欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计31篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、Circ-MALAT1既可以作为mRNA翻译制动器,也可海绵吸附microRNA来促进肝细胞癌干细胞的自我更新。
标题:Circ-MALAT1 Functions as Both an mRNA Translation Brake and a microRNA Sponge to Promote Self-Renewal of Hepatocellular Cancer Stem Cells.
杂志:Adv Sci (Weinh) ;影响因子:15.804
通讯作者:Chuanbin Mao(美国克拉荷马大学)和刘善荣教授(上海长海医院)
已知环状RNA(circRNA)和癌症干细胞(CSC)均与癌症有关,但它们之间的相互作用仍不清楚。上海长海医院刘善荣教授、美国俄克拉荷马大学Mao Chunbin等人发现长链非编码RNA-MALAT1反向剪接产生的circRNA—circ MALAT1调控了肝细胞CSC自我更新。在RNA结合蛋白AUF1的介导下,Circ-MALAT1在临床肝细胞癌样本的CSC中显著高表达。出乎意料的是,circMALAT1在核糖体中起刹车作用,通过与核糖体和mRNA形成新的三元复合物,从而阻止PAX5 mRNA的翻译并促进CSCs的自我更新。这种新发现的circRNA制动机制称为mRNA制动,结合其更传统的miRNA海绵作用,该研究揭示了circRNA-circ MALAT1介导的转录后调控的双重模式,可维持特定的细胞状态。
图注:circRNA-circ MALAT1介导的mRNA翻译制动和microRNA spong转录后调控的双重模式维持肝细胞癌干细胞自我更新作用机制示意图
- CircMUC16通过与ATG13和miR-199a相互作用促进上皮性卵巢癌的自噬。
标题:CircMUC16 promotes autophagy of epithelial ovarian cancer via interaction with ATG13 and miR-199a.
杂志:Mol Cancer ;影响因子:10.679
通讯作者:胡建国 (重庆医科大学附属第二医院)
卵巢癌(EOC)是最常见的妇科恶性肿瘤之一,死亡率很高。尽管卵巢癌的化学疗法和放射疗法取得了快速进展,但复发性卵巢癌患者基本上无法治愈。不幸的是,卵巢癌的分子病因学仍然难以捉摸。环状RNA(circRNA)是近年来发现的一类非编码RNA。CircRNA具有多种生物学功能,包括调节细胞增殖,侵袭,凋亡等。circRNA在卵巢癌中的表达及其作用尚无完整而系统的研究。这项研究中,研究者通过新一代测序(NGS)技术对EOC组织和健康的卵巢组织进行了全基因组circRNA分析。与健康的卵巢组织相比,CircMUC16在EOC组织中的表达显著增加。circMUC16的表达与EOC的阶段和等级有关。因此,沉默circMUC16抑制SKOV3细胞的自噬。相反,circMUC16的过表达促进了A2780细胞的自噬。CircMUC16介导的自噬加剧了EOC的侵袭和转移。从机理上讲,circMUC16可以直接与miR-199a-5p结合并减轻对靶Beclin1和RUNX1的抑制。反过来,RUNX1通过促进circMUC16的转录来提高其表达。CircMUC16可以直接与ATG13结合并促进其表达。
图注:CircMUC16调控EOC细胞体内转移
3、综述:用于circRNA发现和分析的生物信息学工具。
标题:The bioinformatics toolbox for circRNA discovery and analysis.
