欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献20篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。
- CircACC1调节细胞代谢应激下AMPK复合物的组装和活化
论文标题:CircACC1 Regulates Assembly and Activation of AMPK Complex under Metabolic Stress
杂志:Cell Metab影响因子:20.565
通讯作者:吴缅(中国科学技术大学)和胡汪(安徽医科大学)
该研究由中国科学技术大学吴缅和胡汪教授为共同通讯作者完成,首次报道circACC1,一种源自人ACC1的环状RNA,在细胞代谢应激反应中起关键作用。在血清缺失条件下,转录因子c-Jun响应上调CircACC1(c-Jun主要上调circACC1而非ACC1)。circACC1通过与AMPK调节β和γ亚基形成三元复合物而起到稳定和促进AMPK全酶的酶活性的作用。circACC1的细胞水平调节脂肪酸β-氧化和糖酵解,导致细胞脂质储存产生重要变化。在肿瘤异种移植模型中,circACC1的沉默或过表达分别导致生长抑制和增强。此外,结肠直肠癌组织中AMPK活化的增加通常与circACC1表达升高有关。研究结论表明,癌细胞在代谢重编程期间利用circACC1激活AMPK,AMPK在细胞代谢过程中起核心作用,在细胞能量代谢过程中相当于开关作用,平衡细胞合成和分解代谢,同时是肿瘤治疗最重要的潜在靶标。可见该研究阐明circRNA通过AMPK调控细胞能量代谢的重要意义。
图注:血清饥饿条件下,c-Jun特异性上调CircACC1,CircACC1通过结合AMPK的β1和γ1调节亚基,进而稳定并激活AMPK复合物,AMPK的激活促进细胞中的脂肪酸β氧化和糖酵解。
- 环状RNA circTRIM33-12作为MicroRNA-191的海绵抑制肝细胞癌进展。
论文标题:Circular RNA circTRIM33-12 acts as the sponge of MicroRNA-191 to suppress hepatocellular carcinoma progression.
杂志:Mol Cancer影响因子:7.776
通讯作者:Guo-Ming Shi, Ai-Wu Ke和Jia Fan (复旦大学生物医学研究院)
该研究发现circTRIM33-12在HCC(肝细胞癌)组织和细胞系中下调。HCC中circTRIM33-12的下调与恶性特征显著相关,并且可作为手术后HCC患者的总体存活(OS)和无复发存活(RFS)的独立危险因素。CircTRIM33-12在HCC细胞中的表达降低增加肿瘤增殖,迁移,侵袭和免疫逃避。在机理上,研究表明circTRIM33-12通过海绵吸附miR-191上调TET1表达(DNA双加氧酶,DNA去甲基化关键蛋白),导致HCC细胞中5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)水平显着降低。5hmC为DNA去甲基化调控过程中重要的DNA修饰,研究表明5hmC作为强组织特异性的表观遗传标志物,可能是用于肿瘤诊断的更敏感标志物。该研究发现circTRIM33-12调控5hmC降低,对circRNA参与DNA甲基化调控具有重要意义。
图注:在体外体内实验结果均表明circTRIM33–12可抑制HCC细胞
- 哺乳动物散在重复序列(MIRs)介导环状RNA ciRS-7 / CDR1as的生物形成
论文标题:Biosynthesis of Circular RNA ciRS-7/CDR1as Is Mediated by Mammalian-Wide Interspersed Repeats (MIRs)
杂志:BioRxiv 影响因子:NA
通讯作者:Jørgen Kjems和Akila Mayeda (日本藤田健康大学)
研究最早和最多的circRNA之一是ciRS-7(CDR1as),可调控miR-7,然而,ciRS-7生物形成机制仍然是一个谜。该研究中阐述ciRS-7的生物合成途径。通常circRNA的形成反向剪接事件通过灵长类动物特异性Alu元件的侧翼反向重复序列来促进。但ciRS-7基因缺乏这些元件,相反,我们在ciRS-7鉴定了一组属于哺乳动物范围的散在重复(MIR)家族的侧翼倒置元件。在HEK293细胞中报告基因实验测定证明ciRS-7形成需要这些反向MIR,并且CRISPR / Cas9介导的缺失证实了SH-SY5Y细胞中内源性MIR元件的必要性。生物信息学分析,研究者确定了几个通过实验证实的其他MIR依赖性circRNA。因此该研究表明MIR介导的RNA环化是哺乳动物circRNA生物合成的新原理。本文详细解读请见本公众号历史文章:BioRxiv:MIR元件介导circRNA生成
图注:人与小鼠CDR1as两侧存在反向MIR元件
参考文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | CircACC1调节细胞代谢应激下AMPK复合物的组装和活化 | CircACC1 Regulates Assembly and Activation of AMPK Complex under Metabolic Stress | Cell Metab | 20.565 | 中国科学技术大学 |
2 | 环状RNA circTRIM33-12作为MicroRNA-191的海绵抑制肝细胞癌进展。 | Circular RNA circTRIM33-12 acts as the sponge of MicroRNA-191 to suppress hepatocellular carcinoma progression. | Mol Cancer | 7.776 | 复旦大学生物医学研究院 |
3 | circRNA_0025202通过miR-182-5p/FOXO3a轴来调节乳腺癌他莫昔芬敏感性和肿瘤进展。 | circRNA_0025202 Regulates Tamoxifen Sensitivity and Tumor Progression via Regulating the miR-182-5p/FOXO3a Axis in Breast Cancer. | Mol Ther | 7.008 | 山东大学齐鲁医院 |
