欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献20篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。
- 蛋白质和circRNA在肿瘤发生中的基因内拮抗作用。
论文标题:Intragenic antagonistic roles of protein and circRNA in tumorigenesis.杂志:Cell Research. 影响因子:17.848
通讯作者:Pier Paolo Pandolfi(哈佛医学院)
近日Pier Paolo Pandolfi教授(cell杂志2016年发表融合基因来源的circRNA具有癌基因功能的文章通讯作者)报道发现来自Zbtb7a基因(别名POKEMON)的一个circRNA与POKEMON在肿瘤中的作用方式完全相反:POKEMON基因是一种抑癌基因,而这个circRNA分子却起到类似癌基因的作用。PCR实验表明,POKEMON基因第二外显子反向剪切形一个新circRNA,命名为circPOK。后续实验表明circPOK通过共激活ILF2/ILF3复合物,诱导其下游基因表达,促进IL-6,VEGF等促增殖和血管生成因子的表达。该文详细解读请查看本公众号历史文章:Cell Research:抑癌基因来源的circRNA竟然是个癌基因
图注:Pokemon蛋白(抑癌功能)和circPOK(促癌功能)在正常细胞向肿瘤转换过程中的拮抗作用机制示意图。
- hsa_circ_0091570通过海绵hsa-miR-1307作为ceRNA抑制肝细胞癌进展。
论文标题:hsa_circ_0091570 acts as a ceRNA to suppress hepatocellular cancer progression by sponging hsa-miR-1307.
杂志:Cancer Letters. 影响因子:6.508
通讯作者:Min Shi和Bo Zhai(上海交通大学医学院附属仁济医院)
该研究通过分析HCC肝癌circRNA表达谱发现hsa_circ_0091570在HCC中异常低表达,后续qRT-PCR以确定HCC组织和细胞系中验证了hsa_circ_0091570低表达。进一步通过一系列细胞功能实验(CCK8、EdU、细胞集落形成、细胞周期、细胞凋亡、transwell和划痕愈合)评估了hsa_circ_0091570或miR-1307对细胞增殖、凋亡、凋亡和迁移功能的影响。小鼠异种移植模型测量了hsa_circ_0091570的体内功能。 结果表明,hsa_circ_0091570的表达降低与HCC患者的病理分期相关。此外,抑制hsa_circ_0091570促进细胞增殖和迁移,阻断HCC细胞系中的细胞凋亡,并促进小鼠异种移植模型中的肿瘤生长。 RNA免疫沉淀实验验证了hsa_circ_0091570和miR-1307的相互作用。总体而言,hsa_circ_0091570将miR-1307作为ceRNA来调节ISM1表达,并在HCC中发挥功能性作用。
图注:HCC肝癌细胞中hsa_circ_0091570下调,导致miR-1307上调,抑制了ISM1蛋白的表达,最终促进HCC细胞增殖、迁移和抑制细胞凋亡。
- 环状RNA hsa_circ_0089172通过海绵吸附miR-125a-3p在桥本氏甲状腺炎中的潜在作用。
论文标题:Circular RNA Expression Profiling and the Potential Role of hsa_circ_0089172 in Hashimoto s Thyroiditis via Sponging miR125a-3p.
杂志:Molecular Therapy-nucleic Acids. 影响因子:5.919
通讯作者:Yingzhao Liu(江苏大学附属人民医院)
桥本氏甲状腺炎也称慢性淋巴细胞性甲状腺炎(chronic lymphocytic thyroiditis)、桥本氏症(Hashimoto’s disease),是一种由甲状腺被一系列细胞或抗体介导免疫过程攻击所导致的自身免疫病。此症初期可能并无症状,甲状腺会渐渐肿大并形成不会疼痛的甲状腺肿(goiter)。circRNA在桥本氏甲状腺炎(HT)中的作用尚未确定。在该研究中,研究者通过Illumina HiSeq测序仪研究来自5名HT患者和5名健康志愿者的外周血样品。在HT患者中共鉴定出627个差异表达的circRNA,包括370个上调的和257个下调的circRNA。qPCR实验验证结果表明四个上调的circRNA与测序结果具有相同的上升趋势。 hsa_circ_0089172的表达上调并与甲状腺过氧化物酶抗体的血清水平正相关。使用生物信息学工具在hsa_circ_0089172序列中发现miR-125a-3p的两个完全匹配的结合位点。在HT患者中miR-125a-3p的表达降低,并且与hsa_circ_0089172的升高水平相反。此外,hsa_circ_0089172的敲低导致体外miR-125a-3p的表达增加。受试者工作特征(ROC)曲线分析表明hsa_circ_0089172在HT诊断中具有显著价值。总之,这些结果证明hsa_circ_0089172可作为HT的潜在诊断生物标志物,并且可能通过海绵吸附miR-125a-3p在HT的发病机理中起关键作用。
图注:hsa_circ_0089172可能通过海绵样吸附miR-125a-3p,间接调控IL-23R的表达进而参与调控HT桥本氏甲状腺炎的进程。
参考文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 蛋白质和circRNA在肿瘤发生中的基因内拮抗作用。 | Intragenic antagonistic roles of protein and circRNA in tumorigenesis. | Cell Res | 17.848 | 哈佛医学院 |
2 | hsa_circ_0091570通过海绵hsa-miR-1307作为ceRNA抑制肝细胞癌进展。 | hsa_circ_0091570 acts as a ceRNA to suppress hepatocellular cancer progression by sponging hsa-miR-1307. | Cancer Lett | 6.508 | 上海交通大学医学院附属仁济医院 |
3 | 环状RNA表达谱和hsa_circ_0089172通过海绵miR-125a-3p在桥本氏甲状腺炎中的潜在作用。 | Circular RNA Expression Profiling and the Potential Role of hsa_circ_0089172 in Hashimoto s Thyroiditis via Sponging miR125a-3p. | Mol Ther Nucleic Acids | 5.919 | 江苏大学附属人民医院 |
4 | Cecal CircRNAs与鸡肠道沙门氏菌肠炎沙门氏菌接种的反应相关。 | Cecal CircRNAs Are Associated With the Response to Salmonella Enterica Serovar Enteritidis Inoculation in the Chicken. | Front Immunol | 4.716 | 山东农业大学动物科技学院 |
