欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计31篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
- 环状RNA circXPO1促进肺腺癌中的肿瘤生长。
标题:The circular RNA circXPO1 promotes tumor growth in lung adenocarcinoma.
杂志:Ann Oncol;影响因子:14.196
通讯作者:Q. Huang和邱满堂(北京大学人民医院)
体细胞拷贝数变异(CNV)可能通过编码和非编码转录本驱动癌症进展。在肺腺癌中,肿瘤分期与CNV的比例呈正相关。很少有CNV相关的circRNA在肺癌中的报道。该研究的研究者们为了鉴定肺腺癌进展的关键circRNA,在5对成对的肺腺癌组织和邻近的非肿瘤组织中进行了去rRNA的circRNA测序。麦芽糖结合蛋白(MBP)亲和纯化和RNA免疫沉淀(RIP)用于鉴定与circXPO1相关的RNA结合蛋白(RBP)。最后进行了患者源异种移植(PDX)模型以评估靶向circXPO1的临床益处。
结果:通过整合差异circRNA和肺腺癌中的CNV生物信息学分析,研究者确定了从2p15扩增子处的XPO1基因产生的原癌性环状RNA(circXPO1)。 CircXPO1在肺腺癌组织中高表达,并促进了肺腺癌的增殖和肿瘤发生。分子机制研究表明,CircXPO1通过与IGF2BP1相互作用促进β-Catenin的稳定化,表观遗传上调了肺腺癌细胞中β-Catenin的表达。在患者来源的肺腺癌异种移植模型中,瘤内注射特异性靶向circXPO1的胆固醇偶联siRNA抑制了肿瘤的生长。总结起来,该研究鉴定了2q15基因座扩增区CNV相关的环状RNA circXPO1,其在肺腺癌组织中过表达,通过与IGF2BP1相互作用促进了肺腺癌的增殖和肿瘤发生,并促进了β-Catenin的稳定性。同时,了解环状RNA-circXPO1的确切作用为肺癌治疗提供了一种新的策略。
- 孤独症中环状RNA失调和相应环状RNA-microRNA-mRNA调控轴的全基因组综合分析。标题:Genome-wide integrative analysis of circular RNA dysregulation and the corresponding circular RNA-microRNA-mRNA regulatory axes in autism.
杂志:Genome Res;影响因子:9.944
通讯作者:Trees-Juen Chuang(台北Genomics Research Center)
尽管自闭症谱系障碍(ASD)中基因表达的广泛失调已被报道,但是circRNA在ASD中的作用仍然未知。该研究中,研究者在具有ASD和对照的个体死后大脑中进行了全基因组circRNA表达谱分析,并鉴定了60个circRNA和三个在ASD中失调控模块。通过整合来自相同皮层样品的circRNA,microRNA和mRNA失调数据,研究者确定了8,170个与ASD相关的circRNA-microRNA-mRNA相互作用。调控轴推定的靶点富含ASD风险基因和编码抑制性突触后密度(PSD)蛋白的基因,但不包含与其他脑部疾病的单基因形式有关的基因或编码兴奋性PSD蛋白的基因。这反映了先前的观察结果,即ASD衍生的类器官表现出抑制神经元的过量产生。进一步证实,某些ASD风险基因(NLGN1,STAG1,HSD11B1,VIP和UBA6)是通过在人神经元细胞中由上调的circRNA(circARID1A)通过microRNA(miR-204-3p)实现调控的。特别是,已知NLGN1表达的改变会影响记忆整合和增强的动态过程。该研究是ASD皮质样品中circRNA调控网络的第一个系统级视图,提供了丰富的ASD相关circRNA候选集和相应的circRNA-miRNA-mRNA轴,特别是涉及ASD风险基因的轴。因此,该研究发现支持circRNA失调和相应的circRNA-microRNA-mRNA轴在ASD病理生理中的作用。
图注:ASD相关的circRNA-miRNA-mRNA调控作用分析思路
- CircRNA-CIDN通过miR-34a-5p / SIRT1轴减轻了人类髓核细胞中压缩负荷诱导的损伤。
标题:CircRNA-CIDN mitigated compression loading-induced damage in human nucleus pulposus cells via miR-34a-5p/SIRT1 axis.
