欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索(收集最新发布的circRNA文献共计27篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。检索式:circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
- 综述:circRNA的生物形成和特征
标题:The biogenesis, biology and characterization of circular RNAs
杂志:Nat Rev Genet.
影响因子:43.704
通讯作者:Lasse S. Kristensen教授(丹麦奥胡斯大学)
近日丹麦奥胡斯大学的遗传学家Lasse Kristensen教授等在Nature Revies Genetics杂志发表了circRNA的长篇综述,作者在综述中提到,环状RNA(circRNA)是真核生物中具有组织特异性和细胞特异性表达模式的共价封闭内源性生物分子,其生物形成过程受特定的顺式作用元件和反式作用因子调节。一些circRNA表达丰度高且在进化上保守,许多circRNA通过充当microRNA或蛋白质抑制剂(“海绵”),调节蛋白质功能或自身翻译,发挥重要的生物学功能。此外,circRNA涉及广泛疾病发生发展过程,例如糖尿病,神经系统疾病,心血管疾病和癌症。尽管这些circRNA转录本的圆形性质使其检测,定量和功能表征上具有挑战性,但RNA高通量测序和特定针对circRNA的计算工具都有了快速发展,为表征circRNA的功能作用提供了强有力工具。该综述非常全面系统地介绍了目前最新circRNA筛选鉴定及功能研究的方法和方向,强烈推荐大家仔细阅读原文。
图注:目前检测和定量circRNA的主要技术列表。
- 综述:circRNA-癌症中的明星分子
标题:Circular RNAs: The star molecules in cancer.
杂志:Mol Aspects Med
影响因子:8.313
通讯作者:xiao zhu(广东医科大学海洋医药研究院和广东医科大学附属医院)
该综述系统地介绍了与癌症相关的circRNAs及其起源,形成机制,功能以及在十六种肿瘤的诊断和治疗中的应用。circRNA的组织和疾病的特异性表达及参与肿瘤细胞的增殖和迁移特征,针对circRNA的靶向疗法是癌症患者的一种可靠且有希望的新疗法,circRNA将成为靶向治疗领域的热点之一。除了天然海绵外,合成circRNAs海绵也是circRNA应用于临床的值得期待方向之一,与线性同类产品相比,合成的circRNA海绵能够更轻松,便捷地稳定地抑制miRNA的活性,从而调控肿瘤的侵袭。因此,在人类肿瘤治疗中,合成的circRNAs海绵具有广泛的应用前景。但是,我们对circRNA的所知还只是冰山一角,要完全实现circRNA的临床应用,还有很长的路要走。随着全世界临床医生和科学家的不懈努力,对circRNA功能机理认识越来越来深入,相信有更多的circRNA将应用于临床肿瘤的诊断和治疗,将使更多的癌症患者受益。
图注: 部分肿瘤中的circRNA/miRNA/gene调控机制示意图
- 循环系统中环状RNAs作为诊断和预测急性缺血性卒中结果的生物标志物。
标题:Circulating Circular RNAs as Biomarkers for the Diagnosis and Prediction of Outcomes in Acute Ischemic Stroke.
