欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计24篇,下面我们一起回顾下过去一个月circRNA有哪些进展。

1、肝细胞癌EMT过程中YY1复合物通过与Quaking超增强子结合促进Quaking表达

文献标题:YY1 complex promotes Quaking expression via super-enhancer binding during EMT of hepatocellular carcinoma

期刊:Cancer Res. 影响因子:9.13

通讯作者单位:南开大学

QKI可变剪切因子在EMT(上皮间质转化)中可调控circRNA的形成,但具体机制还不明确。HCC肝细胞癌中,高表达的QKI预示临床短生存期,高转移性。该研究发现YY1/p65/p300复合物可促进QKI基因的转录激活,YY1结合QKI基因的超级增强子上,p65结合QKI的启动子,p300起到位置YY1复合体与QKI的结合作用。体内体外实验共同表明,YY1/p65/p300复合物增强QKI的表达并促进circRNA的形成,最终导致HCC恶性程度的增加。进一步的研究表明金丝桃苷(又名槲皮素-3-O-β-D-吡喃半乳糖苷,属于黄酮醇苷类化合物)可靶向YY1/p65/p300复合物抑制QKI的表达,阻止HCC细胞的恶性转化。

图注:QKI与EMT过程相关并促进circRNA形成。A:QKI过表达的PLC-PRF-5细胞表达谱芯片分析发现,主要与VEGF,NF-KB通路激活,细胞粘附和凋亡途径下调相关。B:过表达QKI后上调基因主要与细胞增殖、迁移和血管生成相关。c、d、e:肿瘤、QKI过表达和YY1过表达组中circRNA聚类分析发现大部分circRNA受QKI和YY1影响。F:受QKI和YY1过表达影响而上调的circRNA交集图。G:circRNA,miRNA和mRNA的ceRNA互作网络图。H:qPCR验证的部分受QKI和YY1影响的circRNA。I:QKI调控的circ0008150, circ0007821, 和 circ0029308可促进细胞侵袭能力增强。

2、环状RNA cTFRC充当MicroRNA-107的海绵以促进膀胱癌进展

文献标题:Circular RNA cTFRC acts as the sponge of MicroRNA-107 to promote bladder carcinoma progression

期刊:Mol Cancer. 影响因子:7.776

通讯作者单位:西南医科大学附属中医医院

该研究首先针对3对膀胱癌患者组织进行circRNA高通量筛选,发现circRNA-cTFRC在膀胱癌中显著上调,且与肿瘤恶性程度和生存率密切相关。体内外实验表明敲定circRNA-cTFRC可显著抑制膀胱癌增殖和侵袭。进一步在膀胱癌细胞和临床组织标本中circRNA-cTFRC和miR-107负相关,另外上调circRNA-cTFRC可促进宿主基因TFRC的表达导致BC细胞EMT转化。表明circRNA-cTFRC在膀胱癌中起重要调控功能是潜在的诊断和治疗标志物。

Fig. 6

图注:cTFRC介导TGF-β诱导的EMT过程。A-B:TGF-β或LiCL处理EJ细胞EMT过程中cTFRC和TFRC均增加(qPCR和WB)。C:cTFRC过表达的BC细胞可观察到EMT样细胞形态。D:WB分析cTFRC过表达的BC细胞中TFRC的表达水平升高。E:干扰cTFRC后,TFRC下调,E-cadherin上调。F:干扰TFRC后,E-cadherin上调。

3、精神分裂症患者皮质灰质中环状RNA减少可能改变相关miRNA的功能

文献标题:Circular RNA biogenesis is decreased in postmortem cortical gray matter in schizophrenia and may alter the bioavailability of associated miRNA

期刊:Neuropsychopharmacology 影响因子:6.544

通讯作者单位:澳大利亚悉尼精神分裂症研究所

环状RNA(circRNA)分子在哺乳动物大脑中相对稳定并且特别丰富,因此可能参与神经发育和功能。之前研究报道circRNA分子涉及突触可塑性等多个生物学过程,因此作者推测circRNA可能在神经行为障碍中起作用。该研究中作者利用circRNA高通量测序技术分析了35个皮质灰质(BA46)精神分裂症(已死亡)和非精神病学对照组的患者的脑皮质中circRNA表达。尽管在背外侧前额叶皮层(DLPFC)中鉴定出超过90,000种circRNA物种,但与对照相比,该病症标本中的circRNA复杂性较低,可变剪接率更高且快速耗尽。这些快速耗尽的circRNA预测结合的miRNA,跟多数上调的miRNA重合,预示circRNA可能通过miRNA发挥重要生理功能,差异表达的circRNA宿主基因的基因富集分析发现与神经功能和神经障碍显著相关,该研究首次报道精神分裂症中circRNAs表达异常,并提示circRNA在精神疾病的病理生理学中发挥重要作用,甚至可以作为治疗靶标。

文献列表:

