欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计39篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.干细胞衍生的外泌体可通过新的外泌体/circHIPK3/FOXO3a途径防止细胞焦亡并修复缺血性肌肉损伤。
标题:Stem cell-derived exosomes prevent pyroptosis and repair ischemic muscle injury through a novel exosome/circHIPK3/ FOXO3a pathway.
杂志:Theranostics. 8.063
通讯作者:李杨欣(苏州大学附属第一医院)
骨骼肌缺血性损伤仍然是一个严重的临床问题,目前尚无有效的治疗方法。本研究的目的是确定人脐带间充质干细胞衍生的外泌体(UMSC-Exo)是否可以通过释放环状RNA来修复缺血性损伤。为了产生后肢缺血模型,研究者通过外科手术结扎了C57BL / 6小鼠的左股动脉。使用来自缺血和对照肌肉的总RNA进行circRNA-seq分析,结果发现缺血性肌肉中circHIPK3的表达减少。为了探索circHIPK3在缺血性损伤中的作用,将小鼠在手术后随机分为三组:1)载体;2)UMSC-Exo;3)UMSC-Exo和靶向circHIPK3的siRNA(UMSC-Exo / si-circHIPK3)。UMSC-Exo处理显著增加了circHIPK3的表达并改善了血液灌注,运行距离和肌肉力量,注射UMSC-Exo / si-circHIPK3可以逆转这种现象,表明UMSC-Exo通过释放circHIPK3改善了肌肉功能。UMSC-Exo治疗还可抑制局部缺血诱导的细胞凋亡-炎症小体引起的细胞死亡,如NLRP3的激活,caspase-1的裂解以及随后IL-1β和IL-18的增加。生物信息学分析确定miR-421 / FOXO3a为circHIPK3的潜在靶点,荧光素酶报告基因分析证实了这一点。在C2C12细胞中敲除circHIPK3导致miR-421表达增加。研究者通过用LPS和ATP刺激C2C12细胞建立了体外模型。LPS和ATP处理导致circHIPK3的表达减少,而miR-421的表达增加,这一过程可被UMSC-Exo阻止。蛋白免疫印迹分析表明,当用UMSC-Exo处理细胞时,NLRP3的水平降低,胱天蛋白酶-1裂解。在miR-421抑制剂存在下,FOXO3a在C2C12细胞中的表达增加,而当用LPS和ATP处理细胞时,FOXO3a的表达减少。重要的是,FOXO3a的表达被UMSC-Exo上调,但是当存在si-circHIPK3时FOXO3a的表达降低。使用丧失/获得功能的方法,该研究证明了miR-421 / FOXO3a是circHIPK3的直接靶标,而UMSC-Exo通过释放circHIPK3来预防缺血性损伤,后者反过来调节miR-421,从而导致FOXO3a表达增加并抑制凋亡和释放IL-1β、IL-18。
图注:UMSC-EXo中的circHIPK3抑制炎性体诱导的骨骼肌细胞凋亡
2.Hsa_circ_0085576通过miR-498/YAP1轴促进透明细胞肾细胞癌的发生和转移。
标题:Hsa_circ_0085576 promotes clear cell renal cell carcinoma tumorigenesis and metastasis through the miR-498/YAP1 axis.
杂志:Aging (Albany NY). 5.515
通讯作者:纪志刚教授(北京协和医院)
越来越多的证据表明,环状RNA(circRNA)在各种癌症中起着重要的调节作用。然而,尚不清楚circRNA在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤发生和转移中起什么作用。在这项研究中,研究者使用生物信息学分析和一系列实验,表征了一种新型circRNA hsa_circ_0085576,其在ccRCC组织和细胞系中显著上调。高表达hsa_circ_0085576与肿瘤大小、临床分期、转移状态和较差的生存率显著相关。体外敲低hsa_circ_0085576可显著抑制ccRCC细胞的细胞增殖、迁移、侵袭和促进细胞凋亡。而hsa_circ_0085576的过表达具有相反的效果。此外,hsa_circ_0085576沉默在体内显著抑制了肿瘤的生长和转移,而hsa_circ_0085576的过表达在体内具有相反的作用。研究结果进一步表明,hsa_circ_0085576可以作为竞争性内源RNA与microRNA-498相互作用,从而减弱其对靶基因(YAP1)的抑制作用。最后,功能研究表明,在ccRCC细胞中,抑制hsa_circ_0085576可通过调节miR-498 / YAP1信号传导来抑制细胞生长和转移。基于这些发现,hsa_circ_0085576可能代表了ccRCC有价值的预后生物标志物和抑制肿瘤发生和转移的潜在治疗靶标。
图注:Hsa_circ_0085576通过YAP1信号通路促进ccRCC进展。
3.RNA携带的多种信息:日全食还是隧道尽头的光?
