circRNA研究汇总丨20241209-20241215

欢迎来到“circRNA研究汇总”栏目，本栏目将为您带来circRNA领域的最新研究成果。本期我们精选了20篇最新文献，涵盖了circRNA的基础研究、功能探究以及与疾病的关联。请您紧跟circRNA研究的步伐，共同洞悉科研前沿的最新动态！

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01 有效合成环状RNA用于滚环翻译

标题：Efficient circular RNA synthesis for potent rolling circle translation

杂志：Nat Biomed Eng

影响因子：27.7

通讯作者：Yifei Du、V. Ramakrishnan

DOI：10.1038/s41551-024-01306-3

环状 RNA（circRNA）因其卓越的稳定性而成为下一代信使 RNA 治疗药物的候选者。在这里，该研究团队描述了基于反式剪接的方法来合成超过 8000 个核苷酸的环状 RNA。这些方法独立于细菌序列，优于排列内含子-外显子（PIE）方法，并允许整合 RNA 修饰。由此产生的未修饰的环状 RNA 整合了人类 28S 核糖体 RNA 的序列，显示出低免疫原性，并且比PIE法合成的环状 RNA 翻译效率更高。此外，通过使用病毒内部核糖体进入位点进行滚环翻译，研究表明核糖体可以有效地读取高度结构化的内部核糖体进入位点，相对于以前的构建体，将滚环翻译的效率提高了 7000 倍以上。环状 RNA 的高效可靠生产可能有助于其治疗用途。

标题：A read-through circular RNA RCRIN inhibits metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease

杂志：J Hepatol

影响因子：26.8

通讯作者：Yong Tian、Zusen Fan

DOI：10.1016/j.jhep.2024.11.052

背景与目的：代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的分子机制尚不清楚，非编码 RNA 是否可以作为 MASLD 的生物标志物和治疗靶点尚不明确。
方法：采用外显子捕获 RNA 测序分析来鉴定三名 MASLD 患者和三名非 MASLD 患者肝脏中的通读环状 RNA（rt-circRNAs）。利用肝细胞特异性缺失或过表达 rt-circRNA RCRIN 来研究 MASLD 的发病机制。
结果：该研究团队在 MASLD 患者的肝脏组织中鉴定出 1126 个 rt-circRNAs。RCRIN 在正常肝脏中高表达，在 MASLD 肝脏中表达下调。肝细胞中 RCRIN 的缺失导致脂质积累和 MASLD 发展，而 RCRIN 的过表达抑制了 MASLD 的进展。从机制上讲，在正常肝细胞中，高表达的 RCRIN 与 RPL8 蛋白结合，招募 RNF2 使其降解，减少含 RPL8 的核糖体数量和脂质积累。在 MASLD 肝脏中，低表达的 RCRIN 释放 RPL8 蛋白，促进含 RPL8 的核糖体数量和脂质合成，导致更高的脂质积累和内质网应激。该团队合成了 RCRIN 和 N – 乙酰半乳糖胺（GalNAc）-Rpl8 siRNA 来治疗已建立的小鼠 MASLD，两者都抑制了 MASLD 的发病机制。
结论：该研究团队的研究结果提供了 rt-circRNA RCRIN 的体内功能，显示了其在 MASLD 发病机制中的抑制作用，表明 RCRIN 和 RPL8 可能是治疗 MASLD 的治疗靶点和候选核酸药物。
影响和意义：该研究团队的发现揭示了一种连接通读环状 RNA RCRIN、核糖体异质性和 MASLD 发病机制的新机制。在正常肝细胞中，RCRIN 通过促进 RPL8 降解来减少肝脏脂质积累和内质网应激从而发挥作用。在 MASLD 患者中，较低的 RCRIN 释放 RPL8 以形成含 RPL8 的核糖体，从而促进脂质积累和内质网应激。RCRIN 过表达和 RPL8 缺失显著抑制 MASLD 的发展和进展。该团队的研究结果表明，RCRIN 和 RPL8 可能是治疗 MASLD 患者的潜在治疗靶点。

标题：Translation of circular RNAs

杂志：Nucleic Acids Res

影响因子：16.7

通讯作者：Stefan Stamm

DOI：10.1093/nar/gkae1167

环状RNA（circRNA）在癌症中有致癌和抑癌的两面性。研究表明，T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）中circRNA的异常表达与功能影响显著。QKI（Quaking）是一个与circRNA生物合成相关的剪接因子，可能在T-ALL中失调。利用RNA测序数据，将T-ALL患者分为QKI表达正常（QKI_normal）和异常低（QKI_low）两组，结果显示QKI表达水平与circRNA表达水平显著相关，209个circRNA与QKI水平显著相关。通过随机森林分析，识别出149个能够分类低和正常QKI表达的T-ALL病例的circRNA。在QKI_low与QKI_normal T-ALL中，分别识别出328个和425个circRNA表达和比例（CLP）显著变化。QKI的沉默影响了T-ALL细胞中circRNA的全局表达谱。这些结果表明，QKI表达水平可以用于T-ALL患者分期，低QKI水平与circRNA表达的显著变化相关。QKI的沉默在体外实验中影响了circRNA的表达，揭示了QKI表达降低可能是解释T-ALL中circRNA失调的新因素。这项研究揭示了QKI在T-ALL中作为潜在的生物标志物和治疗靶点的可能性，强调了circRNA在癌症中的复杂调控网络。

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