欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献24篇，下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。
1、circEPSTI1作为三阴性乳腺癌独立预后因素的研究
论文标题：circEPSTI1 as a Prognostic Marker and Mediator of Triple-Negative Breast Cancer Progression.
杂志：Theranostics 影响因子：8.573
通讯作者单位：中山大学肿瘤医院
三阴性乳腺癌（TNBC）是指癌组织免疫组织化学检查结果为雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）和原癌基因Her-2均为阴性的乳腺癌。TNBC是侵袭性最强的乳腺癌类型，该疾病复发率高和致死率高。这类乳腺癌占所有乳腺癌病理类型的10.0%～20.8%，具有特殊的生物学行为和临床病理特征，预后较其他类型差。广州中山大学肿瘤医院谢小明团队发现circEPSTI1环状RNA可通过miRNA sponge作用机制，通过竞争性吸附miR-4753和miR-6809后上调BCL11A的表达，促进三阴性乳腺癌（TNBC）细胞的增殖和降低凋亡功能，结合临床资料分析发现，circEPSTI1可作为TNBC患者的独立预后因素。该文详细解读请点击circEPSTI1作为三阴性乳腺癌的预后标志物和介导因子
图注：circEPSTI1在三阴性乳腺癌（TNBC）中的作用机制示意图
2、实体瘤中circRNA的功能及临床意义
论文标题：Function and clinical significance of circRNAs in solid tumors.
杂志：J Hematol Oncol 影响因子：7.33
通讯作者单位：苏州大学附属第三医院
自1979年研究者第一次在真核细胞中发现circRNA到现在，circRNA研究并非一帆风顺，最初被认为是基因转录过程中错误剪切产物。高通量测序和生物信息学技术的发展才真正揭开circRNA的神秘面纱，circRNA非但不是转录垃圾，而且在各种生命体中普遍存在，数量众多，功能强大的一种5’和3’首尾相连不同于线性RNA的环形RNA分子，在生理疾病过程中扮演重要角色。该综述盘点了circRNA的各种特点，生物形成机制假说、分子功能和研究策略，以及circRNA与不同实体瘤的关系及潜在的临床价值，是一份很好的实体瘤circRNA研究快速入门文章。文章详细解读见本公众号文章：circRNA在实体瘤中的功能和临床意义的长篇综述。
3、敲低circRNA.2837可通过调节神经元自噬作用保护坐骨神经损伤
论文标题：Silencing of circRNA.2837 Plays a Protective Role in Sciatic Nerve Injury by Sponging the miR-34 Family via Regulating Neuronal Autophagy
杂志：Mol Ther Nucleic Acids 影响因子：5.66
通讯作者单位：第二军医大学长征医院
周围神经损伤（PNI）是一种常见的临床问题，主要由创伤和外科手术引起，给患者造成长期经济和社会负担。目前已知受损的周围神经有一个轴突再生的内在能力，但功能恢复差。因此，越来越多的研究致力于开发有效的周围神经损伤治疗。目前，周围神经损伤的临床前研究主要在动物模型中进行，坐骨神经损伤（SNI）模型是研究周围神经损伤最常用的实验范例，使用SNI模型进行了许多实验试图在周围神经损伤后增加神经再生和功能恢复。然而，现有的神经损伤治疗方法似乎不足，部分原因是对损伤后细胞和分子事件的理解不足。因此，提高对周围神经损伤后分子和分子间相互作用的理解仍然很重要。
目前越来越多研究表明circRNA在多种疾病中起着重要调控功能，但在周围神经损伤方面研究还有很多空白，本文研究者利用去核糖体建库RNA-seq技术对大鼠SNI模型进行高通量测序，鉴定出4942个circRNA分子，并发现circRNA.2837环状RNA分子存显著差异，在受损坐骨神经组织中下调。进一步研究该circRNA的功能和机制发现，circRNA.2837的下调通过诱导自噬减轻了坐骨神经损伤。此外，荧光素酶报告基因实验显示circRNA.2837可以与miR-34家族成员结合，包括miR-34a，miR-34b和miR-34c。circRNA.2837的沉默通过直接靶向miR-34a诱导神经元中的自噬。综合各项实验证据表明，circRNA.2837可发挥ceRNA（竞争性内源RNA）作用，通过吸附miR-34家族调节神经元自噬。该研究结果表明，差异表达的circRNA.2837参与了坐骨神经损伤的发病机制，环状RNA在SNI中发挥调节功能，可作为SNI治疗的潜在靶点。
图注：circRNA.2837调节神经元自噬作用保护坐骨神经损伤作用机制示意图
4、NanoString nCounter一种优秀的circRNA定量技术
论文标题：Enzyme-free digital counting of endogenous circular RNA molecules in B-cell malignancies.