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 肝细胞癌EMT过程中YY1复合物通过与Quaking超增强子结合促进Quaking表达 YY1 complex promotes Quaking expression via super-enhancer binding during EMT of hepatocellular carcinoma Cancer Res. 9.13 南开大学
2 环状RNA cTFRC充当MicroRNA-107的海绵以促进膀胱癌进展 Circular RNA cTFRC acts as the sponge of MicroRNA-107 to promote bladder carcinoma progression Mol Cancer. 7.776 西南医科大学附属中医医院
3 CircPSMC3通过海绵样吸附miR-296-5p抑制胃癌的增殖和转移 CircPSMC3 suppresses the proliferation and metastasis of gastric cancer by acting as a competitive endogenous RNA through sponging miR-296-5p Mol Cancer. 7.776 南京医科大学附属南京第一医院
4 精神分裂症皮质灰质中环状RNA减少可能改变相关miRNA的功能 Circular RNA biogenesis is decreased in postmortem cortical gray matter in schizophrenia and may alter the bioavailability of associated miRNA Neuropsychopharmacology 6.544 澳大利亚悉尼精神分裂症研究所
5 CircSETD3(Hsa_circ_0000567)吸附microRNA-421抑制肝细胞癌生长 CircSETD3 (Hsa_circ_0000567) acts as a sponge for microRNA-421 inhibiting hepatocellular carcinoma growth J Exp Clin Cancer Res. 6.217 四川大学华西医院
6 环状RNA的计算分析方法介绍 Computational approaches for circular RNA analysis Wiley Interdiscip Rev RNA. 5.844 海德堡大学医院
7 cibc RAPGEF5通过调节miR-198 / FGFR1促进乳头状甲状腺增殖和转移 circRAPGEF5 Contributes to Papillary Thyroid Proliferation and Metastatis by Regulation miR-198/FGFR1 Mol Ther Nucleic Acids. 5.66 上海同仁医院
8 环状RNA circBACH2通过吸附miR-139-5p和调节LMO4表达在乳头状甲状腺癌中发挥作用 Circular RNA circBACH2 plays a role in papillary thyroid carcinoma by sponging miR-139-5p and regulating LMO4 expression Cell Death Dis. 5.638 第二军医大学
9 circTADA2As通过靶向miR-203a-3p / SOCS3轴抑制乳腺癌进展和转移 circTADA2As suppress breast cancer progression and metastasis via targeting miR-203a-3p/SOCS3 axis Cell Death Dis. 5.638 汕头大学医学院
10 骨关节炎关节软骨干/祖细胞中鉴定核心调节功能的RNA分子 Core regulatory RNA molecules identified in articular cartilage stem/progenitor cells during osteoarthritis progression Epigenomics. 4.979 深圳大学
11 两个可作为肺腺癌的非侵入性诊断生物标志物的circRNA分子研究 A two-circular RNA signature as a noninvasive diagnostic biomarker for lung adenocarcinoma J Transl Med. 4.197 山东大学齐鲁医院
12 从circRNA异常形成,运输和降解角度看癌症中环状RNA的失调 Deregulation of Circular RNAs in Cancer From the Perspectives of Aberrant Biogenesis, Transport and Removal Front Genet. 4.151 中南大学湘雅三医院
13 洞察外显子环状RNA的生物形成和潜在功能 Insights into the biogenesis and potential functions of exonic circular RNA Sci Rep. 4.122 澳大利亚国立大学
14 多囊卵巢综合征患者卵泡液外泌体的circRNAs高通量测序分析 High throughput circRNAs sequencing profile of follicle fluid exosomes of polycystic ovary syndrome patients J Cell Physiol. 3.923 扬州大学临床医学院
15 人脐带间充质干细胞向心肌样细胞分化过程中的环状RNA表达谱研究 Circular RNA expression profiles during the differentiation of human umbilical cord-derived mesenchymal stem cells into cardiomyocyte-like cells J Cell Physiol. 3.923 泰州市人民医院
16 环状RNA hsa_circ_0072309通过靶向miR-492抑制乳腺癌细胞的增殖和侵袭 Circular RNA hsa_circ_0072309 inhibits proliferation and invasion of breast cancer cells via targeting miR-492 Cancer Manag Res. 3.702 温州医科大学附属第一医院
17 基于非负矩阵分解算法模块化解析乳腺癌相关环状RNA功能的系统鉴定 Systematical Identification of Breast Cancer-Related Circular RNA Modules for Deciphering circRNA Functions Based on the Non-Negative Matrix Factorization Algorithm. Int J Mol Sci. 3.687 哈尔滨医科大学
18 结直肠癌中上调的环状RNA circVAPA通过吸附miR-101而发挥致癌特性 Circular RNA circVAPA is up-regulated and exerts oncogenic properties by sponging miR-101 in colorectal cancer. Biomed Pharmacother 3.457 北京朝阳医院
19 高表达的cir_100053可预测慢性粒细胞白血病预后不良,并参与伊马替尼耐药 High circ_100053 predicts a poor outcome for chronic myeloid leukemia and is involved in imatinib resistance Oncol Res. 3.143 湖南师范大学附属第一医院
20 RNA-Seq分析环状RNA和hsa_circ_0002360在人肺腺癌中的潜在功能 RNA-Seq profiling of circular RNAs and potential function of hsa_circ_0002360 in human lung adenocarcinom Am J Transl Res. 3.061 江苏大学附属人民医院
21 肺组织中mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA的表达谱变化与小鼠模型中支气管肺发育不良(BPD)的病理生理学关系 Changing expression profiles of mRNA, lncRNA, circRNA, and miRNA in lung tissue reveal the pathophysiological of bronchopulmonary dysplasia (BPD) in mouse model. J Cell Biochem 2.959 南京市妇幼保健院
22 hsa_circRNA_104597:精神分裂症的新型潜在诊断和治疗生物标志物 hsa_circRNA_104597: a novel potential diagnostic and therapeutic biomarker for schizophrenia Biomark Med. 2.346 南京医科大学附属无锡精神卫生中心
23 在甲基苯丙胺处理的原代皮质神经元中分析环状RNA,发现了与甲基苯丙胺成瘾相关的新型circRNAs Profiling circular RNA in methamphetamine-treated primary cortical neurons identified novel circRNAs related to methamphetamine addiction. Neurosci Lett 2.159 山东大学基础医学院
24 CircRNA circ_0067934过度表达与预后不良相关并促进甲状腺癌进展 CircRNA circ_0067934 Overexpression Correlates with Poor Prognosis and Promotes Thyroid Carcinoma Progression Med Sci Monit. 1.894 哈尔滨医科大学附属第一医院

 

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