欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献22篇，下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。
- 源自EML4-ALK融合基因的环状RNA F-circEA-2a促进非小细胞肺癌细胞迁移和侵袭
论文标题Circular RNA F-circEA-2a derived from EML4-ALK fusion gene promotes cell migration and invasion in non-small cell lung cancer
杂志：Mol Cancer. 影响因子：7.776
通讯作者单位：四川大学华西医院
NSCLC非小细胞肺癌约占肺癌中85%，NSCLC往往确诊既是中晚期，5年生存率极低。NSCLC中通常存在原癌基因样的融合基因，如EML4-ALK融合基因占NSCLC比例约4%-5%，EML4-ALK融合蛋白可激活ALK相关原癌基因信号通路促进NSCLC发展，研究者前期发现EML4-ALK基因剪接体3b可产生一种融合的circRNA，F-circEA-4a可以促进肿瘤发生发展。该研究中发现EML4-ALK产生的另一种融合circRNA，F-circEA-2a拼接位点处包含“AA”motif（F-circEA-4a是“AAAA”），F-circEA-2a主要定位在细胞质促进肺癌细胞转移和侵袭，对细胞增殖影响不大。F-circEA-2a主要在NSCLC患者组织中，而不存在患者血液中，也突出了F-circEA-4a在体液筛查中作为标志物的潜力。
目前融合基因产生的融合circRNA文章并不多，相信不久将来会发现更多有意思的融合circRNA分子。Cell杂志报道的融合circRNA文献解读可参看本公众号历史文章：cell杂志：融合环状RNA文献解读
图注：F-circEA-2a在NSCLC中的鉴定，a：F-circEA-2a起源于EML4-ALK基因的事宜图；b：RT-PCR和sanger测序验证F-circEA-2a的拼接位点；c：斑点印迹和qPCR实验鉴定F-circEA-2a和4a在H2228细胞中的表达情况；d：qPCR实验分析F-circEA-2a/4a在H2228细胞质和细胞核中的表达比例。
2、环状RNA hsa_circ_0008305（circPTK2）通过控制非小细胞肺癌中的TIF1γ抑制TGF-β诱导的上皮-间质转化和转移
论文题目：Circular RNA hsa_circ_0008305 (circPTK2) inhibits TGF-β-induced epithelial-mesenchymal transition and metastasis by controlling TIF1γ in non-small cell lung cancer.
杂志：Mol Cancer 影响因子：7.776
通讯作者单位：苏州大学医学院
在非小细胞肺癌（NSCLC）中，TGF-β通过诱导上皮-间质转化（EMT）来促进肿瘤侵袭和转移。现有研究表明环状RNA（circRNA）是涉及人类癌症的非常重要的一类RNA分子。然而，circRNA是否以及如何促成TGF-β诱导的EMT和NSCLC转移仍然模糊不清。该研究发现hsa_circ_0008305（circPTK2）在TGF-β诱导的EMT和肿瘤转移中，circPTK2和转录中间因子1γ（TIF1γ）之间互作发挥调控作用。研究结果表明：CircPTK2和TIF1γ在经TGF-β诱导的EMT的NSCLC细胞中显着下调。CircPTK2过表达则可增加TIF1γ表达，抑制TGF-β诱导的EMT和NSCLC细胞侵袭能力，而circPTK2敲低则具有相反的作用。CircPTK2可海绵样吸附miR-429 / miR-200b-3p，而miR-429 / miR-200b-3p则可通过靶向TIF1γ促进TGF-β诱导的EMT和NSCLC细胞侵袭。CircPTK2过表达显着降低了Snail的表达，Snail是TGF-β/ Smad信号传导的重要下游转录激活因子。在体内转移模型实验中，circPTK2过表达可抑制NSCLC细胞转移。此外，人NSCLC组织中circPTK2表达显著下调与TIF1γ表达正相关。特别是，转移性NSCLC组织中circPTK2显著性低于非转移组织。研究结果表明，circPTK2（hsa_circ_0008305）通过控制NSCLC中的TIF1γ来抑制TGF-β诱导的EMT和转移，揭示了circRNA调节TGF-β诱导的EMT和肿瘤转移的新机制，并提示circPTK2过表达可为恶性NSCLC治疗提供线索。
图注：在TGF-β诱导的NSCLC细胞EMT过程中TIF1γ 和circPTK2表达下调。a：TGF-β1（5ng / ml）处理24小时后，A549细胞发生上皮-间质转化（EMT）。观察细胞形态并用相差显微镜（上图）拍照，比例尺，50μm。通过蛋白质印迹检查EMT相关蛋白的表达，包括E-钙粘蛋白E-cadherin，N-钙粘蛋白N-cadherin和波形蛋白Vimentin（左下）和TIF1γ蛋白（右下）。b：circRNA芯片检测TGF-β1处理0小时或24小时的两组A549细胞检测绘制circRNA表达层次聚类热图，circPTK2（hsa_circRNA_104703）的表达用箭头表示。cdef:RT-PCR，sanger测序，northblot和免疫荧光实验鉴定circPTK2（hsa_circRNA_104703）特异性存在，并主要分布在细胞质中。
3、CircRNA微阵列分析鉴定用于检测胃癌的新型循环生物标志物
