本月下旬circRNA相关研究文献数量井喷，共计24篇之多，且研究亮点不少，如中大附一的张弩教授团队首次发现人环形RNA可利用重叠密码子翻译功能蛋白；德国科学家发现血小板来源的circRNAs可选择性分选进入胞外囊泡，暗示circRNAs是很好的诊断maker；还有首次报道circRNA可调控胰岛β细胞的活性影响胰岛功能，circRNAs有望成为糖尿病治疗靶点。可以说1月是circRNA研究成果丰收的一个月，2018年circRNA研究开了个好彩，下面我们一起来浏览下相关研究文献。
1、人circSHPRH可发挥类似病毒RNA利用重叠密码子翻译功能蛋白抑制胶质瘤
论文题目：A novel protein encoded by the circular form of the SHPRH gene suppresses glioma tumorigenesis
杂志：oncogene影响因子7.52分
通讯作者单位：中山大学附属医院
该研究成果由中山大学附属第一医院张弩副教授主导完成，也是张教授继JNCI杂志发布 circ-FBXW7环形RNA翻译蛋白后又一力作。本研究首次证明人类转录本中存在重叠密码子编码蛋白产物，即SHPRH基因的circRNA circ-SHPRH编码多肽，该多肽是在跨过接口位点后终止翻译的产物，意义重大，同时也为circRNA研究打开了一扇新大门，庞大的人类基因组上是否还有其他基因存在类似高效经济的调控方式，值得进一步深入研究。具体文章解读我们在前两期已经详细介绍过，详见往期文章：What?人类内源circRNA也能通过重叠密码子编码蛋白！。
图注：circ-SHPRH分子结构示意图
2、整合人转录组测序数据分析探索转录本反式拼接和可变反向拼接现象
论文题目：Integrative transcriptome sequencing reveals extensive alternative trans-splicing and cis-backsplicing in human cells
杂志：Nucleic Acids Research影响因子10.16分
通讯作者单位：台湾中央研究院基因组研究中心
研究中经常会碰到可变转录本的情况，即转录本序列顺序不同于基因组序列，一个基因对应多种转录本，甚至一个转录本来自不同基因区域序列，如果不留意该问题将会为后续研究带来困难，也不利于认识真正的分子事件，比如tsRNA也存在与circRNA一样的junctio point，所以在检测circRNA时要排除tsRNA的影响，才能得到真实可靠的结果。具体文章解读见往期文章：Nucleic Acids Research: 反向拼接产物也可能是分子间拼接的产物！
3、综述：CircRNA在肿瘤免疫和免疫治疗中的研究进展
论文题目：The Potential Role of circRNA in Tumor Immunity Regulation and Immunotherapy
杂志：FRONT IMMUNOL影响因子6.43分
通讯作者单位：中南大学
肿瘤免疫治疗是当前研究热门，以有许多研究表明lncRNA、miRNA在抗肿瘤免疫反应中起到重要作用，但circRNA在抗肿瘤免疫反应中的研究还不多，该综述回顾了lncRNA、miRNA和circRNA等非编码RNA分子在抗肿瘤免疫反应中的研究进展，并提示circRNA在抗肿瘤免疫治疗中将起到重要作用，肿瘤免疫治疗领域将是circRNA研究的下一个重要方向。
图注：a：circRNA可通过吸附miRNA分子上调抗肿瘤免疫相关基因的表达，如PD-L1和STAT3等；B：circRNA可结合MDM2和P53蛋白，调控蛋白稳定性和抗肿瘤；c：circRNA分子可通过外泌体转运进入免疫细胞影响肿瘤发生；d：在外泌体中circRNA可稳定miRNA分子，协助miRNA进入免疫细胞调控肿瘤免疫应答。
表注：目前研究抗肿瘤免疫反应相关的ncRNA分子统计表。
4、血小板来源的胞外囊泡可选择性包装进circRNAs
论文题目：Selective release of circRNAs in platelet-derived extracellular vesicles
通讯作者单位：德国吉森大学
研究者通过密度梯度离心法获取血小板来源的外泌体和胞外囊泡，进一步进行RNA-seq测序发现，circRNAs都可包装入外泌体和胞外囊泡中，并可选择性释放出来，表明存在特殊的分选机制，血小板在止血，伤口愈合和癌症转移等方面都起重要作用，提示circRNA在这些过程中可能起重要功能，是非常有潜力的诊断标志物，极具研究价值。
图注：circRNAs在人血小板中高丰度表达
图注：circRNA被选择性包装进入血小板起源的胞外囊泡中
5、CircRNA在糖尿病β细胞活性调控中的功能研究
论文题目：Circular RNAs as novel regulators of β-cell functions in normal and disease conditions
杂志：Molecular Metabolism影响因子6.79分
通讯作者单位：瑞士诺桑大学
该研究主要探索circRNA在胰岛中的表达水平及对胰岛素分泌、β细胞增殖和凋亡等功能调控作用。高通量测序实验发现db/db小鼠（Ⅱ型糖尿病模型）中circHIPK3和ciRS-7显著下调，在正常动物模型小鼠中敲低circHIPK3和ciRS-7后，胰岛素分泌减少，β细胞增殖和生存能力下降，转录组数据分析发现，circHIPK3可结合miR-124-3p和miR-338-3p调控β细胞关键基因如Slc2a2, Akt1, and Mtpn。表明circRNA在胰岛素分泌和β细胞活性中起重要作用。
图注：circHIPK3和ciRS-7在db/db小鼠中表达下调
6、综述：非编码RNA在阿兹海默疾病中的研究进展
论文题目：Noncoding RNAs in Alzheimer’s disease
杂志：WIRES RNA 影响因子6.02分
通讯作者单位：美国马里兰大学
本文对lncRNA、miRNA和circRNA等非编码RNA在阿茨海默疾病中的研究进行了统计汇总。
图注：目前报道的lncRNA、miRNA和circRNA在阿茨海默疾病中的作用机制示意图
7、论文题目：Functional Characterization of Novel Circular RNA Molecule, circzip-2 and Its Synthesizing Gene zip-2 in C. elegans Model of Parkinson’s Disease
杂志：Molecular Neurobiology影响因子6.19分
通讯作者单位：印度CSIR药物研究中心
该研究利用帕金森线虫研究模型，发现zip-2基因来源的circRNA分子circzip-2在线虫寿命延长中起重要作用，线虫模型中敲低zip-2基因后α突触核蛋白聚集显著减少，线虫寿命延长，进一步RNA-seq转录组分析发现，zip-2可能通过Daf-16通路，circzip-2可通过吸附miR-60在帕金森疾病中发挥作用。
图注：circzip-2在帕金森线虫模型中下调
图注：沉默zip-2基因线虫模型中NGS和qPCR实验推断zip-2作用通路
图注：circzip-2结合miRNA信息表
8、circ-ZFR通过吸附miR-130a和miR-107抑制胃癌细胞增殖和促进凋亡