标题:Multiple information carried by RNAs: total eclipse or a light at the end of the tunnel?
杂志:RNA Biol. 5.477
通讯作者:Dr. Florent Hubé (巴黎大学)
大约15年前,研究者发现RNA不一定是编码的或非编码的,前体RNA可以产生不同类型的成熟RNA,这些发现跟RNA是否编码或长短没有必然联系。越来越多的研究都对RNA世界的这种二分类法(编码或非编码的、长或短)提出了挑战,但对RNA的传递信息多样性,在进一步的功能研究中还是很大程度上被忽略。该综述中,作者列举了相同RNA或由相同前体RNA产生的RNA在大多数生物体中的生物相关性最新案例,发现一个重要的结论即RNA的总体功能实际来自不同起源或不同功能的各种RNA之间的平衡来实现。所以当目标功能分子不是人们认知的那个分子时,此时考虑RNA分子的多样性对其下游功能研究显然至关重要。
图注:组成性或选择性剪接使蛋白质组和转录组的产物多样化
文献列表:
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | 影响因子 | 单位 |
1 | 干细胞衍生的外泌体可通过新的外泌体/circHIPK3/FOXO3a途径防止细胞焦亡并修复缺血性肌肉损伤。 | Stem cell-derived exosomes prevent pyroptosis and repair ischemic muscle injury through a novel exosome/circHIPK3/ FOXO3a pathway. | Theranostics. | 8.063 | 苏州大学附属第一医院 |
2 | Hsa_circ_0085576通过miR-498/YAP1轴促进透明细胞肾细胞癌的发生和转移。 | Hsa_circ_0085576 promotes clear cell renal cell carcinoma tumorigenesis and metastasis through the miR-498/YAP1 axis. | Aging (Albany NY). | 5.515 | 北京协和医院 |
3 | RNA携带的多种信息:日全食还是隧道尽头的光? | Multiple information carried by RNAs: total eclipse or a light at the end of the tunnel? | RNA Biol. | 5.477 | 巴黎大学 |
4 | 脊髓性肌萎缩症中的RNA:靶向治疗的意义。 | RNA in spinal muscular atrophy: therapeutic implications of targeting. | Expert Opin Ther Targets. | 4.621 | 爱荷华州立大学 |
5 | 具有集成序列和表观遗传学特征的circRNA表达模式建模证明了H3K79me2可能参与circRNA表达。 | Modeling circRNA expression pattern with integrated sequence and epigenetic features demonstrates the potential involvement of H3K79me2 in circRNA expression. | Bioinformatics. | 4.531 | 西安交通大学生命科学与技术学院 |
6 | 精神分裂症患者血浆外泌体中环状RNA表达的变化。 | The alterations of circular RNA expression in plasma exosomes from patients with schizophrenia. | J Cell Physiol. | 4.522 | 中山大学中山纪念医院 |
7 | 鉴定血清外泌体中的三种环状RNA作为中国人群非小细胞肺癌的诊断生物标志物。 | Identification of three circular RNA cargoes in serum exosomes as diagnostic biomarkers of non-small-cell lung cancer in the Chinese population. | J Mol Diagn. | 4.426 | 广州呼吸疾病研究所 |
8 | 高温胁迫下涉及牛奶脂肪代谢的circRNA相关ceRNA网络的鉴定。 | Identification of circRNA-Associated-ceRNA Networks Involved in Milk Fat Metabolism under Heat Stress. | Int J Mol Sci. | 4.183 | 华南农业大学动物科学学院 |
9 | 条件培养基人类羊膜来源的间充质干细胞Circ-100290通过miR-449a/eNOS和miR-449a/VEGFA轴促进血管生成 | Circ-100290 Positively Regulates Angiogenesis Induced by Conditioned Medium of Human Amnion-Derived Mesenchymal Stem Cells Through miR-449a/eNOS and miR-449a/VEGFA Axes. | Int J Biol Sci. | 4.067 | 南京医科大学 |
10 | PDGF-BB诱导的血管平滑肌细胞中CircRNA的差异表达和生物信息学分析。 | Differential Expression and Bioinformatics Analysis of CircRNA in PDGF-BB-Induced Vascular Smooth Muscle Cells. | Front Genet. | 3.517 | 哈尔滨医科大学附属第二医院 |
11 | 胃肠道间质瘤中CircRNA-miRNA-mRNA调控网络的鉴定。 | Identification of CircRNA-miRNA-mRNA Regulatory Network in Gastrointestinal Stromal Tumor. | Front Genet. | 3.517 | 中南大学湘雅二医院 |
