欢迎来到“circRNA研究汇总”栏目,本栏目将为您带来circRNA领域的最新研究成果。本期我们精选了16篇最新文献,涵盖了circRNA的基础研究、功能探究以及与疾病的关联。请您紧跟circRNA研究的步伐,共同洞悉科研前沿的最新动态!

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR (circular RNA[Title/Abstract]) OR (circular mRNA[Title/Abstract])

01 人类和病毒环状RNA的成像和定量

标题:Imaging and quantification of human and viral circular RNAs

杂志:Nucleic Acids Res

影响因子:16.6

通讯作者:Sanjay Tyagi、Hua Zhu(美国罗格斯大学)

DOI: 10.1093/nar/gkae583

作者提出了一种利用扩增荧光原位杂交(ampFISH)对人类和病毒编码环状RNA (circRNA)进行细胞检测、成像、定位和定量的稳健方法。在这个过程中,一对发夹探针在相邻的序列上彼此结合,然后进行构象重组,启动靶依赖性杂交链反应(HCR),从而使荧光信号在该位点累积放大。通过利用ampFISH和单分子FISH (smFISH)的功能,作者选择性地使来自人类基因组、SARS-CoV-2(一种RNA病毒)和人类巨细胞病毒(HCMV,一种DNA病毒)的环状RNA及其线性RNA鉴定和成像。计算图像处理促进了单个细胞中环状RNA分子的准确定量。通过原位RNase R处理选择性地降解线性RNA而不影响环状RNA,然后ampFISH检测环状RNA,证明了该方法的特异性。使用不匹配的ampFISH探针和探针对进一步验证了环状RNA检测的有效性,这些探针对不结合其靶RNA中的连续序列,而是结合在分离的位点。另一项特异性测试是针对细胞中缺失的环状RNA序列设计的阴性链的探针。重要的是,该技术允许在同一细胞内以单分子灵敏度同时检测环状RNA及其线性对应物,从而探索环状RNA的生物发生,亚细胞定位和功能。

02 环状RNA寡核苷酸:酶合成和纳米结构支架

标题:Circular RNA oligonucleotides: enzymatic synthesis and scaffolding for nanoconstruction

杂志:Nanoscale Horiz

影响因子:8.0

通讯作者:毛诚德教授(美国普渡大学)、肖守军教授(南京大学)

DOI: 10.1039/d4nh00236a

该文章报道了一种新的DNA哑铃夹板和T4 DNA连接酶策略有效地合成了16-44 nt大小的单体环状RNA (circRNAs)。这种DNA哑铃夹板策略是由作者课题组最近开发的,用于将短线性DNA近定量地转化为单连环状DNA。此外,作者利用44 nt环状RNA作为支架链,构建了杂合RNA:DNA和纯RNA:RNA双交叉框架及其核酸纳米管和平面阵列的组装。

研究汇总列表

发表评论