杂志：Lab Invest 影响因子：4.254
通讯作者单位：丹麦奥胡斯大学
在前期高通量实验筛选多个差异circRNA后，进一步就是针对特定circRNA进行定量分析了，通常的PCR定量检测，看似分子生物学一项基础实验技术，但由于circRNA的特殊环形结构，且circRNA数量众多，可变剪切形式多样（可参看环状RNA的可变剪接研究又一新作），对circRNA的准确定量鉴定依然充满挑战，技术层面还有很多提升的空间。需要考虑的因素也相对较多，比如PCR前是否需要进行RNaseR消化，内参如何选择，引物设计技巧，如何识别circRNA“滚环扩增”等（可参看环状RNA定量PCR技术详解，环状RNA研究实验流程详解）。本文研究者就选用了基于NanoString nCounter 荧光条形码标记检测技术实现circRNA绝对定量分析，该技术一次可检测约800个circRNA的表达水平，通量上比定量PCR有明显优势，且定量效果和检测灵敏度也可以与定量PCR媲美，是一种不错的选择，该技术具体介绍可参看基于NanoString nCounter进行circRNA绝对定量。
文献列表：
| 序号 |
主要内容 |
论文标题 |
杂志 |
IF |
单位 |
| 1 |
circEPSTI1作为三阴性乳腺癌独立预后因素的研究 |
circEPSTI1 as a Prognostic Marker and Mediator of Triple-Negative Breast Cancer Progression. |
Theranostics |
8.537 |
中山大学肿瘤医院 |
| 2 |
综述：实体瘤中circRNA的功能及临床意义 |
Function and clinical significance of circRNAs in solid tumors |
J Hematol Oncol. |
7.33 |
苏州大学附属第三医院 |
| 3 |
综述：Circular RNAs作为疾病标志物的潜力 |
Circular RNAs: Promising Biomarkers for Human Diseases. |
EBioMedicine. |
6.183 |
上海大学生命科学学院 |
| 4 |
敲低circRNA.2837可通过调节神经元自噬作用保护坐骨神经损伤 |
Silencing of circRNA.2837 Plays a Protective Role in Sciatic Nerve Injury by Sponging the miR-34 Family via Regulating Neuronal Autophagy. |
Mol Ther Nucleic Acids |
5.66 |
第二军医大学长征医院 |
| 5 |
CircularRNA_104670通过作为ceRNA在椎间盘退变中起关键作用 |
CircularRNA_104670 plays a critical role in intervertebral disc degeneration by functioning as a ceRNA |
Exp Mol Med. |
5.584 |
复旦大学附属华山医院骨科 |
| 6 |
紫杉醇耐受非小细胞肺癌细胞中circRNA差异表达的分析及生物信息学分析 |
Profiles and Bioinformatics Analysis of Differentially Expressed Circrnas in Taxol-Resistant Non-Small Cell Lung Cancer Cells. |
Cell Physiol Biochem. |
5.5 |
苏州大学附属第一医院肿瘤科 |
| 7 |
缺血后处理小肠缺血/再灌注损伤小鼠环状RNA差异表达谱的微阵列分析 |
Microarray Analysis of Differentially Expressed Profiles of Circular RNAs in a Mouse Model of Intestinal Ischemia/Reperfusion Injury with and Without Ischemic Postconditioning |
Cell Physiol Biochem. |
5.5 |
大连医科大学第二医院 |
| 8 |
环状RNAs在肝细胞癌中的特征，功能和临床意义 |
Circular RNAs: Characteristics, Function and Clinical Significance in Hepatocellular Carcinoma |
Cancers (Basel). |
5.326 |
青岛大学医学院转化医学研究所 |
| 9 |
大鼠BodyMap转录组揭示了组织类型和发育阶段的独特环状RNA特征 |
Rat BodyMap transcriptomes reveal unique circular RNA features across tissue types and developmental stages. |
RNA |
4.49 |
东南大学 |
| 10 |
NanoString nCounter一种优秀的circRNA定量技术 |
Enzyme-free digital counting of endogenous circular RNA molecules in B-cell malignancies. |
Lab Invest |
4.254 |
奥胡斯大学 |
| 11 |
用于探索肝细胞癌潜在发病机制和治疗策略的circRNA-miRNA-mRNA网络鉴定 |
A circRNA-miRNA-mRNA network identification for exploring underlying pathogenesis and therapy strategy of hepatocellular carcinoma. |
