欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计31篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

  1. 环状RNA circXPO1促进肺腺癌中的肿瘤生长。

标题:The circular RNA circXPO1 promotes tumor growth in lung adenocarcinoma.

杂志:Ann Oncol;影响因子:14.196

通讯作者:Q. Huang和邱满堂(北京大学人民医院)

体细胞拷贝数变异(CNV)可能通过编码和非编码转录本驱动癌症进展。在肺腺癌中,肿瘤分期与CNV的比例呈正相关。很少有CNV相关的circRNA在肺癌中的报道。该研究的研究者们为了鉴定肺腺癌进展的关键circRNA,在5对成对的肺腺癌组织和邻近的非肿瘤组织中进行了去rRNA的circRNA测序。麦芽糖结合蛋白(MBP)亲和纯化和RNA免疫沉淀(RIP)用于鉴定与circXPO1相关的RNA结合蛋白(RBP)。最后进行了患者源异种移植(PDX)模型以评估靶向circXPO1的临床益处。

结果:通过整合差异circRNA和肺腺癌中的CNV生物信息学分析,研究者确定了从2p15扩增子处的XPO1基因产生的原癌性环状RNA(circXPO1)。 CircXPO1在肺腺癌组织中高表达,并促进了肺腺癌的增殖和肿瘤发生。分子机制研究表明,CircXPO1通过与IGF2BP1相互作用促进β-Catenin的稳定化,表观遗传上调了肺腺癌细胞中β-Catenin的表达。在患者来源的肺腺癌异种移植模型中,瘤内注射特异性靶向circXPO1的胆固醇偶联siRNA抑制了肿瘤的生长。总结起来,该研究鉴定了2q15基因座扩增区CNV相关的环状RNA circXPO1,其在肺腺癌组织中过表达,通过与IGF2BP1相互作用促进了肺腺癌的增殖和肿瘤发生,并促进了β-Catenin的稳定性。同时,了解环状RNA-circXPO1的确切作用为肺癌治疗提供了一种新的策略。

  1. 孤独症中环状RNA失调和相应环状RNA-microRNA-mRNA调控轴的全基因组综合分析。标题:Genome-wide integrative analysis of circular RNA dysregulation and the corresponding circular RNA-microRNA-mRNA regulatory axes in autism.

杂志:Genome Res;影响因子:9.944

通讯作者:Trees-Juen Chuang(台北Genomics Research Center)

尽管自闭症谱系障碍(ASD)中基因表达的广泛失调已被报道,但是circRNA在ASD中的作用仍然未知。该研究中,研究者在具有ASD和对照的个体死后大脑中进行了全基因组circRNA表达谱分析,并鉴定了60个circRNA和三个在ASD中失调控模块。通过整合来自相同皮层样品的circRNA,microRNA和mRNA失调数据,研究者确定了8,170个与ASD相关的circRNA-microRNA-mRNA相互作用。调控轴推定的靶点富含ASD风险基因和编码抑制性突触后密度(PSD)蛋白的基因,但不包含与其他脑部疾病的单基因形式有关的基因或编码兴奋性PSD蛋白的基因。这反映了先前的观察结果,即ASD衍生的类器官表现出抑制神经元的过量产生。进一步证实,某些ASD风险基因(NLGN1,STAG1,HSD11B1,VIP和UBA6)是通过在人神经元细胞中由上调的circRNA(circARID1A)通过microRNA(miR-204-3p)实现调控的。特别是,已知NLGN1表达的改变会影响记忆整合和增强的动态过程。该研究是ASD皮质样品中circRNA调控网络的第一个系统级视图,提供了丰富的ASD相关circRNA候选集和相应的circRNA-miRNA-mRNA轴,特别是涉及ASD风险基因的轴。因此,该研究发现支持circRNA失调和相应的circRNA-microRNA-mRNA轴在ASD病理生理中的作用。

图注:ASD相关的circRNA-miRNA-mRNA调控作用分析思路

  1. CircRNA-CIDN通过miR-34a-5p / SIRT1轴减轻了人类髓核细胞中压缩负荷诱导的损伤。

标题:CircRNA-CIDN mitigated compression loading-induced damage in human nucleus pulposus cells via miR-34a-5p/SIRT1 axis.

杂志:EBioMedicine;影响因子:6.68

通讯作者:Cao Yang和张宇坤(华中科技大学同济医学院附属协和医院)

