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1、 环状RNA——circFGFR1通过海绵吸附miR-381-3p促进非小细胞肺癌进展和PD-1抵抗。

标题 Circular RNA circFGFR1 promotes progression and anti-PD-1 resistance by sponging miR-381-3p in non-small cell lung cancer cells.

杂志 Mol Cancer

IF 10.679

通讯作者 Fei Wang 1 , Jing Wu 和 张雪梅(上海东方医院肿瘤科)

免疫逃逸,远端转移和细胞增殖增加是非小细胞肺癌(NSCLC)进展和NSCLC患者死亡的主要原因。环状RNA的失调在NSCLC的发展中起着至关重要的作用。因此,进一步了解异常表达的circRNA的生物学机制对于发现新的,有希望的NSCLC治疗靶点至关重要。该研究通过RT-qPCR检测NSCLC及配对的非肿瘤组织和细胞系中环状RNA——circFGFR1的表达。CCK-8,克隆形成,划痕愈合和Matrigel Transwell细胞功能实验分析评估了circFGFR1在NSCLC进展中的作用,体内异种移植动物实验检测了circFGFR1的功能,circRNA-RIP,RNA-pulldown和荧光素酶报告基因检测探索了circFGFR1和miR-381-3p之间的相互作用。实验结果表明,circFGFR1在NSCLC组织中上调,并且circFGFR1表达与NSCLC患者的不良临床病理特征和预后相关。过表达circFGFR1促进了NSCLC细胞的迁移,侵袭,增殖和免疫逃逸。分子机制上,circFGFR1可以直接与miR-381-3p相互作用,作为miRNA海绵体来上调miR-381-3p靶基因趋化因子受体4—CXCR4的表达,从而促进NSCLC的发展和对抗PD-1的治疗。该研究成果,表明circFGFR1在非小细胞肺癌细胞的增殖,迁移,侵袭和免疫逃逸中的关键作用,并为非小细胞肺癌发展过程中的circRNA的作用机制提供了新的视角。

图注:circFGFR1在非小细胞肺癌患者组织中高表达且与不良预后相关

2、 Circ_0001955通过海绵吸附miR-516a-5p释放TRAF6和MAPK11表达促进肝细胞癌(HCC)的肿瘤发生。

标题 Circ_0001955 facilitates hepatocellular carcinoma (HCC) tumorigenesis by sponging miR-516a-5p to release TRAF6 and MAPK11.

杂志 Cell Death & Disease

IF 5.959

通讯作者 林楠(中山大学附属第三医院肝胆外科)

该研究论文主要探讨了circRNA在HCC中的复杂机制。研究者首先从三个GSE数据集(GSE7852,GSE94508和GSE97322)中识别出一种新型circRNA——circ_0001955,circ_0001955在HCC和正常样品之间存在显著差异表达。实验结果表明,与邻近的正常组织相比,HCC肿瘤组织中的circ_0001955,TRAF6和MAPK11水平升高,而miR-516a-5p水平降低。人为敲低circ_0001955在体外和体内实验中均抑制了HCC肿瘤细胞的生长,而circ_0001955的过表达则表现出相反的作用。Circ_0001955被鉴定为miR-145-5p和miR-516a-5p的海绵,并且TRAF6和MAPK11被证明是miR-516a-5p的两个靶基因。总之,circ_0001955通过使miR-516a-5p海绵化以释放TRAF6和MAPK11表达来促进肝癌的发生。

图注:HCC中 miR-516a-5p, TRAF6, MAPK11 和 circ_0001955的相互调控关系

3、 circCLK3/miR-320a/FoxM1信号轴可促进宫颈癌的进展。

标题 The novel circCLK3/miR-320a/FoxM1 axis promotes cervical cancer progression.

杂志 Cell Death & Disease

IF 5.959

通讯作者 李红雨 和 秦巧红(郑州大学第三附属医院妇产科)

