欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献22篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。

  1. circOSBPL10鉴定为胃癌中的致癌因子和预后标志物的研究

论文标题:Circular RNA profile identifies circOSBPL10 as an oncogenic factor and prognostic marker in gastric cancer

期刊:Oncogene 影响因子:6.634

通讯作者:徐泽宽教授(南京医科大学第一附属医院)

胃癌根治性切除术后的预后仍然不能令人满意,因此,寻找新的可替代分子和遗传靶标的治疗方法的发展至关重要。环状RNA(circRNA)作为新发现的分子,在非编码RNA调控网络中具有关键作用,已被确定为各种癌症的关键调节因子。该研究中,研究者首先通过circRNA新一代测序分析,筛选到胃癌组织中高表达的环状RNA分子——hsa_circ_0008549,来源于OSBPL10基因并将其命名为circOSBPL10。通过定量RT-PCR鉴定circOSBPL10的表达在GC组织中上调,并且circOSBPL10的沉默在多个实验中显着抑制GC细胞生长,迁移和侵袭。我们进一步证实miR-136-5p是使用RNA下拉和荧光素酶报告基因测定的circOSBPL10的下游靶标。拯救实验证实,circOSBPL10通过circOSBPL10-miR-136-5p-WNT2轴调节GC细胞中的生物学功能。体内实验表明,circOSBPL10促进小鼠的肿瘤生长和转移。此外,观察到circOSBPL10的水平是GC患者的总体存活和无病生存的预后标志物。总之,我们的研究结果表明circOSBPL10可能作为GC中新的增殖因子和预后标志物。

图注:RNA-seq和RT-PCR筛选鉴定到circOSBPL10在胃癌组织和细胞中显著上调。

  1. 在去势抵抗性前列腺癌中环状RNA增加了雄激素受体亚型多样性

论文标题:Circular RNAs add diversity to androgen receptor isoform repertoire in castration-resistant prostate cancer

期刊:Oncogene 影响因子:6.634

通讯作者: Flemington EK和 Dong Y(杜兰大学医学院)

环状RNA(circRNA)的表达失调与各种人类癌症相关,但人们对转移性去势抵抗性前列腺癌(前列腺癌高死亡率的主要原因)中的circRNA表征仍然有限。该研究中,研究者通过分析外显子组捕获RNA-seq数据集和来自患者的异种移植物(PDX)和细胞模型的ribodepletion-seq和RNase R-seq测序数据,鉴定了13个关键的来自前列腺癌驱动基因-雄激素受体(AR)的circRNA分子。最终验证表达最丰富的前四个circRNAs且临床相关的AR circRNA。这些AR circRNA的表达特异性地在PDX的去势抗性进展期间上调。另外,在临床样品和PDX中AR circRNA的表达水平与线性AR转录物(AR和AR变体)的水平强烈相关,表明存在潜在的转录调控机制。在细胞水平,雄激素抑制了这些AR circRNA和线性AR转录物的表达,并且抑制能力因雄激素抵抗而减弱。使用核/细胞质分离PCR和RNA原位杂交实验测定,发现这些AR circRNA主要定位在细胞质,表明其在细胞质中发挥功能。该研究,首次对AR基因产生的circRNA进行了全面的表征。与线性AR转录物相比AR circRNA耐受RNAaseR酶抗性,具备在患者血浆中检测AR circRNA的可能性,因此,这些AR circRNA可以作为AR/AR-亚型表达和去势抗性前列腺癌进展的新型标志物。

图注:高通量测序实验筛选到AR相关circRNA分子

  1. circKDM4C通过调节乳腺癌中的miR-548p/PBLD轴抑制肿瘤进展并减弱阿霉素的耐药性论文标题:circKDM4C suppresses tumor progression and attenuates doxorubicin resistance by regulating miR-548p/PBLD axis in breast cancer

期刊:Oncogene 影响因子:6.634

通讯作者:杨其峰教授(山东大学齐鲁医院乳腺外科)

越来越多的证据表明环状RNA(circRNAs)在癌症发展中起着关键作用。然而,只有少数circRNA已通过实验验证和功能注释。在这项研究中,研究者使用circRNA芯片测定筛选到一种新的circRNA——circKDM4C,circKDM4C在具有转移的乳腺癌组织中下调。此外,研究者发现低表达的circKDM4C与乳腺癌预后不良和转移相关。体外体内功能研究结果表明circKDM4C可显著抑制乳腺癌增殖、转移和阿霉素抗性。分子机制研究中,研究者利用双荧光素酶和AGO2 RNA免疫沉淀实验鉴定到circKDM4C可作为miR-548p海绵。miR-548p在乳腺癌中起到抑癌基因的作用,且miR-548p可直接靶向结合PBLD。此外,乳腺癌细胞中miR-548p过表达能够逆转减弱circKDM4C诱导的恶性表型和PBLD表达的升高。该研究结果表明circKDM4C可作为乳腺癌预后生物潜在标志物,circKDM4C/miR-548p/PBLD信号轴可能是靶向治疗乳腺癌的有希望的靶标。