椎间盘退变(IDD)是导致下背痛的主要因素,但是,人们对IDD的分子机制和致病机理了解甚少。作为IDD的高危因素,据报道,压迫应力会导致IDD进展过程中髓核(NP)细胞凋亡和细胞外基质(ECM)降解。circRNA是否以及如何调节受压诱导的NP细胞损伤仍不清楚。该研究调查circRNA在压缩负荷诱导的IDD中的关键作用。研究者首先使用circRNA微阵列分析法分析了来自压缩处理的NP细胞的三个样品和三个对照样品的circRNA表达,并进一步研究了circRNA参与压缩诱导的NP细胞损伤(circRNA-CIDN)。研究者调查了circRNA-CIDN在体外和离体对压缩诱导的细胞凋亡和NP ECM降解的影响。circRNA芯片和qRT-PCR分析证实,在压缩处理的人NP细胞中CircRNA-CIDN显著下调,而过表达的circRNA-CIDN抑制了压缩诱导的细胞凋亡和NP ECM降解。进一步的研究表明,circRNA-CIDN充当miR-34a-5p的海绵,miR-34a-5p是一种重要的miRNA,通过抑制SIRT1来增强NP细胞的压缩诱导损伤。该研究结果表明,circRNA-CIDN与miR-34a-5p的结合在通过靶向SIRT1减轻压缩负荷诱导的髓核细胞损伤中发挥了重要作用,为IDD治疗提供了潜在的治疗策略。

图注:人类髓核细胞中CircRNA-CIDN特征鉴定

文献列表:

