欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献17篇，下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。

  1. 综述：心脏和心血管系统中的环状RNA。

论文标题：Circles in the heart and cardiovascular system.

杂志：Cardiovasc Res

影响因子：7.014

通讯作者：Roger Sik-Yin Foo（新加坡国立大学心血管研究所）

该综述系统回顾了近年来circRNA在心脏和心血管系统中的研究。几十年来，心血管疾病（CVD）是世界范围内发病和死亡最大的疾病之一，是全球医疗保健支出的主要负担。 尽管经过多年努力的CVD研究已步入正轨，但CVD的诊断，管理和治疗仍然不足。 急需新颖的治疗和干预方法。 现在越来越多的报道提示许多circRNA是CVD发病机理中的重要调节分子。作者列举了已发表的与CVD疾病相关的circRNA分子列表，很多研究虽然发现了大量疾病状态下失调的circRNA分子，但具体的circRNA致病机理还需澄清，目前大部分研究还是聚焦在circRNA识别miRNA海绵方向，但基于circRNA序列全局性的miRNA作用位点生信预测结果并没有提供强有力的证据。因此这可能并不是circRNA的主要作用方式。此外circRNA与RBP互作，直接翻译成多肽也是重要的研究方向。高通量测序实验结果表明只有30%的circRNA在小鼠和大鼠中保守，10%的circRNA在人、小鼠和大鼠心脏中保守。因此在动物模型中针对这些保守的circRNA研究有利于阐明人类心脏疾病的作用机理。作者还重点提及了circRNA的一个少研究未开发的方向，circRNA的二级结构，circRNA的折叠方式对其功能可能有较大影响。最近一些研究表明：使用RNase V1裂解RNA的碱基配对区域并结合高通量测序方法，确定单链RNA形成完全配对或非规范配对的区域的RNA碱基配对基序（RNA motif），例如circRNA的RNA碱基配对基序可能指导理解RNA–RNA和RNA-蛋白质相互作用。circRNA的折叠对于其在细胞内源性功能也很重要，circRNA的错误折叠会导致疾病的发生。同时作者还指出，circRNA研究最有前途的前景之一是它作为CVD的循环生物标记。 迄今为止，大多数研究受限于样本量小，统计分析有限和缺乏独立的验证。 是否存在循环系统中的circRNA作为游离分子，与配体结合或包裹在细胞外囊泡中如外泌体，微泡和凋亡小体。还有很多其他有趣的领域值得去探索。

图注：CVD相关的circRNA

  1. 上调circRNA ARHGAP10通过调节miR-150-5p / GLUT-1轴可预测NSCLC的不良预后。

论文标题：Upregulated circRNA ARHGAP10 Predicts an Unfavorable Prognosis in NSCLC through Regulation of the miR-150-5p/GLUT-1 Axis.

杂志：Mol Ther Nucleic Acids 影响因子：5.919

通讯作者： chen yang（复旦大学附属华山医院泌尿科），刘建军（上海交通大学医学院附属仁济医院核医学科），黄钢（上海健康医学院院长）

该研究主要阐释了circARHGAP10在NSCLC（非小细胞肺癌）进展中的作用，之前的研究已观察到circARHGAP10在NSCLC组织和细胞系中均显著上调。荧光原位杂交（FISH）结果也显示circARHGAP10高表达且与NSCLC患者的不良预后相关。体外和体内实验均发现circARHGAP10的下调通过降低GLUT1的表达来抑制糖代谢。沉默circARHGAP10还可以通过靶向miR-150-5p / GLUT1轴来抑制NSCLC细胞增殖和转移，并得到荧光素酶报告基因检测结果证实。在敲除circARHGAP10后，GLUT1的过表达或miR-150-5p下调可恢复NSCLC细胞的增殖和转移。综上所述，这些发现表明circARHGAP10通过充当miR-150-5p海绵来促进GLUT1表达，进而抑制NSCLC进展。因此，circARHGAP10可能是NSCLC治疗的潜在靶标。

图注：NSCLC非小细胞肺癌中circRNA差异表达谱分析

  1. mRNA，miRNA，lncRNA和circRNA的串扰及其在肺纤维化中的调控模式。

论文标题：Crosstalk of mRNA, miRNA, lncRNA, and circRNA and Their Regulatory Pattern in Pulmonary Fibrosis.

杂志：Mol Ther Nucleic Acids 影响因子：5.919

通讯作者：宋晓冬副教授和吕长俊教授 （滨州医学院）

非编码RNA（ncRNA），例如microRNA（miRNA），长链ncRNA（lncRNA）和环状RNA（circRNA），是具有重要生物学功能的调控因子。因此，了解它们的相互间的串扰和调控模式可以为疾病治疗提供重要线索。在这项研究中，研究者通过博莱霉素诱导的小鼠肺纤维化模型，利用高通量测序方法，获得了差异表达的RNA转录本。在肺纤维化中有差异表达的585个mRNA，236个miRNA，272个lncRNA和74个circRNA，随后验证了4个miRNA，10个lncRNA和2个circRNA。进一步分析它们在染色体上的位置，长度变异，相互作用和宿主基因。研究者选择lnc949，circ949和circ057来探索它们间的详细的串扰和调控模式，通过使用RNA-FISH，双荧光素酶报告基因测定，实时细胞分析和拯救实验，共定位分析和RNA免疫沉淀这些方法进行研究。结果显示，三种ncRNA主要定位在细胞质中，其调控模式集中于转录后。lnc949影响肺纤维化功能取决于其宿主基因FKBP5。circ949，circ057和lnc865，lnc556形成了一个调控网络，可同时调节靶向STAT3磷酸化的miR-29b-2-5p。总的来说，不同的RNA可以相互串扰，以通过不同的调节方式调节肺纤维化。该研究为肺纤维化的治疗提示了新的方向。

