欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献18篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。

1、综述:环状RNA生物形成和生物学功能特征

论文标题:The biogenesis, biology and characterization of circular RNAs.

期刊:Nat Rev Genet 影响因子:43.704

通讯作者:Thomas B.Hansen和 Jørgen Kjems(丹麦奥尔胡斯大学)

该综述文章是由2013年在nature杂志上最早发表环状RNA——ciRS-7通过吸附miR-7发挥生物学功能的文章的作者Thomas B.Hansen团队最新发表。该综述文章非常系统全面地总结了近年来circRNA研究领域的最新进展、从circRNA生物学形成机制到circRNA分子功能,比如circRNA通过类似海绵的作用吸附miRNA或蛋白质调控蛋白功能,circRNA自身翻译成蛋白质发挥重要生物学功能。此外,circRNA与糖尿病,神经障碍,心血管疾病和癌症等疾病密切相关,表明circRNA与人类疾病发生发展密切相关并在其中扮演重要功能角色。同时文章也系统介绍了用于鉴定circRNA功能的各类技术特点和面临的挑战。虽然circRNA转录本环状特性使其检测、定量和功能表征检测面临困难,但高通量测序和circRNA特定计算方法推动了circRNA鉴定方法的发展,并涌现了一系列的新颖的技术,表明circRNA领域还有很多研究空白需要填补。通过细读该综述文章,相信您对circRNA研究领域会有一个全面细致的了解。

表注:circRNA检测和定量方法的优缺点对比表

2、CircMYBL2通过招募PTBP1调节FLT3翻译以促进FLT3-ITD AML进展。

论文标题:CircMYBL2, a circRNA from MYBL2, Regulates FLT3 Translation by Recruiting PTBP1 to Promote FLT3-ITD AML Progression.

期刊:Blood 影响因子:16.562

通讯作者:陈月琴(中山大学)

FLT3基因的内部串联重复(internal tandem duplication,ITD)突变在急性白血病AML中占比30%以上,且患者预后较差。因此FLT3癌基因是AML重要的治疗靶点,特异性靶向FLT3激酶的抑制剂可诱导完全缓解AML;然而,由于FLT3中的继发性突变使其获得性抗性,导致AML复发,研究针对FLT3-ITD突变的新策略具有重要临床意义。最近的研究报道,环状RNA(circRNA)的异常形成是生物肿瘤发生相关机制和潜在的治疗靶标。在该文中,研究者发现来自细胞周期检查点基因MYBL2来源的circRNA——circMYBL2。在具有FLT3-ITD突变的AML患者中CircMYBL2比在没有FLT3-ITD突变的患者中表达水平更高。进一步功能研究发现,特异性地c敲低ircMYBL2可抑制FLT3-ITD AML细胞增殖和促进细胞的分化。有趣的是, circMYBL2依赖FLT3-ITD信号通路激活显著影响突变体FLT3激酶的蛋白质水平。机制上,circMYBL2通过增加PTBP1与FLT3 mRNA的结合来增强FLT3激酶的翻译效率。此外,circMYBL2敲低后,FLT3激酶表达显著降低,随后其下游途径失活。最终导致FLT3-ITD阳性细胞的抑制剂抗性降低,进而细胞活性下降。该文首次揭示在FLT3-ITD AML中通过调控FLT3激酶水平的特异性circRNA——circMYBL2,表明circMYBL2可能是FLT3-ITD AML的潜在治疗靶点。

3、环状RNA circRNA_000203通过抑制miR26b-5p和miR-140-3p与Gata4的结合而加重心脏肥大。

论文标题:Circular RNA circRNA_000203 aggravates cardiac hypertrophy via suppressing miR26b-5p and miR-140-3p binding to Gata4.

期刊:Cardiovasc Res 影响因子:7.014

通讯作者:单志新(南方医科大学,广东省人民医院)

该研究探讨了circRNA_000203对心肌肥厚的影响及其可能的机制。实验结果发现CircRNA_000203在Ang-II注入的小鼠心肌中和在Ang-II处理的新生小鼠心室心肌细胞(NMVC)的细胞质中上调。circRNA_000203的过表达增强NMVC的细胞大小和心房利钠肽(ANP)和β-肌球蛋白重链(MHC)和表达。在体内实验中,在Ang-II输注的心肌特异性circRNA_000203转基因小鼠(Tg-circ203)中心脏功能受损并且心脏肥大加剧。机制实验结果,研究者发现circRNA_000203可以在NMVCs中特异性地吸附miR-26b-5p和miR-140-3p。双荧光素酶报告基因检测显示miR-26b-5p和miR-140-3p可与Gata4基因的3’UTR相互作用,circRNA_000203可阻断上述相互作用。另外,Gata4表达在NMVC中被miR-26b-5p和miR-140-3p模拟物转录抑制,但在体外和体内过表达circRNA_000203后Gata4表达得以恢复。功能上,Gata4 siRNA可逆转Ang-II诱导的NMVCs的肥大性生长,并消除circRNA_000203在NMVCs中的促肥大作用。此外,实验结果证明NF-κB信号介导暴露于Ang-II处理的NMVCs中circRNA_000203的上调。

