欢迎来到“circRNA研究汇总”栏目,本栏目将为您带来circRNA领域的最新研究成果。本期我们精选了29篇最新文献,涵盖了circRNA的基础研究、功能探究以及与疾病的关联。请您紧跟circRNA研究的步伐,共同洞悉科研前沿的最新动态!
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01 环状RNA ACVR2A通过mir-511-5p靶向PI3K-Akt信号通路促进肝细胞癌的进展
标题:Circular RNA ACVR2A promotes the progression of hepatocellular carcinoma through mir-511-5p targeting PI3K-Akt signaling pathway
杂志:Mol Cancer
影响因子:27.7
通讯作者:章卓教授(西南医科大学)、姜鲜副教授(西南医科大学附属医院)
DOI:10.1186/s12943-024-02074-z
环状RNA (circRNA)被认为介导人类癌症的发生和发展,通常作为微小RNA (miRNA)海绵调节下游基因的表达。然而,目前尚不清楚circACVR2A (hsa_circ_0001073)是否以及如何参与HCC的进展。该研究的目的是阐明circACVR2A在调节肝细胞癌(HCC)进展中的潜在作用和分子机制。通过定量逆转录酶聚合酶链反应(RT-PCR)或Western blot检测circACVR2A、microRNA (miR511-5p)和PI3K-Akt信号通路相关蛋白的丰度。CCK-8染色、Transwell染色和Tunel染色分别检测细胞活力、侵袭和凋亡。通过双荧光素酶报告基因试验评估circACVR2A与microRNA之间的相互作用。
结果表明circACVR2A在肝癌细胞系中高表达。体内和体外数据表明,circACVR2A促进了HCC的增殖、迁移和侵袭。在机制方面,研究发现circACVR2A可以直接与miR511-5p相互作用,作为miRNA海绵调节PI3K-Akt信号通路中相关蛋白的表达。在HCC中,circACVR2A可以介导miR-511-5p/mRNA网络激活PI3K信号通路。这表明以circACVR2A为核心的分子调控网络是肝细胞癌诊断和治疗的一个新的潜在靶点。
02 发明circRNA促进RNA,特异性地促进circRNA的产生
标题:Invention of circRNA promoting RNA to specifically promote circRNA production
杂志:Nucleic Acids Res
影响因子:16.6
通讯作者:朱曲波教授(中南大学)
DOI: 10.1093/nar/gkae693
CircRNA是参与多种生物功能和疾病的重要RNA分子,经常在肿瘤组织中表达下调,发挥肿瘤抑制作用,具有治疗癌症的潜力。然而,目前促进circRNA产生的方法有限。该研究介绍了一种增强circRNA生物发生的新方法,称为circRNA促进RNA (cpRNA)。
CpRNA原理是补充pre-mRNA中反向互补匹配(RCMs)的侧翼序列,从而通过改善外显子环化促进circRNA的形成。使用分裂- GFP报告系统,结果证明了cpRNA显著提高环状GFP的产生。经过优化,确定了cpRNA促进circRNA生物发生的最佳条件,然后将这些cpRNA用于增加内源性circRNA的产生。这些结果表明,cpRNAs可以特异性地增加癌细胞中含有RCMs的内源性circRNAs的产生,如circZKSCAN1和circSMARCA5,从而通过调节circRNA相关通路抑制细胞增殖和迁移,显示了cpRNAs的治疗潜力。机制研究也表明,cpRNA促进circRNA的生物发生,部分是通过拮抗DHX9的解旋功能。总的来说,这些发现表明,cpRNA代表了一种有希望的circRNA过表达策略,为低circRNA表达水平的疾病提供了潜在的治疗方法。
03 传染病RNA疫苗的设计和递送进展
标题:Advances in the design and delivery of RNA vaccines for infectious diseases
杂志:Adv Drug Deliv Rev
影响因子:15.2
通讯作者:Camilla Foged(丹麦哥本哈根大学)
DOI: 10.1016/j.addr.2024.115419
RNA药物是治疗和预防全球重大疾病(例如传染病)方面的一种模式转变的代表。在2019年冠状病毒病大流行期间,以创纪录的速度开发了非常成功的针对严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)的信使RNA (mRNA)疫苗。疫苗开发时间大大缩短,再加上适应性,RNA疫苗技术对预防传染病和预防大流行极具吸引力。该综述回顾了基于不同类型的传染病RNA疫苗的设计和递送的最新进展,包括线性mRNA、自扩增RNA、反式扩增RNA和环状RNA。文章概述了用于传染病的RNA疫苗的临床管线,并介绍了分析表征质量属性和保证其质量的重要方法,并讨论了使用RNA疫苗对抗SARS-CoV-2以外病原体的未来前景。
