欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索(收集最新发布的circRNA文献共计25篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。检索式:circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、:环状RNA的准确定量及识别广泛的环状RNA可变剪切事件。
标题:Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform switching events.
杂志:Nature Communications
IF:11.878
通讯作者:赵方庆(中国科学院北京生命科学研究院)
环状RNA(circRNA)的检测和定量面临若干重大挑战,包括较高的错误发现率,rRNA去除和RNase R处理效率不均匀性,以及反向剪接读数可能被低估。该研究中,研究者提出了一种新颖的算法——CIRIquant,用于circRNA的精确定量和差异表达分析。通过构建伪circRNA参考组重新排列RNA-seq读段,并采用复杂的统计模型来纠正RNase R处理偏倚,CIRIquant可以为circRNA提供更准确的表达值,并显著降低错误发现率。研究者进一步开发了实施两种独立措施的一站式差异表达分析流程,有助于揭示circRNA及其线性对应转录本之间竞争性剪接的调控。CIRIquant在处理肝细胞癌的RNA-seq数据集中,可表征circRNA转录组及其对应线性转录组之间竞争性剪切关系,表明CIRIquant在探索肝脏肿瘤发生中广泛的转录组变化能力方面表现突出。
图注:CIRIquant分析流程示意图
2、:大肠癌中外泌体传递的circRNA通过miR-122-PKM2轴促进糖酵解并诱导化疗抗性。
标题:Exosome-delivered circRNA promotes glycolysis to induce chemoresistance through the miR-122-PKM2 axis in colorectal cancer.
杂志:Molecular Oncology
IF:5.962
通讯作者: 巴一 和 应国光(天津医科大学附属肿瘤医院)
大肠癌(CRC)及其其他恶性肿瘤通常依靠有氧糖酵解来产生ATP,以实现快速生长和化疗耐药性。丙酮酸激酶(PKM2)的M2同工酶在催化糖酵解中起关键作用,PKM2的表达甚至在同一肿瘤内也会发生变化。在这项研究中,研究者证实PKM2在CRC细胞中的表达是异质的,即在奥沙利铂抗性细胞中较高,而在敏感细胞中相对较低,并且发现化疗抗性细胞糖酵解和ATP产生增强。并且发现此为一种依赖PKM2的化疗耐药机制,通过该机制,化疗敏感性细胞可能逐渐转化为化疗抗性细胞。环状RNA hsa_circ_0005963(在该研究中称为ciRS-122),被确定为靶向PKM2的miRNA-122的海绵,与化疗抗性呈正相关。体外和体内研究表明,来自奥沙利铂抗性细胞的外泌体将ciRS-122传递至敏感细胞,从而通过海绵吸附miR-122和上调PKM2促进糖酵解和耐药性。此外,外泌体转运的si-ciRS-122可通过调节体内的ciRS-122-miR-122-PKM2途径抑制糖酵解并逆转CRC细胞对奥沙利铂的耐药性。源自化疗抗性CRC细胞的外泌体可以跨细胞转移ciRS-122并促进糖酵解,从而降低化疗敏感性细胞中的药物敏感性。这种细胞间信号传递暗示了潜在的新型治疗靶点,并为耐药性CRC的未来临床应用奠定了基础。
图注:小鼠尾静脉注射exo-si-ciRS-122可在体内导致SW480细胞对奥沙利铂(L-OHP)的敏感性。
3、:环状RNA circSLC26A4通过miR-1287-5p / HOXA7轴加速宫颈癌的进展。
标题:Circular RNA circSLC26A4 Accelerates Cervical Cancer Progression via miR-1287-5p/HOXA7 Axis.