J Transl Med |
4.197 |
广西医科大学第一附属医院病理科 |
| 12 |
circRNA-miRNA-mRNA的调节网络有助于胃癌的组织学分类和疾病进展 |
Regulatory network of circRNA-miRNA-mRNA contributes to the histological classification and disease progression in gastric cancer. |
J Transl Med. |
4.197 |
福建医科大学附属协和医院 |
| 13 |
消化系统癌症中的环状RNA：潜在的生物标志物和治疗靶点 |
Circular RNAs in digestive system cancer: potential biomarkers and therapeutic targets. |
Am J Cancer Res |
3.998 |
华中科技大学同济医学院 |
| 14 |
NFIX环状RNA通过Notch信号通路调节miR-34a-5p促进胶质瘤进展 |
NFIX Circular RNA Promotes Glioma Progression by Regulating miR-34a-5p via Notch Signaling Pathway |
Front Mol Neurosci. |
3.902 |
吉林大学第一医院肿瘤神经外科 |
| 15 |
在未感染和玉米伊朗花叶病毒感染的玉米中检测和分析环状RNA |
Detection and profiling of circular RNAs in uninfected and maize Iranian mosaic virus-infected maize |
Plant Sci. |
3.712 |
昆士兰大学 |
| 16 |
食管癌和乳腺癌中差异表达circRNA的概况 |
Profiles of differentially expressed circRNAs in esophageal and breast cancer |
Cancer Manag Res |
3.702 |
扬中市人民医院胸外科 |
| 17 |
非编码rna在骨原性肉瘤的发病机理、诊断和预后方面的新作用 |
Emerging roles of non-coding RNAs in the pathogenesis, diagnosis and prognosis of osteosarcoma. |
Invest New Drugs |
3.502 |
安徽医科大学附属第二医院 |
| 18 |
竞争性内源RNA分析揭示了circRNA_036186在HNSCC中的调控功能 |
Competing endogenous RNA analysis reveals the regulatory potency of circRNA_036186 in HNSCC |
Int J Oncol. |
3.33 |
中国医科大学附属第一医院 |
| 19 |
在C2C12成肌细胞分化期间表达环状RNA并基于开放阅读框和N6-甲基腺苷基序的数目预测编码潜力 |
Expression of circular RNAs during C2C12 myoblast differentiation and prediction of coding potential based on the number of open reading frames and N6-methyladenosine motifs. |
Cell Cycle |
3.304 |
中山大学附属第三医院 |
| 20 |
家蚕核多角体病毒感染后家蚕中肠的环状RNA改变 |
Circular RNA alterations in the Bombyx mori midgut following B. mori nucleopolyhedrovirus infection. |
Mol Immunol |
3.188 |
苏州大学生物与基础医学院 |
| 21 |
hsa_circ_001242在口腔鳞状细胞癌中表达下降的临床意义 |
Clinical Significance of the Decreased Expression of hsa_circ_001242 in Oral Squamous Cell Carcinoma |
Dis Markers. |
2.949 |
深圳北京大学 – 香港科技大学医学中心 |
| 22 |
在2型糖尿病患者中筛选环状RNA并验证与炎症相关的circANKRD36 |
Screening of circular RNAs and validation of circANKRD36 associated with inflammation in patients with type 2 diabetes mellitus. |
Int J Mol Med |
2.784 |
北京医院国家老年医学中心 |
| 23 |
蜜蜂幼虫真菌病原体Ascosphaera apis中环状RNA的系统研究 |
Systematic investigation of circular RNAs in Ascosphaera apis, a fungal pathogen of honeybee larvae. |
Gene |
2.498 |
中国农业科学院农业研究所 |
| 24 |
综述：环状RNA与神经疾病关系的研究进展 |
Progress in Understanding the Relationship Between Circular RNAs and Neurological Disorders. |
J Mol Neurosci |
2.454 |
吉林大学第一医院神经外科 |
