欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献28篇，下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。
- 来自胃癌外泌体的circRNA通过靶向miR-133/PRDM16途径促进白色脂肪褐变
文献标题：Exosomal circRNA derived from gastric tumor promotes white adipose browning by targeting the miR-133/PRDM16 pathway
期刊：Int J Cancer. 影响因子：7.36
通讯作者单位：天津医科大学肿瘤医院
癌症相关的恶病质是一种代谢综合征，其特征在于脂肪和骨骼肌的消耗紊乱，并伴有体重减轻和全身性炎症。癌症恶病质的治疗选择是有限的，并且分子机制仍然知之甚少。环状RNA（circRNA）是一种新的内源性RNA家族，已被发现广泛参与调节哺乳动物的基因表达。外泌体是源自细胞的小囊泡，并且最近的研究表明circRNA在外泌体中稳定存在。然而，关于circRNA在外泌体中的生物学作用知之甚少。在这项研究中，我们发现在胃癌（GC）血浆外泌体中的circRNAs具有特异性表达特征，并且ciRS-133与GC患者中白色脂肪组织（WAT）的褐变相关。源自GC细胞的外泌体将ciRS-133递送到前脂肪细胞中，通过激活PRDM16和抑制miR-133促进前脂肪细胞分化成棕色样细胞。此外，ciRS-133的敲低减少了肿瘤移植小鼠的癌症恶病质，减少了氧气消耗和产热。因此，外泌体递送的circRNA参与WAT褐变并在癌症相关的恶病质中起关键作用。
图注：A:电镜检测分离自人血浆外泌体；B：NTA纳米颗粒示踪仪分析外泌体粒径；C：Western blot分析外泌体表面标志物；D:circRNA芯片初步筛查胃癌血浆来源外泌体中的circRNAs；E:RT-qPCR验证ciRS-133在胃癌血浆中显著高表达。
图注：F：相对于癌旁组织，ciRS-133在胃癌组织中显著高表达；G：生信预测发现ciRS-133上存在2个miR-133结合位点；H:ciRS-133与褐色脂肪组织（BAT）质量正相关；I：ciRS-133与个体脂肪比率负相关。
2 一种新的环状RNA circFAT1(e2)通过靶向细胞质中的miR-548g并与细胞核中的YBX1相互作用来抑制胃癌的进展
文献标题：A novel circular RNA, circFAT1(e2), inhibits gastric cancer progression by targeting miR-548g in the cytoplasm and interacting with YBX1 in the nucleus
期刊：Cancer Lett. 影响因子：6.494
通讯作者单位：苏州大学第一附属医院
在本研究中，研究者通过分析挖掘GEO数据库中胃癌(GC)组织环状RNA (circRNA)表达谱。发现一个新的circRNA, has_circ_0001461，我们称之为circFAT1(e2)并进一步证实circFAT1(e2)在胃癌组织和细胞系中显著下调，并与胃癌患者的总体生存率相关。荧光原位杂交(FISH)分析显示circFAT1(e2)分布在GC细胞的细胞质中，也可分布在细胞核中。功能实验表明，circFAT1(e2)的过表达抑制了GC细胞的增殖、迁移和侵袭。然后，我们研究circFAT1(e2)是否作为microRNA-549g(miR-548g)的海绵并调控肿瘤抑制因子RUNX1在GC细胞中的表达。此外，我们发现位于核的circFAT1(e2)可以直接与Y-box结合蛋白-1 (YBX1)相互作用并抑制其功能。综上所述，circFAT1(e2)可能通过调节细胞质中的miR-548g/RUNX1轴，靶向细胞核中的YBX1，在GC细胞中发挥抑癌作用。
图注：A：通过生物信息学技术挖掘GEO中胃癌中差异表达的circRNA表达谱并绘制聚类热图；B：两个GEO数据集中存在两个重叠的circRNA（GSE100170和 GSE83521）；C: circFAT1(e2)基因组定位示意图；
图注：D:RT-PCR在gDNA和cDNA中验证circFAT1(e2)的表达；E:sanger测序验证circFAT1(e2)的反向拼接位点序列；F：RT-PCR检测circFAT1(e2)和linFAT1在放线菌D处理MGC803细胞中的表达情况；G：RT-PCR检测circFAT1(e2)和linFAT1在RNase R处理MGC803细胞中的表达情况；
- 环状RNA表达谱鉴定前列腺癌特异性环状RNA
文献标题：Circular RNA Expression Profiling Identifies Prostate Cancer- Specific circRNAs in Prostate Cancer
期刊：Cell Physiol Biochem. 影响因子：5.5
通讯作者单位：上海复旦大学
前列腺癌(PCa)是严重损害男性健康的主要癌症之一，发病率和死亡率均较高，但目前对于前列腺癌的诊断和预后尚无理想的分子标志物。该研究采用ceRNA芯片在4对前列腺癌及癌旁组织中筛选差异表达环状RNA，以确定其是否可作为前列腺癌诊断的新生物标志物。利用Cytoscape软件构建了circRNA-miRNA-mRNA的差异环状RNA及其宿主基因调控网络。通过qRT-PCR技术验证微阵列数据。结果表明我们在PCa肿瘤中发现了1021个差异表达的环状RNA，并通过qRT-PCR分析证实了circ_0057558、circ_0062019和SLC19A1在PCa细胞系和肿瘤组织中的表达。我们发现，PSA水平与两种差异表达的环状RNA联合使用后，诊断性能AUC灵敏度和特异性(分别为0.938、84.5%和90.9%)均明显高于单独使用PSA(血清PSA的AUC为0.854)。此外，circ_0057558与总胆固醇呈正相关。circRNA-miRNA-mRNA分析的功能网络显示circ_0057558和circ_0034467调控了miR-6884, circ_0062019和circ_0060325调控了miR-5008。研究结果表明，circ_0062019和circ_0057558两个差异表达环状RNA和circ_0062019的宿主基因SLC19A1可作为前列腺癌潜在的新型生物标志物。
