欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计23篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、CircAtlas：来自1070个脊椎动物转录组的100万个高精度环状RNA的整合资源。
标题：CircAtlas: an integrated resource of one million highly accurate circular RNAs from 1070 vertebrate transcriptomes.
杂志：Genome Biol；影响因子：14.028；
通讯作者：赵方庆教授（中科院北京生命科学研究院）
环状RNA（circRNA）相关表达谱数据已成为转录组学的重要组成部分。赵方庆教授团队开发的circAtlas数据库，从6个脊椎动物物种的19个正常组织中收集1070个RNA-seq样本数据，整合展示约100万个环状RNA的相关信息。其中81.3％以上circRNA提供了全长序列。用户通过circAtlas网站可免费检索这些circRNA的表达模式，保守性和功能注释等信息。CircAtlas网址：http://circatlas.biols.ac.cn/；数据库详细介绍请点击：CircAtlas | 来自1070个脊椎动物转录组的100万个高精度circRNA的综合数据库
图注：circAtlas数据库概要
2、环状RNA-ZNF532调节糖尿病引起的视网膜周细胞变性和血管功能障碍。
标题：Circular RNA-ZNF532 regulates diabetes-induced retinal pericyte degeneration and vascular dysfunction.
杂志：J Clin Invest；影响因子：12.282
通讯作者：颜标教授 和Chen Zhao（复旦大学），Qin Jiang（南京医科大学）
糖尿病视网膜病（DR）是工作年龄成人视力丧失的主要原因。血管周细胞变性是DR的主要临床表现，但对周细胞变性的机制了解甚少。环状RNA（circRNA）在多种生物学过程和疾病进展中起重要作用。该研究中，研究者调查了circRNA在周细胞生物学和糖尿病引起的视网膜血管功能障碍中的作用。在糖尿病应激下的周细胞中，糖尿病鼠模型的视网膜血管中以及糖尿病患者的玻璃体液中，cZNF532的表达上调。cZNF532沉默可降低周细胞的活力，增殖和分化，并抑制周细胞向内皮细胞募集。cZNF532通过充当miR-29a-3p海绵并诱导NG2，LOXL2和CDK2的表达增加，进而调节周细胞生物学功能。敲低cZNF532或miR-29a-3p的过表达加剧了链脲佐菌素诱导的视网膜周细胞变性和血管功能障碍。相比之下，cZNF532的过表达或miR-29a-3p的抑制可改善人糖尿病性视网膜病变引起的玻璃体和视网膜周细胞变性和血管功能障碍。该研究结果数据确定了circRNA介导的机制，可协调DR中的周细胞生物学和血管稳态。诱导cZNF532或抑制miR-29a-3p是治疗DR的一种可利用的治疗方法。
图注：cZNF532在糖尿病视网膜病（DR）中功能机制示意图
3、VirusCircBase：病毒circRNA数据库。
标题：VirusCircBase: a database of virus circular RNAs.
杂志：Brief Bioinform；影响因子：9.101；
通讯作者：彭友松教授（湖南大学）
环状RNA（circRNA）对多种细胞活动和多种人类疾病至关重要。在双链DNA病毒（dsDNA）中已鉴定出几种与癌症相关的病毒circRNA，但尚未有关于病毒circRNA的系统研究报道。该研究中，作者通过病毒感染相关RNA测序数据对病毒circRNA进行计算预测，对23种病毒物种的11924个circRNA进行了系统的调查。除了dsDNA病毒外，该研究还发现了单链RNA病毒和逆转录病毒中的许多circRNA，例如寨卡病毒，甲型流感病毒，埃博拉病毒和HIV1等。大多数病毒circRNA在反向剪接位点的侧翼序列具有反向互补序列或重复序列。大多数病毒circRNA仅在特定物种的特定细胞系或组织中表达。功能富集分析表明，来自dsDNA病毒的病毒circRNA参与了与癌症相关的KEGG信号通路。VirusCircBase数据库存储和组织了目前研究中的所有病毒circRNA，是第一个病毒circRNA数据库。在当下全球公共卫生背景下，VirusCircBase为进一步探索和研究病毒circRNA提供了数据指南。数据库详细介绍请点击：VirusCircBase | 病毒circRNA数据库
图注：VirusCircBase数据库统计概览
| 序号 |
主要内容 |
论文标题 |
杂志 |
影响因子 |
单位 |
| 1 |
CircAtlas：来自1070个脊椎动物转录组的一百万个高精度环状RNA的整合资源。 |
CircAtlas: an integrated resource of one million highly accurate circular RNAs from 1070 vertebrate transcriptomes. |
Genome Biol |
14.028 |
中科院北京生命科学研究院 |
| 2 |
环状RNA-ZNF532调节糖尿病引起的视网膜周细胞变性和血管功能障碍。 |
Circular RNA-ZNF532 regulates diabetes-induced retinal pericyte degeneration and vascular dysfunction. |
J Clin Invest |
12.282 |
南京医科大学附属眼科医院等 |
| 3 |
VirusCircBase：病毒circRNA数据库。 |
VirusCircBase: a database of virus circular RNAs. |
Brief Bioinform |
9.101 |
湖南大学 |
| 4 |
神经干细胞中沉默环状RNA HIPK2可增强缺血性中风后的功能恢复 |
Corrigendum to ‘Silencing of circular RNA HIPK2 in neural stem cells enhances functional recovery following ischaemic stroke’ [EBioMedicine 52 (2020) 102660]. |
EBioMedicine |
6.68 |
东南大学医学院等 |
| 5 |
非小细胞肺癌细胞的环状RNA景观。 |
The Circular RNA Landscape of Non-Small Cell Lung Cancer Cells. |
Cancers (Basel) |
6.162 |
德国弗莱堡大学医学院等 |
| 6 |
CircRNA在口腔癌中的功能和临床影响。 |
Functional and Clinical Impact of CircRNAs in Oral Cancer. |
Cancers (Basel) |
6.162 |
西班牙IIS卫生研究基金会等 |
| 7 |
CircGCN1L1通过靶向TMJ骨关节炎中的miR-330-3p和TNF-α促进滑膜细胞增殖和软骨细胞凋亡。 |