杂志:EBioMedicine;影响因子:6.68
通讯作者:Cao Yang和张宇坤(华中科技大学同济医学院附属协和医院)
椎间盘退变(IDD)是导致下背痛的主要因素,但是,人们对IDD的分子机制和致病机理了解甚少。作为IDD的高危因素,据报道,压迫应力会导致IDD进展过程中髓核(NP)细胞凋亡和细胞外基质(ECM)降解。circRNA是否以及如何调节受压诱导的NP细胞损伤仍不清楚。该研究调查circRNA在压缩负荷诱导的IDD中的关键作用。研究者首先使用circRNA微阵列分析法分析了来自压缩处理的NP细胞的三个样品和三个对照样品的circRNA表达,并进一步研究了circRNA参与压缩诱导的NP细胞损伤(circRNA-CIDN)。研究者调查了circRNA-CIDN在体外和离体对压缩诱导的细胞凋亡和NP ECM降解的影响。circRNA芯片和qRT-PCR分析证实,在压缩处理的人NP细胞中CircRNA-CIDN显著下调,而过表达的circRNA-CIDN抑制了压缩诱导的细胞凋亡和NP ECM降解。进一步的研究表明,circRNA-CIDN充当miR-34a-5p的海绵,miR-34a-5p是一种重要的miRNA,通过抑制SIRT1来增强NP细胞的压缩诱导损伤。该研究结果表明,circRNA-CIDN与miR-34a-5p的结合在通过靶向SIRT1减轻压缩负荷诱导的髓核细胞损伤中发挥了重要作用,为IDD治疗提供了潜在的治疗策略。
图注:人类髓核细胞中CircRNA-CIDN特征鉴定
文献列表:
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 环状RNA circXPO1促进肺腺癌中的肿瘤生长。 | The circular RNA circXPO1 promotes tumor growth in lung adenocarcinoma. | Ann Oncol | 14.196 | 北京大学人民医院 |
2 | 孤独症中环状RNA失调和相应环状RNA-microRNA-mRNA调控轴的全基因组综合分析。 | Genome-wide integrative analysis of circular RNA dysregulation and the corresponding circular RNA-microRNA-mRNA regulatory axes in autism. | Genome Res | 9.944 | 中国科学院北京基因组研究所 |
3 | CircRNA-CIDN通过miR-34a-5p / SIRT1轴减轻了人类髓核细胞中压缩负荷诱导的损伤。 | CircRNA-CIDN mitigated compression loading-induced damage in human nucleus pulposus cells via miR-34a-5p/SIRT1 axis. | EBioMedicine | 6.68 | 华中科技大学同济医学院 |
4 | 沉默RACRACGAP1可通过靶向miR-3657和ATG7调节自噬来使胃癌细胞对apatinib敏感。 | Silencing of circRACGAP1 sensitizes gastric cancer cells to apatinib via modulating autophagy by targeting miR-3657 and ATG7. | Cell Death Dis | 5.959 | 南京医科大学附属第一医院等 |
5 | 腺瘤-癌变过程中的RNA测序确定了人类CRC的预测生物标记物和治疗靶标。 | Comprehensive RNA Sequencing in Adenoma-Cancer Transition Identified Predictive Biomarkers and Therapeutic Targets of Human CRC. | Mol Ther Nucleic Acids | 5.919 | 上海中医药大学附属龙华医院 |
6 | ncRPheno:用于识别和验证与疾病相关的非编码RNA的综合数据库平台。 | ncRPheno: a comprehensive database platform for identification and validation of disease related noncoding RNAs. | RNA Biol | 5.477 | 中山大学中山医学院 |
7 | MicroRNA-31-5p通过quaking和环状RNA Pan3减弱阿霉素诱导的心脏毒性。 | MicroRNA-31-5p attenuates doxorubicin-induced cardiotoxicity via quaking and circular RNA Pan3. | J Mol Cell Cardiol | 5.055 | 青岛大学基础医学院 |
8 | 深入了解circRNA在血管生成中的调控作用及其临床意义。 | Insights into the regulatory role of circRNA in angiogenesis and clinical implications. | Atherosclerosis | 4.255 | 青岛大学附属医院 |
