欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计27篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。检索式：
(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
- 通过合理设计前体链，T4 RNA连接酶2优先生产环形RNA分子而不需要splint。
标题：Preferential production of RNA rings by T4 RNA ligase 2 without any splint through rational design of precursor strand.
杂志：Nucleic Acids Res ；影响因子：11.147
通讯作者：梁兴国教授（中国海洋大学食品科学与工程学院）
环状单链RNA在许多实际应用中很有前途，但尚未建立规模制备方法。以前，RNA环化是通过T4 RNA连接酶2（Rnl2，dsRNA连接酶）使用夹板实现的，但由于并发分子间聚合，收率低。该研究发现，各种功能性RNA（siRNA，miRNA，核酶等）被Rnl2显性地转化为环，而大小和序列没有明显的限制。关键是设计一种前体RNA，该前体RNA被高度激活以实现高效环化而不需要任何夹板。首先，通过Mfold模拟靶RNA环的二级结构，然后假设在一个位点切割，从而在末端形成一些分子内碱基对。简单地通过用Rnl2处理该RNA，可以选择性且有效地产生靶环。出乎意料的是，即使在3′-OH侧仅形成2 bp且在5′-磷酸侧不形成完全匹配的碱基对，也可以高产率（> 90％）获得环状RNA。通过将常规Rnl2缓冲液稀释至异常低的浓度，进一步抑制了聚合物副产物的形成。即使在高RNA浓度（例如50μM）下，也可以实现极高的选择性（> 95％）。
图注：Rnl2通过常规方法（A和B）或新方法（C和D）制备c-erbB-2特异性锤头状核酶环。
2、circFNDC3B编码的新型蛋白质通过调节结肠癌中的Snail抑制肿瘤进展和EMT。
标题：A novel protein encoded by circFNDC3B inhibits tumor progression and EMT through regulating Snail in colon cancer.
杂志：Mol Cancer；影响因子：10.679
通讯作者：张磊和郑俊教授（中山大学附属三医院）和Qiao Liang（悉尼西米德医院）
结肠癌（CC）是一种常见的恶性肿瘤。该研究发现circFNDC3B在多种癌症中发挥生物学功能。但是，尚不清楚circFNDC3B编码的潜在蛋白是否参与CC的致癌作用。研究者使用Sanger序列和RNase R消化测定法确认circFNDC3B的存在，并使用定量实时PCR评估circRNA的表达。然后进行荧光原位杂交（FISH）研究circFNDC3B的定位。使用LC-MS / MS对circFNDC3B编码的蛋白质进行鉴定。通过CCK8分析，集落形成分析，transwell分析，伤口愈合分析和动物实验评估了circFNDC3B-218aa对增殖，侵袭和迁移的功能。RNA测序和western blot用于鉴定由circFNDC3B-218aa调控的基因。最后，进行了葡萄糖代谢相关的测定，以进一步研究circFNDC3B-218aa的功能。结果表明：CircFNDC3B主要位于细胞质中，而在CC细胞系和组织中表达水平减少。circFNDC3B表达低的患者的OS（P = 0.0014）比高表达的患者短。此外，circFNDC3B抑制CC细胞的增殖，侵袭和迁移。circFNDC3B可以编码一种新型蛋白质circFNDC3B-218aa。此外，circFNDC3B-218aa而非circFNDC3B抑制了CC的增殖，侵袭和迁移。另外，体内实验暗示circFNDC3B-218aa上调对CC进展显示出抑制作用。通过RNA测序，蛋白质印迹和葡萄糖代谢相关的测定，结果发现circFNDC3B-218aa抑制Snail的表达，并随后促进FBP1在CC中的肿瘤抑制作用。新型circFNDC3B-218aa可以作为肿瘤抑制因子和潜在的生物标志物，可以为CC提供潜在的治疗靶点。
图注：circFNDC3B编码能力的评估
- 环状RNA circSKA3与整联蛋白β1结合，从而诱导侵袭性伪足形成、增强了乳腺癌的侵袭能力。
The Circular RNA circSKA3 Binds Integrin β1 to Induce Invadopodium Formation Enhancing Breast Cancer Invasion.