杂志:Molecular Therapy-nucleic Acids
IF:5.919
通讯作者: 朱元方(暨南大学附属深圳市宝安区妇幼保健院); 罗新 (暨南大学附属第一医院妇产科); 丁岩(新疆医科大学第一附属医院)
该研究关注circRNA在宫颈癌中的作用及生物形成。研究者鉴定出一种新型的circRNA,circSLC26A4在宫颈癌组织和细胞中显著上调。在临床上,circSLC26A4的高表达与宫颈癌患者生存率低有关。细胞功能上,circSLC26A4敲低抑制了体外和体内宫颈癌细胞的增殖,侵袭和肿瘤生长。此外,circSLC26A4充当miR-1287-5p的海绵;而miR-1287-5p靶向HOXA7 mRNA的3’UTR。此外,RNA结合蛋白(RBP)——QKI被确定与SLC26A4基因内含子中的QKI反应元件(QREs)相互作用,从而促进circSLC26A4生物形成。这些发现表明,circSLC26A4通过QKI / circSLC26A4 / miR-1287-5p / HOXA7轴促进宫颈癌的进展,这可能为宫颈癌带来新的治疗策略。
图注:circSLC26A4通过QKI / circSLC26A4 / miR-1287-5p / HOXA7轴促进宫颈癌的进展示意图。
文献列表:
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 环状RNA的准确定量及识别广泛的环状RNA可变剪切事件。 | Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform switching events. | Nat Commun | 11.878 | 中国科学院北京生命科学研究院 |
2 | 大肠癌中外泌体传递的circRNA通过miR-122-PKM2轴促进糖酵解并诱导化疗抗性。 | Exosome-delivered circRNA promotes glycolysis to induce chemoresistance through the miR-122-PKM2 axis in colorectal cancer. | Mol Oncol | 5.962 | 天津医科大学附属肿瘤医院 |
3 | 环状RNA circSLC26A4通过miR-1287-5p / HOXA7轴加速宫颈癌的进展。 | Circular RNA circSLC26A4 Accelerates Cervical Cancer Progression via miR-1287-5p/HOXA7 Axis. | Mol Ther Nucleic Acids | 5.919 | 暨南大学附属深圳市宝安区妇幼保健院等 |
4 | CircNFIX通过调节miR-378e/RPN2轴促进神经胶质瘤的进展。 | CircNFIX promotes progression of glioma through regulating miR-378e/RPN2 axis. | J Exp Clin Cancer Res | 5.646 | 福建医科大学附属第一医院 |
5 | 环状RNA SMO通过海绵吸附miR-338-3p增强SMO的表达,促进神经胶质瘤的生长。 | Circular RNA SMO sponges miR-338-3p to promote the growth of glioma by enhancing the expression of SMO. | Aging (Albany NY) | 5.515 | 华中科技大学同济医学院 |
6 | 环状RNA circ_0003204通过miR-370-3p/TGFβR2/phospho-SMAD3轴抑制动脉粥样硬化中内皮细胞的增殖,迁移和管形成。 | Circular RNA circ_0003204 inhibits proliferation, migration and tube formation of endothelial cell in atherosclerosis via miR-370-3p/TGFβR2/phosph-SMAD3 axis. | J Biomed Sci | 5.203 | 山东第一医科大学第一附属医院 |
7 | 从缺氧预处理的心肌细胞中释放的外泌体circHIPK3通过miR-29a/IGF-1途径调节心脏微血管内皮细胞的氧化损伤。 | Exosomal circHIPK3 Released from Hypoxia-Pretreated Cardiomyocytes Regulates Oxidative Damage in Cardiac Microvascular Endothelial Cells via the miR-29a/IGF-1 Pathway. | Oxid Med Cell Longev | 4.868 | 遵义医科大学附属医院 |
8 | 综述:破译环状RNA在神经退行性疾病中的作用。 | Going around in circles: deciphering the role of circular RNAs in neurodegenerative disease. | Curr Opin Psychiatry | 4.483 | 新南威尔士大学 |
9 | 环状RNAs是心脏纤维化中潜在的治疗疗法。 | Circular RNAs as potential theranostics in the cardiac fibrosis. | Heart Fail Rev | 4.015 | 塔比亚特莫达雷斯大学 |
10 | 血清环状RNA充当肥厚性梗阻性心肌病的血液生物标记。 | Serum circular RNAs act as blood-based biomarkers for hypertrophic obstructive cardiomyopathy. | Sci Rep | 4.011 | 汉诺威汉诺威医学院 |
11 | 敲低环状RNA circZNF652可通过调节miR-181a减轻LPS诱导的炎症损伤。 | Knockdown of circular RNA circZNF652 remits LPS-induced inflammatory damage by regulating miR-181a. | Biofactors | 3.598 | 济宁市妇幼保健计划生育服务中心 |