12 | 全基因组分析的宿主编码环状RNA突显了它们在日本脑炎病毒引起的神经炎症反应中的潜在作用。 | Genome-wide profiling of host-encoded circular RNAs highlights their potential role during the Japanese encephalitis virus-induced neuroinflammatory response. | BMC Genomics. | 3.501 | 华中农业大学 |
13 | 环状RNA circ_0000284通过miR-377-3p介导的PD-L1促进在非小细胞肺癌的进展中发挥致癌作用。 | Circular RNA circ_0000284 plays an oncogenic role in the progression of non-small cell lung cancer through the miR-377-3p-mediated PD-L1 promotion. | Cancer Cell Int. | 3.439 | 山西白求恩医院 |
14 | 苦参碱通过调节circ_0027345/miR-345-5p/HOXD3轴抑制肝细胞癌的细胞生长、迁移、侵袭并促进自噬。 | Matrine inhibits cell growth, migration, invasion and promotes autophagy in hepatocellular carcinoma by regulation of circ_0027345/miR-345-5p/HOXD3 axis. | Cancer Cell Int. | 3.439 | 浙江大学爱丁堡大学联合学院 |
15 | 血清来源的三个环RNA标记作为肝细胞癌的诊断生物标志物。 | Serum-derived three-circRNA signature as a diagnostic biomarker for hepatocellular carcinoma. | Cancer Cell Int. | 3.439 | 中国医科大学附属盛京医院 |
16 | 人类生存运动神经元基因产生的环状RNA的特征。 | Characteristics of circular RNAs generated by human Survival Motor Neuron genes. | Cell Signal.Review | 3.388 | 爱荷华州立大学 |
17 | 敲除circ_0003340可以诱导细胞凋亡,并通过miR-564/TPX2抑制食管癌细胞中的侵袭和增殖。 | Knockdown of circ_0003340 induces cell apoptosis, inhibits invasion and proliferation through miR-564/TPX2 in esophageal cancer cells. | Exp Cell Res. | 3.329 | 郑州大学基础医学学院 |
18 | 环状RNA-hsa-circ-0000670通过microRNA-384/SIX4轴促进胃癌的进展。 | Circular RNA-hsa-circ-0000670 promotes gastric cancer progression through the microRNA-384/SIX4 axis. | Exp Cell Res. | 3.329 | 中国医科大学附属第四医院 |
19 | 在无乳链球菌感染的尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)感染期间,单分子实时测序和RNA-seq揭示了调控网络中长非编码和环状RNA的作用。 | Single molecule real-time sequencing and RNA-seq unravel the role of long non-coding and circular RNA in the regulatory network during Nile tilapia (Oreochromis niloticus) infection with Streptococcus agalactiae. | Fish Shellfish Immunol. | 3.298 | 广西水产科学研究院 |
20 | 环状RNA hsa_circ_0131242通过使hsa-miR-2682海绵化促进三阴性乳腺癌的进展。 | Circular RNA hsa_circ_0131242 Promotes Triple-Negative Breast Cancer Progression by Sponging hsa-miR-2682. | Onco Targets Ther. | 3.046 | 中国医科大学附属肿瘤医院 |
21 | CircHIPK3海绵吸附miR-338-3p促进前列腺癌细胞的G2/M转化。 | CircHIPK3 Facilitates the G2/M Transition in Prostate Cancer Cells by Sponging miR-338-3p. | Onco Targets Ther. | 3.046 | 重庆医科大学附属第一医院 |
22 | 环状RNA Gprc5a海绵吸附miR-1283激活YAP1/TEAD1信号通路来促进HCC进程。 | Circular RNA Gprc5a Promotes HCC Progression by Activating YAP1/TEAD1 Signalling Pathway by Sponging miR-1283. | Onco Targets Ther. | 3.046 | 广州医科大学附属第五医院 |
23 | 组合的circRNAs作为区分乳头状甲状腺癌的诊断工具。 | A Combination of circRNAs as a Diagnostic Tool for Discrimination of Papillary Thyroid Cancer. | Onco Targets Ther. | 3.046 | 安徽医科大学附属合肥医院 |
24 | 非酒精性脂肪肝疾病中遗传学和表观遗传学研究目的。 | Genetics and epigenetics purpose in non-alcoholic fatty liver disease. | Expert Rev Gastroenterol Hepatol. | 2.991 | 墨西哥Médica Sur Clinic & Foundation |
