欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计24篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、精神病相关的环状RNA控制突触基因的表达和认知。
标题:A psychiatric disease-related circular RNA controls synaptic gene expression and cognition.
杂志:Molecular Psychiatry;影响因子: 11.973
通讯作者:Nikolaos Mellios (新墨西哥大学医学院)
尽管环状RNA(circRNA)富集在哺乳动物的大脑中,但关于其参与脑功能和精神疾病的潜在功能知之甚少。这篇研究中,作者发现一种在额叶皮层神经元中大量表达富集的circRNA——circHomer1a,衍生自Homer蛋白同源物1(HOMER1),在精神分裂症(SCZ)和双相情感障碍(BD)患者的额叶前皮层(PFC)和诱导的多能干细胞来源的神经元培养物中均显著减少。此外,circHomer1a的改变与精神分裂症(SCZ)的背外侧前额叶皮层(DLPFC)和眶额叶皮层(OFC)发病年龄呈正相关。没有观察到SCZ发病年龄和线性HOMER1 mRNA之间的相关性,其表达在BD和SCZ死后大脑中基本不变。使用体内circRNA特异性敲低技术敲低小鼠额叶前皮层(PFC)中circHomer1a,结果显示circHomer1a调节了突触可塑性和许多精神病相关基因的可变剪切mRNA的表达。有趣的是,小鼠眶额叶皮层(OFC)中circHomer1a的敲低导致OFC介导的认知灵活性的特定缺陷。最后,作者证明了神经元RNA结合蛋白HuD与circHomer1a结合并可以影响其在额叶皮层中的突触表达。总的来说,该研究成果揭示了一种新型的精神疾病相关的circRNA——circHomer1a调节突触基因的表达和认知的灵活性。
图注:circHomer1a敲低后影响精神疾病和神经相关基因的可变剪切mRNA表达
- 胶质瘤中circ-MAPK4通过海绵吸附miR-125a-3p抑制经由MAPK信号通路的细胞凋亡。
标题:Circular RNA MAPK4 (circ-MAPK4) inhibits cell apoptosis via MAPK signaling pathway by sponging miR-125a-3p in gliomas.
杂志:Molecular Cancer ;影响因子:10.679
通讯作者:尹东 和 刘安民(中山大学孙逸仙纪念医院)
神经胶质瘤是中枢神经系统(CNS)中最常见,最具侵略性的原发性恶性肿瘤,环状RNA在其中的作用还有很多未解之谜。在这项研究中,研究者通过生物信息学分析早期神经发育过程中的失调circRNA,筛选鉴定到circ-MAPK4(has_circ_0047688),circ-MAPK4在早期神经分化过程中被显著下调。在神经胶质瘤中,circ-MAPK4作为一种癌基因,被逆向上调并与神经胶质瘤的临床病理阶段有关(P <0.05)。最后,体内外实验证实circ-MAPK4在体外和体内均可促进神经胶质瘤细胞的存活并抑制其凋亡。此外,研究者还证明circ-MAPK4参与调节p38 / MAPK通路,从而影响神经胶质瘤的增殖和凋亡。miR-125a-3p(一种miRNA)通过削弱p38 / MAPK途径显示出肿瘤抑制功能,这种抑制作用可通过抑制circ-MAPK4而增强。抑制miR-125a-3p可以部分挽救p38 / MAPK磷酸化水平的提高和circ-MAPK4敲低诱导的凋亡增加。研究结论表明,circ-MAPK4是通过调节miR-125a-3p的p38 / MAPK信号通路在神经胶质瘤细胞存活和凋亡中发挥关键作用,可以作为神经胶质瘤治疗的新靶点。
图注:人神经胚状体和神经胶质瘤中circ-MAPK4的表达特征。
- 综述:环状RNA数据库的现状和观点。
标题:Closing the circle: current state and perspectives of circular RNA databases.