杂志:Stroke
影响因子:6.046
通讯作者:张志珺 教授(东南大学附属中大医院神经内科)和 姚红红 教授(东南大学医学院)
该研究首先利用circRNA微阵列技术鉴定筛选急性缺血性中风患者血液中差异表达的circRNA(3对3)。进一步通过qRT-PCR在独立队列(36对36)和重复样本(200对100)中进行验证。从血液中分离出血小板,淋巴细胞和粒细胞,以检查circRNA的起源。与健康对照相比,中国人群AIS患者中有3个circRNA上调。3个circRNA的组合ROC曲线下面积为0.875,在AIS诊断中对应于91%的特异性和71.5%的灵敏度。此外,在治疗的前7天内3种circRNA中变化率的组合在预测卒中预后方面显示出0.960,ROC曲线下的面积。与健康对照相比,AIS患者中circPDS5B(环状RNA PDS5B)的淋巴细胞和粒细胞显著增加,而circCDC14A(环状RNA CDC14A)的仅粒细胞显著增加。三种circRNA可以作为AIS诊断和中风预后的生物标记。脑卒中后circPDS5B和circCDC14A可能在淋巴细胞和粒细胞水平的升高。
图注:筛选和鉴定出急性缺血性中风患者血液中的circRNA标志物
参考文献列表:
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 综述:circRNA的生物形成和特征 | The biogenesis, biology and characterization of circular RNAs | Nat Rev Genet. | 43.704 | 丹麦奥胡斯大学 |
2 | 综述:癌症中的明星分子circRNA | Circular RNAs: The star molecules in cancer. | Mol Aspects Med | 8.313 | 广东医科大学海洋医药研究院等 |
3 | 循环系统中环状RNAs作为诊断和预测急性缺血性卒中结果的生物标志物。 | Circulating Circular RNAs as Biomarkers for the Diagnosis and Prediction of Outcomes in Acute Ischemic Stroke. | Stroke | 6.046 | 东南大学医学院等 |
4 | hsa_circ_0092306靶向miR-197-3p的分子通过调节MKN-45细胞中的PRKCB促进胃癌的发展。 | hsa_circ_0092306 Targeting miR-197-3p Promotes Gastric Cancer Development by Regulating PRKCB in MKN-45 Cells. | Mol Ther Nucleic Acids | 5.919 | 河北医科大学第四医院等 |
5 | 环状RNA作为环境化学暴露相关疾病中的生物标志物和治疗靶标。 | Circular RNAs as biomarkers and therapeutic targets in environmental chemical exposure-related diseases. | Environ Res | 5.026 | 成都理工大学 |
6 | 探索环状RNA在神经退行性疾病中的调控作用。 | Exploring the Regulatory Role of Circular RNAs in Neurodegenerative Disorders. | Int J Mol Sci | 4.183 | 意大利罗马大学等 |
7 | 秀丽隐杆线虫中毒过程中circRNA-miRNA-mRNA分子调控网络的构建和分析。 | Construction and Analysis of circRNA-miRNA-mRNA Molecular Regulatory Networks During Herba Gelsemium elegans Intoxication. | Front Pharmacol | 3.845 | 福建中医药大学 |
8 | SOX9诱导的环状RNA circ-FOXP1通过海绵吸附miR-875-3p和miR-421促进肝癌的进展。 | Circular RNA circ-FOXP1 induced by SOX9 promotes hepatocellular carcinoma progression via sponging miR-875-3p and miR-421. | Biomed Pharmacother | 3.743 | 河南省人民医院 |
9 | 环形RNA全局鉴定分析得到的CircFAM120A为低氧性肺腺癌的新生物标记。 | Comprehensive circular RNA profiling identifies CircFAM120A as a new biomarker of hypoxic lung adenocarcinoma. | Ann Transl Med | 3.689 | 华东师范大学 |
10 | 环状RNA或mRNA是否来源于环状DNA? | To Be or Not to Be: Circular RNAs or mRNAs From Circular DNAs? | Front Genet | 3.517 | 哥本哈根大学 |
11 | 沉默环状RNA circANKRD36可通过调节microRNA-15/MyD88减轻脂多糖诱导的炎症损伤。 | Silencing circular RNA circANKRD36 remits lipopolysaccharide-induced inflammatory damage by regulating microRNA-15/MyD88. | J Cell Biochem | 3.448 | 青岛市第六人民医院 |
12 | 肾癌细胞系中环状RNA-NRIP1通过靶向microRNA-505发挥致癌作用。 | The circular RNA-NRIP1 plays oncogenic roles by targeting microRNA-505 in the renal carcinoma cell lines. | J Cell Biochem | 3.448 | 青岛大学附属医院 |
13 | 环形RNA circ_0074027指示NSCLC患者的预后较差,并通过miR-185-3p介导的BRD4/MADD激活调节细胞增殖,凋亡和侵袭。 | Circular RNA circ_0074027 indicates a poor prognosis for NSCLC patients and modulates cell proliferation, apoptosis, and invasion via miR-185-3p mediated BRD4/MADD activation. | J Cell Biochem | 3.448 | 哈尔滨医科大学附属第二医院 |