该研究报道了circRNA在宫颈癌中的详细功能。研究者首先通过circRNA微阵列芯片筛选了宫颈癌组织和邻近正常组织之间差异表达的circRNA。circCLK3差异表达水平与临床病理特征和预后相关。体外CCK-8,细胞计数,细胞集落,细胞划痕愈合,transwell迁移和侵袭实验以及体内肿瘤形成和肺转移动物模型评估circCLK3的功能。使用RNA-pulldown,RNA免疫沉淀(RIP),萤光素酶报告基因和功能挽救实验阐明circCLK3和miR-320a之间的相互作用以及miR-320a对FoxM1的调控。研究结果表明,在宫颈癌组织中,circCLK3的水平显著高于癌旁正常组织,并且与肿瘤分化,FIGO分期和基质浸润深度密切相关。circCLK3的敲低明显抑制了宫颈癌在体外和体内的细胞生长和转移,而过表达circCLK3显著促进了体外和体内的癌细胞生长和转移。RNA-pulldown和荧光素酶报告基因和RIP实验分析表明circCLK3直接与miR-320a结合充当miRNA海绵,而MiR-320a通过直接结合FoxM1 mRNA的3’UTR抑制FoxM1的表达。此外,FoxM1可促进宫颈癌的细胞增殖,迁移和侵袭,而miR-320a通过抑制FoxM1抑制细胞增殖,迁移和侵袭,而circCLK3通过海绵吸附miR-320a并促进FoxM1表达来增强细胞增殖,迁移和侵袭。综上所述,circCLK3可以作为宫颈癌进展的新型诊断生物标志物和治疗的分子靶标。

图注:circCLK3在裸鼠异种移植模型中促进宫颈癌细胞增殖和转移

文献列表:

