欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索(收集最新发布的circRNA文献共计19篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。检索式:circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

1、:PTBP1调控CircRNA_001160的形成并通过CircRNA_001160/miR-195-5p/ETV1轴调节BTB的通透性。

标题:Biosynthetic CircRNA_001160 induced by PTBP1 regulates the permeability of BTB via the CircRNA_001160/miR-195-5p/ETV1 axis.

杂志:Cell Death & Disease

IF:5.959

通讯作者:薛一雪中国医科大学基础医学院神经生物学教研室

血液肿瘤屏障(BTB)的存在严重阻碍了抗肿瘤药物向中枢神经系统的运输,影响了神经胶质瘤的治疗效果。胶质瘤内皮细胞(GEC)是BTB的主要结构基础。环状RNA被认为是内皮细胞生长的重要调节剂。在这项研究中,研究者发现在GEC中,聚嘧啶束结合蛋白1(PTBP1)和circRNA_001160被显著上调。敲低PTBP1或circRNA_001160分别显著增加了BTB的通透性。作为miR-195-5p的分子海绵,circRNA_001160通过吸附miR-195-5p减弱了其对靶基因ETV1的负调控。此外,ETC1在GEC中过表达。ETV1绑定到紧密连接相关蛋白的启动子区域,并增加了启动子活性,从而显著提高了紧密连接相关蛋白的表达水平。该研究表明,PTBP1,circRNA_001160和miR-195-5p与抗肿瘤药物Dox的联合应用有效地促进了Dox通过BTB,并极大地诱导了神经胶质瘤细胞的凋亡。研究结果表明PTBP1/circRNA_001160/miR-195-5p/ETV1轴在调节BTB渗透性中至关重要,并为神经胶质瘤的治疗提供了新的靶点。

图注: PTBP1, circRNA_001160, miR-195-5p增强Dox的抗肿瘤效应促进U87细胞凋亡

2、:小鼠视网膜发育的环状RNA转录组研究。

标题:The Circular RNome of Developmental Retina in Mice.

杂志:Molecular Therapy-nucleic Acids

IF:5.919

通讯作者: MengZhou和金子兵教授(温州医科大学附属眼视科医院)

环状RNA(circRNA)是一类具有广泛表达模式的非编码RNA,它们构成了基因组调控网络的重要组成部分。迄今为止,尚未很好地了解circRNA在视网膜(中枢神经系统的关键部分)中的表达模式和调控能力。在这项研究中,研究者对小鼠视网膜发育五个阶段(E18.5,P1,P7,P14和P30)的RNA进行了测序。总共鉴定出9,029个circRNA。大多数circRNA在不同阶段以特定的特征表达,它们的表达模式与宿主线性转录本不同。一些circRNA可以充当多个视网膜microRNA(miRNA)的海绵。此外,circTulp4可以充当竞争性内源RNA(ceRNA)来调节靶基因。值得注意的是,体内沉默circTulp4导致小鼠的外核层薄(ONL)和视网膜功能缺陷。另外,在视网膜变性模型(rd8小鼠)中,circRNA在疾病发作更早的时间点失调。总而言之,该研究提供了视网膜发育过程中第一个circRNA表达图谱,并突出了circRNA在视网膜发育和变性中的关键生物学作用。

图注:circRNA在小鼠视网膜发育阶段的表达特征

3、:去极化相关的CircRNA调节神经基因表达,在某些情况下可能充当翻译模板。

标题:Depolarization-Associated CircRNA Regulate Neural Gene Expression and in Some Cases May Function as Templates for Translation.

杂志:Cells

IF:5.656

通讯作者: Murray J. Cairns(澳大利亚纽卡斯尔大学)

环状RNA(circRNA)是一类相对较新的RNA转录本,在哺乳动物脑中具有较高的丰度。该研究结果显示分化的神经母细胞瘤细胞中的circRNAs表达明显改变,去极化后有107个上调和47个下调的circRNAs。这与去极化细胞中microRNA(miRNA)(n = 269)和mRNA(n = 1511)表达的整体变化相吻合,表明circRNA-miRNA-mRNA的调控轴参与了对神经活动的细胞反应。生物信息学分析表明,环状RNA通过与常见miRNA相互作用来影响mRNA表达的能力。高表达的circRNA——circ-EXOC6B的功能缺失导致与EXOC6B功能相关的过程的大量mRNA的表达改变,这表明circRNA可能特异性调节与其宿主基因相关的基因。研究还发现,circRNA的一个子集,特别是在去极化细胞中与核糖体有关,表明它们可能被翻译成蛋白质。总体而言,这些数据支持circRNA在神经元活性相关的基因修饰和调控中起作用。

图注:分化的神经母细胞瘤细胞中的circRNAs表达谱

文献列表:

