欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献22篇，下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。
- 人脑中环状RNA表达情况研究
标题：The Landscape of Circular RNA Expression in the Human Brain.
杂志：Biol Psychiatry
影响因子：11.501
通讯作者：Irina Voineagu（澳大利亚新南威尔士大学）
在该研究中，研究者主要针对近200个健康对照和自闭症病例的人脑组织样本中circRNA进行表达谱研究。最终鉴定到几百种全新circRNAs，且发现这些circRNA不是随机表达，具有主要表达模式的亚型。CircRNA表达在个体间的变异性不如大脑皮层和小脑之间的变异性明显。最后，研究者鉴定了自闭症样本中上调的circRNA共表达模块，从而为观察到的自闭症大脑中转录组变化增加了另一层复杂性。该研究为circRNA在大脑中的研究提供了一个全面的数据目录，并提供了免费网页工具查询浏览这些circRNA表达数据，为circRNA在大脑中的进一步深入研究提供了重要参考资源。（资源网址http://www.voineagulab.unsw.edu.au/circ_rna）。
图注：ZENBU基因组浏览器展示该文献中的circRNA表达数据，circRNA以线条形式呈现，红色代表表达值高，蓝色代表表达值偏低。
2、剪接因子衍生的环状RNA——circUHRF1通过反馈回路加速口腔鳞状细胞癌的发生
标题：Splicing factor derived circular RNA circUHRF1 accelerates oral squamous cell carcinoma tumorigenesis via feedback loop.
杂志：Cell Death And Differentiation
影响因子：8.086
通讯作者：武杰，Zihao Liu（天津医科大学口腔医学院）和王左敏（首都医科大学北京朝阳医院）
该研究主要在口腔鳞状细胞癌（OSCC）中，鉴定了新的circRNA——circUHRF1（hsa_circ_0002185）的生物形成机制和致癌作用。研究结果表明，circUHRF1在OSCC细胞和组织中明显上调，circUHRF1的高表达与OSCC患者的不良预后密切相关。体外体内功能研究结果显示，circUHRF1促进OSCC增殖，迁移，侵袭和上皮间充质转化（EMT），可促进肿瘤生长。分子机制研究结果表明，circUHRF1充当miR-526b-5p的海绵，从而上调c-Myc。转录因子c-Myc可以促进TGF-β1和ESRP1的转录。此外，剪接因子ESRP1通过靶向circUHRF1侧翼内含子促进了circUHRF1的环化和形成，circUHRF1/miR-526b-5p/c-Myc/TGF-β1/ESRP1形成了正反馈环路。该研究通过circUHRF1/miR-526b-5p/c-Myc/TGF-β1/ESRP1正反馈环确定了circUHRF1在OSCC肿瘤发生和EMT中的致癌作用，从而阐明了circUHRF1对OSCC的致病机制，为OSCC治疗提供了潜在的治疗靶标。该文献详细解读，推荐阅读历史文章：Cell Death & Differentiation | 口腔鳞状细胞癌中circUHRF1促癌机制。
图注：circUHRF1/miR-526b-5p/c-Myc/TGF-β1/ESRP1形成的反馈环路示意图
3、NUDT21调节肝细胞癌中circRNA环化和ceRNA串扰。
标题：NUDT21 regulates circRNA cyclization and ceRNA crosstalk in hepatocellular carcinom
杂志：Oncogene
影响因子：6.634
通讯作者：朱曲波（中南大学湘雅药学院）
NUDT21是一个保守的剪接因子，参与调控mRNA前体的组装。NUDT21可绑定在poly（A）上游有两个UGUA元件形成二聚体环，从而阻止了CPSF介导的mRNA前体裂解。作为关键的3′-UTR长度调控因子，敲低NUDT21（KD）将导致poly（A）位置近端选择，从而减少了3′-
UTR长度。之前研究表明HCC（肝癌）中NUDT21低表达，低水平的NUDT21患者的总生存期和无病生存较短。NUDT21低表达也与肝癌患者的不良临床预后相关，例如较大的肿瘤，晚期肿瘤淋巴结转移的较早阶段和远处转移。普遍的假设认为NUDT21减少缩短了各种致癌基因的3′-UTR，帮助癌基因成功躲避miRNA介导的抑制作用。但是，Poly A测序和TCGA RNA-Seq数据分析结果显示肿瘤中大多数致癌基因3′-UTR的长度几乎没有发生变化。另一种机制假说认为，癌基因的3′-UTR缩短通过破坏ceRNA-crosstalk的方式反式抑制抑癌基因的表达 的可能性更大，这可能是NUDT21在癌细胞中起作用的主要方式。由于circRNA是重要的ceRNA，可与miRNA结合并影响靶mRNA的稳定性和翻译效率，本文作者假设NUDT21缺失，除了导致3′-UTR缩短，还可以减少circRNA生物形成，然后释放miRNA以抑制HCC中的肿瘤抑癌基因。通过一系列实验结果表明，NUDT21的高表达对circRNA的形成至关重要，UGUA序列元件则对circRNA环化非常关键。HCC中敲低NUDT21可破坏circRNA-miRNA-mRNA的ceRNA途径，circRNA环化受到阻止，miRNA被释放进而抑制一部分抑癌基因的表达，最终导致HCC细胞不受控增殖。