杂志：Mol Ther；影响因子：8.402
通讯作者：杨柏华教授（加拿大多伦多大学）
转移性癌细胞通过形成动态的基于肌动蛋白的侵袭伪足，侵袭周围组织，从而降解周围的细胞外基质并允许癌细胞侵袭。调控RNA，包括环状RNA，已经牵涉到该过程中。通过微阵列芯片技术，研究者发现环状RNA circSKA3在乳腺癌细胞和人类乳腺癌组织中高表达，进一步发现，通过侵袭伪足的形成，乳腺癌细胞的侵袭能力与circSKA3表达正相关。从机制上讲，研究者将Tks5和整联蛋白β1鉴定为这些肿瘤来源的伪足中circSKA3的结合伴侣。过表达circSKA3赋予肿瘤体外和体内侵袭性增加。作者进一步确定了circSKA3，Tks5和整联蛋白β1之间的RNA蛋白结合位点。在肿瘤形成实验中，结果发现circSKA3表达促进了肿瘤的进展和invadopodium（侵袭伪足）的形成。circSKA3结合位点的突变或siRNA的转染抑制了伪足的形成。因此，该研究结果表明环状RNA circSKA3通过与Tks5和整联蛋白β1结合，促进了invadopodium的形成，促进了肿瘤的进展。
文献列表：
| 序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
| 1 | 通过合理设计前体链，T4 RNA连接酶2优先生产环形RNA分子而不需要splint。 | Preferential production of RNA rings by T4 RNA ligase 2 without any splint through rational design of precursor strand. | Nucleic Acids Res | 11.147 | 中国海洋大学食品科学与工程学院 |
| 2 | circFNDC3B编码的新型蛋白质通过调节结肠癌中的Snail抑制肿瘤进展和EMT。 | A novel protein encoded by circFNDC3B inhibits tumor progression and EMT through regulating Snail in colon cancer. | Mol Cancer | 10.679 | 中山大学附属三医院等 |
| 3 | 环状RNA circSKA3与整联蛋白β1结合，从而诱导侵袭性伪足形成增强了乳腺癌的侵袭能力。 | The Circular RNA circSKA3 Binds Integrin β1 to Induce Invadopodium Formation Enhancing Breast Cancer Invasion. | Mol Ther | 8.402 | 加拿大多伦多珊尼布鲁克健康科学中心 |
| 4 | 竞争性内源性RNA网络分析揭示了MERS-CoV繁殖所需的新型宿主依赖性因子。 | Competing endogenous RNA network profiling reveals novel host dependency factors required for MERS-CoV propagation. | Emerg Microbes Infect | 6.212 | 香港大学新兴传染病国家重点实验室 |
| 5 | circFOXM1通过充当ceRNA来上调FAM83D，从而促进非小细胞肺癌细胞的增殖。 | circFOXM1 promotes proliferation of non-small cell lung carcinoma cells by acting as a ceRNA to upregulate FAM83D. | J Exp Clin Cancer Res | 5.646 | 仁济医院肿瘤研究所 |
| 6 | 洞察环形RNA在巨噬细胞活化和纤维化疾病中的作用。 | Insights into the role of circular RNA in macrophage activation and fibrosis disease. | Pharmacol Res | 5.574 | 江苏大学附属人民医院 |
| 7 | 全转录组分析揭示了大肠癌中潜在的hsa_circ_0001955/hsa_circ_0000977介导的miRNA-mRNA调节子网络。 | Whole-transcriptome analysis reveals a potential hsa_circ_0001955/hsa_circ_0000977-mediated miRNA-mRNA regulatory sub-network in colorectal cancer. | Aging (Albany NY) | 5.515 | 浙江大学医学院第一附属医院 |
| 8 | Hsa_circ_0079662通过人结肠癌中的TNF-α途径诱导化疗药物奥沙利铂的耐药机制。 | Hsa_circ_0079662 induces the resistance mechanism of the chemotherapy drug oxaliplatin through the TNF-α pathway in human colon cancer. | J Cell Mol Med | 4.658 | 南方医科大学第二临床医学院 |
| 9 | 环状RNA circFBXO11通过miR-605/FOXO3/ABCB1轴调节肝细胞癌的进展和奥沙利铂耐药性。 | Circular RNA circFBXO11 modulates hepatocellular carcinoma progress and oxaliplatin resistance through miR-605/FOXO3/ABCB1 axis. | J Cell Mol Med | 4.658 | 暨南大学附属第一医院 |
| 10 | RNA聚合酶II使用马铃薯纺锤块茎类病毒环状RNA模板催化从头转录的证据。 | Evidence Supporting That RNA Polymerase II Catalyzes De Novo Transcription Using Potato Spindle Tuber Viroid Circular RNA Templates. | Viruses | 3.811 | 密西西比州立大学生物科学系 |
| 11 | RNA-Seq揭示了汉坦病毒感染中的环形RNA-microRNA-mRNA调控网络。 | RNA-Seq Revealed a Circular RNA-microRNA-mRNA Regulatory Network in Hantaan Virus Infection. | Front Cell Infect Microbiol | 3.518 | 武汉大学人民医院基础医学院感染科 |