杂志:Briefings In Bioinformatics;影响因子:9.101
通讯作者:Marieke Vromman,Pieter-Jan Volders和Pieter-Jan Volders(比利时根特大学)
环状RNA(circRNA)与多种疾病(包括癌症)密切关联。但是,大多数circRNA的精确功能和分子机制还不清楚。目前,许多研究者遵循不同的实验和计算方法鉴定circRNA,开发了多个circRNA数据库,为circRNA研究带来了许多便利。但当前的circRNA数据库存在几个主要问题,克服这些问题将大大提高该领域的发展。首先,由于circRNA的低丰度和高度特异性表达,以及各种测序方法,circRNA检测工具和数据分析方法不同,导致circRNA内容重叠,因此缺少真正的circRNA参考集。第二个主要问题是circRNA术语的模棱两可,跨不同数据库的circRNA的冗余名称甚至冲突名称都会导致重现性危机。第三,circRNA数据库本质上依赖于circRNA反向剪接拼接的位置,而选择性剪接可能导致circRNA具有不同的长度和序列。为了唯一地识别circRNA分子,需要完整的环状序列。第四,有些circRNA数据库注释了circRNA的miRNA结合和蛋白质编码潜力,但这些注释通常基于假定的circRNA序列。最后,一些数据库没有定期更新,包含不完整的数据或存在链接问题。在这篇综述中,作者对当前circRNA数据库及其内容,功能和可用性进行了全面概述。除了讨论有关circRNA数据库的当前问题外,作者还提出了一些重要建议。
表注:已有的circRNA数据库简介
文献列表:
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 精神病相关的环状RNA控制突触基因的表达和认知。 | A psychiatric disease-related circular RNA controls synaptic gene expression and cognition. | Mol Psychiatry | 11.973 | 新墨西哥大学医学院 |
2 | 胶质瘤中circ-MAPK4通过海绵吸附miR-125a-3p抑制经由MAPK信号通路的细胞凋亡 | Circular RNA MAPK4 (circ-MAPK4) inhibits cell apoptosis via MAPK signaling pathway by sponging miR-125a-3p in gliomas. | Mol Cancer | 10.679 | 中山大学孙逸仙纪念医院 |
3 | 综述:环状RNA数据库的现状和观点。 | Closing the circle: current state and perspectives of circular RNA databases. | Brief Bioinform | 9.101 | 比利时根特大学 |
4 | 来自反转录转座子的反向剪接RNA与着丝粒结合并调节玉米着丝粒染色质环。 | Back-spliced RNA from retrotransposon binds to centromere and regulates centromeric chromatin loops in maize. | PLoS Biol | 8.386 | 中国科学院遗传与发育生物学研究所 |
5 | 靶向雌激素受体α(ERα)介导的circ-SMG1.72 / miR-141-3p / Gelsolin信号传导可更好地抑制HCC细胞侵袭。 | Targeting the estrogen receptor alpha (ERα)-mediated circ-SMG1.72/miR-141-3p/Gelsolin signaling to better suppress the HCC cell invasion. | Oncogene | 6.634 | 中南大学湘雅医院等 |
6 | Hsa_circ_0070963通过调节miR-223-3p和LEMD3抑制肝纤维化。 | Hsa_circ_0070963 inhibits liver fibrosis via regulation of miR-223-3p and LEMD3. | Aging (Albany NY) | 5.515 | 陕西中医药大学附属医院 |
7 | 血浆环状RNA hsa_circ_0001445和冠状动脉疾病:作为生物标志物的性能。 | Plasma circular RNA hsa_circ_0001445 and coronary artery disease: Performance as a biomarker. | FASEB J | 5.391 | 德国汉诺威医学院 |
8 | 心力衰竭患者血浆中与血小板活动相关的环状RNA表达谱。 | Circular RNA Expression Profiles in Plasma from Patients with Heart Failure Related to Platelet Activity. | Biomolecules | 4.694 | 滨州医学院药学院 |
9 | 环状RNA circTET3通过靶向miR-351-5p介导大鼠血管平滑肌细胞的迁移。 | Circular RNA circTET3 mediates migration of rat vascular smooth muscle cells by targeting miR-351-5p. | J Cell Physiol | 4.522 | 上海交通大学生命科学技术学院 |
10 | 环状RNA–乳腺癌的新生物标志物:系统评价。 | Circular RNA; a new biomarker for breast cancer: A systematic review. | J Cell Physiol | 4.522 | 伊朗德黑兰健康科学研究所 |