图注： circRNA芯片的散点图和聚类热图展示了circRNA和mRNA在前列腺癌组织和正常组织中的差异表达情况
图注：前列腺癌中差异表达circRNA的宿主基因gene ontology富集分析结果（前30个term）
表2:生物信息学预测4个差异表达的circRNA可能结合的miRNAs
图注：三个circRNA分子（circ_0057558, circ_0062019, circ_0075538）和SLC19A1在前列腺癌和癌旁组织中的差异表达情况（采用qRT-PCR技术检测）
参考文献列表
| 序号 |
主要内容 |
文献标题 |
期刊 |
IF |
单位 |
| 1 |
源自胃肿瘤的外泌体circRNA通过靶向miR-133/PRDM16途径促进白色脂肪褐变 |
Exosomal circRNA derived from gastric tumor promotes white adipose browning by targeting the miR-133/PRDM16 pathway |
Int J Cancer. |
7.36 |
天津医科大学肿瘤医院 |
| 2 |
一种新的环状RNA circFAT1(e2)通过靶向细胞质中的miR-548g并与细胞核中的YBX1相互作用来抑制胃癌的进展 |
A novel circular RNA, circFAT1(e2), inhibits gastric cancer progression by targeting miR-548g in the cytoplasm and interacting with YBX1 in the nucleus |
Cancer Lett. |
6.494 |
苏州大学第一附属医院 |
| 3 |
环状RNA表达谱鉴定前列腺癌特异性环状RNA |
Circular RNA Expression Profiling Identifies Prostate Cancer- Specific circRNAs in Prostate Cancer |
Cell Physiol Biochem. |
5.5 |
上海复旦大学 |
| 4 |
ER阳性亚型乳腺癌关键差异表达环状rna的鉴定与综合分析 |
Identification and integrated analysis of key differentially expressed circular RNAs in ER-positive subtype breast cancer |
Epigenomics. |
4.979 |
上海仁济医院 |
| 5 |
RPAD（RNase R处理，聚腺苷酸化和poly（A）+RNA去除）方法分离高纯环状RNA |
RPAD (RNase R treatment, polyadenylation, and poly(A)+ RNA depletion) method to isolate highly pure circular RNA |
Methods. |
3.998 |
美国国立卫生研究院 |
| 6 |
环状RNA在机械力处理人牙周韧带干细胞(PDLSCs)过程的表达特征 |
Identification and characterization of circular RNAs involved in mechanical force-induced periodontal ligament stem cells |
J Cell Physiol. |
3.923 |
山东大学口腔医学院 |
| 7 |
CircRNA circPDSS1通过海绵状吸附miR-186-5p和调节NEK2促进胃癌进展 |
CircRNA circPDSS1 promotes the gastric cancer progression by sponging miR-186-5p and modulating NEK2 |
J Cell Physiol. |
3.923 |
云南省第一人民医院 |
| 8 |
Hsa_circ_0136666通过miR-136/SH2B1轴促进结直肠癌的增殖和侵袭 |
Hsa_circ_0136666 promotes the proliferation and invasion of colorectal cancer through miR-136/SH2B1 axis |
J Cell Physiol. |
3.923 |
河南科技大学附属第一医院 |
| 9 |
早期妊娠小鼠着床部位和着床间部位环状rna表达模式的改变 |
Altered expression patterns of circular RNAs between implantation sites and interimplantation sites in early pregnant mice |
J Cell Physiol. |
3.923 |
重庆医科大学 |
| 10 |
肌肉功能和疾病中的环状RNA研究进展Circular RNAs in Muscle Function and Disease. |
|
Int J Mol Sci. |
3.687 |
圣多纳托米拉内塞 |
| 11 |
PWCDA:预测环状rna -疾病关联的路径加权方法 |
PWCDA: Path Weighted Method for Predicting circRNA-Disease Associations |
Int J Mol Sci. |
3.687 |
陕西师范大学 |
| 12 |
circRNA circ_0001721上调可预测骨肉瘤的不良预后，并通过海绵样吸附miR-569和miR-599促进细胞恶化进展 |
Upregulation of circular RNA circ_0001721 predicts unfavorable prognosis in osteosarcoma and facilitates cell progression via sponging miR-569 and miR-599 |
Biomed Pharmacother. |
3.457 |
牡丹江医学院 |
| 13 |
肝组织中环状rna在肝纤维化模型中的差异表达及其靶基因功能分析 |
Differential expression of circular RNAs in hepatic tissue in a model of liver fibrosis and functional analysis of theirtarget genes |
