欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献20篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。

  1. 阿尔茨海默症患者大脑皮质中的环状RNA表达谱证明circRNA的强临床和病理学关联性。

标题:An atlas of cortical circular RNA expression in Alzheimer disease brains demonstrates clinical and pathological associations.

杂志: Nature Neuroscience

影响因子:21.126

通讯作者: Carlos Cruchaga教授(美国华盛顿大学医学院)

前期已有多项研究表明circRNA在大脑和神经系统中表达丰度高且独立其线性基因表达,提示circRNA在大脑发育和神经元兴奋中起重要调控作用。阿尔茨海默症(Alzheimer’s disease,AD)则是一种多因素引起、难治疗的不可逆神经退行性疾病。目前人们对AD的发病机制所知甚少,提高AD早期筛查和治疗能力非常紧迫,因此急需找到新的AD的诊断标记物和治疗靶标。美国华盛顿大学医学院Carlos Cruchaga教授带领的研究团队,利用生信息学技术对Knight ADRC研究中心和西奈山脑库(MSBB)的两个阿尔茨海默氏症RNA测序(RNA-seq)数据集进行定量和深度挖掘,结果显示circRNA表达水平变化与AD诊断,临床痴呆严重程度和神经病理学严重程度之间存在重要关联性,大多数circRNA-AD关联与其同源线性mRNA表达或脑细胞类型比例变化无关。还观察到与AD相关的circRNA与已知AD基因共表达关系。该研究结果凸显circRNA与AD的重要关联,强烈地提示circRNA或可成为AD的新型临床指标,为进一步研究circRNA在AD发病机理中的潜在作用提供了重要资源。

图注:AD密切相关的circRNA列表

  1. 环状RNA Foxo3的减少促进前列腺癌的进展和对多西紫杉醇的耐药性。

标题:Reduction of circular RNA Foxo3 promotes prostate cancer progression and chemoresistance to docetaxel.

杂志: Cancer Letters

影响因子:6.508

通讯作者: 徐骏(复旦大学附属华东医院泌尿外科)

据报道,circFoxo3的失调与乳腺癌和非小细胞肺癌的进展有关。但是,关于circFoxo3在前列腺癌中的作用知之甚少,该研究对此进行了研究。在22个低级别前列腺癌样本,24个高级别前列腺癌样本和18个正常前列腺组织中分析了CircFoxo3的表达,发现与低级别前列腺癌和正常前列腺组织相比,CircFoxo3在高级别前列腺癌中的表达量显著减少。进一步研究表明,circFoxo3通过对Foxo3和EMT的抑制作用,实现对多西紫杉醇耐药性,提高前列腺癌细胞的存活,迁移,侵袭能力。沉默circFoxo3表达可促进前列腺癌细胞的生存,迁移,侵袭及对多西紫杉醇的化学耐药性,以及雄激素对前列腺癌生存能力的积极影响。前列腺荷瘤小鼠中过表达circfoxo3可增强小鼠对多西紫杉醇的化学敏感性并延长了小鼠的寿命,而siRNA干扰circFoxo3后促进了对多西紫杉醇的化学耐药性并导致荷瘤小鼠的寿命缩短。靶向circFoxo3 / Foxo3 / EMT可能为探索潜在的前列腺癌预后和治疗方法提供一种新的适用策略。

3、环状RNA hsa_circ_0016070通过促进PASMC增殖与肺动脉高压相关。

标题:Circular RNA hsa_circ_0016070 Is Associated with Pulmonary Arterial Hypertension by Promoting PASMC Proliferation.