杂志:Brief Bioinform;影响因子:9.101
通讯作者:陈亮副教授(汕头大学工学院计算机系)Garry Wong(澳门大学健康科学学院 )
环状RNA(circRNA)是40年前鉴定的一类独特的RNA分子,它是通过线性RNA的反向剪接通过共价键连接产生的。测序技术和生物信息学工具的最新进展直接导致circRNA的类型和生物学功能不断扩大。在技术发展的同时,circRNA的实际应用已经出现,包括将其用作人类疾病的生物标记。目前,与circRNA相关的生物信息学工具可以支持包括circRNA注释,circRNA鉴定和竞争性内源RNA(ceRNA)的网络分析在内的项目。在这篇综述中,作者收集了约100种circRNA相关的生物信息学工具,并总结了它们当前的属性和功能。作者还对circRNA工具出版物进行了网络分析和文本挖掘,以揭示其持续发展的趋势。
图注:circRNA生物信息工具分类
文献列表:
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | Circ-MALAT1既可以作为mRNA翻译制动器,也可以作为microRNA海绵来促进肝细胞癌干细胞的自我更新。 | Circ-MALAT1 Functions as Both an mRNA Translation Brake and a microRNA Sponge to Promote Self-Renewal of Hepatocellular Cancer Stem Cells. | Adv Sci (Weinh) | 15.804 | 上海长海医院等 |
2 | CircMUC16通过与ATG13和miR-199a相互作用促进上皮性卵巢癌的自噬。 | CircMUC16 promotes autophagy of epithelial ovarian cancer via interaction with ATG13 and miR-199a. | Mol Cancer | 10.679 | 重庆医科大学附属第二医院 |
3 | 用于circRNA发现和分析的生物信息学工具箱。 | The bioinformatics toolbox for circRNA discovery and analysis. | Brief Bioinform | 9.101 | 澳门大学健康科学学院等 |
4 | Circ-SOX4通过激活Wnt /β-catenin途径促进非小细胞肺癌的进展。 | Circ-SOX4 promotes non-small cell lung cancer progression by activating the Wnt/β-catenin pathway. | Mol Oncol | 5.962 | 温州医科大学附属第二医院 |
5 | 环状RNA circRNF20通过miR-487a/HIF-1α/ HK2促进乳腺癌的肿瘤发生和Warburg效应。 | Circular RNA circRNF20 promotes breast cancer tumorigenesis and Warburg effect through miR-487a/HIF-1α/HK2. | Cell Death Dis | 5.959 | 淄博市中心医院 |
6 | 环状RNA NT5E通过海绵化microRNA-134促进非小细胞肺癌细胞的生长。 | The circular RNA NT5E promotes non-small cell lung cancer cell growth via sponging microRNA-134. | Aging (Albany NY) | 5.515 | 苏州大学附属第一医院 |
7 | ncEP:人工整理经过实验验证的ncRNA编码的蛋白质或肽的数据库。 | ncEP: a manually curated database for experimentally validated ncRNA-encoded proteins or peptides. | J Mol Biol | 5.067 | 南京航空航天大学 |
8 | 液体活检中的外泌体非编码RNA作为结直肠癌的有前途的生物标志物。 | Exosomal Non Coding RNA in LIQUID Biopsies as a Promising Biomarker for Colorectal Cancer. | Int J Mol Sci | 4.183 | 贝鲁特美国大学医学中心 |
9 | CircPRKCI通过上调miR-545目标基因ZEB2的表达来减轻脂多糖诱导的HK2细胞损伤。 | CircPRKCI relieves lipopolysaccharide-induced HK2 cell injury by upregulating the expression of miR-545 target gene ZEB2. | Biofactors | 3.598 | 大连医科大学附属第二医院 |
10 | 在Aohan细毛羊的毛囊发育过程中皮肤中circRNA的鉴定和表征。 | Identification and characterization of circRNAs in the skin during wool follicle development in Aohan fine wool sheep. | BMC Genomics | 3.501 | 青岛农业大学 |
11 | circHIPK3通过海绵化miR-107并调节BDNF表达来促进胃癌细胞的增殖和迁移。 | circHIPK3 Promotes Cell Proliferation and Migration of Gastric Cancer by Sponging miR-107 and Regulating BDNF Expression. | Onco Targets Ther | 3.046 | 南京医科大学附属第一医院 |
12 | Circ_0058124通过海绵吸附miR-940上调MAPK1表达,从而促进甲状腺癌的增殖,转移和代谢能力。 | Circ_0058124 Upregulates MAPK1 Expression to Promote Proliferation, Metastasis and Metabolic Abilities in Thyroid Cancer Through Sponging miR-940. | Onco Targets Ther | 3.046 | 临沂市中医院 |
13 | 环状RNA circ_0006282通过使miR-155海绵化以上调FBXO22的表达而有助于胃癌的发展。 | Circular RNA circ_0006282 Contributes to the Progression of Gastric Cancer by Sponging miR-155 to Upregulate the Expression of FBXO22. | Onco Targets Ther | 3.046 | 安徽省立医院 |
14 | 环状RNA TUBD1充当miR-146a-5p海绵,通过TLR4途径影响LX-2细胞的活力和促炎性细胞因子的产生。 | Circular RNA TUBD1 Acts as the miR-146a-5p Sponge to Affect the Viability and Pro-Inflammatory Cytokine Production of LX-2 Cells through the TLR4 Pathway. | Radiat Res | 2.779 | 复旦大学附属中山医院 |
15 | 环状RNA hsa_circ_0017247通过诱导Wnt/β-catenin信号通路在膀胱癌中充当癌基因。 | Circular RNA hsa_circ_0017247 acts as an oncogene in bladder cancer by inducing Wnt/β-catenin signaling pathway. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 上海交通大学医学院附属同仁医院 |
