欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献34篇，下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。
- 使用RNase R进行环状RNA纯化的改进方法，可有效去除含有G-四链体或3’末端结构
化的线性RNA
论文标题：An improved method for circular RNA purification using RNase R that efficiently removes linear RNAs containing G-quadruplexes or structured 3′ ends. 杂志：Nucleic Acids Res 影响因子：11.147
通讯作者：Jeremy E. Wilusz（美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院）
真核生物的蛋白编码基因可产生成千上万的环状RNA，circRNA具有共价连接的末端并且对外切核酸酶的降解具有抗性。为了证明环状RNA的成环性以及这些转录本的丰度，使用3′-5’核酸外切酶RNase R已成为该领域的标准。该研究中，作者证明涉及RNase R的标准方案> 20％高表达的线性RNA不能消化，但这些缺点可以在很大程度上克服。具有高度结构化的3’末端的RNA（包括snRNA和组蛋白mRNA）天然地对RNase R具有抗性，但是一旦将poly（A）尾添加到其末端，就可以有效降解。此外，RNase R在许多多腺苷酸化mRNA的体内停滞，特别是在以前注释为G-四链体（G4）结构的富含G的序列中。在用反应缓冲液中的Li +代替K +（其稳定G4s）后，作者发现RNase R能够将这些序列进行并完全降解mRNA。该研究的结果为目前用于分离环状RNA的方法提供了重要的改进，以及揭示可以天然抑制细胞核酸外切酶降解RNA结构的方法。
注：
G-四链体(G-quadruplex)是由富含串联重复鸟嘌呤(G)的DNA或RNA折叠形成的高级结构。G-四链体是由富含鸟嘌呤的DNA或RNA折叠形成的高级结构。可形成G-四链体的序列在人基因组中广泛分布，涉及DNA复制、端粒维持、基因表达与调控以及遗传不稳定性等过程。研究发现有些化学合成的G-四链体序列也具有生物活性，如核仁素的核酸适体AS1411具有抑制恶性肿瘤增殖活性。
图注：在含有KCl缓冲液RNaseR处理中，通常有G四链体结构的线性RNA通常难以被消化（左）。而通过RNaseR消化前耦合A碱基和在缓冲液中添加LiCl可更有效去除线性RNA分子，增加circRNA的纯度（右）。
2、线粒体mecciRNA的鉴定及调控蛋白质进入线粒体中的作用
论文标题：The identification of mecciRNAs and their roles in mitochondrial entry of proteins
杂志：BioRxiv
近日中国科学技术大学单革教授首次报道人与小鼠线粒体来源的circRNA（mecciRNAs）的最新研究成果在BioRxiv发表。哺乳动物线粒体基因组很小，仅编码数量非常有限的蛋白。线粒体需要的其他上千种核基因组编码的蛋白质和非编码RNA必须从细胞质输入线粒体。该研究中，作者报告鉴定了由线粒体基因组编码的数百个环状RNA（mecciRNA）。体外和体内实验结果，证明mecciRNA通过在蛋白折叠中作为分子伴侣来促进核编码蛋白进入线粒体。已知的线粒体蛋白和RNA输入组分如TOM40和PNPASE与mecciRNA相互作用并调节蛋白质进入。mecciRNA的表达受到调节，并且这些circRNAs通过调节线粒体蛋白质输入来适应各种生理条件和应激反应，对癌症等疾病至关重要。该研究发现的线粒体mecciRNA–环状RNA及其相关的生理作用，丰富了人们对真核环状RNA类别和功能认识，并为线粒体和细胞核之间的通讯提供了新的视角，具有重要的研究意义。该文献详细解读请参考本公众号历史文章：BioRxiv | 线粒体来源circRNA及其功能。
- 综述：环状RNA直接结合蛋白质并调控蛋白的行为
论文标题：Guidance of circular RNAs to proteins’ behavior as binding partners. 杂志：Cell Mol Life Sci 影响因子：7.014
通讯作者：李兆勇（湖南大学生物学院）
越来越多的研究表明，环状RNA（circRNA）可通过与蛋白质的直接相互作用影响蛋白质的行为。该综述文章中，作者总结通过直接与蛋白质结合的circRNA研究现状。包括：circRNA可促进蛋白质的细胞核或细胞质定位；调节蛋白的功能或稳定性；促进或抑制蛋白之间的相互作用；影响蛋白与DNA之间的相互作用。此外，这些circRNA结合蛋白包括转录因子，RNA加工蛋白，蛋白酶和一些其他RNA结合蛋白。circRNA参与多种生理或病理过程的调节，包括肿瘤发生，动脉粥样硬化，伤口修复，心脏衰老，心肌缺血/再灌注损伤等。因此，进一步研究与circRNA相互作用的更多类型的蛋白质，将有助于揭示circRNA指导细胞蛋白质行为变化和其他未知生物学功能。
表注：上表总结了目前已研究的circRNA直接结合的蛋白及对蛋白功能的调控作用。
参考文献列表