序号 主要内容 论文标题 杂志 IF 单位
1 环状RNA circXPO1促进肺腺癌中的肿瘤生长。 The circular RNA circXPO1 promotes tumor growth in lung adenocarcinoma. Ann Oncol 14.196 北京大学人民医院
2 孤独症中环状RNA失调和相应环状RNA-microRNA-mRNA调控轴的全基因组综合分析。 Genome-wide integrative analysis of circular RNA dysregulation and the corresponding circular RNA-microRNA-mRNA regulatory axes in autism. Genome Res 9.944 中国科学院北京基因组研究所
3 CircRNA-CIDN通过miR-34a-5p / SIRT1轴减轻了人类髓核细胞中压缩负荷诱导的损伤。 CircRNA-CIDN mitigated compression loading-induced damage in human nucleus pulposus cells via miR-34a-5p/SIRT1 axis. EBioMedicine 6.68 华中科技大学同济医学院
4 沉默RACRACGAP1可通过靶向miR-3657和ATG7调节自噬来使胃癌细胞对apatinib敏感。 Silencing of circRACGAP1 sensitizes gastric cancer cells to apatinib via modulating autophagy by targeting miR-3657 and ATG7. Cell Death Dis 5.959 南京医科大学附属第一医院等
5 腺瘤-癌变过程中的RNA测序确定了人类CRC的预测生物标记物和治疗靶标。 Comprehensive RNA Sequencing in Adenoma-Cancer Transition Identified Predictive Biomarkers and Therapeutic Targets of Human CRC. Mol Ther Nucleic Acids 5.919 上海中医药大学附属龙华医院
6 ncRPheno:用于识别和验证与疾病相关的非编码RNA的综合数据库平台。 ncRPheno: a comprehensive database platform for identification and validation of disease related noncoding RNAs. RNA Biol 5.477 中山大学中山医学院
7 MicroRNA-31-5p通过quaking和环状RNA Pan3减弱阿霉素诱导的心脏毒性。 MicroRNA-31-5p attenuates doxorubicin-induced cardiotoxicity via quaking and circular RNA Pan3. J Mol Cell Cardiol 5.055 青岛大学基础医学院
8 深入了解circRNA在血管生成中的调控作用及其临床意义。 Insights into the regulatory role of circRNA in angiogenesis and clinical implications. Atherosclerosis 4.255 青岛大学附属医院
9 CircRNAs作为肌萎缩性侧索硬化症中潜在的生物标志物。 Circulating RNAs as Potential Biomarkers in Amyotrophic Lateral Sclerosis. Int J Mol Sci 4.183 卢布尔雅那大学医学院
10 沉默circFoxO3可通过调节线粒体细胞凋亡途径保护HT22细胞免受谷氨酸诱导的氧化损伤。 Silencing of circFoxO3 Protects HT22 Cells from Glutamate-Induced Oxidative Injury via Regulating the Mitochondrial Apoptosis Pathway. Cell Mol Neurobiol 3.811 广州医科大学附属第二医院
11 环状RNA hsa_circ_0084443在糖尿病足溃疡中被上调并调节角质形成细胞的迁移和增殖。 Circular RNA hsa_circ_0084443 Is Upregulated in Diabetic Foot Ulcer and Modulates Keratinocyte Migration and Proliferation. Adv Wound Care (New Rochelle) 3.714 瑞典斯德哥尔摩卡罗林斯卡学院
12 鉴定血液环状RNAs作为急性缺血性卒中的潜在生物标志物。 Identification of Blood Circular RNAs as Potential Biomarkers for Acute Ischemic Stroke. Front Neurosci 3.648 暨南大学附属第一医院
13 与泌乳母猪泌乳有关的热诱导circRNA的新兴作用。 Emerging Roles of Heat-Induced circRNAs Related to Lactogenesis in Lactating Sows. Front Genet 3.517 华南农业大学
14 使用de Bruijn图从高通量序列数据中检测环状RNA。 Detecting circular RNA from high-throughput sequence data with de Bruijn graph. BMC Genomics 3.501 康涅狄格大学
15 鉴定功能性circRNA / miRNA /mRNA调控网络,以探索结直肠癌的前瞻性治疗策略。 Identification of functional circRNA/miRNA/mRNA regulatory network for exploring prospective therapy strategy of colorectal cancer. J Cell Biochem 3.448 中国医科大学附属第一医院
16 致癌的hsa_circ_0091581通过阻止miR-526b降解c-MYC mRNA来促进HCC细胞的恶性肿瘤。 Oncogenic hsa_circ_0091581 promotes the malignancy of HCC cell through blocking miR-526b from degrading c-MYC mRNA. Cell Cycle 3.259 第三军医大学西南医院
17 姜黄素通过CircRNA网络介导肿瘤干细胞样细胞的调节,增强鼻咽癌的放射增敏作用。 Curcumin Enhances Radiosensitization of Nasopharyngeal Carcinoma via Mediating Regulation of Tumor Stem-like Cells by a CircRNA Network. J Cancer 3.182 南方医科大学中医药学院
18 环状RNA circ_0017247通过靶向miR-145促进黑色素瘤迁移和侵袭。 Circular RNA circ_0017247 promotes melanoma migration and invasion via targeting miR-145. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 唐山市职工医院
19 hsa_circ_0008039通过海绵吸附miR-515-5p上调CBX4来促进乳腺癌细胞的增殖,迁移和侵袭。 Circular RNA hsa_circ_0008039 promotes proliferation, migration and invasion of breast cancer cells through upregulating CBX4 via sponging miR-515-5p. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 焦作市人民医院
20 环状RNA_LARP4通过调节SMAD7的表达抑制非小细胞肺癌的进展。 Circular RNA_LARP4 inhibits the progression of non-small-cell lung cancer by regulating the expression of SMAD7. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 北京胸科医院
21 环状RNA hsa_circ_0012673通过miR-320a/LIMK18521轴促进肺癌细胞的增殖和侵袭。 Circular RNA hsa_circ_0012673 facilitates lung cancer cell proliferation and invasion via miR-320a/LIMK18521 axis. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 胜利油田中心医院
22 CircDDX17通过调节miR-31-5p/KANK1轴降低了5-氟尿嘧啶耐药性并阻碍了大肠癌的发生。 CircDDX17 reduces 5-fluorouracil resistance and hinders tumorigenesis in colorectal cancer by regulating miR-31-5p/KANK1 axis. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 洛阳市中心医院
23 环状RNA circ-SMAD7在大肠癌中被下调,并通过调节上皮间质转化来抑制肿瘤转移。 Circular RNA circ-SMAD7 is downregulated in colorectal cancer and suppresses tumor metastasis by regulating epithelial mesenchymal transition. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2.721 青岛市城阳区人民医院
24 环状RNA circ-RELL1通过内皮细胞中的miR-6873-3p / MyD88 /NF-κB轴调节炎症反应。 Circular RNA circ-RELL1 regulates inflammatory response by miR-6873-3p/MyD88/NF-κB axis in endothelial cells. Biochem Biophys Res Commun 2.705 福建医科大学胜利临床医学院
25 环状RNA 0060428使miR-375海绵通过上调RPBJ的表达来促进骨肉瘤细胞增殖。 Circular RNA 0060428 sponges miR-375 to promote osteosarcoma cell proliferation by upregulating the expression of RPBJ. Gene 2.638 复旦大学附属上海市第五人民医院
26 泌尿肿瘤环状RNA的研究进展。 Progress of research into circular RNAs in urinary neoplasms. PeerJ 2.353 海口市人民医院
27 CircRNA_0005075通过调节miR-431 / p53 /上皮间质转化轴抑制胃癌的发生。 CircRNA_0005075 suppresses carcinogenesis via regulating miR-431/p53/epithelial-mesenchymal transition axis in gastric cancer. Cell Biochem Funct 2.142 嘉兴市第一医院
28 Circ_0000388通过调节miR-337-3p / TCF12轴在宫颈癌细胞中发挥致癌作用。 Circ_0000388 Exerts Oncogenic Function in Cervical Cancer Cells by Regulating miR-337-3p/TCF12 Axis. Cancer Biother Radiopharm 1.894 山东省济南市妇幼保健院
29 MiRNA:动脉粥样硬化性中风的基因诊断和治疗的潜在目标。 MiRNA: A potential target for gene diagnosis and treatment of atherosclerotic stroke. Int J Neurosci 1.852 湖北医科大学
30 CircRNA_103762通过靶向DNA损伤诱导转录本3(CHOP)来促进NSCLC的多药耐药性。 CircRNA_103762 promotes multidrug resistance in NSCLC by targeting DNA damage inducible transcript 3 (CHOP). J Clin Lab Anal 1.728 南方医科大学南方医院
31 circACTR2:一种通过焦磷酸调节肾小管细胞中高糖诱导的纤维化的新机制。 circACTR2: A Novel Mechanism Regulating High Glucose-Induced Fibrosis in Renal Tubular Cells via Pyroptosis. Biol Pharm Bull 1.54 中国医科大学附属第一医院

 

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