欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献23篇,下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。
1、长链非编码RNA:LINC-PINT来源的circRNA编码多肽抑制胶质母细胞瘤中的癌基因转录延伸
论文标题:A peptide encoded by circular form of LINC-PINT suppresses oncogenic transcriptional elongation in glioblastoma
杂志:Nat Commun. 影响因子:12.353
通讯作者单位:中山大学附属第一医院
环状RNA种类功能都具有多样性,关于环状RNA直接翻译蛋白或多肽调控细胞功能已有多篇报道(详细见往期文章)。本研究前期通过高通量转录组和翻译组测序分析发现长非编码RNA LINC-PINT的2号外显子可单独形成Circ-PINT的环状RNA,Circ-PINT包含一个完整的开放阅读框,可能编码多肽,进一步通过制备针对该多肽的特异性抗体并结合CRISPR/cas9基因敲除细胞株等实验,证实Circ-PINT可通过核糖体进入位点序列IRES翻译出87个氨基酸组成的全新多肽PINT87aa通过结合聚合酶相关因子复合物基因PAF1,抑制多种癌基因的转录延伸,进而抑制恶性胶质瘤的发生和进展,细胞功能实验表明PINT87aa通过结合聚合酶相关因子复合物基因PAF1,抑制多种癌基因的转录延伸,进而抑制恶性胶质瘤的发生和进展,体内动物实验,在小鼠脑部原位以及皮下成瘤实验中过表达PINT87aa蛋白的肿瘤细胞,成瘤能力大大减弱,动物生存期延长,而基因敲除低成瘤细胞中circ-PINT的编码区的部分序列后,动物的成瘤能力得到增强,证实环状RNA circ-PINT翻译的多肽具有抑制肿瘤的作用。该研究结果提示环状RNA编码的多肽产物可能在恶性肿瘤诊断、预后及靶向治疗方面具有重要的研究意义,该文详细解读见本公众号往期文章Nature Communications:长非编码RNA形成环状RNA翻译功能性多肽。
图注:证实Circ-PINT翻译全新多肽PINT87aa的系列实验
2、环状RNA-circAGO2通过HuR阻止AGO2-miRNA复合物形成维持靶基因稳定性促进肿瘤进展
论文标题:Circular RNA circAGO2 drives cancer progression through facilitating HuR-repressed functions of AGO2-miRNA complexes
杂志:Cell Death Differ. 影响因子:8
通讯作者单位:华中科技大学同济医学院
Argonaute 2(AGO2)是microRNA(miRNA)诱导的沉默复合物的核心成分,在肿瘤发生和侵袭性中起着重要作用。然而,调节AGO2在癌症中功能的机制仍然难以捉摸。在该研究中,研究者鉴定了由AGO2基因产生的一个内含子来源的环状RNA(circAGO2)在AGO2-miRNA复合物和癌症进展中起新型调控功能。CircAGO2在胃癌,结肠癌,前列腺癌和神经母细胞瘤中上调,并且与患者预后不良有关。CircAGO2在体外和体内实验中可促进癌细胞的生长,侵袭和转移。机理研究表明,circAGO2与人类抗原R(HuR)蛋白直接相互作用,circAGO2促进HuR在靶基因3’UTR区的活化和富集,从而减少AGO2结合miRNA和抑制AGO2/miRNA介导的基因沉默。在胃癌细胞中稳定干扰circAGO2后可抑制肿瘤细胞增殖和侵袭能力,皮下成瘤实验也表明干扰circAGO2后AGS细胞成瘤减弱,尾静脉注射sh-circAGO2细胞后肿瘤迁移能力下降。进一步基于HuR与circAGO2相互作用的分子模拟,设计了可阻断该相互作用的小肽HIP-13,实验表明该多肽能有效竞争性结合内源circAGO2,阻碍其与HuR的结合并抑制肿瘤迁移作用。这些实验结果表明circAGO2通过直接结合HuR抑制AGO2-miRNA复合物形成进而驱动癌症进展,为circRNA功能机制研究提供了新视角。该文详细解读见本公众号往期文章:Cell Death & Differentiation连发两篇circRNA研究论文。
图注:体内外实验证实circAGO2可促进胃癌细胞增殖和迁移
3、人造circRNA海绵样吸附miR-21抑制胃癌细胞增殖
论文标题:Synthetic Circular RNA Functions as a miR-21 Sponge to Suppress Gastric Carcinoma Cell Proliferation
杂志:Mol Ther Nucleic Acids. 影响因子:5.66
通讯作者单位:西安交通大学第一附属医院
含有miRNA结合位点的miR海绵样序列被认为是潜在的强有力的分子治疗策略。天然形成的环状RNA(circRNA)在癌细胞中显示出了有效的miR海绵起作用。因此该研究推测人造的circRNA样海绵可以实现针对特定miR缺失的治疗性功能。首先将含有miR-21结合位点的线性RNA分子在体外转录;经去磷酸化和磷酸化后,使用T4 RNA连接酶1将线性序列5′-3’末端连接实现环化。随后研究者使用RNase R和胎牛血清评估circRNA稳定性;使用荧光素酶报告基因,细胞增殖和细胞凋亡实验在三种胃癌细胞系中评估合成的circRNA海绵对miR-21活性的竞争性抑制能力;还通过Tandem Mass Tag(TMT)标记技术筛查了miR-21下游蛋白质的circRNA海绵效应,进一步通过Western blot实验验证。该研究结论表明,可以使用简单的酶促连接步骤合成对RNase R耐受的人工circRNA海绵。circRNA海绵可抑制癌细胞增殖并抑制miR-21对下游蛋白质靶标(包括癌症蛋白质DAXX)的活性。人造的circRNA海绵代表了一种简单,有效,方便的策略,用于在体外实现特定靶向miR缺失功能,在人类疾病治疗中具有潜在应用价值。