图注：HCC肝癌中，NUDT21敲低后circRNA形成受到抑制
参考文献列表
| 序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
| 1 | Previews评述文章：环形RNA免疫原性的黑匣子 | Going in Circles: The Black Box of Circular RNA Immunogenicity. | Mol Cell | 14.548 | 宾夕法尼亚大学 |
| 2 | 人脑中环状RNA表达情况研究 | The Landscape of Circular RNA Expression in the Human Brain. | Biol Psychiatry | 11.501 | 新南威尔士大学 |
| 3 | 剪接因子衍生的环状RNA circUHRF1通过反馈回路加速口腔鳞状细胞癌的发生 | Splicing factor derived circular RNA circUHRF1 accelerates oral squamous cell carcinoma tumorigenesis via feedback loop. | Cell Death Differ | 8.086 | 天津医科大学等 |
| 4 | NUDT21调节肝细胞癌中circRNA环化和ceRNA串扰 | NUDT21 regulates circRNA cyclization and ceRNA crosstalk in hepatocellular carcinoma. | Oncogene | 6.634 | 中南大学湘雅药学院 |
| 5 | 透明细胞肾细胞癌中的环状RNAs：基于微阵列的鉴定，分析验证以及在临床基因组模型中改善预后准确性的潜在用途 | Circular RNAs in Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Their Microarray-Based Identification, Analytical Validation, and Potential Use in a Clinico-Genomic Model to Improve Prognostic Accuracy. | Cancers (Basel) | 6.162 | 德国Charité医学中心 |
| 6 | CircUBAP2介导的竞争性内源性RNA网络调控胰腺腺癌的发生 | CircUBAP2-mediated competing endogenous RNA network modulates tumorigenesis in pancreatic adenocarcinoma. | Aging (Albany NY) | 5.515 | 浙江大学医学院 |
| 7 | CircRNA Cdr1as可作为竞争性内源RNA促进肝细胞癌的进展 | CircRNA Cdr1as functions as a competitive endogenous RNA to promote hepatocellular carcinoma progression. | Aging (Albany NY) | 5.515 | 淮安市第一人民医院 |
| 8 | 环状RNA相关的CeRNA网络的系统表征鉴定阿尔茨海默中的新型circRNA生物标记 | Systematic Characterization of Circular RNA-Associated CeRNA Network Identified Novel circRNA Biomarkers in Alzheimer’s Disease. | Front Bioeng Biotechnol | 5.122 | 温州医科大学 |
| 9 | 对circRNA-miRNA-mRNA网络的综合分析揭示肝脏再生过程中细胞增殖潜在机制的新见解 | An integrated analysis of the circRNA-miRNA-mRNA network reveals novel insights into potential mechanisms of cell proliferation during liver regeneration. | Artif Cells Nanomed Biotechnol | 4.462 | 河南师范大学 |
| 10 | 甘蓝型油菜CMS系中花药发育的CircRNA表达模式以及ceRNA和miRNA-mRNA网络 | CircRNA Expression Pattern and ceRNA and miRNA-mRNA Networks Involved in Anther Development in the CMS Line of Brassica campestris. | Int J Mol Sci | 4.183 | 浙江大学等 |
