欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计24篇,下面我们一起回顾下过去一个月circRNA有哪些进展。
1、肝细胞癌EMT过程中YY1复合物通过与Quaking超增强子结合促进Quaking表达
文献标题:YY1 complex promotes Quaking expression via super-enhancer binding during EMT of hepatocellular carcinoma
期刊:Cancer Res. 影响因子:9.13
通讯作者单位:南开大学
QKI可变剪切因子在EMT(上皮间质转化)中可调控circRNA的形成,但具体机制还不明确。HCC肝细胞癌中,高表达的QKI预示临床短生存期,高转移性。该研究发现YY1/p65/p300复合物可促进QKI基因的转录激活,YY1结合QKI基因的超级增强子上,p65结合QKI的启动子,p300起到位置YY1复合体与QKI的结合作用。体内体外实验共同表明,YY1/p65/p300复合物增强QKI的表达并促进circRNA的形成,最终导致HCC恶性程度的增加。进一步的研究表明金丝桃苷(又名槲皮素-3-O-β-D-吡喃半乳糖苷,属于黄酮醇苷类化合物)可靶向YY1/p65/p300复合物抑制QKI的表达,阻止HCC细胞的恶性转化。
图注:QKI与EMT过程相关并促进circRNA形成。A:QKI过表达的PLC-PRF-5细胞表达谱芯片分析发现,主要与VEGF,NF-KB通路激活,细胞粘附和凋亡途径下调相关。B:过表达QKI后上调基因主要与细胞增殖、迁移和血管生成相关。c、d、e:肿瘤、QKI过表达和YY1过表达组中circRNA聚类分析发现大部分circRNA受QKI和YY1影响。F:受QKI和YY1过表达影响而上调的circRNA交集图。G:circRNA,miRNA和mRNA的ceRNA互作网络图。H:qPCR验证的部分受QKI和YY1影响的circRNA。I:QKI调控的circ0008150, circ0007821, 和 circ0029308可促进细胞侵袭能力增强。
2、环状RNA cTFRC充当MicroRNA-107的海绵以促进膀胱癌进展
文献标题:Circular RNA cTFRC acts as the sponge of MicroRNA-107 to promote bladder carcinoma progression
期刊:Mol Cancer. 影响因子:7.776
通讯作者单位:西南医科大学附属中医医院
该研究首先针对3对膀胱癌患者组织进行circRNA高通量筛选,发现circRNA-cTFRC在膀胱癌中显著上调,且与肿瘤恶性程度和生存率密切相关。体内外实验表明敲定circRNA-cTFRC可显著抑制膀胱癌增殖和侵袭。进一步在膀胱癌细胞和临床组织标本中circRNA-cTFRC和miR-107负相关,另外上调circRNA-cTFRC可促进宿主基因TFRC的表达导致BC细胞EMT转化。表明circRNA-cTFRC在膀胱癌中起重要调控功能是潜在的诊断和治疗标志物。
图注:cTFRC介导TGF-β诱导的EMT过程。A-B:TGF-β或LiCL处理EJ细胞EMT过程中cTFRC和TFRC均增加(qPCR和WB)。C:cTFRC过表达的BC细胞可观察到EMT样细胞形态。D:WB分析cTFRC过表达的BC细胞中TFRC的表达水平升高。E:干扰cTFRC后,TFRC下调,E-cadherin上调。F:干扰TFRC后,E-cadherin上调。
3、精神分裂症患者皮质灰质中环状RNA减少可能改变相关miRNA的功能
文献标题:Circular RNA biogenesis is decreased in postmortem cortical gray matter in schizophrenia and may alter the bioavailability of associated miRNA
期刊:Neuropsychopharmacology 影响因子:6.544
通讯作者单位:澳大利亚悉尼精神分裂症研究所
环状RNA(circRNA)分子在哺乳动物大脑中相对稳定并且特别丰富,因此可能参与神经发育和功能。之前研究报道circRNA分子涉及突触可塑性等多个生物学过程,因此作者推测circRNA可能在神经行为障碍中起作用。该研究中作者利用circRNA高通量测序技术分析了35个皮质灰质(BA46)精神分裂症(已死亡)和非精神病学对照组的患者的脑皮质中circRNA表达。尽管在背外侧前额叶皮层(DLPFC)中鉴定出超过90,000种circRNA物种,但与对照相比,该病症标本中的circRNA复杂性较低,可变剪接率更高且快速耗尽。这些快速耗尽的circRNA预测结合的miRNA,跟多数上调的miRNA重合,预示circRNA可能通过miRNA发挥重要生理功能,差异表达的circRNA宿主基因的基因富集分析发现与神经功能和神经障碍显著相关,该研究首次报道精神分裂症中circRNAs表达异常,并提示circRNA在精神疾病的病理生理学中发挥重要作用,甚至可以作为治疗靶标。
文献列表:
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 肝细胞癌EMT过程中YY1复合物通过与Quaking超增强子结合促进Quaking表达 | YY1 complex promotes Quaking expression via super-enhancer binding during EMT of hepatocellular carcinoma | Cancer Res. | 9.13 | 南开大学 |
