欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献23篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。

  1. 环状RNA CircFndc3b通过FUS/VEGF-A轴调节心肌梗死后的心脏修复。

标题:Circular RNA CircFndc3b modulates cardiac repair after myocardial infarction via FUS/VEGF-A axis

杂志:Nat Commun

影响因子:11.878

通讯作者:Walter J. Koch和Raj Kishore(坦普尔大学Lewis Katz医学院)

许多蛋白质编码基因的外显子反向拼接可产生circRNA,但circRNA在心血管健康和疾病状态中的作用仍然未知。该研究中,作者报告鉴定了circRNA转录物在心肌梗死后(MI)小鼠心脏中差异表达情况,其中包括在心肌梗死后心脏中显着下调的circFndc3b。值得注意的是,在缺血性心肌病患者的心脏组织中,人circFndc3b直向同源物也显著下调。circFndc3b在心脏内皮细胞中的过表达增加了VEGF-A(血管内皮生长因子-A)的表达,并增强了它们的血管生成活性,减少了心肌细胞和内皮细胞的凋亡。MI后心脏中,利用腺相关病毒9介导的circFndc3b过度表达可减少心肌细胞凋亡,增强新血管形成并改善左心室功能。从分子机制上,circFndc3b与RNA结合蛋白FUS相互作用以调节VEGF的表达和信号传导。这些发现突出了circRNA在心脏修复中的生理作用,并表明circFndc3b表达的调节可能代表了MI后促进心脏功能和重塑的重要潜在机制。

图注:circFndc3b介导心脏修复的潜在机制

  1. 综述:环状RNA在上皮到间质转化过程中的功能作用。

标题:Functional roles of circular RNAs during epithelial-to-mesenchymal transition.

杂志:Mol Cancer

影响因子:10.679

通讯作者:郑骏年 和 白津教授(徐州医科大学肿瘤研究所)

癌症已成为世界范围内的主要健康问题,导致人高死亡率。上皮向间质转化(EMT)诱导的肿瘤转移则是癌症患者死亡的主要原因。在EMT期间,上皮细胞失去其特性,例如细胞间粘附和细胞极性,以及细胞获得运动能力,迁移潜能和侵袭性,成为间充质干细胞。目前许多研究证据表明,环状RNA(circRNA)与肿瘤转移和患者预后密切相关。 在这篇综述中,作者简要讨论了circRNA的特征和功能,重点阐述了已报道的circRNA与EMT的相关研究,包括circRNA通过转录调控EMT进展的方式因素,与EMT相关的信号通路和其他机制。总结了EMT相关的circRNA在各种癌症中的应用的最新研究,为EMT相关的circRNA在靶向治疗中的应用提供了理论基础。

图注:circRNA在肿瘤转移中扮演重要角色,在EMT过程中,circRNA竞争性吸附miRNA会减弱miRNA对EMT相关靶基因的抑制作用,例如EMT-TF / E-cad,N-cad, vimentin(波形蛋白)和cdc42。 结果,上皮细胞丧失了细胞间粘附和细胞极性等特征,获得运动性,迁移潜力和侵袭性,成为间充质干细胞。 另外,EMT触发原发性肿瘤细胞进入循环系统或淋巴系统。 然后,循环的肿瘤细胞被转运到远处组织或器官通过EMT形成继发转移性肿瘤灶。 值得注意的是,在血清/尿液中检测到了外泌体分泌的circRNA,为癌症的诊断和治疗提供了一种新的策略。

  1. 肿瘤中ncRNA编码的肽或蛋白的功能及机制综述。

标题:ncRNA-Encoded Peptides or Proteins and Cancer.

杂志: Molecular Therapy

影响因子:8.402

通讯作者:晏光荣教授(广州医科大学附属第三医院)

非编码RNA(ncRNA)是一类独特的RNA转录本,已在真核生物基因组中得到广泛鉴定,并在许多癌症的发展中起关键作用。但是,全基因组翻译谱和核糖体谱的快速发展表明,ncRNA中的少量小开放阅读框(sORF)实际上具有编码肽或蛋白质潜能。例如:

由长链ncRNA [lncRNA]编码HOXB-AS3;

环状RNA [circRNA]编码的FBXW7-185aa,PINT-87aa和SHPRH-146aa;

由初级miRNA编码的miPEP-200a和miPEP-200b。

ncRNA编码的肽或蛋白质,通过对糖代谢的调节,上皮向间充质转化以及泛素化途径的影响,在癌症的发展和进程中起着至关重要的作用。在这篇综述中,作者详细总结了在癌症中由ncRNA编码的报道的肽或蛋白质,并探讨了这些肽或蛋白质在开发抗肿瘤药物以及鉴定相关治疗靶标和肿瘤生物标记物中的应用。