| 11 | 人牙髓间质细胞在氧化应激下CircRNA表达谱研究 | CircRNA expression profiles in human dental pulp stromal cells undergoing oxidative stress. | J Transl Med | 4.098 | 广东医科大学 |
| 12 | 脂多糖诱导的炎症条件下circRNA CDR1as调节人牙周膜干细胞的增殖 | circRNA CDR1as Regulated the Proliferation of Human Periodontal Ligament Stem Cells under a Lipopolysaccharide-Induced Inflammatory Condition. | Mediators Inflamm | 3.545 | 南京大学医学院 |
| 13 | 基于circRNA表达相似性和功能相似性预测circRNA与疾病关联 | Predicting circRNA-Disease Associations Based on circRNA Expression Similarity and Functional Similarity. | Front Genet | 3.517 | 哈尔滨工业大学 |
| 14 | 环状RNA CDR1通过吸附miR-7-5p增强E2F3的稳定性并促进鼻咽癌的生长 | Circular RNA CDR1as sponges miR-7-5p to enhance E2F3 stability and promote the growth of nasopharyngeal carcinoma. | Cancer Cell Int | 3.439 | 赣州市人民医院 |
| 15 | 骨骼肌肌发生中的circRNA生物形成和ceRNA作用 | Biogenesis and ceRNA role of circular RNAs in skeletal muscle myogenesis. | Int J Biochem Cell Biol | 3.144 | 西北农林科技大学 |
| 16 | 环状RNA SMARCA5通过miR-19b-3p/HOXA9轴抑制非小细胞肺癌的增殖，迁移和侵袭 | Circular RNA SMARCA5 inhibits the proliferation, migration, and invasion of non-small cell lung cancer by miR-19b-3p/HOXA9 axis. | Onco Targets Ther | 3.046 | 河南大学淮河医院 |
| 17 | 与核糖体蛋白L6相关的环状RNA hsa_circ_0006848可作为早期胃癌的新型生物标志物 | Circular RNA hsa_circ_0006848 Related to Ribosomal Protein L6 Acts as a Novel Biomarker for Early Gastric Cancer. | Dis Markers | 2.761 | 福建医科大学附属协和医院 |
| 18 | 通过滚环扩增方法快速简便特异性地检测circRNA | A Fast and Easy Method for Specific Detection of circRNA by Rolling Circle Amplification. | Chembiochem | 2.593 | 柏林洪堡大学 |
| 19 | 环状RNA circ-TSPAN4通过海绵吸附miR-665上调ZEB1来促进肺腺癌转移 | Circular RNA circ-TSPAN4 promotes lung adenocarcinoma metastasis by upregulating ZEB1 via sponging miR-665. | Mol Genet Genomic Med | 2.448 | 杭州市肿瘤医院 |
| 20 | circRNA作为大肠癌中miRNA-mRNA竞争性内源性RNA的鉴定和表征 | Identification and characterization of circRNAs as competing endogenous RNAs for miRNA-mRNA in colorectal cancer. | PeerJ | 2.353 | 丽水学院（浙江） |
| 21 | 液体活检原位杂交方案开发中的第一步，检测大鼠体液样本中的环状RNA生物标志物 | First steps in the development of a liquid biopsy in situ hybridization protocol to determine circular RNA biomarkers in rat biofluids. | Pediatr Surg Int | 1.397 | 曼尼托巴大学 |
| 22 | 环状RNA在血液系统恶性肿瘤中的研究进展 | The research progress of circular RNAs in hematological malignancies. | Hematology | 1.318 | 淮安市第一人民医院 |