论文题目：Circular RNA-ZFR Inhibited Cell Proliferation and Promoted Apoptosis in Gastric Cancer by Sponging miR-130a_miR-107 and Modulating PTEN
杂志：Cancer Research and Treatment 影响因子3.77分
通讯作者单位：昆明医科大学附属第一医院
该研究在胃癌中发现circ-ZFR通过miR-130a/miR-107‒PTEN信号轴抑制胃癌细胞增殖和促进凋亡功能。
图注：circ-ZFR在胃癌组织中表达下调
图注：过表达circZFR可抑制胃癌细胞增殖和促进凋亡
图注：circZFR通过吸附miR-130a和miR-107抑制胃癌细胞增殖能力
9、Hsa_circ_0014717抑制结肠癌增殖能力的研究
论文题目：Hsa_circ_0014717 is downregulated in colorectal cancer and inhibits tumor growth by promoting p16 expression
杂志：Biomedicine & Pharmacotherapy影响因子2.76分
通讯作者单位：南通大学附属第三医院
该研究探讨了Hsa_circ_0014717在结肠癌中表达下调并可促进p16表达，抑制结肠癌细胞增殖。
图注：Hsa_circ_0014717在CRC中表达下调，可作为CRC患者的潜在诊断标志物
10、hsa_circ_0001649在胆管癌细胞中下调并调控细胞增殖、迁移和侵袭
论文题目：Downregulated circular RNA hsa_circ_0001649 regulates proliferation, migration and invasion in cholangiocarcinoma cells
杂志：BBRC 影响因子2.47分
通讯作者单位：哈尔滨医科大学附属第二医院
该研究发现hsa_circ_0001649在胆管癌组织和细胞中显著下调，过表达hsa_circ_0001649可抑制CCA细胞增殖、侵袭和迁移能力下降，体内动物实验与细胞实验结果一致。
图注：动物实验表明过表达hsa_circ_0001649可抑制肿瘤增殖
下表是其他一些circRNA文献概要
参考文献：
- The Potential Role of circRNA in Tumor Immunity Regulation and Immunotherapy
- Silencing of hsa_circ_0007534 suppresses proliferation and induces apoptosis in colorectal cancer cells
- Selective release of circRNAs in platelet-derived extracellular vesicles
- Noncoding RNAs in Alzheimer’s disease
- Hsa_circ_0014717 is downregulated in colorectal cancer and inhibits tumor growth by promoting p16 expression
- Global accumulation of circRNAs during aging in Caenorhabditis elegans
- Functional Classification and Experimental Dissection of Long Noncoding RNAs
- Functional Characterization of Novel Circular RNA Molecule, circzip-2 and Its Synthesizing Gene zip-2 in C. elegans Model of Parkinson’s Disease
- Evaluating the bias of circRNA predictions from total RNA-Seq data
- Downregulated circular RNA hsa_circ_0001649 regulates proliferation, migration and invasion in cholangiocarcinoma cells
- Circular RNA-ZFR Inhibited Cell Proliferation and Promoted Apoptosis in Gastric Cancer by Sponging miR-130a_miR-107 and Modulating PTEN
- Circular RNAs_ biogenesis, expression and their potential roles in reproduction
- Circular RNAs as novel regulators of β-cell functions in normal and disease conditions
- Circular RNA_ non-coding RNA with emerging roles in stem cell differentiation
- Circular RNA_ An emerging non-coding RNA as a regulator and biomarker in cancer
- Circular RNA VMA21 protects against intervertebral disc degeneration through targeting miR-200c and X linked inhibitor-of-apoptosis protein
- Circular RNA hsa_circ_0000567 can be used as a promising diagnostic biomarker for human colorectal cancer
- Circular RNA Expression Profiles Alter Significantly After Traumatic Brain Injury in Rats
- Circular RNA expression in ovarian endometriosis
- Circular RNA expression in extracellular vesicles isolated from serum of patients with endometrial cancer
- Biclustering of transcriptome sequencing data reveals human tissue-specific circular RNAs
- Analyzing the interactions of mRNAs, miRNAs, lncRNAs and circRNAs to predict competing endogenous RNA networks in glioblastoma
- A novel circular RNA, hsa_circ_0046701, promotes carcinogenesis by increasing the expression of miR-142-3p target ITGB8 in glioma