欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索(收集最新发布的circRNA文献共计32篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。检索式:circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

1、 Sam68结合SMN基因内含子中富含的Alu元件并促进前体mRNA的环化。

标题 Sam68 binds Alu-rich introns in SMN and promotes pre-mRNA circularization.

杂志 Nucleic Acids Res

IF 11.147

通讯作者 Claudio Sette(意大利天主教圣心大学)

脊髓性肌萎缩症(SMA)又称脊肌萎缩症,是一类由脊髓前角运动神经元变性导致肌无力、肌萎缩的疾病。属常染色体隐性遗传病,临床并不少见。目前遗传学已经确认,SMA主要与两个高度同源的基因密切相关,SMN1与SMN2,这两个基因主要通过7号外显子和8号外显子上的两个基因位点进行区分,编码区仅有两个碱基不同,大部分正常个体都有2份拷贝的SMN1基因与2份拷贝的SMN2基因, SMN2基因发生外显子7的跳跃,只有少量的全长SMN mRNA,所以如果某个人两份拷贝的SMN1基因都失去功能的话一定会患病,只有一份SMN1基因起作用的个体为携带者。在SMN1基因都失去功能的情况下,SMN2基因拷贝数数目,则会影响患者的发病时间与疾病严重程度。尽管蛋白编码序列几乎相同,但相对于小鼠Smn,人SMN基因座的重复元件增多使它的大小增加了一倍。在该研究中,研究者发现SMN属于Alus密度最高的人类基因之一,这些基因在灵长类动物中高度保守,并且经常发生方向倒转。反向重复元件(IRAlus)负调控SMN中长内含子的剪接,同时促进广泛的环状RNA(circRNA)可变剪切生成。生物信息学分析显示,SMN IRAlus中存在超保守的Sam68结合位点。交联免疫沉淀(CLIP),基因过表达和沉默实验表明,Sam68在SMN pre-mRNA中内含子Alus的附近结合,因此有利于circRNA在体内和体外的生物形成。这些发现突出了SMN表达中的新一层调控机制,表明IRAlus发挥的关键作用,并揭示了Sam68在SMN基因起源的circRNA生物发生中的作用。

图注:人SMN基因内含子富含反向重复Alu元件

2、 CircRNA-5692海绵吸附miR-328-5p海绵以增强DAB2IP表达来抑制肝癌的进展。

标题 CircRNA-5692 inhibits the progression of hepatocellular carcinoma by sponging miR-328-5p to enhance DAB2IP expression.

杂志 Cell Death Dis

IF 5.959

通讯作者 全俊 和 范学工(中南大学湘雅医院)

环状RNA(circRNA)是一种非编码RNA,可以与miRNA和转录因子相互作用以调节基因表达。然而,关于哪种circRNA对于肝细胞癌(HCC)的发病机理至关重要任然鲜为人知。研究者,通过CircRNA微阵列分析其表达谱,生物信息学分析预测circRNA调控靶标,并通过荧光素酶报告基因进行验证。通过qRT-PCR和蛋白质免疫印迹确定它们的表达。通过甲基化特异性PCR确定DNA甲基化水平变化。分别由慢病毒介导的shRNA基因敲低和cDNA过表达后,使用MTT法,划痕愈合法,侵袭法和流式细胞术确定HCC细胞的恶性行为。HCC异种移植小鼠模型用于确定circRNA-5692的体内作用。研究结果显示,CircRNA-5692在肝癌组织中的表达下调,而circRNA-5692的过表达减弱了HCC细胞的恶性行为。生物信息学预测到circRNA-5692与靶向DAB2IP mRNA的miR-328-5p相互作用。实际上,miR-328-5p促进了HCC细胞的恶性行为,而DAB2IP具有相反的作用。此外,过表达circRNA-5692可通过降低miR-328-5p表达来增强DAB2IP表达,从而在体内抑制异种移植HCC肿瘤的生长。总之,circRNA-5692-miR-328-5p-DAB2IP调节途径可抑制HCC的进程。该研究发现circRNA-5692可能为肝癌的诊断和治疗提供潜在的新靶标。

图注:circRNA微阵列实验和qRT-PCR实验表明has_circ_0005692 (circRNA-5692)在HCC癌症组织和细胞中显著低表达。

3、 CircRNA-ENO1通过上调其宿主基因ENO1促进肺腺癌的糖酵解和肿瘤进展。

标题 CircRNA-ENO1 promoted glycolysis and tumor progression in lung adenocarcinoma through upregulating its host gene ENO1.

