欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献18篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。
1、综述:环状RNA生物形成和生物学功能特征
论文标题:The biogenesis, biology and characterization of circular RNAs.
期刊:Nat Rev Genet 影响因子:43.704
通讯作者:Thomas B.Hansen和 Jørgen Kjems(丹麦奥尔胡斯大学)
该综述文章是由2013年在nature杂志上最早发表环状RNA——ciRS-7通过吸附miR-7发挥生物学功能的文章的作者Thomas B.Hansen团队最新发表。该综述文章非常系统全面地总结了近年来circRNA研究领域的最新进展、从circRNA生物学形成机制到circRNA分子功能,比如circRNA通过类似海绵的作用吸附miRNA或蛋白质调控蛋白功能,circRNA自身翻译成蛋白质发挥重要生物学功能。此外,circRNA与糖尿病,神经障碍,心血管疾病和癌症等疾病密切相关,表明circRNA与人类疾病发生发展密切相关并在其中扮演重要功能角色。同时文章也系统介绍了用于鉴定circRNA功能的各类技术特点和面临的挑战。虽然circRNA转录本环状特性使其检测、定量和功能表征检测面临困难,但高通量测序和circRNA特定计算方法推动了circRNA鉴定方法的发展,并涌现了一系列的新颖的技术,表明circRNA领域还有很多研究空白需要填补。通过细读该综述文章,相信您对circRNA研究领域会有一个全面细致的了解。
表注:circRNA检测和定量方法的优缺点对比表
2、CircMYBL2通过招募PTBP1调节FLT3翻译以促进FLT3-ITD AML进展。
论文标题:CircMYBL2, a circRNA from MYBL2, Regulates FLT3 Translation by Recruiting PTBP1 to Promote FLT3-ITD AML Progression.
期刊:Blood 影响因子:16.562
通讯作者:陈月琴(中山大学)
FLT3基因的内部串联重复(internal tandem duplication,ITD)突变在急性白血病AML中占比30%以上,且患者预后较差。因此FLT3癌基因是AML重要的治疗靶点,特异性靶向FLT3激酶的抑制剂可诱导完全缓解AML;然而,由于FLT3中的继发性突变使其获得性抗性,导致AML复发,研究针对FLT3-ITD突变的新策略具有重要临床意义。最近的研究报道,环状RNA(circRNA)的异常形成是生物肿瘤发生相关机制和潜在的治疗靶标。在该文中,研究者发现来自细胞周期检查点基因MYBL2来源的circRNA——circMYBL2。在具有FLT3-ITD突变的AML患者中CircMYBL2比在没有FLT3-ITD突变的患者中表达水平更高。进一步功能研究发现,特异性地c敲低ircMYBL2可抑制FLT3-ITD AML细胞增殖和促进细胞的分化。有趣的是, circMYBL2依赖FLT3-ITD信号通路激活显著影响突变体FLT3激酶的蛋白质水平。机制上,circMYBL2通过增加PTBP1与FLT3 mRNA的结合来增强FLT3激酶的翻译效率。此外,circMYBL2敲低后,FLT3激酶表达显著降低,随后其下游途径失活。最终导致FLT3-ITD阳性细胞的抑制剂抗性降低,进而细胞活性下降。该文首次揭示在FLT3-ITD AML中通过调控FLT3激酶水平的特异性circRNA——circMYBL2,表明circMYBL2可能是FLT3-ITD AML的潜在治疗靶点。
3、环状RNA circRNA_000203通过抑制miR26b-5p和miR-140-3p与Gata4的结合而加重心脏肥大。
论文标题:Circular RNA circRNA_000203 aggravates cardiac hypertrophy via suppressing miR26b-5p and miR-140-3p binding to Gata4.
期刊:Cardiovasc Res 影响因子:7.014
通讯作者:单志新(南方医科大学,广东省人民医院)
该研究探讨了circRNA_000203对心肌肥厚的影响及其可能的机制。实验结果发现CircRNA_000203在Ang-II注入的小鼠心肌中和在Ang-II处理的新生小鼠心室心肌细胞(NMVC)的细胞质中上调。circRNA_000203的过表达增强NMVC的细胞大小和心房利钠肽(ANP)和β-肌球蛋白重链(MHC)和表达。在体内实验中,在Ang-II输注的心肌特异性circRNA_000203转基因小鼠(Tg-circ203)中心脏功能受损并且心脏肥大加剧。机制实验结果,研究者发现circRNA_000203可以在NMVCs中特异性地吸附miR-26b-5p和miR-140-3p。双荧光素酶报告基因检测显示miR-26b-5p和miR-140-3p可与Gata4基因的3’UTR相互作用,circRNA_000203可阻断上述相互作用。另外,Gata4表达在NMVC中被miR-26b-5p和miR-140-3p模拟物转录抑制,但在体外和体内过表达circRNA_000203后Gata4表达得以恢复。功能上,Gata4 siRNA可逆转Ang-II诱导的NMVCs的肥大性生长,并消除circRNA_000203在NMVCs中的促肥大作用。此外,实验结果证明NF-κB信号介导暴露于Ang-II处理的NMVCs中circRNA_000203的上调。
图注:circRNA_000203通过吸附miR26b-5p和miR-140-3p后抑制Gata4的表达,进而加重心脏肥大的作用机制示意图。
参考文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 综述:环状RNA生物形成和生物学功能特征 | The biogenesis, biology and characterization of circular RNAs. | Nat Rev Genet | 43.704 | 丹麦奥尔胡斯大学 |
2 | CircMYBL2通过招募PTBP1调节FLT3翻译以促进FLT3-ITD AML进展。 | CircMYBL2, a circRNA from MYBL2, Regulates FLT3 Translation by Recruiting PTBP1 to Promote FLT3-ITD AML Progression. | Blood | 16.562 | 中山大学 |
3 | 环状RNA circRNA_000203通过抑制miR26b-5p和miR-140-3p与Gata4的结合而加重心脏肥大。 | Circular RNA circRNA_000203 aggravates cardiac hypertrophy via suppressing miR26b-5p and miR-140-3p binding to Gata4. | Cardiovasc Res | 7.014 | 南方医科大学 |