14 | 环状RNA circ-Foxo3通过miR-23a/PTEN轴抑制食道鳞状细胞癌的进展。 | Circular RNA circ-Foxo3 inhibits esophageal squamous cell cancer progression via the miR-23a/PTEN axis. | J Cell Biochem | 3.448 | 泰兴市人民医院 |
15 | 沉默cZNF292可通过上调miR-206抑制人食道癌Eca-109细胞的生长,迁移和侵袭。 | Silence of cZNF292 suppresses the growth, migration, and invasion of human esophageal cancer Eca-109 cells via upregulating miR-206. | J Cell Biochem | 3.448 | 济宁市第一人民医院 |
16 | A-3环RNA标记作为结肠直肠癌的无创诊断生物标记。 | A 3-circular RNA signature as a noninvasive biomarker for diagnosis of colorectal cancer. | Cancer Cell Int | 3.439 | 福建医科大学附属协和医院 |
17 | 血清circSETDB1是一种有前途的生物标志物,可预测铂-紫杉烷类联合化疗对高度浆液性卵巢癌的反应和复发。 | Serum circSETDB1 is a promising biomarker for predicting response to platinum-taxane-combined chemotherapy and relapse in high-grade serous ovarian cancer. | Onco Targets Ther | 3.046 | 河南省人民医院等 |
18 | 基于circRNA芯片筛选Kashin-Beck病和骨关节炎患者之间差异表达的circRNA。 | Screening for differentially expressed circRNA between Kashin-Beck disease and osteoarthritis patients based on circRNA chips. | Clin Chim Acta | 2.735 | 西安交通大学 |
19 | 环状RNA circRNA_0000285通过调节FUS促进宫颈癌的发展。 | Circular RNA circRNA_0000285 promotes cervical cancer development by regulating FUS. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 厦门大学附属妇女儿童医院 |
20 | circEPSTI1作为ceRNA来调节骨肉瘤的进展。 | circEPSTI1 acts as a ceRNA to regulate the progression of osteosarcoma. | Curr Cancer Drug Targets | 2.72 | 南方医科大学附属第三医院 |
21 | 在小鼠视网膜新血管形成中鉴定circRNA相关的ceRNA网络。 | Identifying circRNA-associated-ceRNA networks in retinal neovascularization in mice. | Int J Med Sci | 2.333 | 中南大学湘雅二医院 |
22 | 沉默hsa_circ_0008450通过调控microRNA-214-3p/EZH2轴抑制肝癌的进展。 | Silencing Of hsa_circ_0008450 Represses Hepatocellular Carcinoma Progression Through Regulation Of microRNA-214-3p/EZH2 Axis. | Cancer Manag Res | 2.243 | 浙江大学医学院附属邵逸夫医院 |
23 | 敲低EBV编码的circRNA circRPMS1后可通过抑制多个miRNA抑制鼻咽癌细胞的增殖和转移。 | Knockdown of EBV-encoded circRNA circRPMS1 suppresses nasopharyngeal carcinoma cell proliferation and metastasis through sponging multiple miRNAs. | Cancer Manag Res | 2.243 | 湘南大学附属医院 |
24 | 带状疱疹后遗神经痛患者皮肤中的MicroRNA和环状RNA表达。 | MicroRNA And Circular RNA Expression In Affected Skin Of Patients With Postherpetic Neuralgia. | J Pain Res | 2.236 | 遵义医科大学附属医院 |
25 | 非编码RNA相关ceRNA调控网络:肝纤维化的新型治疗方法。 | Non-coding RNA associated Competitive Endogenous RNA Regulatory Network: Novel Therapeutic Approach in Liver Fibrosis. | Curr Gene Ther | 2.218 | 西安交通大学基础医学学院 |
26 | 环状RNA在卵巢癌中是否具有显著作用? | Does Circular RNA Exert Significant Effects in Ovarian Cancer? | Crit Rev Eukaryot Gene Expr | 1.841 | 北京朝阳医院 |
27 | 前列腺癌中环状RNA itchy通过靶向MiR-197抑制细胞增殖并促进细胞凋亡。 | Upregulation of Circular RNA Itchy E3 Ubiquitin Protein Ligase Inhibits Cell Proliferation and Promotes Cell Apoptosis Through Targeting MiR-197 in Prostate Cancer. | Technol Cancer Res Treat | 1.481 | 湖北工业大学附属医院 |