5 | 甲状旁腺肿瘤的环状RNA表达谱:环状RNA和mRNA的共表达网络的分析 | Circular RNA profile of parathyroid neoplasms: analysis of co-expression networks of circular RNAs and mRNAs. | RNA Biol | 5.477 | 北京协和医院 |
6 | CircRNA_28313 / miR-195a / CSF1轴调节破骨细胞分化,影响OVX诱导的小鼠骨吸收 | CircRNA_28313/miR-195a/CSF1 axis modulates osteoclast differentiation to affect OVX-induced bone absorption in mice. | RNA Biol | 5.477 | 中南大学湘雅二医院 |
7 | 合成环状多miRNA海绵同时抑制食管癌中的miR-21和miR-93 | Synthetic circular multi-miR sponge simultaneously inhibits miR-21 and miR-93 in esophageal carcinoma. | Lab Invest | 3.684 | 约翰·霍普金斯大学医学院 |
8 | circ-PKD2通过口腔鳞状细胞癌中的miR-204-3p / APC2轴抑制癌发生 | circ-PKD2 inhibits carcinogenesis via the miR-204-3p/APC2 axis in oral squamous cell carcinoma. | Molecular Carcinogenesis | 3.411 | 青岛大学附属医院 |
9 | lncRNAs和circRNAs的综合分析揭示了氧化和糖酵解骨骼肌中的代谢 | Comprehensive Analysis of lncRNAs and circRNAs Reveals the Metabolic Specialization in Oxidative and Glycolytic Skeletal Muscles. | Int J Mol Sci | 4,183 | 四川农业大学 |
10 | 通过综合分析鉴定肝细胞癌中circRNA-miRNA-mRNA调控网络 | Identification of circRNA-miRNA-mRNA regulatory network in hepatocellular carcinoma by integrated analysis. | J Gastroenterol Hepatol | 3.632 | 临沂市人民医院 |
11 | 环状RNA的失调表达可作为癌症的预后和临床病理标志物 | Dysregulated Expression of Circular RNAs Serve as Prognostic and Clinicopathological Markers in Cancer. | J Cancer | 3.182 | 华中科技大学同济医学院 |
12 | 线性和环状CDKN2B-AS1表达与炎性肠病相关并参与肠屏障形成 | Linear and circular CDKN2B-AS1 expression is associated with Inflammatory Bowel Disease and participates in intestinal barrier formation. | Life Sci | 3.583 | 加州大学洛杉矶分校David Geffen医学院 |
13 | 古细胞中环状RNA和RNA连接酶的多样性 | Diversity of circular RNAs and RNA ligases in archaeal cells. | Biochimie | 3.188 | 巴黎理工学院 |
14 | circRNA_0058097通过海绵吸附miR-365a-5p调节HDAC4表达,促进终板软骨细胞的张力诱导变性 | circRNA_0058097 promotes tension-induced degeneration of endplate chondrocytes by regulating HDAC4 expression through sponge adsorption of miR-365a-5p. | J Cell Biochem | 2.959 | 皖南医学院弋矶山医院 |
15 | 使用生物信息学工具综合分析肾细胞癌中竞争性内源性RNA网络 | Integrated analysis of a competing endogenous RNA network in renal cell carcinoma using bioinformatics tools. | Biosci Rep | 2.899 | 湖北理工大学附属黄石中心医院 |
16 | circ-SHPRH对实体癌的诊断和预后作用:荟萃分析 | Diagnostic and prognostic roles of circ-SHPRH for solid cancers: a meta-analysis. | Onco Targets Ther | 2.656 | 第二军医大学长征医院 |
17 | 环状RNA hsa_circ_009755下调与口腔鳞状细胞癌的临床病理学相关 | Circular RNA hsa_circ_009755 downregulation correlates with clinicopathology in oral squamous cell carcinoma. | Onco Targets Ther | 2.656 | 北京大学深圳医院 |
18 | 环状RNA circ-DCAF6高表达可预测不良预后并通过海绵状miR-1231和miR-1256促进胃癌细胞进展 | Enhanced expression of circular RNA circ-DCAF6 predicts adverse prognosis and promotes cell progression via sponging miR-1231 and miR-1256 in gastric cancer. | Exp Mol Pathol | 2.566 | 齐齐哈尔医科大学附属第三医院 |
19 | CircRAD23B通过海绵吸附miR-5095促进食管癌细胞的增殖和侵袭 | CircRAD23B facilitates proliferation and invasion of esophageal cancer cells by sponging miR-5095. | Biochem Biophys Res Commun | 2.559 | 青岛城阳区人民医院 |
20 | circ_0024169在血管肉瘤组织中下调的潜在意义 | A potential significance of circ_0024169 down regulation in angiosarcoma tissue. | Intractable Rare Dis Res | Not Found | 熊本大学生命科学学院 |