CircGCN1L1 promotes synoviocyte proliferation and chondrocyte apoptosis by targeting miR-330-3p and TNF-α in TMJ osteoarthritis. |
Cell Death Dis |
5.959 |
上海市第九人民医院等 |
| 8 |
TDCIPP暴露引起的PC12细胞circRNA表达谱的变化可能通过Traf2基因调节下游的NF-κB通路。 |
Changes in the circRNA expression profile of PC12 cells induced by TDCIPP exposure may regulate the downstream NF-κB pathway via the Traf2 gene. |
Chemosphere |
5.108 |
天津医科大学等 |
| 9 |
肝炎三角洲病毒与剪接因子SF3B155相互作用，并改变细胞周期控制基因的mRNA前体剪接。 |
Hepatitis Delta Virus interacts with splicing factor SF3B155 and alters pre-mRNA splicing of cell cycle control genes. |
FEBS J |
4.739 |
葡萄牙里斯本大学等 |
| 10 |
在肾细胞癌中环状RNA MYLK通过调节miR-513a-5p / VEGFC信号传导促进肿瘤生长和转移。 |
Circular RNA MYLK promotes tumour growth and metastasis via modulating miR-513a-5p/VEGFC signalling in renal cell carcinoma. |
J Cell Mol Med |
4.658 |
北大深圳医院等 |
| 11 |
肾脏疾病中的环状RNA。 |
Circular RNA in renal diseases. |
J Cell Mol Med |
4.658 |
安徽医科大学等 |
| 12 |
评估阿尔茨海默氏病和额颞叶变性中的环状RNA。 |
Assessing circular RNAs in Alzheimer’s disease and frontotemporal lobar degeneration. |
Neurobiol Aging |
4.398 |
西班牙巴塞罗那大学等 |
| 13 |
circRNA分子翻译起始密码子AUG：蛋白质编码基因和转移RNA之间的联系？ |
AUG as the Translation Start Codon in Circular RNA Molecules: A Connection between Protein-Coding Genes and Transfer RNAs? |
Bioessays |
4.396 |
波兰弗罗茨瓦夫大学等 |
| 14 |
从烟草花粉中消除类病毒涉及繁殖率的降低和降解过程的增加。 |
Elimination of Viroids from Tobacco Pollen Involves a Decrease in Propagation Rate and an Increase of the Degradation Processes. |
Int J Mol Sci |
4.183 |
捷克科学院生物中心等 |
| 15 |
帕金森氏病小鼠模型中不同脑区的环状RNA转录组分析。 |
Transcriptomic Profiling of Circular RNA in Different Brain Regions of Parkinson’s Disease in a Mouse Model. |
Int J Mol Sci |
4.183 |
东南大学等 |
| 16 |
骨肉瘤中环状RNA的治疗潜力。 |
Therapeutic Potential of Circular RNAs in Osteosarcoma. |
Front Oncol |
4.137 |
北京积水潭医院等 |
| 17 |
肝细胞癌相关环状RNA标记的鉴定和综合分析。 |
Identification and integrated analysis of hepatocellular carcinoma-related circular RNA signature. |
Ann Transl Med |
3.689 |
南通大学附属医院等 |
| 18 |
肝细胞癌外周血中环状RNA的表达与临床病理特征的关系 |
Correlation between the expressions of circular RNAs in peripheral venous blood and clinicopathological features in hepatocellular carcinoma. |
Ann Transl Med |
3.689 |
四川大学华西医院等 |
| 19 |
全面的环状RNA表达谱分析揭示了circRNA_0007694在甲状腺乳头状癌中的调节作用。 |
Comprehensive circular RNA profiling reveals the regulatory role of circRNA_0007694 in papillary thyroid carcinoma. |
Am J Transl Res. |
3.266 |
中山大学孙逸仙纪念医院等 |
| 20 |
circRNAprofiler：基于R语言的环状RNA下游分析计算框架。 |
circRNAprofiler: an R-based computational framework for the downstream analysis of circular RNAs. |
BMC Bioinformatics |
2.511 |
阿姆斯特丹大学医学中心等 |
| 21 |
非编码RNA作为急性冠状动脉综合征的生物标志物。 |
Noncoding RNAs as Biomarkers for Acute Coronary Syndrome. |
Biomed Res Int |
2.197 |
中国医科大学附属第四医院等 |
| 22 |
敲低circAPLP2通过调节miR-485-5p / FOXK1轴抑制结直肠癌的进展。 |
Knockdown of circAPLP2 Inhibits Progression of Colorectal Cancer by Regulating miR-485-5p/FOXK1 Axis. |
Cancer Biother Radiopharm |
1.894 |
山西省人民医院等 |
| 23 |
circ_0067934通过抑制miR-1304表达和增加Myc表达水平来增加膀胱癌细胞的增殖，迁移和侵袭。 |
circ_0067934 increases bladder cancer cell proliferation, migration and invasion through suppressing miR-1304 expression and increasing Myc expression levels. |
Exp Ther Med |
1.448 |
武汉科技大学普仁医院等 |
