欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献22篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。
- circOSBPL10鉴定为胃癌中的致癌因子和预后标志物的研究
论文标题:Circular RNA profile identifies circOSBPL10 as an oncogenic factor and prognostic marker in gastric cancer
期刊:Oncogene 影响因子:6.634
通讯作者:徐泽宽教授(南京医科大学第一附属医院)
胃癌根治性切除术后的预后仍然不能令人满意,因此,寻找新的可替代分子和遗传靶标的治疗方法的发展至关重要。环状RNA(circRNA)作为新发现的分子,在非编码RNA调控网络中具有关键作用,已被确定为各种癌症的关键调节因子。该研究中,研究者首先通过circRNA新一代测序分析,筛选到胃癌组织中高表达的环状RNA分子——hsa_circ_0008549,来源于OSBPL10基因并将其命名为circOSBPL10。通过定量RT-PCR鉴定circOSBPL10的表达在GC组织中上调,并且circOSBPL10的沉默在多个实验中显着抑制GC细胞生长,迁移和侵袭。我们进一步证实miR-136-5p是使用RNA下拉和荧光素酶报告基因测定的circOSBPL10的下游靶标。拯救实验证实,circOSBPL10通过circOSBPL10-miR-136-5p-WNT2轴调节GC细胞中的生物学功能。体内实验表明,circOSBPL10促进小鼠的肿瘤生长和转移。此外,观察到circOSBPL10的水平是GC患者的总体存活和无病生存的预后标志物。总之,我们的研究结果表明circOSBPL10可能作为GC中新的增殖因子和预后标志物。
图注:RNA-seq和RT-PCR筛选鉴定到circOSBPL10在胃癌组织和细胞中显著上调。
- 在去势抵抗性前列腺癌中环状RNA增加了雄激素受体亚型多样性
论文标题:Circular RNAs add diversity to androgen receptor isoform repertoire in castration-resistant prostate cancer
期刊:Oncogene 影响因子:6.634
通讯作者: Flemington EK和 Dong Y(杜兰大学医学院)
环状RNA(circRNA)的表达失调与各种人类癌症相关,但人们对转移性去势抵抗性前列腺癌(前列腺癌高死亡率的主要原因)中的circRNA表征仍然有限。该研究中,研究者通过分析外显子组捕获RNA-seq数据集和来自患者的异种移植物(PDX)和细胞模型的ribodepletion-seq和RNase R-seq测序数据,鉴定了13个关键的来自前列腺癌驱动基因-雄激素受体(AR)的circRNA分子。最终验证表达最丰富的前四个circRNAs且临床相关的AR circRNA。这些AR circRNA的表达特异性地在PDX的去势抗性进展期间上调。另外,在临床样品和PDX中AR circRNA的表达水平与线性AR转录物(AR和AR变体)的水平强烈相关,表明存在潜在的转录调控机制。在细胞水平,雄激素抑制了这些AR circRNA和线性AR转录物的表达,并且抑制能力因雄激素抵抗而减弱。使用核/细胞质分离PCR和RNA原位杂交实验测定,发现这些AR circRNA主要定位在细胞质,表明其在细胞质中发挥功能。该研究,首次对AR基因产生的circRNA进行了全面的表征。与线性AR转录物相比AR circRNA耐受RNAaseR酶抗性,具备在患者血浆中检测AR circRNA的可能性,因此,这些AR circRNA可以作为AR/AR-亚型表达和去势抗性前列腺癌进展的新型标志物。
图注:高通量测序实验筛选到AR相关circRNA分子
- circKDM4C通过调节乳腺癌中的miR-548p/PBLD轴抑制肿瘤进展并减弱阿霉素的耐药性论文标题:circKDM4C suppresses tumor progression and attenuates doxorubicin resistance by regulating miR-548p/PBLD axis in breast cancer
期刊:Oncogene 影响因子:6.634
通讯作者:杨其峰教授(山东大学齐鲁医院乳腺外科)
越来越多的证据表明环状RNA(circRNAs)在癌症发展中起着关键作用。然而,只有少数circRNA已通过实验验证和功能注释。在这项研究中,研究者使用circRNA芯片测定筛选到一种新的circRNA——circKDM4C,circKDM4C在具有转移的乳腺癌组织中下调。此外,研究者发现低表达的circKDM4C与乳腺癌预后不良和转移相关。体外体内功能研究结果表明circKDM4C可显著抑制乳腺癌增殖、转移和阿霉素抗性。分子机制研究中,研究者利用双荧光素酶和AGO2 RNA免疫沉淀实验鉴定到circKDM4C可作为miR-548p海绵。miR-548p在乳腺癌中起到抑癌基因的作用,且miR-548p可直接靶向结合PBLD。此外,乳腺癌细胞中miR-548p过表达能够逆转减弱circKDM4C诱导的恶性表型和PBLD表达的升高。该研究结果表明circKDM4C可作为乳腺癌预后生物潜在标志物,circKDM4C/miR-548p/PBLD信号轴可能是靶向治疗乳腺癌的有希望的靶标。
图注:circKDM4C表达水平在乳腺癌组织中显著下调。
参考文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | circOSBPL10鉴定为胃癌中的致癌因子和预后标志物的研究 | Circular RNA profile identifies circOSBPL10 as an oncogenic factor and prognostic marker in gastric cancer | Oncogene | 6.634 | 南京医科大学第一附属医院 |
2 | 在去势抵抗性前列腺癌中环状RNA增加了雄激素受体亚型多样性 | Circular RNAs add diversity to androgen receptor isoform repertoire in castration-resistant prostate cancer | Oncogene | 6.634 | 杜兰大学医学院 |
3 | circKDM4C通过调节乳腺癌中的miR-548p/PBLD轴抑制肿瘤进展并减弱阿霉素的耐药性 | circKDM4C suppresses tumor progression and attenuates doxorubicin resistance by regulating miR-548p/PBLD axis in breast cancer | Oncogene | 6.634 | 山东大学齐鲁医院 |
4 | 环状RNA PRKCI通过抑制microRNA-545促进胶质瘤细胞进展 | Circular RNA PRKCI promotes glioma cell progression by inhibiting microRNA-545 | Cell Death Dis | 5.959 | 温州医科大学附属第一医院 |
5 | 综述:环状RNA调节肌生成 | Circular RNA Regulation of Myogenesis | Cells | 5.656 | 信阳师范学院 |