4 | circRNA circPTPRA通过海绵吸附miR-96-5p抑制NSCLC细胞的上皮-间质转化和转移。 | The circRNA circPTPRA suppresses epithelial-mesenchymal transitioning and metastasis of NSCLC cells by sponging miR-96-5p. | EBioMedicine | 6.183 | 蚌埠医学院第一附属医院 |
5 | 慢性淋巴细胞白血病中circ_0132266下调并通过miR-337-3p / PML轴促进细胞存活。 | Downregulation of circ_0132266 in chronic lymphocytic leukemia promoted cell viability through miR-337-3p/PML axis. | Aging (Albany NY) | 5.179 | 南京医科大学附属第一医院 |
6 | SplintQuant:一种精确定量环状RNA转录本丰度而无逆转录偏倚的方法。 | SplintQuant: A method for accurately quantifying circular RNA transcript abundance without reverse transcription bias. | RNA | 4.49 | 弗林德斯癌症治疗创新研究中心 |
7 | CircRNA-100338及mTOR信号通路和肝细胞癌预后不良有关。 | CircRNA-100338 Is Associated With mTOR Signaling Pathway and Poor Prognosis in Hepatocellular Carcinoma. | Front Oncol | 4.416 | 复旦大学肝癌研究所 |
8 | 肝细胞癌临床样本中RNA网络构建的分析。 | Analyses of a Panel of Transcripts Identified From a Small Sample Size and Construction of RNA Networks in Hepatocellular Carcinoma. | Front Genet | 4.151 | 中国科学技术大学 |
9 | 环状RNA和RNase L在PKR激活和病毒感染中的作用。 | Circular RNAs and RNase L in PKR activation and virus infection. | Cell Biosci | 3.219 | 美国国家癌症研究所 |
10 | 综述:环状RNA在乳腺癌中的新兴作用。 | The Emerging Role of Circular RNAs in Breast Cancer. | Biosci Rep | 2.899 | 南京医科大学附属第一医院 |
11 | circPVT1:具有重要临床意义的致癌非编码RNA。 | Circular PVT1: an oncogenic non-coding RNA with emerging clinical importance. | J Clin Pathol | 2.894 | 印度加尔各答总统大学 |
12 | 多发性硬化症中环状RNAs的新型调节机制。 | Circular RNAs as a novel layer of regulatory mechanism in multiple sclerosis. | J Neuroimmunol | 2.655 | 波兰奥尔什丁瓦尔米亚玛祖里大学 |
13 | 环状RNA circ_0020123作为miR-488-3p的ceRNA来调节ADAM9表达来促进非小细胞肺癌进展。 | Circular RNA circ_0020123 promotes non-small cell lung cancer progression by acting as a ceRNA for miR-488-3p to regulate ADAM9 expression. | Biochem Biophys Res Commun | 2.559 | 齐齐哈尔医科大学附属第二医院 |
14 | 环状RNA circKMT2E 在糖尿病性白内障晶状体中上调,并海绵吸附miR-204-5p。 | Circular RNA circ KMT2E is up-regulated in diabetic cataract lenses and is associated with miR-204-5p sponge function. | Gene | 2.498 | 山东第一医科大学 |
15 | 老化猪肝的综合转录分析。 | Comprehensive transcriptional profiling of aging porcine liver. | PeerJ | 2.118 | 四川农业大学生命科学学院 |
16 | 在牙源性分化期间人牙髓细胞中环状RNA的表达变化。 | Altered expression of circular RNA in human dental pulp cells during odontogenic differentiation. | Mol Med Rep | 1.922 | 中山大学附属口腔医院 |
17 | ceRNA网络分析鉴定circRNA可作为膀胱癌的预后生物标志物。 | Analysis of ceRNA network identifies prognostic circRNA biomarkers in bladder cancer. | Neoplasma | 1.696 | 中南大学湘雅二医院 |
18 | 外泌体在肝细胞癌的发展中起重要作用。 | Exosome plays an important role in the development of hepatocellular carcinoma. | Pathol Res Pract | 1.466 | 武汉大学中南医院 |
19 | 基于RNA深度测序的人结直肠癌中环状RNA的表达谱。 | Expression profiles of circular RNAs in human colorectal cancer based on RNA deep sequencing. | J Clin Lab Anal | 1.303 | 宁波大学医学院附属医院 |
20 | 哺乳动物全散在重复序列(MIRs)介导环状RNA ciRS-7 / CDR1as的生物合成 | Biosynthesis of Circular RNA ciRS-7/CDR1as Is Mediated by Mammalian-Wide Interspersed Repeats (MIRs) | BioRxiv | NA | 日本藤田健康大学 |