杂志:Molecular Therapy-nucleic Acids

影响因子:5.919

通讯作者: Ran Wang和孙耕耘(安徽医科大学附属第一医院),曹超(宁波市第一医院

肺动脉高压(PAH)指肺动脉压力升高超过一定界值的一种血流动力学和病理生理状态,可导致右心衰竭,可以是一种独立的疾病,也可以是并发症,还可以是综合征。非编码RNA在肺动脉高压的发病机理中起重要作用。在这项研究中,作者研究了hsa_circ_0016070,miR-942和CCND1在PAH中的作用。首先利用circRNA芯片筛选PAH中差异表达的circRNA,实时荧光定量PCR和Western blot分析检测不同组中miR-942和CCND1的表达。另外,还分析研究了miR-942对CCND1表达的影响以及hsa_circ_0016070对miR-942和CCND1表达的影响。此外,MTT分析和流式细胞仪检测hsa _circ_0016070对细胞增殖和细胞周期的影响。根据circRNA芯片分析的结果,确定hsa _circ_0016070与慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的PAH风险有关。COPD(+)PAH(+)组中的miR-942水平远低于COPD(+)PAH(-)组,而COPD(+)PAH(+)组中的CCND1水平相比其在COPD(+)PAH(-)组更高。CCND1被鉴定为miR-942的候选靶基因,萤光素酶检测表明,野生型CCND1 3’UTR的萤光素酶活性被miR-942模拟物抑制。此外,hsa _circ_0016070减少了miR-942的表达并增强了CCND1的表达。hsa _circ_0016070明显增加了细胞活力并减少了G1 / G0期停滞的细胞数量。总之,该研究结果表明,hsa_circ_0016070可通过miR-942 / CCND1促进肺动脉平滑肌细胞(PASMC)的增殖且与PAH中的血管重塑有关。因此,has_circ_0016070可用作PAH诊断和治疗中的新型生物标志物。

图注:circRNA芯片检测结果显示hsa_circ_0016070在PAH的COPD患者中表达水平差异。

参考文献列表

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 阿尔茨海默症患者大脑皮质中的环状RNA表达谱证明circRNA的强临床和病理学关联性。 An atlas of cortical circular RNA expression in Alzheimer disease brains demonstrates clinical and pathological associations. Nat Neurosci. 21.126 华盛顿大学医学院
2 环状RNA Foxo3的减少促进前列腺癌的进展和对多西紫杉醇的耐药性。 Reduction of circular RNA Foxo3 promotes prostate cancer progression and chemoresistance to docetaxel. Cancer Lett. 6.508 复旦大学附属华东医院
3 环状RNA hsa_circ_0016070通过促进PASMC增殖与肺动脉高压相关。 Circular RNA hsa_circ_0016070 Is Associated with Pulmonary Arterial Hypertension by Promoting PASMC Proliferation. Mol Ther Nucleic Acids. 5.919 安徽医科大学附属第一医院
4 肿瘤抑制性circRNA:抑制肿瘤发展并做为治疗靶标的机制。 Tumour-suppressive circRNAs: Mechanisms underlying their suppression of tumour occurrence and use as therapeutic targets. Cancer Sci. 4.751 宁波大学医学院
5 circ_0021977 / miR-10b-5p / P21和P53调控轴可抑制结直肠癌的增殖,迁移和侵袭。 The circ_0021977/miR-10b-5p/P21 and P53 regulatory axis suppresses proliferation, migration, and invasion in colorectal cancer. J Cell Physiol. 4.522 南京医科大学附属南京第一医院
6 Circ-HIPK3通过MiR-17-3p-ADCY6轴增强肾上腺素对心力衰竭的作用 Circ-HIPK3 Strengthens the Effects of Adrenaline in Heart Failure by MiR-17-3p – ADCY6 Axis. Int J Biol Sci. 4.067 上海市第一人民医院
7 环状RNA表达谱分析鉴定出高丰度的 circTMTC1,海绵吸附miR-128-3p抑制鸡骨骼肌卫星细胞的分化。 Circular RNA profiling identified an abundant circular RNA circTMTC1 that inhibits chicken skeletal muscle satellite cell differentiation by sponging miR-128-3p. Int J Biol Sci. 4.067 四川农业大学
8 IPEC-J2细胞中环状RNA CircEZH2通过靶向MiR-22抑制传染性胃肠炎冠状病毒诱导的线粒体通透性转变孔的开放。 Circular RNA CircEZH2 Suppresses Transmissible Gastroenteritis Coronavirus-induced Opening of Mitochondrial Permeability Transition Pore via Targeting MiR-22 in IPEC-J2. Int J Biol Sci. 4.067 西北农林科技大学兽医学院
9 小儿急性淋巴细胞白血病中血细胞群中环状RNA差异表达和circRNA失调的探索。 Circular RNA differential expression in blood cell populations and exploration of circRNA deregulation in pediatric acute lymphoblastic leukemia. Sci Rep. 4.011 意大利