12 | 新型环状RNA circFN1通过海绵吸附miR-182-5p增强胃癌的顺铂耐药性。 | A novel circular RNA circFN1 enhances cisplatin resistance in gastric cancer via sponging miR-182-5p. | J Cell Biochem | 3.448 | 皖南医学院弋矶山医院 |
13 | 环状RNA ACR通过降低microRNA-145-3p减轻了葡萄糖引起的RSC96细胞凋亡和自噬。 | Circular RNA ACR relieves high glucose-aroused RSC96 cell apoptosis and autophagy via declining microRNA-145-3p. | J Cell Biochem | 3.448 | 菏泽市立医院 |
14 | 直肠癌细胞系中环状RNA circMTO1通过下调miR-19b-3p充当抗肿瘤因子。 | Circular RNA circMTO1 acts as an antitumor factor in rectal cancer cell lines by downregulation of miR-19b-3p. | J Cell Biochem | 3.448 | 济宁医学院附属医院 |
15 | circSMAD2通过抑制microRNA-9来控制迁移和上皮-间质转化。 | circSMAD2 governs migration and epithelial-mesenchymal transition by inhibiting microRNA-9. | J Cell Biochem | 3.448 | 吉林大学中日联合医院 |
16 | 环状RNA ABCB10通过使miR-670-3p海绵化来增加HMG20A表达,从而促进肝癌的进展。 | Circular RNA ABCB10 promotes hepatocellular carcinoma progression by increasing HMG20A expression by sponging miR-670-3p. | Cancer Cell Int | 3.439 | 吉林大学第一医院 |
17 | 新型环状RNA circ-CAMK2A通过调节miR-615-5p /纤连蛋白1途径来增强肺腺癌的转移。 | The novel circular RNA circ-CAMK2A enhances lung adenocarcinoma metastasis by regulating the miR-615-5p/fibronectin 1 pathway. | Cell Mol Biol Lett | 3.367 | 河南省胸科医院 |
18 | 环形RNA_LARP4通过海绵化miR-1323调节PTEN/ PI3K/AKT途径,阻碍食管鳞状细胞癌的进展。 | Circular RNA_LARP4 Sponges miR-1323 and Hampers Progression of Esophageal Squamous Cell Carcinoma Through Modulating PTEN/PI3K/AKT Pathway. | Dig Dis Sci | 2.937 | 南通大学附属医院 |
19 | 基于MetaDE的胃癌circRNA表达谱分析。 | MetaDE-Based Analysis of circRNA Expression Profiles Involved in Gastric Cancer. | Dig Dis Sci | 2.937 | 中国医科大学附属第一医院 |
20 | 环形RNA_101237通过靶向心肌细胞中的let-7a-5p / IGF2BP3介导缺氧/复氧损伤。 | Circular RNA_101237 mediates anoxia/reoxygenation injury by targeting let‑7a‑5p/IGF2BP3 in cardiomyocytes. | Int J Mol Med | 2.928 | 广西壮族自治区人民医院 |
21 | 玉米中环状RNA的鉴定,表征和功能预测。 | Identification, characterization, and functional prediction of circular RNAs in maize. | Mol Genet Genomics | 2.879 | 浙江大学作物科学研究所 |
22 | 氯胺酮诱导的大鼠海马中rno_circRNA_014900和rno_circRNA_005442的异常表达。 | Abnormal expression of rno_circRNA_014900 and rno_circRNA_005442 induced by ketamine in the rat hippocampus. | BMC Psychiatry | 2.666 | 阿拉巴马大学伯明翰分校 |
23 | 与肝细胞癌相关的环状RNA相关的ceRNA网络的生物信息学分析。 | Bioinformatic Analysis of Circular RNA-Associated ceRNA Network Associated with Hepatocellular Carcinoma. | Biomed Res Int | 2.197 | 吉林大学第二医院 |
24 | Circ_MDM2_000139,Circ_ATF2_001418,Circ_CDC25C_002079和Circ_BIRC6_001271参与XAV939在非小细胞肺癌中的功能。 | Circ_MDM2_000139, Circ_ATF2_001418, Circ_CDC25C_002079, and Circ_BIRC6_001271 Are Involved in the Functions of XAV939 in Non-Small Cell Lung Cancer. | Can Respir J | 1.803 | 吉林大学中日联合医院 |
25 | 前列腺癌上皮-间充质转化相关circRNA和miRNA的筛选和鉴定。 | Screening and identification of epithelial-to-mesenchymal transition-related circRNA and miRNA in prostate cancer. | Pathol Res Pract | 1.794 | 厦门大学中山医院 |