04 环状RNA调节脑多巴胺神经元发育期间的大小和迁移
标题:Circular RNAs regulate neuron size and migration of midbrain dopamine neurons during development
杂志:Nat Commun
影响因子:14.7
通讯作者:R Jeroen Pasterkamp(荷兰乌得勒支大学)
DOI: 10.1038/s41467-024-51041-1
中脑多巴胺(mDA)神经元在认知和运动行为中起着至关重要的作用,并与不同的脑部疾病有关。然而,它们发育的分子机制,特别是非编码RNA (ncRNAs)的作用,仍然不完全清楚。该研究利用荧光激活的细胞分选,然后进行短读和长读RNA测序,在小鼠mDA神经元的关键发育时间点建立了环状RNA (circRNAs)的转录组概况和可选剪接模式。原位杂交显示在mDA神经元早期发育过程中几种环状RNA的表达,转录后沉默揭示了不同环状RNA在调节mDA神经元形态中的作用。最后,子宫内电穿孔和延时成像表明circRmst(一种具有广泛影响形态学的circRNA)参与了mDA神经元在体内的迁移。总之,这些数据首次揭示了环状RNA在mDA神经元发育中的功能作用,并描述了mDA神经元发育中不明确的方面。
05 circUGP2与PURB相互作用调节ADGRB1转录和海绵miR-3191-5p,通过p53信号通路抑制肝内胆管癌进展
标题:CircUGP2 Suppresses Intrahepatic Cholangiocarcinoma Progression via p53 Signaling Through Interacting With PURB to Regulate ADGRB1 Transcription and Sponging miR-3191-5p
杂志:Adv Sci (Weinh)
影响因子:14.3
通讯作者:李长贤副主任医师(南京医科大学第一附属医院)、项成主任医师(无锡市人民医院)
DOI: 10.1002/advs.202402329
肝内胆管癌(ICC)是第二常见的原发性肝癌,其预后仍然很差。尽管越来越多的研究已经证实环状RNA(circRNAs)参与各种癌症类型,但它们在ICC中的具体功能仍然难以捉摸。该文通过circRNA测序鉴定出一种circRNA circUGP2,该circRNA在ICC组织中表达下调,并与患者预后相关。此外,在体外和体内,过表达的circUGP2抑制肿瘤进展。机制上,circUGP2作为PURB的转录共激活因子作用于ADGRB1的表达。circUGP2还可以通过海绵吸附miR-3191-5p上调ADGRB1的表达。因此,ADGRB1阻止MDM2介导的p53多泛素化,从而激活p53信号,抑制ICC进展。研究将circUGP2质粒包封在脂质纳米颗粒(LNP)体系中,成功靶向肿瘤部位,显示出优异的抗肿瘤效果。综上,该研究确定了circUGP2通过调控ADGRB1/p53轴在ICC中发挥抑癌作用,LNP的应用为ICC治疗提供了一种有前景的翻译策略。
06 LNMAC通过表观遗传调控FGF2诱导的淋巴管生成促进宫颈鳞状细胞癌淋巴转移
标题:LNMAC Promotes Cervical Squamous Cell Carcinoma Lymphatic Metastasis via Epigenetic Regulation of FGF2-Induced Lymphangiogenesis
杂志:Adv Sci (Weinh)
影响因子:14.3
通讯作者:姜红叶、王伟副主任医师、沈宏伟主任医师(中山大学附属第一医院)
DOI: 10.1002/advs.202404645
淋巴结是宫颈鳞状细胞癌(CSCC)最常见的远端转移部位,其预后不佳,治疗效率有限。阐明CSCC淋巴转移的机制将提供潜在的治疗策略。该研究基于体内淋巴转移筛查模型,发现了一种环状RNA,称为淋巴结转移相关环状RNA (LNMAC),在淋巴转移性CSCC中显著上调,并与淋巴结转移相关。LNMAC的过表达通过诱导淋巴管生成显著增强了CSCC细胞向淋巴结转移的能力。机制上,LNMAC通过与组蛋白乙酰化酶1 (HDAC1)直接互作,以表观遗传途径上调成纤维细胞生长因子2 (FGF2)的表达,阻止进口蛋白α6/8介导的HDAC1核易位,引发组蛋白H3K27ac诱导的FGF2转录激活。用anti-FGF2单克隆抗体3F12E7治疗可有效抑制LNMAC诱导的CSCC淋巴转移。综上,这些结果表明LNMAC在FGF2介导的淋巴管生成和淋巴转移中起着至关重要的作用,强调LNMAC可能是CSCC患者淋巴结转移的治疗靶点。
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