图注:体外人造circRNA sponges流程图
每个结合位点序列与miR-21种子区域完全互补配对,间隔的9-12位序列含有凸起以防止RNAi切割和降解。一个PCR循环促进合成以产生双链DNA PCR片段,然后将其克隆到TOPO PCR克隆载体中。T7 RNA聚合酶结合到位于PCR插入物5’的T7 RNA聚合酶结合位点处,产生大量上述miR海绵序列的线性RNA。小牛肠磷酸酶使RNA转录物的5’末端去磷酸化, T4多核苷酸激酶(在ATP存在下)产生适于连接的RNA分子。最后T4 RNA连接酶孵育将线性RNA环化,得到人造circRNA sponges。
文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 长链非编码RNA-LINC-PINT来源的circRNA编码多肽抑制胶质母细胞瘤中的癌基因转录延伸 | A peptide encoded by circular form of LINC-PINT suppresses oncogenic transcriptional elongation in glioblastoma | Nat Commun. | 12.353 | 中山大学附属第一医院 |
2 | 环状RNA-circAGO2通过HuR阻止AGO2-miRNA复合物形成维持靶基因稳定性促进肿瘤进展 | Circular RNA circAGO2 drives cancer progression through facilitating HuR-repressed functions of AGO2-miRNA complexes | Cell Death Differ. | 8 | 华中科技大学同济医学院 |
3 | 环状RNA-ACR通过调节Pink1/FAM65B途径抑制自噬进而减轻心肌缺血/再灌注损伤 | The circular RNA ACR attenuates myocardial ischemia/reperfusion injury by suppressing autophagy via modulation of the Pink1/ FAM65B pathway | Cell Death Differ. | 8 | 青岛大学医学院 |
4 | RNA多聚酶II转录的增强型TuD发夹状miRNA吸附分子与ciRS7吸附活性比较 | Enhanced Tailored MicroRNA Sponge Activity of RNA Pol II-Transcribed TuD Hairpins Relative to Ectopically Expressed ciRS7-Derived circRNAs | Mol Ther Nucleic Acids. | 5.66 | 丹麦奥胡斯大学 |
5 | 合成环状RNA作为miR-21海绵抑制胃癌细胞增殖 | Synthetic Circular RNA Functions as a miR-21 Sponge to Suppress Gastric Carcinoma Cell Proliferation | Mol Ther Nucleic Acids. | 5.66 | 西安交通大学第一附属医院 |
6 | 环状RNA-circGprc5a翻译多肽促进膀胱癌进展 | Circgprc5a promoted bladder oncogenesis and metastasis through Gprc5a-targeting peptide | Mol Ther Nucleic Acids. | 5.66 | 郑州大学第一附属医院 |
7 | circRNA_104075通过调节HNF4a刺激YAP依赖性肿瘤发生,可作为肝细胞癌的诊断标志物 | circRNA_104075 stimulates YAP-dependent tumorigenesis through the regulation of HNF4a and may serve as a diagnostic marker in hepatocellular carcinoma | Cell Death Differ. | 5.638 | 上海同济大学第十人民医院 |
8 | Nrf2敲除小鼠的黑质和纹状体中差异表达的环状RNA分析 | The Differentially Expressed Circular RNAs in the Substantia Nigra and Corpus Striatum of Nrf2-Knockout Mice | Cell Physiol Biochem. | 5.5 | 河北医科大学 |
9 | 环状RNA在口腔鳞状细胞癌中的表达 | Circular RNA Expression in Oral Squamous Cell Carcinoma | Front Oncol. | 4.416 | 北京大学深圳医院 |
10 | 在转移性口腔粘膜黑色素瘤中环状RNA的表达模式变化 | Altered expression pattern of circular RNAs in metastatic oral mucosal melanoma | Am J Cancer Res | 3.998 | 上海市第九人民医院 |