杂志 Cell Death Dis

IF 5.959

通讯作者 陈周苗(浙江大学医学院附属邵逸夫医院等)

长期以来,肺腺癌(LUAD)一直是导致全球癌症相关死亡率的主要原因之一。多项研究表明,通过增加糖酵解可以促进肿瘤的进展。烯醇化酶1(ENO1)是一种糖酵解酶,在葡萄糖代谢中起关键作用,并有助于许多癌症的肿瘤进展。环状RNA(circRNA)在调节癌症中基因表达方面起着越来越重要的作用,因此受到越来越多的关注。该研究工作揭示circ-ENO1及其宿主基因ENO1在糖酵解和肿瘤进展中的调控机制和功能。Circ-ENO1及其宿主基因ENO1在LUAD细胞中显著上调。功能上,沉默circ-ENO1可抑制LUAD细胞糖酵解,增殖,迁移和EMT,诱导凋亡。通过FISH和亚细胞分级分离确定circ-ENO1的胞质定位。从机制上讲,circ-ENO1充当ceRNA与miR-22-3p相互作用并上调ENO1表达。体内实验证明,circ-ENO1在体内推动了肿瘤的生长和转移。总而言之,该研究阐明了circ-ENO1可促进miR-22-3p / ENO1轴促进LUAD的糖酵解和肿瘤进展,表明circ-ENO1是LUAD患者的有希望的治疗靶点。

图注:circ-ENO1及其宿主基因ENO1在肺癌细胞中均显著上调

文献列表:

