欢迎来到“circRNA研究汇总”栏目,本栏目将为您带来circRNA领域的最新研究成果。本期我们精选了15篇最新文献,涵盖了circRNA的基础研究、功能探究以及与疾病的关联。请您紧跟circRNA研究的步伐,共同洞悉科研前沿的最新动态!
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR (circular RNA[Title/Abstract]) OR (circular mRNA[Title/Abstract])
01 能量应激诱导的CircEPB41(2)促进肝细胞癌脂肪生成
标题:Energy Stress-induced CircEPB41(2) Promotes Lipogenesis in Hepatocellular Carcinoma
杂志:Cancer Res
影响因子:12.5
通讯作者:Yide Mei
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1630
肿瘤微环境在癌细胞的代谢重编程中起着关键作用。更好地理解调节癌症代谢的潜在机制有助于确定潜在的治疗靶点。在此,该研究团队确定 circEPB41(2)是一种受代谢调节的环状 RNA,它在肝细胞癌(HCC)中介导脂质代谢。circEPB41(2)在葡萄糖缺乏的情况下通过 HNRNPA1 依赖性可变剪接被诱导产生。circEPB41(2)的上调导致促脂肪生成基因表达增强,从而促进脂肪生成。从机制上讲,circEPB41(2)与 m6A 去甲基化酶 FTO 合作,降低组蛋白去乙酰化酶 SIRT6 的 mRNA 稳定性,从而提高 H3K9ac 和 H3K27ac 水平以激活促脂肪生成基因表达。沉默 circEPB41(2)可抑制 HCC 细胞的体外增殖和肿瘤异种移植物的体内生长。在临床上,circEPB41(2)在 HCC 中升高,并且高 circEPB41(2)表达与患者不良预后相关。总体而言,这项研究表明 circEPB41(2)是脂质代谢重编程的重要调节因子,并表明靶向 circEPB41(2)-FTO-SIRT6 轴可能是治疗 HCC 的一种有前景的抗癌策略。
02 反义CircRNA VvcircABH通过抑制葡萄同源mRNA剪接来控制耐盐性和油菜素内酯信号反应
标题:The antisense CircRNA VvcircABH controls salt tolerance and the brassinosteroid signaling response by suppressing cognate mRNA splicing in grape
杂志:New Phytol
影响因子:8.3
通讯作者:Jing Li ,Yuanpeng Du
DOI:10.1111/nph.20306
土壤盐渍化是限制葡萄产业可持续发展的主要因素。环状 RNA(circRNAs)比线性 mRNA 更稳定,并参与应激反应。然而,植物中反义环状 RNA 的生物学功能和分子机制尚不清楚。该研究团队通过高通量测序鉴定出反义环状 RNA VvcircABH。利用遗传转化方法和分子生物学技术,该团队分析了 VvcircABH 对盐胁迫响应的影响及其作用机制。VvcircABH 位于细胞核中,并受盐胁迫上调,而其同源基因 VvABH(α/β- 水解酶)的表达水平则下调。VvcircABH 过表达或 VvABH 沉默极大地增强了葡萄的耐盐性。VvcircABH 可以结合重叠区域并抑制 VvABH 前体 mRNA 的剪接,从而降低 VvABH 的表达水平。此外,VvcircABH 抑制了 VvABH 对 VvBRI1(油菜素内酯不敏感 1)和 VvBKI1(BRI1 激酶抑制剂 1)之间相互作用的加成效应,从而影响植物对 BR 的响应,BR 在植物耐盐性中起重要作用。该团队得出结论,VvcircABH 和 VvABH 在耐盐性和油菜素内酯信号响应中发挥不同的作用,并且 VvcircABH 可以通过抑制 VvABH 的剪接来控制其表达。
03 T细胞急性淋巴细胞白血病中RNA结合蛋白QKI的缺失和环状RNA的失调
标题:Depletion of the RNA binding protein QKI and circular RNA dysregulation in T-cell acute lymphoblastic leukemia
杂志:Haematologica
影响因子:8.2
通讯作者: Stefania Bortoluzzi
DOI:10.3324/haematol.2024.285971
环状RNA(circRNA)在癌症中有致癌和抑癌的两面性。研究表明,T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)中circRNA的异常表达与功能影响显著。QKI(Quaking)是一个与circRNA生物合成相关的剪接因子,可能在T-ALL中失调。利用RNA测序数据,将T-ALL患者分为QKI表达正常(QKI_normal)和异常低(QKI_low)两组,结果显示QKI表达水平与circRNA表达水平显著相关,209个circRNA与QKI水平显著相关。通过随机森林分析,识别出149个能够分类低和正常QKI表达的T-ALL病例的circRNA。在QKI_low与QKI_normal T-ALL中,分别识别出328个和425个circRNA表达和比例(CLP)显著变化。QKI的沉默影响了T-ALL细胞中circRNA的全局表达谱。这些结果表明,QKI表达水平可以用于T-ALL患者分期,低QKI水平与circRNA表达的显著变化相关。QKI的沉默在体外实验中影响了circRNA的表达,揭示了QKI表达降低可能是解释T-ALL中circRNA失调的新因素。这项研究揭示了QKI在T-ALL中作为潜在的生物标志物和治疗靶点的可能性,强调了circRNA在癌症中的复杂调控网络。
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