9 | CircRNAs作为肌萎缩性侧索硬化症中潜在的生物标志物。 | Circulating RNAs as Potential Biomarkers in Amyotrophic Lateral Sclerosis. | Int J Mol Sci | 4.183 | 卢布尔雅那大学医学院 |
10 | 沉默circFoxO3可通过调节线粒体细胞凋亡途径保护HT22细胞免受谷氨酸诱导的氧化损伤。 | Silencing of circFoxO3 Protects HT22 Cells from Glutamate-Induced Oxidative Injury via Regulating the Mitochondrial Apoptosis Pathway. | Cell Mol Neurobiol | 3.811 | 广州医科大学附属第二医院 |
11 | 环状RNA hsa_circ_0084443在糖尿病足溃疡中被上调并调节角质形成细胞的迁移和增殖。 | Circular RNA hsa_circ_0084443 Is Upregulated in Diabetic Foot Ulcer and Modulates Keratinocyte Migration and Proliferation. | Adv Wound Care (New Rochelle) | 3.714 | 瑞典斯德哥尔摩卡罗林斯卡学院 |
12 | 鉴定血液环状RNAs作为急性缺血性卒中的潜在生物标志物。 | Identification of Blood Circular RNAs as Potential Biomarkers for Acute Ischemic Stroke. | Front Neurosci | 3.648 | 暨南大学附属第一医院 |
13 | 与泌乳母猪泌乳有关的热诱导circRNA的新兴作用。 | Emerging Roles of Heat-Induced circRNAs Related to Lactogenesis in Lactating Sows. | Front Genet | 3.517 | 华南农业大学 |
14 | 使用de Bruijn图从高通量序列数据中检测环状RNA。 | Detecting circular RNA from high-throughput sequence data with de Bruijn graph. | BMC Genomics | 3.501 | 康涅狄格大学 |
15 | 鉴定功能性circRNA / miRNA /mRNA调控网络,以探索结直肠癌的前瞻性治疗策略。 | Identification of functional circRNA/miRNA/mRNA regulatory network for exploring prospective therapy strategy of colorectal cancer. | J Cell Biochem | 3.448 | 中国医科大学附属第一医院 |
16 | 致癌的hsa_circ_0091581通过阻止miR-526b降解c-MYC mRNA来促进HCC细胞的恶性肿瘤。 | Oncogenic hsa_circ_0091581 promotes the malignancy of HCC cell through blocking miR-526b from degrading c-MYC mRNA. | Cell Cycle | 3.259 | 第三军医大学西南医院 |
17 | 姜黄素通过CircRNA网络介导肿瘤干细胞样细胞的调节,增强鼻咽癌的放射增敏作用。 | Curcumin Enhances Radiosensitization of Nasopharyngeal Carcinoma via Mediating Regulation of Tumor Stem-like Cells by a CircRNA Network. | J Cancer | 3.182 | 南方医科大学中医药学院 |
18 | 环状RNA circ_0017247通过靶向miR-145促进黑色素瘤迁移和侵袭。 | Circular RNA circ_0017247 promotes melanoma migration and invasion via targeting miR-145. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 唐山市职工医院 |
19 | hsa_circ_0008039通过海绵吸附miR-515-5p上调CBX4来促进乳腺癌细胞的增殖,迁移和侵袭。 | Circular RNA hsa_circ_0008039 promotes proliferation, migration and invasion of breast cancer cells through upregulating CBX4 via sponging miR-515-5p. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 焦作市人民医院 |
20 | 环状RNA_LARP4通过调节SMAD7的表达抑制非小细胞肺癌的进展。 | Circular RNA_LARP4 inhibits the progression of non-small-cell lung cancer by regulating the expression of SMAD7. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 北京胸科医院 |