Hepatol Res. |
3.415 |
宁波大学医学院 |
| 14 |
环状RNA在肺癌中的研究进展 |
Research progress of circular RNAs in lung cancer |
Cancer Biol Ther. |
3.373 |
中国医科大学附属第一医院 |
| 15 |
人乳头瘤病毒16e7癌蛋白改变了Caski细胞中环状rna的表达谱 |
Human papillomavirus 16 E7 oncoprotein alters the expression profiles of circular RNAs in Caski cells |
J Cancer. |
3.249 |
南方医科大学基础医学院 |
| 16 |
Circ_0027599/PHDLA1通过吸附miR-101-3p.1抑制胃癌进展 |
Circ_0027599/PHDLA1 suppresses gastric cancer progression by sponging miR-101-3p.1 |
Cell Biosci. |
3.219 |
上海市第六人民医院 |
| 17 |
猪皮下脂肪形成过程中mrna、lncrna和环状rna的全基因组表达谱研究 |
A genome-wide landscape of mRNAs, lncRNAs, and circRNAs during subcutaneous adipogenesis in pigs |
J Anim Sci Biotechnol. |
3.205 |
南京农业大学 |
| 18 |
WebCircRNA:对编码和非编码RNA的环状RNA潜力进行分类数据库 |
WebCircRNA: Classifying the Circular RNA Potential of Coding and Noncoding RNA |
Genes (Basel). |
3.191 |
哥本哈根大学 |
| 19 |
CircABCB10通过调节miR-1252/FOXR2轴促进非小细胞肺癌细胞增殖和迁移 |
CircABCB10 promotes nonsmall cell lung cancer cell proliferation and migration by regulating the miR-1252/FOXR2 axis |
J Cell Biochem. |
2.959 |
上海同济大学第十人民医院 |
| 20 |
上调环状RNA circ_0007534提示胰腺导管腺癌预后不良，可通过海绵样吸附miR-625和miR-892b调节细胞增殖、凋亡和侵袭 |
Upregulated circular RNA circ_0007534 indicates an unfavorable prognosis in pancreatic ductal adenocarcinoma and regulates cell proliferation, apoptosis, and invasion by sponging miR-625 and miR-892b |
J Cell Biochem. |
2.959 |
齐齐哈尔医科大学附属第三医院 |
| 21 |
CircPAN3通过miR-153-5p/miR-183-5p-XIAP轴介导急性髓系白血病的耐药性 |
CircPAN3 mediates drug resistance in acute myeloid leukemia through the miR-153-5p/miR-183-5p-XIAP axis |
Exp Hematol. |
2.436 |
福建医科大学 |
| 22 |
同型半胱氨酸处理后人视网膜细胞中环状RNA分子的表达分析 |
Expression Analysis of the Circular RNA Molecules in the Human Retinal Cells Treated with Homocysteine. |
Curr Eye Res. |
2.12 |
路易斯维尔大学医学院 |
| 23 |
circCOL3A1-859267通过海绵样吸附miR-29c在人真皮成纤维细胞中调节I型胶原表达 |
|
Eur J Dermatol. |
1.944 |
中山大学附属第三医院 |
| 24 |
环状RNA作为新的生物标志物和癌症治疗靶点研究进展综述 |
Circular RNAs Serve as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Cancers |
Curr Gene Ther. |
1.943 |
宁波大学医学院 |
| 25 |
内源性mirna海绵介导了非编码RNA网络振荡动力学的产生 |
Endogenous mirna sponges mediate the generation of oscillatory dynamics for a non-coding RNA network |
J Theor Biol. |
1.833 |
美国克利夫兰临床医院 |
| 26 |
环状RNA在肺癌中的作用研究进展 |
Progress in research on the role of circular RNAs in lung cancer |
World J Surg Oncol. |
1.792 |
东南大学医学院 |
| 27 |
circRNA_0000285的上调作为鼻咽癌的预后生物标志物，参与放射敏感性 |
Upregulation of circRNA_0000285 serves as a prognostic biomarker for nasopharyngeal carcinoma and is involved in radiosensitivity |
Oncol Lett. |
1.664 |
中南大学湘雅医院 |
| 28 |
环状RNA hsa_circ_0000523作为miRNA海绵调节结直肠癌细胞的增殖和凋亡 |
Circular RNA hsa_circ_0000523 regulates the proliferation and apoptosis of colorectal cancer cells as miRNA sponge |
Braz J Med Biol Res. |
1.492 |
浙江同德医院 |