16 | 环状RNA hsa_circ_0010882通过调节PI3K/Akt/ mTOR信号通路促进胃癌的发展。 | Circular RNA hsa_circ_0010882 promotes the progression of gastric cancer via regulation of the PI3K/Akt/mTOR signaling pathway. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 兰州大学第一医院 |
17 | 环状RNA circ_0079593通过海绵化miR-499a-5p来调节KPNA2表达,从而促进神经胶质瘤的发展。 | Circular RNA circ_0079593 promotes glioma development through regulating KPNA2 expression by sponging miR-499a-5p. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 济南市第五人民医院 |
18 | 环状RNA circ-ABCB10通过靶向KLF6促进甲状腺癌的增殖和侵袭。 | Circular RNA circ-ABCB10 promotes the proliferation and invasion of thyroid cancer by targeting KLF6. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 威海市中心医院 |
19 | 环状RNA hsa_circ_0011946通过上调PCNA促进口腔鳞状细胞癌的细胞生长,迁移和侵袭。 | Circular RNA hsa_circ_0011946 promotes cell growth, migration, and invasion of oral squamous cell carcinoma by upregulating PCNA. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 哈尔滨医科大学附属第四医院 |
20 | 环状RNA-CDR1as充当microRNA-641的海绵,促进骨关节炎的进展。 | Circular RNA-CDR1as acts as the sponge of microRNA-641 to promote osteoarthritis progression. | J Inflamm (Lond) | 2.662 | 上海市第六人民医院 |
21 | Circ-IGF1R在非小细胞肺癌中抑制细胞侵袭和迁移。 | Circ-IGF1R inhibits cell invasion and migration in non-small cell lung cancer. | Thorac Cancer | 2.524 | 广西医科大学附属第一医院 |
22 | 冲击流场中内皮细胞中差异表达的环状RNA的分析。 | Analysis of differentially expressed circular RNAs in endothelial cells under impinging flow. | Mol Cell Probes | 2.511 | 南昌大学第一附属医院 |
23 | circPVT1通过调节骨肉瘤中的miR-205-5p/c-FLIP轴促进侵袭和转移。 | circPVT1 Facilitates Invasion and Metastasis by Regulating miR-205-5p/c-FLIP Axis in Osteosarcoma. | Cancer Manag Res | 2.243 | 中南大学湘雅医院 |
24 | CircHIPK3通过海绵化miR-330-5p和靶标RASSF1来促进胰腺癌细胞中的吉西他滨(GEM)抗性。 | CircHIPK3 Promotes Gemcitabine (GEM) Resistance in Pancreatic Cancer Cells by Sponging miR-330-5p and Targets RASSF1. | Cancer Manag Res | 2.243 | 中南大学湘雅三医院 |
25 | circPCNX和Pecanex通过抑制miR-506促进肝癌细胞的生存能力。 | circPCNX and Pecanex Promote Hepatocellular Carcinoma Cell Viability by Inhibiting miR-506. | Cancer Manag Res | 2.243 | 青岛大学附属医院 |
26 | 环状RNA hsa_circ_0000467通过与MicroRNA miR-326-3p竞争性结合来促进胃癌的发展。 | Circular RNA hsa_circ_0000467 Promotes the Development of Gastric Cancer by Competitively Binding to MicroRNA miR-326-3p. | Biomed Res Int | 2.197 | 苏州大学附属第三医院 |
27 | 环状RNA ciRS-7在各种癌症中的预后价值:PRISMA的荟萃分析。 | Prognostic Value of Circular RNA ciRS-7 in Various Cancers: A PRISMA-Compliant Meta-Analysis. | Biomed Res Int | 2.197 | 中国医科大学附属第一医院 |
28 | Circ-PRMT5通过靶向miR-188-5p / HK2轴增强肝癌细胞的增殖,迁移和糖酵解。 | Circ-PRMT5 enhances the proliferation, migration and glycolysis of hepatoma cells by targeting miR-188-5p/HK2 axis. | Ann Hepatol | 1.895 | 襄阳市第一人民医院 |
29 | Hsa_circ_0003645通过在肝细胞癌细胞中吸附microRNA-1299显示出致癌作用。 | Hsa_circ_0003645 shows an oncogenic role by sponging microRNA-1299 in hepatocellular carcinoma cells. | J Clin Lab Anal | 1.728 | 宁波华美医院 |
30 | CircAP2A2通过使miR-382-5p海绵化调节VEGFA的表达,从而作为ceRNA参与婴儿血管瘤的发展。 | CircAP2A2 acts as a ceRNA to participate in infantile hemangiomas progression by sponging miR-382-5p via regulating the expression of VEGFA. | J Clin Lab Anal | 1.728 | 宁波市临床病理诊断中心 |
31 | 新一代测序技术研究支气管肺发育不良的早产儿外周血中的环状RNA谱。 | Next-generation sequencing to investigate circular RNA profiles in the peripheral blood of preterm neonates with bronchopulmonary dysplasia. | J Clin Lab Anal | 1.728 | 南京医科大学附属儿童医院 |