论文题目：CircRNA microarray profiling identifies a novel circulating biomarker for detection of gastric cancer
杂志：Mol Cancer. 影响因子：7.776
通讯作者单位：南京医科大学南京第一医院
该研究前期通过circRNA高通量筛选胃癌患者血浆中circRNA差异分子，并鉴定到circ-KIAA124在胃癌中低表达，结合临床资料分析发现circ-KIAA1244与TNM分期、淋巴转移和患者总体存活时间长成负相关，同时在血浆外泌体中也检测到circ-KIAA1244，提示该分子可作为胃癌分子诊断的新型标志物。通过circBank数据库的进一步预测分析发现circ-KIAA1244互作的circRNA-miRNA-mRNA分子网络。为后续深入研究circ-KIAA1244分子机制研究提供了线索。该文献具体解读文章见本公众号历史文章：circBank助力胃癌研究发表于Molecular Cancer。
图注：circ-KIAA1244作为胃癌诊断标志物的理论模型示意图
文献列表：
| 序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
| 1 | 源自EML4-ALK融合基因的环状RNA F-circEA-2a促进非小细胞肺癌细胞迁移和侵袭 | Circular RNA F-circEA-2a derived from EML4-ALK fusion gene promotes cell migration and invasion in non-small cell lung cancer | Mol Cancer. | 7.776 | 四川大学华西医院 |
| 2 | CircRNA微阵列分析鉴定用于检测胃癌的新型循环生物标志物。 | CircRNA microarray profiling identifies a novel circulating biomarker for detection of gastric cancer | Mol Cancer. | 7.776 | 南京医科大学南京第一医院 |
| 3 | 环状RNA hsa_circ_0008305（circPTK2）通过控制非小细胞肺癌中的TIF1γ抑制TGF-β诱导的上皮 – 间质转化和转移 | Circular RNA hsa_circ_0008305 (circPTK2) inhibits TGF-β-induced epithelial-mesenchymal transition and metastasis by controlling TIF1γ in non-small cell lung cancer. | Mol Cancer. | 7.776 | 苏州大学医学院 |
| 4 | hsa_circ_0061140敲低通过miR-370海绵吸附作用逆转FOXM1介导的卵巢癌细胞生长和转移 | hsa_circ_0061140 Knockdown Reverses FOXM1-Mediated Cell Growth and Metastasis in Ovarian Cancer through miR-370 Sponge Activity | Mol Ther Nucleic Acids. | 5.66 | 上海同济医院 |
| 5 | 系统性红斑狼疮hsa_circ_0012919（吸附miR-125a-3p）下调有助于CD4 + T细胞中CD11a和CD70的DNA甲基化 | Clin Sci (Lond). | 5.22 | 上海第一人民医院 | |
| 6 | 人卵巢来源的环状RNA的鉴定和表征及其在卵巢衰老中的潜在作用 | Identification and characterization of human ovary-derived circular RNAs and their potential roles in ovarian aging | Aging (Albany NY). | 5.179 | 华中科技大学同济医学院 |
| 7 | 创伤性脑损伤后小鼠脑皮质中的环状RNA表达谱 | Circular RNA expression profile in mouse cortex after traumatic brain injury | J Neurotrauma. | 5.002 | 暂无 |
| 8 | 恒河猴猕猴脑内circRNA表达的注释和功能聚类 | Annotation and functional clustering of circRNA expression in rhesus macaque brain during aging | Cell Discov. | 4.462 | 中国科学院昆明动物研究所 |
| 9 | 一种新型循环hsa_circ_0081001作为骨肉瘤诊断和预后的潜在生物标志物 | A novel circulating hsa_circ_0081001 act as a potential biomarker for diagnosis and prognosis of osteosarcoma | Int J Biol Sci. | 4.057 | 上海同济大学医学院 |
| 10 | Circ0043898抑制食管癌的作用研究 | Circ0043898 acts as a tumor inhibitor and performs regulatory effect on the inhibition of esophageal carcinoma. | Cancer Biol Ther. | 3.737 | 广州医科大学附属第二医院 |