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 PTBP1调控CircRNA_001160的形成并通过CircRNA_001160/miR-195-5p/ETV1轴调节BTB的通透性。 Biosynthetic CircRNA_001160 induced by PTBP1 regulates the permeability of BTB via the CircRNA_001160/miR-195-5p/ETV1 axis. Cell Death Dis 5.959 中国医科大学
2 小鼠视网膜发育的环状RNA转录组研究。 The Circular RNome of Developmental Retina in Mice. Mol Ther Nucleic Acids 5.919 温州医科大学等
3 去极化相关的CircRNA调节神经基因表达,在某些情况下可能充当翻译模板。 Depolarization-Associated CircRNA Regulate Neural Gene Expression and in Some Cases May Function as Templates for Translation. Cells 5.656 澳大利亚纽卡斯尔大学
4 Hsa_circ_0006948通过食管鳞状细胞癌中的miR-490-3p / HMGA2轴增强癌症进展和上皮-间质转化。 Hsa_circ_0006948 enhances cancer progression and epithelial-mesenchymal transition through the miR-490-3p/HMGA2 axis in esophageal squamous cell carcinoma. Aging (Albany NY) 5.515 中山大学孙中山纪念医院
5 环状RNA和胃肠道癌症:具有预后和治疗作用的表观遗传调节剂。 Circular RNAs and gastrointestinal cancers: Epigenetic regulators with a prognostic and therapeutic role. Crit Rev Oncol Hematol 5.012 塔比亚特莫达雷斯大学等
6 环状METRN RNA hsa_circ_0037251通过使miR-1229-3p海绵化并调节mTOR表达来促进神经胶质瘤进展。 Circular METRN RNA hsa_circ_0037251 Promotes Glioma Progression by Sponging miR-1229-3p and Regulating mTOR Expression. Sci Rep 4.011 郑州大学第一附属医院
7 在肺腺癌中环状RNA CDR1-AS通过EGFR / PI3K信号通路促进培美曲塞和顺铂耐药。 Circular RNA CDR1-AS contributes to pemetrexed and cisplatin chemoresistance through EGFR/PI3K signaling pathway in lung adenocarcinoma. Biomed Pharmacother 3.743 华盛顿大学医学院
8 正常和热应激母猪垂体中的环状RNA全基因组分析。 Genomewide analysis of circular RNA in pituitaries of normal and heat-stressed sows. BMC Genomics 3.501 华南农业大学
9 CircACAP2通过靶向miR-29a/b-3p-COL5A1轴促进乳腺癌的增殖和转移。 CircACAP2 promotes breast cancer proliferation and metastasis by targeting miR-29a/b-3p-COL5A1 axis. Life Sci 3.448 周口市中心医院
10 环状RNA circDENND2A通过海绵化microRNA-34a保护H9c2细胞免受氧葡萄糖剥夺诱导的细胞凋亡。 Circular RNA circDENND2A protects H9c2 cells from oxygen glucose deprivation-induced apoptosis through sponging microRNA-34a. Cell Cycle 3.259 济宁市第一人民医院
11 全转录组测序表明,非编码RNA与兔子的胚胎形态发生和发育有关。 Whole transcriptome sequencing reveals that non-coding RNAs are related to embryo morphogenesis and development in rabbits. Genomics 3.16 四川省畜牧科学研究院
12 使用RNA-Seq鉴定和表征两个产奶量不同的绵羊品种的泌乳乳腺中的环状RNA。 Identification and characterization of circular RNA in lactating mammary glands from two breeds of sheep with different milk production profiles using RNA-Seq. Genomics 3.16 甘肃农业大学
13 CircRNA circPDSS1通过下调miR-16促进膀胱癌进展。 CircRNA circPDSS1 promotes bladder cancer by downregulating miR-16. Biosci Rep 2.535 甘肃省人民医院
14 环状RNA circ-CMPK1通过海绵miR-302e升高cyclin D1来促进非小细胞肺癌的细胞增殖。 Circular RNA circ-CMPK1 contributes to cell proliferation of non-small cell lung cancer by elevating cyclin D1 via sponging miR-302e. Mol Genet Genomic Med 2.448 郑州大学附属肿瘤医院
15 环状RNA HIPK3通过使miR-192-5p海绵化并上调转录因子forkhead box O1来促进高血糖和胰岛素稳态。 Circular RNA HIPK3 contributes to hyperglycemia and insulin homeostasis by sponging miR-192-5p and upregulating transcription factor forkhead box O1. Endocr J 1.94 福建医科大学附属第二医院
16 环状RNA SMARCA5与良好的临床肿瘤特征和预后相关,并提高了肝内胆管癌的化疗敏感性。 Circular RNA SMARCA5 correlates with favorable clinical tumor features and prognosis, and increases chemotherapy sensitivity in intrahepatic cholangiocarcinoma. J Clin Lab Anal 1.728 黄石市中心医院
17 鼻咽癌的放射敏感性:聚焦于Epstein-Barr病毒,MicroRNA,长非编码RNA和环状RNA。 Radio-Susceptibility of Nasopharyngeal Carcinoma: Focus on Epstein-Barr virus, MicroRNAs, Long non-coding RNAs and Circular RNAs. Curr Mol Pharmacol 1.596 南华大学衡阳医学院
18 从致病,诊断和治疗的角度看:Exosomes在糖尿病及其并发症中的作用 [Exosomes and their roles in diabetes mellitus and its complications: from pathogenic, diagnostic and therapeutical perspectives]. Sheng Li Xue Bao Not Found 上海市第一人民医院
19 环状RNA参与干细胞分化的机制研究及其组织工程应用前景 [Research progress on the mechanism of circular RNA involved in stem cell differentiation and its prospect of tissue engineering application]. Sheng Wu Yi Xue Gong Cheng Xue Za Zhi Not Found 四川大学华西口腔医院

 

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