2 | 环状RNA cTFRC充当MicroRNA-107的海绵以促进膀胱癌进展 | Circular RNA cTFRC acts as the sponge of MicroRNA-107 to promote bladder carcinoma progression | Mol Cancer. | 7.776 | 西南医科大学附属中医医院 |
3 | CircPSMC3通过海绵样吸附miR-296-5p抑制胃癌的增殖和转移 | CircPSMC3 suppresses the proliferation and metastasis of gastric cancer by acting as a competitive endogenous RNA through sponging miR-296-5p | Mol Cancer. | 7.776 | 南京医科大学附属南京第一医院 |
4 | 精神分裂症皮质灰质中环状RNA减少可能改变相关miRNA的功能 | Circular RNA biogenesis is decreased in postmortem cortical gray matter in schizophrenia and may alter the bioavailability of associated miRNA | Neuropsychopharmacology | 6.544 | 澳大利亚悉尼精神分裂症研究所 |
5 | CircSETD3(Hsa_circ_0000567)吸附microRNA-421抑制肝细胞癌生长 | CircSETD3 (Hsa_circ_0000567) acts as a sponge for microRNA-421 inhibiting hepatocellular carcinoma growth | J Exp Clin Cancer Res. | 6.217 | 四川大学华西医院 |
6 | 环状RNA的计算分析方法介绍 | Computational approaches for circular RNA analysis | Wiley Interdiscip Rev RNA. | 5.844 | 海德堡大学医院 |
7 | cibc RAPGEF5通过调节miR-198 / FGFR1促进乳头状甲状腺增殖和转移 | circRAPGEF5 Contributes to Papillary Thyroid Proliferation and Metastatis by Regulation miR-198/FGFR1 | Mol Ther Nucleic Acids. | 5.66 | 上海同仁医院 |
8 | 环状RNA circBACH2通过吸附miR-139-5p和调节LMO4表达在乳头状甲状腺癌中发挥作用 | Circular RNA circBACH2 plays a role in papillary thyroid carcinoma by sponging miR-139-5p and regulating LMO4 expression | Cell Death Dis. | 5.638 | 第二军医大学 |
9 | circTADA2As通过靶向miR-203a-3p / SOCS3轴抑制乳腺癌进展和转移 | circTADA2As suppress breast cancer progression and metastasis via targeting miR-203a-3p/SOCS3 axis | Cell Death Dis. | 5.638 | 汕头大学医学院 |
10 | 骨关节炎关节软骨干/祖细胞中鉴定核心调节功能的RNA分子 | Core regulatory RNA molecules identified in articular cartilage stem/progenitor cells during osteoarthritis progression | Epigenomics. | 4.979 | 深圳大学 |
11 | 两个可作为肺腺癌的非侵入性诊断生物标志物的circRNA分子研究 | A two-circular RNA signature as a noninvasive diagnostic biomarker for lung adenocarcinoma | J Transl Med. | 4.197 | 山东大学齐鲁医院 |
12 | 从circRNA异常形成,运输和降解角度看癌症中环状RNA的失调 | Deregulation of Circular RNAs in Cancer From the Perspectives of Aberrant Biogenesis, Transport and Removal | Front Genet. | 4.151 | 中南大学湘雅三医院 |
13 | 洞察外显子环状RNA的生物形成和潜在功能 | Insights into the biogenesis and potential functions of exonic circular RNA | Sci Rep. | 4.122 | 澳大利亚国立大学 |