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 环状RNA——circFGFR1通过海绵吸附miR-381-3p促进非小细胞肺癌进展和PD-1抵抗。 Circular RNA circFGFR1 promotes progression and anti-PD-1 resistance by sponging miR-381-3p in non-small cell lung cancer cells. Mol Cancer 10.679 上海东方医院肿瘤科
2 具有单链环状RNA作为siRNA前体的细胞行使RNAi功能。 Intracellular build-up RNAi with single-strand circular RNAs as siRNA precursors. Chem Commun (Camb) 6.164 日本名古屋大学
3 circCLK3/miR-320a/FoxM1信号轴可促进宫颈癌的进展。 The novel circCLK3/miR-320a/FoxM1 axis promotes cervical cancer progression. Cell Death Dis 5.959 郑州大学第三附属医院妇产科
4 Circ_0001955通过海绵吸附miR-516a-5p释放TRAF6和MAPK11表达促进肝细胞癌(HCC)的肿瘤发生。 Circ_0001955 facilitates hepatocellular carcinoma (HCC) tumorigenesis by sponging miR-516a-5p to release TRAF6 and MAPK11. Cell Death Dis 5.959 中山大学附属第三医院
5 CircPTPRA通过使miR-636海绵化并上调KLF9,在膀胱癌中起到抑癌作用。 CircPTPRA acts as a tumor suppressor in bladder cancer by sponging miR-636 and upregulating KLF9. Aging (Albany NY) 5.515 中山大学孙逸仙纪念医院
6 环形RNA血管动蛋白样1对AKT的转录后调节介导了乳腺癌细胞对紫杉醇的化学耐药性。 Posttranscriptional regulation of AKT by circular RNA angiomotin- like 1 mediates chemoresistance against paclitaxel in breast cancer cells. Aging (Albany NY) 5.515 森尼布鲁克健康科学中心
7 CircHECTD1通过HECTD1介导肺成纤维细胞活化。 CircHECTD1 mediates pulmonary fibroblast activation via HECTD1. Ther Adv Chronic Dis 4.455 东南大学医学院生理学系
8 CircSLNN:通过序列标记神经网络识别circRNA上的RBP结合位点。 CircSLNN: Identifying RBP-Binding Sites on circRNAs via Sequence Labeling Neural Networks. Front Genet 3.517 上海交通大学计算机科学与工程系等
9 线粒体mRNA片段在人类HEK细胞系中环化。 Mitochondrial mRNA Fragments are Circularized in a Human HEK Cell Line. Mitochondrion 3.449 弗吉尼亚大学怀斯分校
10 环状RNA ITCH通过海绵吸附miR-17-5p增加HOXB13表达来抑制前列腺癌的进展。 Circular RNA ITCH suppressed prostate cancer progression by increasing HOXB13 expression via spongy miR-17-5p. Cancer Cell Int 3.439 厦门大学第一附属医院泌尿外科
11 环状RNA H19的敲低通过多嘧啶束结合蛋白1诱导人脂肪干细胞成脂分化。 Knock-down of circular RNA H19 induces human adipose-derived stem cells adipogenic differentiation via a mechanism involving the polypyrimidine tract-binding protein 1. Exp Cell Res 3.329 浙江大学医学院附属邵逸夫医院内分泌科
12 冠状动脉疾病中的环状RNA谱。 Circular RNA profile in coronary artery disease. Am J Transl Res 3.266 东南大学附属中大医院心血管内科
13 低氧诱导的环状RNA has_circRNA_403658通过激活LDHA促进膀胱癌细胞的生长。 Hypoxia-induced circular RNA has_circRNA_403658 promotes bladder cancer cell growth through activation of LDHA. Am J Transl Res 3.266 郑州大学第一附属医院麻醉科
14 EBV病毒相关的胃癌研究 Thirty years of Epstein-Barr virus-associated gastric carcinoma. Virchows Arch 2.868 日本千叶大学医学研究科
15 类固醇诱导的股骨头坏死中差异表达的环状RNA的表达谱分析。 Expression Profile Analysis of Differentially Expressed Circular RNAs in Steroid-Induced Osteonecrosis of the Femoral Head. Dis Markers 2.761 浙江省中医骨伤研究所
16 MC-LR处理人正常肝细胞系(HL7702)细胞后高通量测序分析环状RNA表达谱。 Circular RNA expression profiles following MC-LR treatment in human normal liver cell line (HL7702) cells using high-throughput sequencing analysis. J Toxicol Environ Health A 2.649 中南大学湘雅公共卫生学院等
17 非编码RNA在抑郁症发病机制中的作用。 Role of Non-coding RNA in the Pathogenesis of Depression. Gene 2.638 北京协和医学院药物研究所
18 一种使用部分比对的reads进行指导性比对可以实现单核苷酸分辨率灵敏地检测环状DNA的方法。 Sensitive detection of circular DNAs at single-nucleotide resolution using guided realignment of partially aligned reads. BMC Bioinformatics 2.511 丹麦哥本哈根大学
19 在阿尔茨海默氏病患者的外周血单核细胞中差异表达的环状RNA的分析。 Profiling of differentially expressed circular RNAs in peripheral blood mononuclear cells from Alzheimer’s disease patients. Metab Brain Dis 2.411 济宁医学院附属医院神经内科
20 CircCDYL作为被套细胞淋巴瘤中的新生物标记物,并促进细胞增殖。 CircCDYL Serves as a New Biomarker in Mantle Cell Lymphoma and Promotes Cell Proliferation. Cancer Manag Res 2.243 郑州大学第一附属医院
21 下调的环状RNA hsa_circ_0000291通过靶向miR-183/ITGB1轴抑制胃癌的迁移和增殖。 Downregulated Circular RNA hsa_circ_0000291 Suppresses Migration And Proliferation Of Gastric Cancer Via Targeting The miR-183/ITGB1 Axis. Cancer Manag Res 2.243 同济大学附属第十人民医院血管外科
22 脑死亡大鼠供者肝移植后肝中lncRNA和circRNA表达谱的微阵列分析。 Microarray Analysis For Expression Profiles of lncRNAs and circRNAs in Rat Liver after Brain-Dead Donor Liver Transplantation. Biomed Res Int 2.197 郑州大学第一附属医院等
23 调节2型糖尿病胰岛β细胞自噬的环状RNA的鉴定。 Identification of Circular RNAs Regulating Islet β-Cell Autophagy in Type 2 Diabetes Mellitus. Biomed Res Int 2.197 三亚中心医院内分泌科
24 血清circ_0068481升高的水平可作为特发性肺动脉高压的潜在诊断和预后指标。 Elevated serum circ_0068481 levels as a potential diagnostic and prognostic indicator in idiopathic pulmonary arterial hypertension. Pulm Circ 2.075 广东省心血管病研究所
25 血府逐瘀胶囊对气滞血瘀型患者的敏感生物标志物分析:嵌套病例对照研究。 Sensitive Biomarker Analysis of Xue-Fu-Zhu-Yu Capsule for Patients with Qi Stagnation and Blood Stasis Pattern: A Nested Case-Control Study. Evid Based Complement Alternat Med 1.984 广安门医院心内科
26 circCDYLmicroRNA-105-5p参与调节结肠癌细胞的生长和迁移。 circCDYL/microRNA-105-5p participates in modulating growth and migration of colon cancer cells. Gen Physiol Biophys 1.309 宁波市医疗中心李惠利医院
27 急性髓系白血病耐药细胞中Circrna,Lncrna和Mrna的表达谱筛选及生物信息学分析 Expression Profile Screening and Bioinformatics Analysis of Circrna, Lncrna and Mrna in Acute Myeloid Leukemia Drug-Resistance Cells Turk J Haematol 0.779 厦门大学附属中山医院血液科
28 环状RNA hsa_circ_0014130在肺腺癌细胞系中的表达及其对肺腺癌细胞增殖和侵袭的影响。 Expression of circular RNA hsa_circ_0014130 in lung adenocarcinoma cell lines and its effect on proliferation and invasion of lung adenocarcinoma cell line. Zhonghua Bing Li Xue Za Zhi Not Found 天津市第四中心医院肿瘤介入科

 

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