欢迎来到“circRNA研究汇总”栏目，本栏目将为您带来circRNA领域的最新研究成果。本期我们精选了51篇最新文献，涵盖了circRNA的基础研究、功能探究以及与疾病的关联。请您紧跟circRNA研究的步伐，共同洞悉科研前沿的最新动态！
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01 circRNA和lncRNA编码肽在疾病中的作用
标题：CircRNA and lncRNA-encoded peptide in diseases, an update review
杂志：Mol Cancer
影响因子：27.7
通讯作者： 冯建国副教授（西南医科大学附属医院），孙炜教授、Weichao Sun（深圳第二人民医院）
DOI: 10.1186/s12943-024-02131-7
非编码RNA (ncRNAs)是真核生物基因组中广泛发现的独特RNA分子，包括环状RNA (circRNAs)和长链非编码RNA (lncRNAs)。它们的失调在包括癌症在内的许多疾病的发病机制中发挥关键作用。以前认为circRNA和lncRNA缺乏蛋白质编码能力，最近的研究表明，这些ncRNA中的少量开放阅读框(ORF)赋予了它们编码蛋白质的潜力。这些ncRNA衍生的肽或蛋白质已被证明通过多种机制调节各种生理和病理过程。它们在疾病诊断和靶向治疗中的新作用强调了其在临床中的潜在效用。该文旨在系统综述lncRNAs和circRNAs编码的蛋白或肽，阐明其产生和功能机制，并探讨其在癌症诊断、疾病预测和靶向治疗方面的应用前景。
02 含有整合素α6的细胞外囊泡通过与CD151的相互作用促进淋巴结转移前生态位形成的淋巴重塑
标题：Integrin α6-containing extracellular vesicles promote lymphatic remodelling for pre-metastatic niche formation in lymph nodes via interplay with CD151
杂志：J Extracell Vesicles
影响因子：15.5
通讯作者：林天歆教授、陈长昊主治医师（中山大学孙逸仙纪念医院）
DOI: 10.1002/jev2.12518
来自不同类型肿瘤的异质性细胞外囊泡(EV)被认为在引流淋巴结(LNs)中诱导形成转移前“生态位”，从而促进淋巴转移。为了确定所涉及的EV的特定亚群，研究对膀胱癌(BCa)组织源性EV进行了高分辨率蛋白质组学分析，结合纳米流式细胞术，发现了一个含有整合素α6 (ITGA6+ EV)的新肿瘤源性EV亚群，并在820例BCa患者的多中心临床分析中揭示了ITGA6+ EV与引流LNs中转移前生态位的形成和淋巴转移的正相关。BCa来源的ITGA6+ EV诱导E-选择素(SELE)标记的淋巴重塑转移前生态位，并通过向淋巴内皮细胞递送circRNA-LIPAR促进引流LNs的转移。在机制上，LIPAR将ITGA6连接到RAB5A的开关II结构域，并维持RAB5A GTP结合的激活状态，从而通过内体运输维持装载LIPAR的ITGA6+ EV的产生。ITGA6+ EV通过ITGA6-CD151相互作用靶向淋巴管，释放LIPAR诱导SELE过表达的淋巴重塑转移前生态位。研究还构建了工程ITGA6 EV用于抑制淋巴转移前生态位，从而抑制淋巴转移并延长临床前模型的生存期。总之，该研究揭示了BCa衍生的ITGA6+ EV介导转移前生态位的机制，并提供了一种基于工程EV的对抗BCa淋巴转移策略。
03 人乳头瘤病毒编码的环状RNA circE7促进头颈部鳞状细胞癌的免疫逃避
标题：Human papillomavirus-encoded circular RNA circE7 promotes immune evasion in head and neck squamous cell carcinoma
杂志：Nat Commun
影响因子：14.7
通讯作者：龚朝建副教授（中南大学湘雅二医院），熊炜教授、曾朝阳研究员（中南大学癌症研究所）
DOI: 10.1038/s41467-024-52981-4
免疫逃避是肿瘤发展的重要里程碑，是肿瘤免疫治疗的理论基础。该研究揭示了人乳头瘤病毒(HPV)编码的环状RNA circE7与头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中CD8+ T细胞浸润之间呈负相关。体外和体内实验均表明，circE7通过下调编码半乳糖凝集素-9蛋白的LGALS9的转录，从而抑制T细胞的功能和活性。其分子机制涉及circE7与乙酰辅酶a羧化酶1 (ACC1)结合，促进其去磷酸化，从而激活ACC1。活化的ACC1降低LGALS9基因启动子处的H3K27乙酰化，导致半乳糖凝集素-9表达降低。值得注意的是，半乳糖凝集素-9与免疫检查点分子TIM-3和PD-1相互作用，抑制T细胞分泌细胞毒性细胞因子，促进T细胞凋亡。研究阐述了HPV通过circE7驱动的表观遗传修饰，促进HNSCC免疫逃避的机制，并提出了一种潜在的HNSCC免疫治疗策略，包括联合使用anti-PD -1和anti-TIM-3抑制剂。
04 动态构象:向环状RNA的功能和应用迈进
标题：Dynamic conformation: Marching toward circular RNA function and application
杂志：Mol Cell
影响因子：14.5
通讯作者：陈玲玲研究员（中国科学院分子细胞科学卓越创新中心）
DOI：10.1016/j.molcel.2024.08.020
环状RNA是一组共价封闭的单链转录物，具有独特的生物发生、稳定性和构象，在调节细胞功能方面发挥着独特的作用，并且在开发基于环状RNA的治疗方面也具有巨大的潜力。重要的是，由于其环状构象，环状RNA产生不同于线性转录物的独特的分子内碱基配对。该综述从这个角度回顾了环状RNA构象对其生命周期和作用模式的影响，以及哪些因素可以调节环状RNA构象。文章还讨论了理解环状RNA构象如何有助于了解其功能以及进一步解决其构象的剩余技术问题。该综述将为生物医学应用的环状RNA平台的设计提供信息。
05 利用液滴数字CRISPR/Cas13a平台在医疗点定量检测环状RNA和microRNA
标题：Quantitative detection of circular RNA and microRNA at point-of-care using droplet digital CRISPR/Cas13a platform
杂志：Biosens Bioelectron
影响因子：10.7
通讯作者： Keying Guo （莫纳什大学），王佳思副教授（中山大学）
DOI: 10.1016/j.bios.2024.116825
环状RNA (circRNA)和小RNA (miRNA)都是非编码RNA (ncRNA)，作为癌症诊断和预后的生物标志物。这些ncRNA的定量检测对于阐明其功能机制和评估其作为生物标志物的潜力具有特别重要的意义。然而，circRNA和miRNA的固有结构与mRNA不同，传统的qRT-PCR不适合检测这些ncRNA。该文章提出了一种使用多分散液滴数字CRISPR/Cas13a (PddCas13a)的circRNA和miRNA定量检测的灵敏方法。它可以实现低至10 aM的检测限(LOD)，而无需基于聚合酶的扩增。为了有效地检测真实样品中的circRNA和miRNA，研究使用化学修饰的crRNA来增强crRNA的稳定性，提高Cas13a在含污染物的复杂环境中的性能。通过将无提取过程与PddCas13a相结合，并通过临床样本测试实验证明了PddCas13a的适用性。此外，研究开发了一种自动化的便携式PddCas13a仪器，并验证了其在即时护理(POC)环境下检测外泌体circRNA和miRNA的适用性。这是首次在POC环境中同时检测circRNA和miRNA的报道。该平台有望能够促进ncRNA的研究。
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