circRNA研究汇总丨20241216-20241222

欢迎来到“circRNA研究汇总”栏目，本栏目将为您带来circRNA领域的最新研究成果。本期我们精选了26篇最新文献，涵盖了circRNA的基础研究、功能探究以及与疾病的关联。请您紧跟circRNA研究的步伐，共同洞悉科研前沿的最新动态！

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标题：Circular RNA circPHLPP2 promotes tumor growth and anti-PD-1 resistance through binding ILF3 to regulate IL36γ transcription in colorectal cancer

杂志：Mol Cancer

影响因子：27.7

通讯作者：Dong-Liang Chen

DOI：10.1186/s12943-024-02192-8

背景：大多数结直肠癌（CRC）患者对抗程序性细胞死亡蛋白 1（PD-1）治疗的反应有限，其潜在机制尚不清楚。环状 RNA（circRNAs）在肿瘤发生和发展中起着重要作用，在肿瘤筛查和预测治疗效果方面具有潜在应用。然而，很少有研究探索 circRNAs 在 CRC 免疫逃逸中的作用。

方法：使用 circRNA 微阵列来鉴定 circPHLPP2。使用逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR）来检查 circPHLPP2 的表达水平与 CRC 患者临床特征之间的关联。使用 MTS 测定、克隆形成实验、皮下肿瘤植入和多色流式细胞术来确认 circPHLPP2 的生物学功能。进行 RNA 测序（RAN-seq）、RT-qPCR 和 WB 实验以研究 circPHLPP2 涉及的下游信号通路。进行 RNA pull-down、RNA 免疫沉淀（RIP）和免疫荧光染色以鉴定与 circPHLPP2 相关的蛋白质。

结果：在对抗 PD-1 治疗有抗性的 CRC 患者中，circPHLPP2 上调。circPHLPP2 显著促进 CRC 细胞的增殖和肿瘤生长。敲低 circPhlpp2 可增强体内抗 PD-1 的疗效。从机制上讲，circPHLPP2 与 ILF3 之间的特定相互作用促进了 ILF3 的核积累，随后增强了 IL36γ 的转录。这个过程减少了自然杀伤（NK）细胞的浸润，并损害 NK 细胞的颗粒酶 B 和干扰素-γ的产生，从而促进肿瘤进展。

结论：总的来说，该团队的研究结果揭示了 circRNA 调节 CRC 免疫逃逸的一种新机制。circPHLPP2 可能作为 CRC 患者的预后生物标志物和潜在治疗靶点。

标题：Circular RNAs trigger nonsense-mediated mRNA decay

杂志：Mol Cell

影响因子：14.5

通讯作者：Yoon Ki Kim

DOI：10.1016/j.molcel.2024.11.022

环状 RNA（circRNAs）是主要通过反向剪接过程产生的共价闭合单链 RNA。它们在各种生物和生理过程中发挥调节作用；然而，circRNAs 发挥作用的分子机制仍不清楚。在此，该研究团队证明 circRNAs 通过 circRNAs 与 mRNA 的 3′ 非翻译区（3′ UTRs）之间的 RNA-RNA 相互作用促进 mRNA 的快速降解。这种相互作用将通过反向剪接沉积在 circRNAs 上的外显子连接复合物（EJCs）定位在 mRNA 的 3′ UTRs 附近，从而导致依赖于 EJC 的无义介导的 mRNA 降解（NMD），该团队将这个过程描述为环状 RNA 诱导的 NMD（circNMD）。该团队的转录组分析揭示了数百个潜在的 circNMD 候选者，并且 circNMD 在细胞凋亡中的生物学重要性得到了验证。该团队还证明，设计用于与内源 mRNA 的 3′ UTRs 相互作用的外源表达的 circRNAs 显著下调 mRNA 水平。总之，该团队的观察结果为 circNMD 及其在选择性 mRNA 下调中的潜在治疗应用提供了令人信服的分子证据。

标题：CircRREB1 Mediates Metabolic Reprogramming and Stemness Maintenance to Facilitate Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Progression

杂志：Cancer Res

影响因子：12.5

通讯作者：Chen Liang , Xianjun Yu , Si Shi

DOI：10.1158/0008-5472.CAN-23-3596

胰腺导管腺癌（PDAC）是一种高度致命的肿瘤，治疗选择有限，患者生存率低。环状 RNA（circRNA）在包括 PDAC 在内的各种癌症的发生和发展中起着至关重要的调节作用。在这项研究中，通过对不同的 PDAC 样本进行 circRNA 测序，该研究团队确定 circRREB1 是一种致癌性 circRNA，在 PDAC 中显著上调，并且与患者不良预后相关。在功能上，circRREB1 的缺失显著抑制糖酵解和干性，而升高的 circRREB1 则产生相反的效果。从机制上讲，circRREB1 与 PGK1 相互作用，破坏 PTEN 与 PGK1 之间的关联，并增加 PGK1 磷酸化以激活糖酵解通量。此外，circRREB1 通过直接与 YBX1 相互作用并促进其核易位来促进 WNT7B 转录，从而激活 Wnt/β- 连环蛋白信号通路以维持 PDAC 干性。总体而言，这些结果突出了 circRREB1 作为 PDAC 代谢和干性特性的关键调节因子。重要性：CircRREB1 刺激 PGK1 诱导糖酵解，并激活 Wnt/β- 连环蛋白信号通路以维持胰腺癌中的干性，表明 circRREB1 作为生物标志物和治疗靶点的潜力。

标题：Super-enhancer-associated CircPVT1 Promotes Malignancy of Hepatocellular Carcinoma via YBX1-mediated RRM2 activation

杂志：Cancer Lett

影响因子：9.1

通讯作者：Haiyang Xie , Shusen Zheng , Zhengliang Tu 

DOI：10.1016/j.canlet.2024.217395

环状 RNA（circRNAs）是表观遗传重编程的重要成员，正在成为肝细胞癌（HCC）中一个引人关注的层面。超级增强子（SEs）是具有巨大基因激活潜力的转录增强子大簇，在癌症研究中被广泛研究。本研究探索并揭示了一种与 SE 相关的环状 RNA circPVT1，确定了其在 HCC 中的生物学功能和下游机制。circPVT1 在 HCC 中上调，是 HCC 患者的独立预后因素。在 circPVT1 宿主基因的基因组位点上已确认 H3K27ac 和 H3K4me1 修饰的富集，并且 circPVT1 的表达由 SE 触发。在功能上，circPVT1 增强体外细胞增殖和迁移能力，并促进体内肿瘤生长和转移。在机制上，circPVT1 将 YBX1 招募到细胞核中，促进 RRM2 的转录。circPVT1-RRM2 轴的失调促进 HCC 的恶性进展，而抑制 RRM2 或 SE 可减轻 circPVT1 过表达的影响。总之，该实验研究结果表明 circPVT1 由超级增强子驱动。circPVT1 通过 YBX1 介导的 RRM2 转录激活促进 HCC 进展。这些发现为探索 HCC 的发病机制提供了建设性的见解。

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