4 | 环状RNA circSCAF11通过miR-421 / SP1 / VEGFA轴加速胶质瘤肿瘤发生。 | Circular RNA circSCAF11 Accelerates the Glioma Tumorigenesis through the miR-421/SP1/VEGFA Axis. | Mol Ther Nucleic Acids | 5.919 | 第四军医大学唐都医院等 |
5 | 一种新型环状RNA通过作为竞争性内源RNA介导糖尿病性心肌病的糖尿病。 | A Novel Circular RNA Mediates Pyroptosis of Diabetic Cardiomyopathy by Functioning as a Competing Endogenous RNA. | Mol Ther Nucleic Acids | 5.919 | 哈尔滨医科大学 |
6 | 环状RNA circ-ITCH通过调节miR-22充当骨肉瘤中的肿瘤抑制剂。 | The circular RNA circ-ITCH acts as a tumour suppressor in osteosarcoma via regulating miR-22. | Artif Cells Nanomed Biotechnol | 4.462 | 青岛大学附属医院 |
7 | 前列腺癌中沉默环状RNA circZNF609通过上调的microRNA-186-5p来抑制癌细胞生长,迁移和侵袭。 | Silencing circular RNA circZNF609 restrains growth, migration and invasion by up-regulating microRNA-186-5p in prostate cancer. | Artif Cells Nanomed Biotechnol | 4.462 | 哈尔滨医科大学附属第一医院 |
8 | 神经发育中的表观遗传学:环状RNA的新兴作用。 | Epigenetics in Neurodevelopment: Emerging Role of Circular RNA. | Front Cell Neurosci | 3.9 | 中南大学附属肿瘤医院 |
9 | 慢性脑缺血大鼠白质损伤与神经元死亡及全转录组分析的综合评价。 | Comprehensive Evaluation of White Matter Damage and Neuron Death and Whole-Transcriptome Analysis of Rats With Chronic Cerebral Hypoperfusion. | Front Cell Neurosci | 3.9 | 暨南大学附属第一医院 |
10 | 整合转录组和生物信息学分析揭示与槲皮素诱导的HCT-116细胞凋亡相关的调节途径。 | Integrated Whole Transcriptome Profiling and Bioinformatics Analysis for Revealing Regulatory Pathways Associated With Quercetin-Induced Apoptosis in HCT-116 Cells. | Front Pharmacol | 3.845 | 中南大学湘雅医院 |
11 | 水稻光温敏核不育系武乡S中,环状RNA谱分析揭示了参与育性转换的circRNA。 | Circular RNA profiling of the rice photo-thermosensitive genic male sterile line Wuxiang S reveals circRNA involved in the fertility transition. | BMC Plant Biol | 3.67 | 武汉大学生命科学学院 |
12 | 与AGA相比,来自SGA的母体和新生儿脐带血浆中差异表达的环状RNA。 | Differentially expressed circular RNAs in maternal and neonatal umbilical cord plasma from SGA compared with AGA. | J Cell Biochem | 3.448 | 北京大学第三医院 |
13 | CircRNA LRP6通过负调节KLF2和APC水平促进骨肉瘤的发展 | CircRNA LRP6 promotes the development of osteosarcoma via negatively regulating KLF2 and APC levels | Am J Transl Res | 3.266 | 南京医科大学附属南京第一医院 |
14 | 基于局部约束线性编码预测人类疾病相关的circRNA。 | Predicting human disease-associated circRNAs based on locality-constrained linear coding. | Genomics | 3.16 | 沈阳航空航天大学 |
15 | 环状RNA ABCB10与晚期上皮性卵巢癌临床病理学特征和不良预后相关,并促进癌细胞增殖,同时减少细胞凋亡。 | Circular RNA ABCB10 correlates with advanced clinicopathological features and unfavorable survival, and promotes cell proliferation while reduces cell apoptosis in epithelial ovarian cancer. | Cancer Biomark | 2.859 | NA |
16 | cPWWP2A-miR-579轴的失调介导地塞米松诱导的人成骨细胞中的细胞毒性。 | Dysregulation of cPWWP2A-miR-579 axis mediates dexamethasone-induced cytotoxicity in human osteoblasts. | Biochem Biophys Res Commun | 2.705 | 南通大学第二附属医院 |
17 | Circ-IGF1R通过激活PI3K / AKT途径促HCC细胞增殖和抗凋亡作用。 | Circ-IGF1R has pro-proliferative and anti-apoptotic effects in HCC by activating the PI3K/AKT pathway. | Gene | 2.638 | 第三军医大学大坪医院 |
18 | 在氧-葡萄糖剥夺/恢复后脑微血管内皮细胞中表达的新型环状RNA。 | Novel circular RNAs expressed in brain microvascular endothelial cells after oxygen-glucose deprivation/recovery. | Neural Regen Res | 2.472 | 复旦大学华山医院等 |