11 | CircPVT1通过miR-145-5p / ABCC1轴促进了肺腺癌的化疗耐药性。 | CircPVT1 contributes to chemotherapy resistance of lung adenocarcinoma through miR-145-5p/ABCC1 axis. | Biomed Pharmacother | 3.743 | 中国医科大学附属盛京医院 |
12 | 阿尔茨海默氏病小鼠模型中松果体的转录组分析。 | Transcriptome Analysis of Pineal Glands in the Mouse Model of Alzheimer’s Disease. | Front Mol Neurosci | 3.72 | 韩国全南大学医学院 |
13 | 综述:环状RNA–行人路少的新领域。 | Circular RNAs-The Road Less Traveled. | Front Mol Biosci | 3.565 | 印度马杜赖卡玛拉大学 |
14 | 对神经胶质瘤中circRNAs表达谱的微阵列分析表明,circ_0037655可以通过调节miR-214 / PI3K信号传导来促进神经胶质瘤的进展。 | Microarray analysis of circRNAs expression profile in gliomas reveals that circ_0037655 could promote glioma progression by regulating miR-214/PI3K signaling. | Life Sci | 3.448 | 河北北方学院附属第一医院 |
15 | 环状RNA ATXN7通过使miR-4319变海绵并调节ENTPD4来促进胃癌的发展。 | Circular RNA ATXN7 promotes the development of gastric cancer through sponging miR-4319 and regulating ENTPD4. | Cancer Cell Int | 3.439 | 山东大学第二医院 |
16 | 与免疫监视相关的分子标记物可作为非小细胞肺癌的预测和监测工具:最新成就和未来前景。 | Molecular markers related to immunosurveillance as predictive and monitoring tools in non-small cell lung cancer: recent accomplishments and future promises. | Expert Rev Mol Diagn | 3.099 | 希腊海拉斯技术与研究基金会 |
17 | CircCTDP1通过microRNA‑320b / HOXA10 /TGFβ2途径促进鼻咽癌的进展。 | CircCTDP1 promotes nasopharyngeal carcinoma progression via a microRNA‑320b/HOXA10/TGFβ2 pathway. | Int J Mol Med | 2.928 | 苏州大学附属第三医院 |
18 | 环状RNA circ-itch通过microRNA-93-5p / FOXK2轴抑制宫颈癌的恶性行为。 | Circular RNA Circ-ITCH Inhibits the Malignant Behaviors of Cervical Cancer by microRNA-93-5p/FOXK2 Axis. | Reprod Sci | 2.559 | 山东大学第二医院 |
19 | 环状RNA和糖尿病:具有诊断作用的表观遗传调节剂。 | Circular RNA and Diabetes: Epigenetic Regulator with Diagnostic role. | Curr Mol Med | 2.196 | 伊朗马什哈德医科大学院等 |
20 | 环状RNA CCDC66通过CCDC66的过表达促进腹主动脉瘤。 | Circular RNA CCDC66 facilitates abdominal aortic aneurysm through the overexpression of CCDC66. | Cell Biochem Funct | 2.142 | 武汉市第五医院 |
21 | 环形RNA(CircRNA)Ddx17在小鼠卵清蛋白(OVA)致敏性鼻炎(AR)中的保护作用。 | Protective Effect of Circular RNA (CircRNA) Ddx17 in Ovalbumin (OVA)-Induced Allergic Rhinitis (AR) Mice. | Med Sci Monit | 1.98 | 中国医科大学附属盛京医院 |
22 | 在乳腺癌中环状RNA相关竞争性内源RNA网络的分析。 | Analysis of circular RNA-associated competing endogenous RNA network in breast cancer. | Oncol Lett | 1.871 | 青岛大学医学院 |
23 | 年龄相关的黄斑变性的动物(小鼠)模型中研究circRNA表达特征并分析circRNA-miRNA-mRNA网络。 | Investigation of circRNA Expression Profiles and Analysis of circRNA-miRNA-mRNA Networks in an Animal (Mouse) Model of Age-Related Macular Degeneration. | Curr Eye Res | 1.672 | 中南大学湘雅二医院 |
24 | CircRNA_0000502通过靶向microRNA-124促进肝癌转移并抑制细胞凋亡 | CircRNA_0000502 promotes hepatocellular carcinoma metastasis and inhibits apoptosis through targeting microRNA-124. | J BUON. | 1.379 | 贵州省人民医院 |