6 | circ-Ankib1调节周围神经损伤后的施万细胞增殖 | A Schwann cell-enriched circular RNA circ-Ankib1 regulates Schwann cell proliferation following peripheral nerve injury | FASEB J | 5.391 | 南通大学附属医院 |
7 | 脓毒症急性肺损伤小鼠肺巨噬细胞环RNA表达特征 | Characteristics of circular RNA expression of pulmonary macrophages in mice with sepsis-induced acute lung injury | J Cell Mol Med | 4.658 | 上海东方医院 |
8 | 环状RNA ZFR通过充当miR-101-3p海绵来增强CUL4B表达,从而加速非小细胞肺癌的进展 | Circular RNA ZFR accelerates non-small cell lung cancer progression by acting as a miR-101-3p sponge to enhance CUL4B expression | Artif Cells Nanomed Biotechnol | 4.462 | 河南大学 |
9 | 综述:人类癌症的环状RNA生物形成,机制和功能 | Circular RNAs: Biogenesis, Mechanism, and Function in Human Cancers | Int J Mol Sci | 4.183 | 汕头大学医学院 |
10 | 研究circRNA蛋白编码功能的通用方法 | A universal approach to investigate circRNA protein coding function | Sci Rep | 4.011 | 德国明斯特大学等 |
11 | 全基因组鉴定花生中的环状RNA(Arachis hypogaea L.) | Genome-wide identification of circular RNAs in peanut (Arachis hypogaea L) | BMC Genomics | 3.501 | 河南农业大学 |
12 | 环状RNA-CDC45过表达吸附miR-516b和miR-527促进神经胶质瘤细胞进展并预测不良预后 | Overexpression of circular RNA circ-CDC45 facilitates glioma cell progression by sponging miR-516b and miR-527 and predicts an adverse prognosis | J Cell Biochem | 3.448 | 哈尔滨医科大学附属第二医院 |
13 | 环状RNA MYLK通过海绵吸附miR-362-3p增加Rab23表达来促进肝细胞癌的进展 | Circular RNA MYLK promotes hepatocellular carcinoma progression by increasing Rab23 expression by sponging miR-362-3p | Cancer Cell Int | 3.439 | 郑州大学第一附属医院 |
14 | CircABCC2通过诱导MiR-665调节肝细胞癌的进展 | CircABCC2 Regulates Hepatocellular Cancer Progression by Decoying MiR-665 | J Cancer | 3.182 | 中南大学湘雅医院 |
15 | Hsa_circ_0003998可用作肝细胞癌诊断和预后的新生物标志物 | Hsa_circ_0003998 may be used as a new biomarker for the diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma | Onco Targets Ther | 3.046 | 第二军医大学长海医院 |
16 | 环状RNA hsa_circRNA_102958通过miR-585/CDC25B轴促进结肠直肠癌的肿瘤发生 | Circular RNA hsa_circRNA_102958 promotes tumorigenesis of colorectal cancer via miR-585/CDC25B axis | Cancer Manag Res | 2.243 | 温州医科大学附属第一医院 |
17 | 环状RNA ITCH下调GLUT1并抑制黑素瘤中的葡萄糖摄取以抑制癌细胞增殖 | Circular RNA ITCH downregulates GLUT1 and suppresses glucose uptake in melanoma to inhibit cancer cell proliferation | J Dermatolog Treat | 2.112 | 第二军医大学长征医院 |
18 | CircPAN3通过调节自噬促进急性髓性白血病的耐药性 | CircPAN3 contributes to drug resistance in acute myeloid leukemia through regulation of autophagy | Leuk Res | 2.066 | 福建省立医院 |
19 | circZNF609的表达在结肠直肠癌组织中下调,并通过上调p53促进结肠直肠癌细胞的凋亡 | Expression of circZNF609 is Down-Regulated in Colorectal Cancer Tissue and Promotes Apoptosis in Colorectal Cancer Cells by Upregulating p53 | Med Sci Monit | 1.98 | 河北医科大学第四医院 |
20 | 比较转录组学识别参与绵羊(Ovis aries)繁殖的关键下丘脑环状RNA | Comparative Transcriptomics Identify Key Hypothalamic Circular RNAs that Participate in Sheep (Ovis aries) Reproduction | Animals (Basel) | 1.832 | 中国农业科学院 |
21 | TMPRSS3通过对circ-Slc4a2,miR-182和AKT级联的调节来调节HEI-OC1细胞的细胞活力和凋亡过程 | TMPRSS3 regulates cell viability and apoptosis processes of HEI-OC1 cells via regulation on circ-Slc4a2, miR-182, and AKT cascade | J Gene Med | 1.561 | 中南大学湘雅二医院 |
22 | 一种用于basecope TM原位杂交的基于碱性磷酸酶的显色和荧光检测方法 | Alkaline phosphatase-based chromogenic and fluorescence detection method for basescope™ In Situ hybridization | J Histotechnol | 0.333 | 美国斯托尔斯医学研究所 |