最多的环状RNA。根据RNA测序和qRT-PCR结果,hsa_circ_0013936是表达差异最大的上调的circRNA(补充图2C)。图3B显示了circRNA_0013936的形成。qRT-PCR显示,与正常尿路上皮细胞来源的外泌体相比,三种BCa细胞来源的外泌体中circRNA_0013936的表达显著上调(图3C)。此外,作者还设计了聚合引物和发散引物来扩增circRNA_0013936。以UMUC3和T24细胞系的cDNA和gDNA(基因组DNA)为模板,仅在cDNA中使用发散引物扩增到circRNA_0013936,gDNA中未见扩增产物(图3D)。通过qRT-PCR,作者进一步证实了circRNA_0013936对RNase R具有耐受性(图3E)。FISH分析显示,circRNA_ 0013936主要位于膀胱肿瘤细胞的细胞质中(图3F)。

图3 circRNA_0013936的鉴定和表征

CircRNA_ 0013936在PMN-MDSCs中上调FATP2,下调RIPK3

为了证实circRNA_0013936可以在PMN-MDSCs中上调FATP2的表达,下调RIPK3的表达,作者用circRNA_0013936模拟物转染了PMN-MDSCs。Western blot结果显示,circRNA_0013936模拟物显著上调了PMNMDSCs中FATP2的表达,下调了RIPK3的表达(图4A-B)。ELISA分析显示,circRNA_0013936模拟物促进了PMN-MDSCs中免疫抑制细胞因子(Arg-1、IL-10、iNOS)的合成(图4C)。LC-MS分析显示,circRNA_0013936模拟物增加了PMN-MDSCs中脂质代谢分子(AA、TG、PGE2)的水平(图4D)。

图4 CircRNA_ 0013936在PMN-MDSCs中上调FATP2,下调RIPK3

CircRNA_ 0013936可以作为miR-320a和miR-301b-3p的海绵

为了研究circRNA_0013936是否可以在PMN-MDSCs中海绵化miRNA,作者通过CircInteractome数据库以及荧光素酶报告基因分析实验,发现了3个候选miRNA(图5A)。然后使用生物素化circRNA探针下拉PMN-MDSCs中的circRNA_0013936(图5B)。RIP实验发现circRNA_0013936、miR-320a和miR- 301b-3p特异性富集,表明miR-320a和miR- 301b-3p是PMN-MDSCs中与circRNA_0013936相关的miRNA(图5C)。图5D显示了miR-320a和miR-301b-3p在PMN-MDSCs中的基本表达情况。为了进一步证实miR-320a和miR-301b-3p是否能与circRNA_0013936结合,作者在293T细胞中进行了双荧光素酶报告实验。结果显示,miR-320a和miR-301b-3p mimic均显著降低了WT-circRNA_0013936的荧光素酶活性(图5E-G)。这些结果表明,circRNA_0013936可作为miR- 320a和miR-301b-3p的海绵发挥作用

图5 CircRNA_ 0013936可作为miR-320a和miR-301b-3p的海绵

JAK2是miR-320a的直接靶基因,而CREB1是miR-301b-3p的直接靶基因

为了进一步探索其潜在机制,作者利用Targetscan、miRDB、DIANA-microT和Starbase预测miR-320a和miR-301b-3p的靶基因。此外,作者通过RNA测序分析了PMN-MDSCs(circ_0013936-sh vs. circ_0013936-nc)中的差异基因表达。根据RNA测序结果和对靶基因的预测,作者发现miR-320a和miR-301b-3p的下游靶基因分别有9个基因和7个基因(图6A和G)。然后,通过qRT-PCR来验证候选基因。在含有miR-320a保守结合位点的基因中,JAK2在PMN-MDSC-lv-circ_0013936中上调,在PMN-MDSC-sh-circ_0013936中下调(图6B)。在含有miR-301b-3p保守结合位点的基因中,CREB1在PMN-MDSC-lv-circ_0013936中上调,在PMN-MDSC-sh-circ_0013936中下调(图6H)。

此外,双荧光素酶报告基因检测显示,miR-320a模拟物显著降低了JAK2野生型的活性,但没有降低JAK2突变体的活性(图6C-D),miR-301b-3p模拟物显著降低了CREB1野生型的活性,但没有降低CREB1突变体的活性(图6J-K)。此外,如图6J-K和L-M所示,在转染miR-320a/miR-301b-3p模拟物或miR-320a/miR-301b-3p抑制剂的PMN-MDSCs中,JAK2和CREB1的表达在mRNA和蛋白水平上均显著上调或下调。