帕多瓦大学

10 大白菜叶片中钙缺乏引起的叶枯萎的环状RNA转录组全鉴定和特征 Transcriptome-Wide Identification and Characterization of Circular RNAs in Leaves of Chinese Cabbage (Brassica rapa L. ssp. pekinensis) in Response to Calcium Deficiency-Induced Tip-burn. Sci Rep. 4.011 浙江省农业科学院
11 新烟碱二甲呋喃对蜜蜂的选择性嗅觉作用。 Enantioselective olfactory effects of the neonicotinoid dinotefuran on honey bees (Apis mellifera L.). J Agric Food Chem. 3.571 广西大学农学院
12 综述:circRNA在癌症形成和发展中的新兴作用 Emerging roles of circRNA in formation and progression of cancer. J Cancer. 3.182 广东医科大学
13 环状RNA HIPK3通过海绵吸附miR-149诱导非小细胞肺癌细胞增殖并抑制细胞凋亡。 Circular RNA HIPK3 induces cell proliferation and inhibits apoptosis in non-small cell lung cancer through sponging miR-149. Cancer Biol Ther. 2.897 郑州大学第一附属医院
14 circHIPK3上调通过Wnt /β-catenin途径促进胃癌的进展,预后不良 Upregulation of circHIPK3 promotes the progression of gastric cancer via Wnt/β-catenin pathway and indicates a poor prognosis Eur Rev Med Pharmacol Sci. 2.721 北京博爱医院中国康复研究中心
15 卵巢癌中环状RNA表达谱的差异分析。 Profiling and bioinformatics analyses reveal differential circular RNA expression in ovarian cancer. Gene. 2.638 上海交通大学附属第六人民医院
16 大肠癌进展中Circ_0000218通过调节miR-139-3p / RAB1A轴发挥致癌作用 Circ_0000218 plays a carcinogenic role in colorectal cancer progression by regulating miR-139-3p/RAB1A axis J Biochem. 2.23 临沂市中心医院
17 胰腺导管腺癌患者血浆囊泡中的环状RNA表达谱。 Circular RNA expression profiles in extracellular vesicles from the plasma of patients with pancreatic ductal adenocarcinoma. FEBS Open Bio. 1.959 同济大学医学院附属上海东方医院
18 RNA测序揭示类风湿性关节炎患者外周血单核细胞中异常调控的环状RNA:RNA的新型诊断标记物。 Aberrant dysregulated circular RNAs in the peripheral blood mononuclear cells of patients with rheumatoid arthritis revealed by RNA sequencing: novel diagnostic markers for RA. Scand J Clin Lab Invest. 1.38 青岛大学医学院
19 在神经胶质瘤细胞中敲除环状RNA CEP128可通过调控miR-145-5p抑制增殖并提高替莫唑胺的细胞毒性。 Knockdown of circular RNA CEP128 suppresses proliferation and improves cytotoxic efficacy of temozolomide in glioma cells by regulating miR-145-5p. Neuroreport. 1.146 浙江中医药大学
20 在剪接体活性降低的条件下,长和富含重复片段的内含子序列有利于环状RNA的形成。 Long and Repeat-Rich Intronic Sequences Favor Circular RNA Formation under Conditions of Reduced Spliceosome Activity. iScience. NA 马克斯·普朗克脑科学研究所

 

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