参考文献列表

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 环状RNA CircFndc3b通过FUS/VEGF-A轴调节心肌梗死后的心脏修复。 Circular RNA CircFndc3b modulates cardiac repair after myocardial infarction via FUS/VEGF-A axis. Nat Commun 11.878 坦普尔大学Lewis Katz医学院等
2 环状RNA在上皮到间质转化过程中的功能作用。 Functional roles of circular RNAs during epithelial-to-mesenchymal transition. Mol Cancer 10.679 徐州医科大学附属医院
3 ncRNA编码的肽或蛋白质与癌症。 ncRNA-Encoded Peptides or Proteins and Cancer. Mol Ther 8.402 广州医科大学附属第三医院
4 HOLMESv2:CRISPR-Cas12b辅助平台,用于核酸检测和DNA甲基化定量。 HOLMESv2: a CRISPR-Cas12b-assisted platform for nucleic acid detection and DNA methylation quantitation. ACS Synth Biol 5.571 上海师范大学
5 Interior环状RNA。 Interior circular RNA. RNA Biol 5.477 江汉大学等
6 GW182在circRNA降解作用中进化保守性作用 Defining an evolutionarily conserved role of GW182 in circular RNA degradation Cell Discov 4.6 重庆大学等
7 通过机器学习特征提取模型对环状RNA的生物形成机制进行分类。 Biogenesis mechanisms of circular RNA can be categorized through feature extraction of a machine learning model. Bioinformatics 4.531 加州大学
8 吗啡耐受的大鼠脊髓中的环状RNA表达谱和关键circRNA的筛选。 Circular RNA expression profile in the spinal cord of morphine tolerated rats and screen of putative key circRNAs. Mol Brain 4.051 中南大学湘雅医院
9 血浆hsa_circ_0027089是乙型肝炎病毒相关的肝细胞癌的诊断生物标志物。 Plasma hsa_circ_0027089 is a diagnostic biomarker for hepatitis B virus-related hepatocellular carcinoma. Carcinogenesis 4.004 复旦大学附属中山医院等
10 CRIP:使用基于密码子的编码和混合深度神经网络预测circRNA-RBP相互作用位点。 CRIP: predicting circRNA-RBP interaction sites using a codon-based encoding and hybrid deep neural networks. RNA 3.949 上海交通大学
11 Hsa_circ_0042666通过调节miR-223/TGFBR3轴在喉鳞状细胞癌中抑制增殖和侵袭。 Hsa_circ_0042666 inhibits proliferation and invasion via regulating miR-223/TGFBR3 axis in laryngeal squamous cell carcinoma. Biomed Pharmacother 3.743 洛阳市中心医院
12 circRNA的高通量测序揭示了尼日霉素在胰腺癌中的机制的新见解。 High-throughput sequencing of circRNAs reveals novel insights into mechanisms of nigericin in pancreatic cancer. BMC Genomics 3.501 南京医科大学附属苏州医院
13 环状RNA circ-LDLRAD3的下调通过miR-137-3p/PTN轴抑制胰腺癌的进展。 Downregulation of circular RNA circ-LDLRAD3 suppresses pancreatic cancer progression through miR-137-3p/PTN axis. Life Sci 3.448 河南科技大学第一附属医院
14 肝细胞癌中环状RNA,转化生长因子-β和长非编码RNA的分子机制。 Molecular mechanisms of circular RNAs, transforming growth factor-β, and long noncoding RNAs in hepatocellular carcinoma. Cancer Med 3.357 徐州医科大学
15 Circ_0015756通过microRNA-7依赖性的FAK抑制肝细胞癌促进增殖,侵袭和迁移。 Circ_0015756 promotes proliferation, invasion and migration by microRNA-7-dependent inhibition of FAK in hepatocellular carcinoma. Cell Cycle 3.259 中南大学湘雅医院
16 Circ-Foxo3与Foxo3基因正相关,可导致急性髓性白血病患者更好的预后。 Circ-Foxo3 is positively associated with the Foxo3 gene and leads to better prognosis of acute myeloid leukemia patients. BMC Cancer 2.933 江苏大学附属人民医院
17 EpCAM敲除小鼠肝脏组织中的环状RNA谱。 Circular RNA profile in liver tissue of EpCAM knockout mice. Int J Mol Med 2.928 中国科学院广州生物医药与健康研究院
18 CircRNA UBAP2通过吸附microRNA-144促进卵巢癌的发展。 CircRNA UBAP2 promotes the progression of ovarian cancer by sponging microRNA-144. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 潍坊市益都中心医院
19 人类巨细胞病毒pTRS1刺激不依赖帽的翻译。 Human cytomegalovirus pTRS1 stimulates cap-independent translation. Virology 2.657 北卡罗来纳大学教堂山分校
20 MSC衍生的基于外泌体的周围神经损伤治疗:一种新的治疗策略。 MSC-Derived Exosomes-Based Therapy for Peripheral Nerve Injury: A Novel Therapeutic Strategy. Biomed Res Int 2.197 河南科技大学
21 冠状动脉搭桥术后认知功能障碍患者血浆外泌体中circRNA_089763的异常表达。 Abnormal expression of circRNA_089763 in the plasma exosomes of patients with post‑operative cognitive dysfunction after coronary artery bypass grafting. Mol Med Rep 1.851 首都医科大学附属北京朝阳医院
22 外周血中hsa_circ_0032131水平作为骨关节炎的潜在诊断生物标志物的初步探索。 Preliminary Exploration of hsa_circ_0032131 Levels in Peripheral Blood as a Potential Diagnostic Biomarker of Osteoarthritis. Genet Test Mol Biomarkers 1.121 西安交通大学公共卫生学院
23 心力衰竭中心外膜脂肪组织中环状RNA的表达谱 Expression Profile of Circular RNAs in Epicardial Adipose Tissue in Heart Failure bioRxiv 2.353 首都医科大学附属北京朝阳医院

 

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