图注:circRNA_000203通过吸附miR26b-5p和miR-140-3p后抑制Gata4的表达,进而加重心脏肥大的作用机制示意图。

参考文献列表

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 综述:环状RNA生物形成和生物学功能特征 The biogenesis, biology and characterization of circular RNAs. Nat Rev Genet 43.704 丹麦奥尔胡斯大学
2 CircMYBL2通过招募PTBP1调节FLT3翻译以促进FLT3-ITD AML进展。 CircMYBL2, a circRNA from MYBL2, Regulates FLT3 Translation by Recruiting PTBP1 to Promote FLT3-ITD AML Progression. Blood 16.562 中山大学
3 环状RNA circRNA_000203通过抑制miR26b-5p和miR-140-3p与Gata4的结合而加重心脏肥大。 Circular RNA circRNA_000203 aggravates cardiac hypertrophy via suppressing miR26b-5p and miR-140-3p binding to Gata4. Cardiovasc Res 7.014 南方医科大学
4 环状RNA circSCAF11通过miR-421 / SP1 / VEGFA轴加速胶质瘤肿瘤发生。 Circular RNA circSCAF11 Accelerates the Glioma Tumorigenesis through the miR-421/SP1/VEGFA Axis. Mol Ther Nucleic Acids 5.919 第四军医大学唐都医院等
5 一种新型环状RNA通过作为竞争性内源RNA介导糖尿病性心肌病的糖尿病。 A Novel Circular RNA Mediates Pyroptosis of Diabetic Cardiomyopathy by Functioning as a Competing Endogenous RNA. Mol Ther Nucleic Acids 5.919 哈尔滨医科大学
6 环状RNA circ-ITCH通过调节miR-22充当骨肉瘤中的肿瘤抑制剂。 The circular RNA circ-ITCH acts as a tumour suppressor in osteosarcoma via regulating miR-22. Artif Cells Nanomed Biotechnol 4.462 青岛大学附属医院
7 前列腺癌中沉默环状RNA circZNF609通过上调的microRNA-186-5p来抑制癌细胞生长,迁移和侵袭。 Silencing circular RNA circZNF609 restrains growth, migration and invasion by up-regulating microRNA-186-5p in prostate cancer. Artif Cells Nanomed Biotechnol 4.462 哈尔滨医科大学附属第一医院
8 神经发育中的表观遗传学:环状RNA的新兴作用。 Epigenetics in Neurodevelopment: Emerging Role of Circular RNA. Front Cell Neurosci 3.9 中南大学附属肿瘤医院
9 慢性脑缺血大鼠白质损伤与神经元死亡及全转录组分析的综合评价。 Comprehensive Evaluation of White Matter Damage and Neuron Death and Whole-Transcriptome Analysis of Rats With Chronic Cerebral Hypoperfusion. Front Cell Neurosci 3.9 暨南大学附属第一医院
10 整合转录组和生物信息学分析揭示与槲皮素诱导的HCT-116细胞凋亡相关的调节途径。 Integrated Whole Transcriptome Profiling and Bioinformatics Analysis for Revealing Regulatory Pathways Associated With Quercetin-Induced Apoptosis in HCT-116 Cells. Front Pharmacol 3.845 中南大学湘雅医院
11 水稻光温敏核不育系武乡S中,环状RNA谱分析揭示了参与育性转换的circRNA。 Circular RNA profiling of the rice photo-thermosensitive genic male sterile line Wuxiang S reveals circRNA involved in the fertility transition. BMC Plant Biol 3.67 武汉大学生命科学学院
12 与AGA相比,来自SGA的母体和新生儿脐带血浆中差异表达的环状RNA。 Differentially expressed circular RNAs in maternal and neonatal umbilical cord plasma from SGA compared with AGA. J Cell Biochem 3.448 北京大学第三医院
13 CircRNA LRP6通过负调节KLF2和APC水平促进骨肉瘤的发展 CircRNA LRP6 promotes the development of osteosarcoma via negatively regulating KLF2 and APC levels Am J Transl Res 3.266 南京医科大学附属南京第一医院
14 基于局部约束线性编码预测人类疾病相关的circRNA。 Predicting human disease-associated circRNAs based on locality-constrained linear coding. Genomics 3.16 沈阳航空航天大学
15 环状RNA ABCB10与晚期上皮性卵巢癌临床病理学特征和不良预后相关,并促进癌细胞增殖,同时减少细胞凋亡。 Circular RNA ABCB10 correlates with advanced clinicopathological features and unfavorable survival, and promotes cell proliferation while reduces cell apoptosis in epithelial ovarian cancer. Cancer Biomark 2.859 NA
16 cPWWP2A-miR-579轴的失调介导地塞米松诱导的人成骨细胞中的细胞毒性。 Dysregulation of cPWWP2A-miR-579 axis mediates dexamethasone-induced cytotoxicity in human osteoblasts. Biochem Biophys Res Commun 2.705 南通大学第二附属医院
17 Circ-IGF1R通过激活PI3K / AKT途径促HCC细胞增殖和抗凋亡作用。 Circ-IGF1R has pro-proliferative and anti-apoptotic effects in HCC by activating the PI3K/AKT pathway. Gene 2.638 第三军医大学大坪医院
18 在氧-葡萄糖剥夺/恢复后脑微血管内皮细胞中表达的新型环状RNA。 Novel circular RNAs expressed in brain microvascular endothelial cells after oxygen-glucose deprivation/recovery. Neural Regen Res 2.472 复旦大学华山医院等

 

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