图6 JAK2是miR-320a的直接靶基因,而CREB1是miR-301b-3p的直接靶基因

CircRNA_0013936通过
circ_0013936/miR-320a/JAK2通路上调FATP2,通过circ_0013936/ miR-301b-3p/ CREB1通路下调RIPK3

CircRNA_0013936通过促进PMN-MDSCs中JAK2的表达来增加FATP2的表达,这一作用可被miR-320a模拟物逆转。circRNA_0013936的敲低通过降低JAK2的表达来抑制FATP2的表达,而miR-320a抑制剂可以逆转此现象(图7A-C)。CircRNA_0013936通过增加CREB1的表达来抑制PMN-MDSCs中RIPK3的表达,这一作用可被miR-301b-3p模拟物逆转。相反,敲低CircRNA_0013936会通过降低CREB1的表达促进RIPK3的表达,而miR-301b-3p抑制剂可逆转这一现象(图7H-J)。qRT-PCR和Western blot分析结果显示,敲低JAK2或CREB1可显著下调FATP2的表达或上调RIPK3的表达,并这一现象可通过过表达JAK2或CREB1来逆转(图7D-F和K-M)。CircRNA_0013936促进了PMN-MDSCs衍生的细胞因子(Arg-1、IL-10、iNOS、AA、TG、PGE2)的产生,这一作用可被miR-320a或miR-301b-3p模拟物逆转。而敲低circRNA_0013936则抑制了PMN-MDSCs衍生的细胞因子的产生,这可被miR-320a或miR-301b-3p抑制剂所逆转(图7G和N)。综上所述,circRNA_0013936通过海绵化miR-320a和miR-301b-3p来调控FATP2和RIPK3的表达。

图7 CircRNA_0013936通过miR-320a/JAK2和miR-301b-3p/CREB1通路上调FATP2和下调RIPK3

在PMN-MDSCs中,外泌体circRNA_0013936通过
circ_0013936/miR-320a/JAK2通路上调FATP2,通过circ_0013936/ miR-301b-3p/ CREB1通路下调RIPK3,从而促进抑制性免疫

为了研究BCa衍生的外泌体circRNA_0013936是否通过miR-320a/JAK2和miR- 301b-3p/CREB1通路调控PMN-MDSCs中FATP2和RIPK3的表达,作者使用CRISPR-Cas9基因组编辑系统生成了circRNA_0013936敲除膀胱癌细胞。然后,作者检测了与BCa-外泌体或circRNA_0013936-KO-Bca-外泌体共培养的PMN-MDSCs中FATP2和RIPK3的表达。图8A-B,BCa衍生的外泌体circRNA_0013936海绵化miR-320a,通过激活JAK2/pSTAT5通路促进FATP2的表达,而circRNA_0013936-KO-外泌体则表现出相反的作用。同时,BCa衍生的外泌体circRNA_0013936海绵化miR-301b-3p,然后通过激活CREB1通路抑制RIPK3的表达,而circRNA_0013936-KO-外泌体则表现出相反的作用(图8D-E)。最终,BCa衍生的外泌体circRNA_0013936促进了PMN-MDSCs的免疫抑制细胞因子的产生(图8C,F)。

为了研究BCa来源的外泌体circRNA_0013936是否通过调节PMN-MDSCs中的FATP2和RIPK3来影响CD8+ T细胞的功能,作者将CD8+ T细胞与BCa来源的外泌体或circRNA_0013936-KO-BCa-外泌体诱导的PMN-MDSCs共培养。流式细胞术和CFSE分析结果显示,BCa来源的外泌体通过调节FATP2和RIPK3的表达,显著抑制了IFN-γ的产生和CD8+ T细胞的增殖功能,而circRNA_0013936-KO-BCa-外泌体则表现出相反的作用(图8G-H)

图8 在PMN-MDSCs中,外泌体circRNA_0013936通过miR-320a/JAK2通路上调FATP2,通过miR-301b-3p/CREB1通路下调RIPK3,从而促进抑制性免疫

小结

在BCa衍生的外泌体中富集的CircRNA_0013936可以促进FATP2的表达,并抑制PMN-MDSCs中RIPK3的表达。在机制上,circRNA_0013936通过海绵化miR-320a和miR-301b促进RIPK2的表达,而miR-301b分别直接靶向JAK2和CREB1,抑制RIPK3的表达。最终,circRNA_0013936在PMN-MDSCs中,通过
circRNA_0013936/miR-320a/JAK2通路上调FATP2,通过circRNA_0013936/miR-301b/CREB1通路下调RIPK3,显著抑制CD8+ T细胞的功能。结果表明,circRNA_0013936有望成为BCa的有效治疗靶点。这些发现为膀胱癌的临床治疗提供了理论基础和新的思路。

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