21 | 环状RNA hsa_circ_0012673通过miR-320a/LIMK18521轴促进肺癌细胞的增殖和侵袭。 | Circular RNA hsa_circ_0012673 facilitates lung cancer cell proliferation and invasion via miR-320a/LIMK18521 axis. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 胜利油田中心医院 |
22 | CircDDX17通过调节miR-31-5p/KANK1轴降低了5-氟尿嘧啶耐药性并阻碍了大肠癌的发生。 | CircDDX17 reduces 5-fluorouracil resistance and hinders tumorigenesis in colorectal cancer by regulating miR-31-5p/KANK1 axis. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 洛阳市中心医院 |
23 | 环状RNA circ-SMAD7在大肠癌中被下调,并通过调节上皮间质转化来抑制肿瘤转移。 | Circular RNA circ-SMAD7 is downregulated in colorectal cancer and suppresses tumor metastasis by regulating epithelial mesenchymal transition. | Eur Rev Med Pharmacol Sci | 2.721 | 青岛市城阳区人民医院 |
24 | 环状RNA circ-RELL1通过内皮细胞中的miR-6873-3p / MyD88 /NF-κB轴调节炎症反应。 | Circular RNA circ-RELL1 regulates inflammatory response by miR-6873-3p/MyD88/NF-κB axis in endothelial cells. | Biochem Biophys Res Commun | 2.705 | 福建医科大学胜利临床医学院 |
25 | 环状RNA 0060428使miR-375海绵通过上调RPBJ的表达来促进骨肉瘤细胞增殖。 | Circular RNA 0060428 sponges miR-375 to promote osteosarcoma cell proliferation by upregulating the expression of RPBJ. | Gene | 2.638 | 复旦大学附属上海市第五人民医院 |
26 | 泌尿肿瘤环状RNA的研究进展。 | Progress of research into circular RNAs in urinary neoplasms. | PeerJ | 2.353 | 海口市人民医院 |
27 | CircRNA_0005075通过调节miR-431 / p53 /上皮间质转化轴抑制胃癌的发生。 | CircRNA_0005075 suppresses carcinogenesis via regulating miR-431/p53/epithelial-mesenchymal transition axis in gastric cancer. | Cell Biochem Funct | 2.142 | 嘉兴市第一医院 |
28 | Circ_0000388通过调节miR-337-3p / TCF12轴在宫颈癌细胞中发挥致癌作用。 | Circ_0000388 Exerts Oncogenic Function in Cervical Cancer Cells by Regulating miR-337-3p/TCF12 Axis. | Cancer Biother Radiopharm | 1.894 | 山东省济南市妇幼保健院 |
29 | MiRNA:动脉粥样硬化性中风的基因诊断和治疗的潜在目标。 | MiRNA: A potential target for gene diagnosis and treatment of atherosclerotic stroke. | Int J Neurosci | 1.852 | 湖北医科大学 |
30 | CircRNA_103762通过靶向DNA损伤诱导转录本3(CHOP)来促进NSCLC的多药耐药性。 | CircRNA_103762 promotes multidrug resistance in NSCLC by targeting DNA damage inducible transcript 3 (CHOP). | J Clin Lab Anal | 1.728 | 南方医科大学南方医院 |
31 | circACTR2:一种通过焦磷酸调节肾小管细胞中高糖诱导的纤维化的新机制。 | circACTR2: A Novel Mechanism Regulating High Glucose-Induced Fibrosis in Renal Tubular Cells via Pyroptosis. | Biol Pharm Bull | 1.54 | 中国医科大学附属第一医院 |