25 | 环状RNA circ_0003645沉默可通过oxLDL诱导的内皮细胞中的NF-kβ途径减轻炎症和凋亡。 | Circular RNA circ_0003645 silencing alleviates inflammation and apoptosis via the NF-kβpathway in endothelial cells induced by oxLDL. | Gene. | 2.638 | 徐州医科大学附属医院 |
26 | circPUM1通过吸附miR-760促进多囊卵巢综合征的进展。 | circPUM1 promotes polycystic ovary syndrome progression by sponging to miR-760. | Gene. | 2.638 | 淮安市第二人民医院 |
27 | 上调的环状RNA hsa_circ_0008433通过miRNA调节子宫内膜异位症的发病机制。 | Upregulated Circular RNA hsa_circ_0008433 Regulates Pathogenesis in Endometriosis Via miRNA. | Reprod Sci. | 2.559 | 中山大学附属第一医院 |
28 | 环形RNA FUNDC1改善了具有高风险的急性缺血性中风患者中风相关感染的预测。 | Circular RNA FUNDC1 improves prediction of stroke associated infection in acute ischemic stroke patients with high risk. | Biosci Rep. | 2.535 | 东南大学医学院附属中大医院 |
29 | Hsa_circ_0003732通过miR-545/CCNA2轴促进骨肉瘤细胞增殖。 | Hsa_circ_0003732 promotes osteosarcoma cells proliferation via miR-545/CCNA2 axis. | Biosci Rep. | 2.535 | 安徽医科大学附属第一医院 |
30 | Circ-APBB1IP作为一种预后性生物标志物,通过ERK1/2信号通路促进透明细胞肾细胞癌的进展。 | Circ-APBB1IP as a Prognostic Biomarker Promotes Clear Cell Renal Cell Carcinoma Progression Through The ERK1/2 Signaling Pathway. | Int J Med Sci. | 2.333 | 广东医科大学附属医院 |
31 | hsa_circRNA_102958的上调指示预后不良,并通过miR-1205/SH2D3A轴促进卵巢癌进展。 | Upregulation of hsa_circRNA_102958 Indicates Poor Prognosis and Promotes Ovarian Cancer Progression Through miR-1205/SH2D3A Axis. | Cancer Manag Res. | 2.243 | 哈尔滨医科大学附属第二医院 |
32 | hsa_circ_0008285通过靶向miR-211-5p/SOX4轴促进宫颈癌的进展。 | hsa_circ_0008285 Facilitates the Progression of Cervical Cancer by Targeting miR-211-5p/SOX4 Axis. | Cancer Manag Res. | 2.243 | 洛阳市中心医院 |
33 | circMTO1过表达通过miR-9-5p/NOX4轴对肝癌细胞增殖和凋亡调控作用的机制。 | Mechanism of the Regulatory Effect of Overexpression of circMTO1 on Proliferation and Apoptosis of Hepatoma Cells via miR-9-5p/NOX4 Axis. | Cancer Manag Res. | 2.243 | 荆州中心医院 |
34 | circRNA在膀胱癌中的生物发生,功能和作用。 | The Biogenesis, Functions, and Roles of circRNAs in Bladder Cancer. | Cancer Manag Res.Review | 2.243 | 杭州市第一人民医院 |
35 | circRNA MYLK通过上调RHEB和激活mTOR信号来促进宫颈癌。 | circRNA MYLK Accelerates Cervical Cancer via Up-Regulation of RHEB and Activation of mTOR Signaling. | Cancer Manag Res. | 2.243 | 同济大学附属东方医院 |
36 | 环状痴呆大鼠血管中环状RNA的表达。 | Expression of Circular RNAs in the Vascular Dementia Rats. | Neurosci Lett. | 2.173 | 赣州市人民医院 |
37 | Hsa_Circ_0007841通过上调ABCG2增强多发性骨髓瘤化疗的抵抗力。 | Hsa_Circ_0007841 Enhances Multiple Myeloma Chemotherapy Resistance Through Upregulating ABCG2. | Technol Cancer Res Treat. | 1.481 | 荆门市第一人民医院 |
38 | Mmu-circRNA_016901对骨髓间充质干细胞放射敏感性的影响 | [Effect of Mmu-circRNA_016901 on the Radiosensitivity of Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells]. | Zhongguo Shi Yan Xue Ye Xue Za Zhi | 中南大学附属湘雅第三医院 | |
39 | 环状RNA-UBXN7在肝细胞癌中促进增殖,迁移和抑制细胞凋亡 | [Circular RNA-UBXN7 promotes proliferation, migration and suppresses apoptosis in hepatocellular cancer]. | Zhonghua Gan Zang Bing Za Zhi | 郑州大学第一附属医院 |