图注:circKDM4C表达水平在乳腺癌组织中显著下调。

参考文献列表

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 circOSBPL10鉴定为胃癌中的致癌因子和预后标志物的研究 Circular RNA profile identifies circOSBPL10 as an oncogenic factor and prognostic marker in gastric cancer Oncogene 6.634 南京医科大学第一附属医院
2 在去势抵抗性前列腺癌中环状RNA增加了雄激素受体亚型多样性 Circular RNAs add diversity to androgen receptor isoform repertoire in castration-resistant prostate cancer Oncogene 6.634 杜兰大学医学院
3 circKDM4C通过调节乳腺癌中的miR-548p/PBLD轴抑制肿瘤进展并减弱阿霉素的耐药性 circKDM4C suppresses tumor progression and attenuates doxorubicin resistance by regulating miR-548p/PBLD axis in breast cancer Oncogene 6.634 山东大学齐鲁医院
4 环状RNA PRKCI通过抑制microRNA-545促进胶质瘤细胞进展 Circular RNA PRKCI promotes glioma cell progression by inhibiting microRNA-545 Cell Death Dis 5.959 温州医科大学附属第一医院
5 综述:环状RNA调节肌生成 Circular RNA Regulation of Myogenesis Cells 5.656 信阳师范学院
6 circ-Ankib1调节周围神经损伤后的施万细胞增殖 A Schwann cell-enriched circular RNA circ-Ankib1 regulates Schwann cell proliferation following peripheral nerve injury FASEB J 5.391 南通大学附属医院
7 脓毒症急性肺损伤小鼠肺巨噬细胞环RNA表达特征 Characteristics of circular RNA expression of pulmonary macrophages in mice with sepsis-induced acute lung injury J Cell Mol Med 4.658 上海东方医院
8 环状RNA ZFR通过充当miR-101-3p海绵来增强CUL4B表达,从而加速非小细胞肺癌的进展 Circular RNA ZFR accelerates non-small cell lung cancer progression by acting as a miR-101-3p sponge to enhance CUL4B expression Artif Cells Nanomed Biotechnol 4.462 河南大学
9 综述:人类癌症的环状RNA生物形成,机制和功能 Circular RNAs: Biogenesis, Mechanism, and Function in Human Cancers Int J Mol Sci 4.183 汕头大学医学院
10 研究circRNA蛋白编码功能的通用方法 A universal approach to investigate circRNA protein coding function Sci Rep 4.011 德国明斯特大学等
11 全基因组鉴定花生中的环状RNA(Arachis hypogaea L.) Genome-wide identification of circular RNAs in peanut (Arachis hypogaea L) BMC Genomics 3.501 河南农业大学
12 环状RNA-CDC45过表达吸附miR-516b和miR-527促进神经胶质瘤细胞进展并预测不良预后 Overexpression of circular RNA circ-CDC45 facilitates glioma cell progression by sponging miR-516b and miR-527 and predicts an adverse prognosis J Cell Biochem 3.448 哈尔滨医科大学附属第二医院
13 环状RNA MYLK通过海绵吸附miR-362-3p增加Rab23表达来促进肝细胞癌的进展 Circular RNA MYLK promotes hepatocellular carcinoma progression by increasing Rab23 expression by sponging miR-362-3p Cancer Cell Int 3.439 郑州大学第一附属医院
14 CircABCC2通过诱导MiR-665调节肝细胞癌的进展 CircABCC2 Regulates Hepatocellular Cancer Progression by Decoying MiR-665 J Cancer 3.182 中南大学湘雅医院
15 Hsa_circ_0003998可用作肝细胞癌诊断和预后的新生物标志物 Hsa_circ_0003998 may be used as a new biomarker for the diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma Onco Targets Ther 3.046 第二军医大学长海医院
16 环状RNA hsa_circRNA_102958通过miR-585/CDC25B轴促进结肠直肠癌的肿瘤发生 Circular RNA hsa_circRNA_102958 promotes tumorigenesis of colorectal cancer via miR-585/CDC25B axis Cancer Manag Res 2.243 温州医科大学附属第一医院
17 环状RNA ITCH下调GLUT1并抑制黑素瘤中的葡萄糖摄取以抑制癌细胞增殖 Circular RNA ITCH downregulates GLUT1 and suppresses glucose uptake in melanoma to inhibit cancer cell proliferation J Dermatolog Treat 2.112 第二军医大学长征医院
18 CircPAN3通过调节自噬促进急性髓性白血病的耐药性 CircPAN3 contributes to drug resistance in acute myeloid leukemia through regulation of autophagy Leuk Res 2.066 福建省立医院
19 circZNF609的表达在结肠直肠癌组织中下调,并通过上调p53促进结肠直肠癌细胞的凋亡 Expression of circZNF609 is Down-Regulated in Colorectal Cancer Tissue and Promotes Apoptosis in Colorectal Cancer Cells by Upregulating p53 Med Sci Monit 1.98 河北医科大学第四医院
20 比较转录组学识别参与绵羊(Ovis aries)繁殖的关键下丘脑环状RNA Comparative Transcriptomics Identify Key Hypothalamic Circular RNAs that Participate in Sheep (Ovis aries) Reproduction Animals (Basel) 1.832 中国农业科学院
21 TMPRSS3通过对circ-Slc4a2,miR-182和AKT级联的调节来调节HEI-OC1细胞的细胞活力和凋亡过程 TMPRSS3 regulates cell viability and apoptosis processes of HEI-OC1 cells via regulation on circ-Slc4a2, miR-182, and AKT cascade J Gene Med 1.561 中南大学湘雅二医院
22 一种用于basecope TM原位杂交的基于碱性磷酸酶的显色和荧光检测方法 Alkaline phosphatase-based chromogenic and fluorescence detection method for basescope™ In Situ hybridization J Histotechnol 0.333 美国斯托尔斯医学研究所

 

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