11 | 综述:环状RNA在心血管疾病中进展 | Circular RNA in cardiovascular disease | J Cell Physiol. | 3.923 | 加拿大西部大学 |
12 | Circ-U2AF1通过海绵样吸附hsa-miR-7-5p去抑制神经肿瘤学腹侧抗原2促进人脑胶质瘤 | Circ-U2AF1 promotes human glioma via derepressing neuro-oncological ventral antigen 2 by sponging hsa-miR-7-5p | J Cell Physiol. | 3.923 | 南方医科大学珠江医院 |
13 | Circ_0058063通过海绵吸附miR-145-5p调节CDK6以促进膀胱癌进展 | Circ_0058063 regulates CDK6 to promote bladder cancer progression by sponging miR-145-5p | J Cell Physiol. | 3.923 | 中国医科大学附属盛京医院 |
14 | 过表达circ_0067934作为癌基因通过miR-545/EIF3C轴促进宫颈癌进展 | Overexpressed circ_0067934 acts as an oncogene to facilitate cervical cancer progression via the miR-545/EIF3C axis | J Cell Physiol. | 3.923 | 哈尔滨医科大学附属第四医院 |
15 | 竞争性内源性环状RNA ADAMTS14通过调节钙调神经蛋白1的microRNA-572 /调节因子抑制肝细胞癌的进展 | The competing endogenous circular RNA ADAMTS14 suppressed hepatocellular carcinoma progression through regulating microRNA-572/regulator of calcineurin 1. | J Cell Physiol. | 3.923 | 南京市六合区中医院 |
16 | 综述:环状RNA作为治疗试剂和靶标 | Circular RNAs as Therapeutic Agents and Targets | Front Physiol. | 3.394 | 慕尼黑大学 |
17 | 用于鉴定结肠直肠癌中共表达RNA网络和特征的差异表达环状RNA的分析 | Analysis of differentially expressed circular RNAs for the identification of a coexpression RNA network and signature in colorectal cancer | J Cell Biochem. | 2.959 | 新乡医科大学 |
18 | Hsa_circ_0008309是口腔鳞状细胞癌的潜在生物标志物 | Hsa_circ_0008309 May Be a Potential Biomarker for Oral Squamous Cell Carcinoma | Dis Markers | 2.949 | 北京大学深圳医院 |
19 | CircRNA相关的ceRNA网络揭示了下咽癌中的ErbB和Hippo信号通路 | CircRNA-associated ceRNA network reveals ErbB and Hippo signaling pathways in hypopharyngeal cancer | Int J Mol Med. | 2.784 | 昆明医科大学附属第一医院 |
20 | Circ-DLG1促进食管鳞状细胞癌的增殖 | Circ-DLG1 promotes the proliferation of esophageal squamous cell carcinoma | Onco Targets Ther. | 2.656 | 南京医科大学 |
21 | CircRNA has_circ_0078710吸附microRNA-31参与肝细胞癌进展 | CircRNA has_circ_0078710 acts as the sponge of microRNA-31 involved in hepatocellular carcinoma progression | Gene | 2.498 | 中山大学附属第一医院 |
22 | 高通量测序揭示人类增生性瘢痕中差异表达的lncRNA和circRNA及其相关的功能网络 | High‑throughput sequencing reveals differentially expressed lncRNAs and circRNAs, and their associated functional network, in human hypertrophic scars | Mol Med Rep. | 1.922 | 南昌市妇幼保健院 |
23 | 产气荚膜梭菌C型诱导仔猪坏死性肠炎模型中脾脏环状RNA表达谱 | Circular RNA expression profile of spleen in a Clostridium perfringens type C-induced piglet model of necrotizing enteritis | FEBS Open Bio. | 1.782 | 兰州生产工程技术研究中心 |