图注：博莱霉素诱导的小鼠肺纤维化模型中circRNA差异表达谱

参考文献列表

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 心脏和心血管系统中的圆圈。 Circles in the heart and cardiovascular system. Cardiovasc Res 7.014 新加坡国立大学心血管研究所
2 上调circRNA ARHGAP10通过调节miR-150-5p / GLUT-1轴可预测NSCLC的不良预后。 Upregulated circRNA ARHGAP10 Predicts an Unfavorable Prognosis in NSCLC through Regulation of the miR-150-5p/GLUT-1 Axis. Mol Ther Nucleic Acids 5.919 上海仁济医院等
3 mRNA，miRNA，lncRNA和circRNA的串扰及其在肺纤维化中的调控模式。 Crosstalk of mRNA, miRNA, lncRNA, and circRNA and Their Regulatory Pattern in Pulmonary Fibrosis. Mol Ther Nucleic Acids 5.919 滨州医学院
4 卵母细胞和卵丘细胞中的环状RNA表达谱分析表明circARMC4对于猪卵母细胞的成熟至关重要。 Circular RNA profiling in the oocyte and cumulus cells reveals that circARMC4 is essential for porcine oocyte maturation. Aging (Albany NY) 5.515 安徽农业大学
5 用于在缺氧胁迫下检测人类癌细胞中环状RNA的组合计算管道。 A combined computational pipeline to detect circular RNAs in human cancer cells under hypoxic stress. J Mol Cell Biol 4.671 法兰克福歌德大学
6 环状RNA hsa_circ_0053277通过miR-2467-3p螯合作用上调基质金属肽酶14来促进结直肠癌的发展。 Circular RNA hsa_circ_0053277 promotes the development of colorectal cancer by upregulating matrix metallopeptidase 14 via miR-2467-3p sequestration. J Cell Physiol 4.522 哈尔滨医科大学附属第四医院
7 circ_0005576上调通过miR-153 / KIF20A轴促进宫颈癌的进展。 Upregulated circ_0005576 facilitates cervical cancer progression via the miR-153/KIF20A axis. Biomed Pharmacother 3.743 中山大学附属第一医院等
8 通过调节miR-7-5p /REGγ轴，CircRNA CDR1as的下调特异性地触发了小剂量的地球蛋白B诱导的胃癌细胞死亡。 Downregulation of CircRNA CDR1as specifically triggered low-dose Diosbulbin-B induced gastric cancer cell death by regulating miR-7-5p/REGγ axis. Biomed Pharmacother 3.743 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院
9 患有润滑障碍的妇女的阴道上皮组织中的环状RNA表达谱。 Circular RNA Expression Profiles in Vaginal Epithelial Tissue of Women With Lubrication Disorders. J Sex Med 3.649 南京医科大学附属妇产医院
10 CeRNA表达谱可鉴定胃肠道间质瘤中与KIT相关的circRNA-miRNA-mRNA网络。 CeRNA Expression Profiling Identifies KIT-Related circRNA-miRNA-mRNA Networks in Gastrointestinal Stromal Tumour. Front Genet 3.517 上海市公共卫生临床中心
11 环状RNA PIP5K1A通过抑制miR-1273a促进结肠癌的发展。 Circular RNA PIP5K1A promotes colon cancer development through inhibiting miR-1273a. World J Gastroenterol 3.411 湖北省肿瘤医院
12 热适应大鼠下丘脑的环状RNA表达谱分析和关键环状RNA的选择。 Circular RNA Expression Profiling and Selection of Key Circular RNAs in the Hypothalamus of Heat-Acclimated Rats. Front Physiol 3.201 天津环境医学与作业医学研究所
13 全面的环形RNA分析揭示了hsa_circ_0137606 / miR‑1231途径在膀胱癌进展中的调节作用。 Comprehensive circular RNA profiling reveals the regulatory role of the hsa_circ_0137606/miR‑1231 pathway in bladder cancer progression. Int J Mol Med 2.928 南京大学医学院
14 环状RNA PVT1 / miR-203 / HOXD3途径促进人类肝细胞癌的发展。 The circular RNA PVT1/miR-203/HOXD3 pathway promotes the progression of human hepatocellular carcinoma. Biol Open 1.962 第二军医大学长海医院
15 全面的表达谱和生物信息学分析显示，特发性膜性肾病患者外周血中特殊的环状RNA表达和潜在的可预测性。 Comprehensive expression profiles and bioinformatics analysis reveal special circular RNA expression and potential predictability in the peripheral blood of humans with idiopathic membranous nephropathy. Mol Med Rep 1.851 广西壮族自治区人民医院
16 环状RNA的生物发生，生物学功能及其在癌症中的分子诊断价值。 The biogenesis and biological functions of circular RNAs and their molecular diagnostic values in cancers. J Clin Lab Anal 1.728 宁波大学医学院
17 NZB / W F1狼疮性肾炎小鼠肾小球中环状RNA的微阵列表达和功能分析。 Microarray expression and functional analysis of circular RNAs in the glomeruli of NZB/W F1 mice with lupus nephritis. Exp Ther Med 1.448 中国医科大学附属第一医院

 

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