| 11 | 一种从RNA-seq数据中检测环状RNA的灵敏算法 | An Efficient Algorithm for Sensitively Detecting Circular RNA from RNA-seq Data | Int J Mol Sci. | 3.687 | 西安交通大学 |
| 12 | 系统性红斑狼疮差异表达环状RNA及其临床意义 | Differentially expressed circular RNAs in systemic lupus erythematosus and their clinical significance. | Biomed Pharmacother. | 3.457 | 安徽医科大学附属阜阳医院 |
| 13 | 环状RNA hsa_circ_0052112通过作为乳腺癌中miR-125a-5p的海绵起促进细胞迁移和侵袭 | Circular RNA hsa_circ_0052112 promotes cell migration and invasion by acting as sponge for miR-125a-5p in breast cancer | Biomed Pharmacother. | 3.457 | 东南大学中大医院 |
| 14 | circRNA_101368 / miR-200a轴通过HMGB1 / RAGE信号通路调节肝细胞癌的迁移 | Circular RNA 101368/miR-200a axis modulates the migration of hepatocellular carcinoma through HMGB1/RAGE signaling. | Cell Cycle | 3.304 | 中南大学湘雅医院 |
| 15 | EIciRNA介导的基因表达：可调性和双峰性 | EIciRNA-mediated gene expression: tunability and bimodality | FEBS Lett. | 2.999 | 中山大学数学与计算科学学院 |
| 16 | 成年大鼠脑室下区circRNA表达鉴定及功能研究 | Identification, characterization, and functional investigation of circular RNAs in subventricular zone of adult rat brain | J Cell Biochem. | 2.959 | 军事医学科学院 |
| 17 | 全转录组测序揭示了高糖诱导的心肌细胞肥大中显著RNA分子标记和相关的调节生物学途径 | Whole transcriptome sequencing reveals biologically significant RNA markers and related regulating biological pathways in cardiomyocyte hypertrophy induced by high glucose. | J Cell Biochem. | 2.959 | 上海同仁医院 |
| 18 | CircScd1通过Janus激酶2 /信号转导和转录激活因子5途径促进脂肪肝 | CircScd1 Promotes Fatty Liver Disease via the Janus Kinase 2/Signal Transducer and Activator of Transcription 5 Pathway | Dig Dis Sci. | 2.819 | 宁波市第一医院 |
| 19 | Hsa_circRNA_103809通过 miR-532-3p / FOXO4信号轴调控结肠癌细胞增殖和迁移 | Hsa_circRNA_103809 regulated the cell proliferation and migration in colorectal cancer via miR-532-3p / FOXO4 axis | Biochem Biophys Res Commun. | 2.559 | 南通大学附属医院 |
| 20 | 环状RNA circ-ITCH通过靶向miR-145 / RASA1信号传导抑制卵巢癌进展 | The circular RNA circ-ITCH suppresses ovarian carcinoma progression through targeting miR-145/RASA1 signaling. | Biochem Biophys Res Commun. | 2.559 | 苏州大学附属第一医院 |
| 21 | Circ-SATB2通过miR-939上调STIM1表达并调节血管平滑肌细胞增殖和分化 | Circ-SATB2 upregulates STIM1 expression and regulates vascular smooth muscle cell proliferation and differentiation through miR-939 | Biochem Biophys Res Commun. | 2.559 | 西安交通大学第二附属医院 |
| 22 | CircBA9.3通过上调c-ABL1或BCR-ABL1蛋白水平来支持白血病细胞的存活 | CircBA9.3 supports the survival of leukaemic cells by up-regulating c-ABL1 or BCR-ABL1 protein levels | Blood Cells Mol Dis | 1.836 | 深圳市第二人民医院 |