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 Sam68结合SMN中富含Alu的内含子并促进mRNA前的环化。 Sam68 binds Alu-rich introns in SMN and promotes pre-mRNA circularization. Nucleic Acids Res 11.147 意大利天主教圣心大学等
2 CircRNA-5692海绵吸附miR-328-5p海绵以增强DAB2IP表达来抑制肝癌的进展。 CircRNA-5692 inhibits the progression of hepatocellular carcinoma by sponging miR-328-5p to enhance DAB2IP expression. Cell Death Dis 5.959 中南大学湘雅医院
3 CircRNA-ENO1通过上调其宿主基因ENO1促进肺腺癌的糖酵解和肿瘤进展。 CircRNA-ENO1 promoted glycolysis and tumor progression in lung adenocarcinoma through upregulating its host gene ENO1. Cell Death Dis 5.959 浙江大学医学院附属邵逸夫医院等
4 抑制circDcbld1可通过靶向miR-145-3p / Neuropilin-1减轻大鼠颈动脉的内膜增生。 Suppression of circDcbld1 Alleviates Intimal Hyperplasia in Rat Carotid Artery by Targeting miR-145-3p/Neuropilin-1. Mol Ther Nucleic Acids 5.919 西南医科大学附属医院
5 环状RNA TTN可充当miR-432海绵通过IGF2/PI3K/AKT信号通路促进成肌细胞的增殖和分化。 Circular RNA TTN Acts As a miR-432 Sponge to Facilitate Proliferation and Differentiation of Myoblasts via the IGF2/PI3K/AKT Signaling Pathway. Mol Ther Nucleic Acids 5.919 西北农林科技大学
6 雄激素受体基因编码的前列腺和前列腺癌特异性环状RNA的表征。 Characterization of a Prostate- and Prostate Cancer-Specific Circular RNA Encoded by the Androgen Receptor Gene. Mol Ther Nucleic Acids 5.919 不列颠哥伦比亚大学
7 环状RNA hsa_circ_0000515充当miR-326海绵,通过上调ELK1促进宫颈癌的进展。 Circular RNA hsa_circ_0000515 acts as a miR-326 sponge to promote cervical cancer progression through up-regulation of ELK1. Aging (Albany NY) 5.515 武汉市中心医院等
8 环状RNA CircCCNB1海绵吸附miRNA-449a靶向CCNE2使抑制细胞衰老。 Circular RNA CircCCNB1 sponges micro RNA-449a to inhibit cellular senescence by targeting CCNE2. Aging (Albany NY) 5.515 北京大学衰老研究中心等
9 CircRNA hsa_circ_001895充当miR-296-5p的海绵,通过调节SOX12促进细胞癌的进展。 CircRNA hsa_circ_001895 serves as a sponge of miR-296-5p to promote cell carcinoma progression via regulating SOX12. Cancer Sci 4.751 南方医科大学南方医院
10 CircNr1h4通过靶向miR-155-5p来调节盐敏感性高血压小鼠的肾脏损伤的病理过程。 CircNr1h4 regulates the pathological process of renal injury in salt-sensitive hypertensive mice by targeting miR-155-5p. J Cell Mol Med 4.658 温州医科大学附属第一医院
11 环状RNA相关竞争内源RNA网络和结直肠癌患者Nomogram预后分析。 Circular RNA-Associated Competing Endogenous RNA Network and Prognostic Nomogram for Patients With Colorectal Cancer. Front Oncol 4.137 武汉大学人民医院
12 急性髓细胞性白血病环状RNA研究的最新进展。 Recent Progress on Circular RNA Research in Acute Myeloid Leukemia. Front Oncol 4.137 武汉大学基础医学学院等
13 人体液和细胞外囊泡的RNA测序评估。 Performance assessment of total RNA sequencing of human biofluids and extracellular vesicles. Sci Rep 4.011 比利时根特大学等
14 Hsa_circ_0000285作为竞争性内源RNA通过吸附hsa-miRNA-599来促进骨肉瘤进展。 Hsa_circ_0000285 functions as a competitive endogenous RNA to promote osteosarcoma progression by sponging hsa-miRNA-599. Gene Ther 3.749 华中科技大学同济医学院
15 CircRNA及其与胃癌的关系。 CircRNAs and its relationship with gastric cancer. J Cancer 3.182 中国医科大学附属第一医院
16 环状RNA hsa_circ_0000654通过调节miR-149-5p/IL-6/STAT3途径促进食管鳞状细胞癌进展。 Circular RNA hsa_circ_0000654 promotes esophageal squamous cell carcinoma progression by regulating the miR-149-5p/IL-6/STAT3 pathway. IUBMB Life 3.051 开封市中心医院
17 Hsa_circ_0046159参与了慢性血栓栓塞性肺动脉高压的发展。 Hsa_circ_0046159 is involved in the development of chronic thromboembolic pulmonary hypertension. J Thromb Thrombolysis 2.941 北京朝阳医院等
18 环状RNA在中国人群肺癌诊断中的准确性评估。 Accuracy Evaluation of Circular RNA in Diagnosing Lung Cancer in a Chinese Population. Dis Markers 2.761 广州医科大学化学致癌研究所
19 Circ-TFCP2L1通过海绵吸附miR-7抑制PAK1促进三阴性乳腺癌的增殖和迁移。 Circ-TFCP2L1 Promotes the Proliferation and Migration of Triple Negative Breast Cancer through Sponging miR-7 by Inhibiting PAK1. J Mammary Gland Biol Neoplasia 2.758 南京医科大学
20 环状RNA circ_0067934通过靶向Mcl-1作为乳腺癌的癌基因发挥作用。 Circular RNA circ_0067934 functions as an oncogene in breast cancer by targeting Mcl-1. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 山西医科大学
21 Circ-ZNF609通过抑制miRNA-145-5p表达来促进胃癌细胞的癌变。 Circ-ZNF609 promotes carcinogenesis of gastric cancer cells by inhibiting miRNA-145-5p expression. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 山东省立医院
22 环状RNA circ-PRKCI通过与胃癌中的microRNA-545结合来促进细胞增殖和侵袭。 Circular RNA circ-PRKCI promotes cell proliferation and invasion by binding to microRNA-545 in gastric cancer. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 武汉大学人民医院
23 小儿急性髓细胞性白血病中非编码RNA调控网络的鉴定表明circ-0004136可以通过miR-142促进细胞增殖。 Identification of non-coding RNA regulatory networks in pediatric acute myeloid leukemia reveals circ-0004136 could promote cell proliferation by sponging miR-142. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 复旦大学附属中山医院(青浦分院)
24 环状RNA circDLGAP4通过调节miR-134-5p / CREB途径在帕金森氏病中发挥神经保护作用。 Circular RNA circDLGAP4 exerts neuroprotective effects via modulating miR-134-5p/CREB pathway in Parkinson’s disease. Biochem Biophys Res Commun 2.705 温岭市第一人民医院
25 非阻塞性无精子症患者睾丸组织中CircRNA表达谱和功能分析。 CircRNA expression profile and functional analysis in testicular tissue of patients with non-obstructive azoospermia. Reprod Biol Endocrinol 2.589 西北妇女儿童医院等
26 在成对的病变和非病变皮肤样本中,高通量RNA测序揭示了牛皮癣circRNAome中的主要变化。 High-throughput RNA sequencing from paired lesional- and non-lesional skin reveals major alterations in the psoriasis circRNAome. BMC Med Genomics 2.568 丹麦奥尔胡斯大学等
27 环状RNA:癌细胞中能量代谢重编程的主要调节剂。 Circular RNA: The main regulator of energy metabolic reprogramming in cancer cells. Thorac Cancer 2.524 中山大学肿瘤防治中心
28 非编码RNA与肺癌进展。 Non-coding RNA and Lung Cancer Progression. J Chin Med Assoc 1.894 台湾国立阳明大学
29 环状RNA通过Wnt /β-Catenin信号传导途径调节癌症的发生和进展。 Circular RNAs Regulate Cancer Onset and Progression via Wnt/β-Catenin Signaling Pathway. Yonsei Med J 1.759 吉林大学第二医院
30 严重先兆子痫胎盘中circRNA的表达及其潜在调控靶点。 The expression profile of circRNA and its potential regulatory targets in the placentas of severe pre-eclampsia. Taiwan J Obstet Gynecol 1.2 中山大学孙逸仙纪念医院
31 坐骨神经损伤后近端和远端节段中环状RNA的差异表达。 Differential expression of circular RNAs in the proximal and distal segments of the sciatic nerve after injury. Neuroreport 1.146 韩国东亚大学
32 表观遗传学的基因组工具及其对公共卫生的影响。 Genomic Tools for Environmental Epigenetics and Implications for Public Health. Curr Opin Toxicol Not Found 密歇根大学公共卫生学院

 

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