14 | 多囊卵巢综合征患者卵泡液外泌体的circRNAs高通量测序分析 | High throughput circRNAs sequencing profile of follicle fluid exosomes of polycystic ovary syndrome patients | J Cell Physiol. | 3.923 | 扬州大学临床医学院 |
15 | 人脐带间充质干细胞向心肌样细胞分化过程中的环状RNA表达谱研究 | Circular RNA expression profiles during the differentiation of human umbilical cord-derived mesenchymal stem cells into cardiomyocyte-like cells | J Cell Physiol. | 3.923 | 泰州市人民医院 |
16 | 环状RNA hsa_circ_0072309通过靶向miR-492抑制乳腺癌细胞的增殖和侵袭 | Circular RNA hsa_circ_0072309 inhibits proliferation and invasion of breast cancer cells via targeting miR-492 | Cancer Manag Res. | 3.702 | 温州医科大学附属第一医院 |
17 | 基于非负矩阵分解算法模块化解析乳腺癌相关环状RNA功能的系统鉴定 | Systematical Identification of Breast Cancer-Related Circular RNA Modules for Deciphering circRNA Functions Based on the Non-Negative Matrix Factorization Algorithm. | Int J Mol Sci. | 3.687 | 哈尔滨医科大学 |
18 | 结直肠癌中上调的环状RNA circVAPA通过吸附miR-101而发挥致癌特性 | Circular RNA circVAPA is up-regulated and exerts oncogenic properties by sponging miR-101 in colorectal cancer. | Biomed Pharmacother | 3.457 | 北京朝阳医院 |
19 | 高表达的cir_100053可预测慢性粒细胞白血病预后不良,并参与伊马替尼耐药 | High circ_100053 predicts a poor outcome for chronic myeloid leukemia and is involved in imatinib resistance | Oncol Res. | 3.143 | 湖南师范大学附属第一医院 |
20 | RNA-Seq分析环状RNA和hsa_circ_0002360在人肺腺癌中的潜在功能 | RNA-Seq profiling of circular RNAs and potential function of hsa_circ_0002360 in human lung adenocarcinom | Am J Transl Res. | 3.061 | 江苏大学附属人民医院 |
21 | 肺组织中mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA的表达谱变化与小鼠模型中支气管肺发育不良(BPD)的病理生理学关系 | Changing expression profiles of mRNA, lncRNA, circRNA, and miRNA in lung tissue reveal the pathophysiological of bronchopulmonary dysplasia (BPD) in mouse model. | J Cell Biochem | 2.959 | 南京市妇幼保健院 |
22 | hsa_circRNA_104597:精神分裂症的新型潜在诊断和治疗生物标志物 | hsa_circRNA_104597: a novel potential diagnostic and therapeutic biomarker for schizophrenia | Biomark Med. | 2.346 | 南京医科大学附属无锡精神卫生中心 |
23 | 在甲基苯丙胺处理的原代皮质神经元中分析环状RNA,发现了与甲基苯丙胺成瘾相关的新型circRNAs | Profiling circular RNA in methamphetamine-treated primary cortical neurons identified novel circRNAs related to methamphetamine addiction. | Neurosci Lett | 2.159 | 山东大学基础医学院 |
24 | CircRNA circ_0067934过度表达与预后不良相关并促进甲状腺癌进展 | CircRNA circ_0067934 Overexpression Correlates with Poor Prognosis and Promotes Thyroid Carcinoma Progression | Med Sci Monit. | 1.894 | 哈尔滨医科大学附属第一医院 |