| 12 | CircRNA的表达谱和CircZFP644在重症急性胰腺炎小鼠体内通过海绵吸附miR-21-3p的作用。 | CircRNA Expression Profiles and the Potential Role of CircZFP644 in Mice With Severe Acute Pancreatitis via Sponging miR-21-3p. | Front Genet | 3.517 | 成都军区总医院 |
| 13 | circ_ARF3通过使miR-1299保持海绵状以维持CDK6表达来调节骨肉瘤的发病机制。 | circ_ARF3 regulates the pathogenesis of osteosarcoma by sponging miR-1299 to maintain CDK6 expression. | Cell Signal | 3.388 | 上海交通大学医学院上海总医院 |
| 14 | 催乳素反应性环状RNA circHIPK3促进奶牛乳腺上皮细胞的增殖。 | Prolactin-Responsive Circular RNA circHIPK3 Promotes Proliferation of Mammary Epithelial Cells from Dairy Cow. | Genes (Basel) | 3.331 | 江苏师范大学生命科学学院 |
| 15 | circ-0000495吸附miR-488-3p，并介导TROP2在头颈部鳞状细胞癌发展中的上调。 | miR-488-3p sponged by circ-0000495 and mediated upregulation of TROP2 in head and neck squamous cell carcinoma development. | J Cancer | 3.182 | 吉林大学第二医院耳鼻咽喉头颈外科 |
| 16 | 环状RNA MAN2B2通过miRNA-217/MAPK1轴促进肝癌细胞的细胞增殖。 | Circular RNA MAN2B2 promotes cell proliferation of hepatocellular carcinoma cells via the miRNA-217/MAPK1 axis. | J Cancer | 3.182 | 深圳市第三人民医院 |
| 17 | 索拉非尼耐药肝癌细胞中circRNA表达谱的全球转录组学研究。 | Global transcriptomic study of circRNAs expression profile in sorafenib resistant hepatocellular carcinoma cells. | J Cancer | 3.182 | 广西医科大学肿瘤医院 |
| 18 | 环状RNA CCDC66通过调节c-Myc和TGF-β信号通路促进胃癌的进展。 | Circular RNA CCDC66 promotes gastric cancer progression by regulating c-Myc and TGF-β signaling pathways. | J Cancer | 3.182 | 江苏大学附属人民医院 |
| 19 | 早产儿脑室周围白质损伤的全血中环状RNA表达改变。 | Circular RNA expression alteration in whole blood of premature infants with periventricular white matter damage. | Genomics | 3.16 | 东南大学中大医院 |
| 20 | 环状RNA在骨肉瘤中的调节功能。 | The regulatory functions of circular RNAs in osteosarcoma. | Genomics | 3.16 | 伊朗巴博尔医学科学大学 |
| 21 | EMT相关的环状RNA表达谱鉴定circSCYL2为乳腺癌转移中的新型分子。 | EMT related circular RNA expression profiles identify circSCYL2 as a novel molecule in breast tumor metastasis. | Int J Mol Med | 2.928 | 南昌大学第二附属医院 |
| 22 | 环状RNA circ‑ACACA通过miR‑1183和PI3K/PKB途径调节非小细胞肺癌的增殖，迁移和糖酵解。 | Circular RNA circ‑ACACA regulates proliferation, migration and glycolysis in non‑small‑cell lung carcinoma via miR‑1183 and PI3K/PKB pathway. | Int J Mol Med | 2.928 | 聊城市人民医院 |
| 23 | 基于诱导性matrix completion的circRNA-疾病关联预测。 | Prediction of circRNA-disease associations based on inductive matrix completion. | BMC Med Genomics | 2.568 | 安徽大学计算机科学与技术学院 |
| 24 | 全基因组识别长的非编码RNA和环状RNA揭示了它们的ceRNA网络，以响应西瓜中黄瓜绿斑驳花叶病毒的感染。 | Genome-wide identification of long non-coding RNAs and circular RNAs reveal their ceRNA networks in response to cucumber green mottle mosaic virus infection in watermelon. | Arch Virol | 2.261 | 浙江省农业科学院蔬菜研究所 |
| 25 | 右美托咪定通过环状RNA减轻老年大鼠的术后认知功能障碍。 | Dexmedetomidine alleviates postoperative cognitive dysfunction through circular RNA in aged rats. | 3 Biotech | 1.786 | 南昌大学第二附属医院 |
| 26 | 顺铂耐药相关的circRNA_101237可作为肝细胞癌的预后生物标志物。 | Cisplatin resistance-associated circRNA_101237 serves as a prognostic biomarker in hepatocellular carcinoma. | Exp Ther Med | 1.448 | 淮南市第一人民医院 |
| 27 | 使用含有Alu元件的微基因来分析环状RNA。 | Use of Alu Element Containing Minigenes to Analyze Circular RNAs. | J Vis Exp | 1.108 | 肯塔基大学分子和细胞生物化学研究所 |