欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计39篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

1.干细胞衍生的外泌体可通过新的外泌体/circHIPK3/FOXO3a途径防止细胞焦亡并修复缺血性肌肉损伤。

标题:Stem cell-derived exosomes prevent pyroptosis and repair ischemic muscle injury through a novel exosome/circHIPK3/ FOXO3a pathway.

杂志:Theranostics. 8.063

通讯作者:李杨欣(苏州大学附属第一医院)

骨骼肌缺血性损伤仍然是一个严重的临床问题,目前尚无有效的治疗方法。本研究的目的是确定人脐带间充质干细胞衍生的外泌体(UMSC-Exo)是否可以通过释放环状RNA来修复缺血性损伤。为了产生后肢缺血模型,研究者通过外科手术结扎了C57BL / 6小鼠的左股动脉。使用来自缺血和对照肌肉的总RNA进行circRNA-seq分析,结果发现缺血性肌肉中circHIPK3的表达减少。为了探索circHIPK3在缺血性损伤中的作用,将小鼠在手术后随机分为三组:1)载体;2)UMSC-Exo;3)UMSC-Exo和靶向circHIPK3的siRNA(UMSC-Exo / si-circHIPK3)。UMSC-Exo处理显著增加了circHIPK3的表达并改善了血液灌注,运行距离和肌肉力量,注射UMSC-Exo / si-circHIPK3可以逆转这种现象,表明UMSC-Exo通过释放circHIPK3改善了肌肉功能。UMSC-Exo治疗还可抑制局部缺血诱导的细胞凋亡-炎症小体引起的细胞死亡,如NLRP3的激活,caspase-1的裂解以及随后IL-1β和IL-18的增加。生物信息学分析确定miR-421 / FOXO3a为circHIPK3的潜在靶点,荧光素酶报告基因分析证实了这一点。在C2C12细胞中敲除circHIPK3导致miR-421表达增加。研究者通过用LPS和ATP刺激C2C12细胞建立了体外模型。LPS和ATP处理导致circHIPK3的表达减少,而miR-421的表达增加,这一过程可被UMSC-Exo阻止。蛋白免疫印迹分析表明,当用UMSC-Exo处理细胞时,NLRP3的水平降低,胱天蛋白酶-1裂解。在miR-421抑制剂存在下,FOXO3a在C2C12细胞中的表达增加,而当用LPS和ATP处理细胞时,FOXO3a的表达减少。重要的是,FOXO3a的表达被UMSC-Exo上调,但是当存在si-circHIPK3时FOXO3a的表达降低。使用丧失/获得功能的方法,该研究证明了miR-421 / FOXO3a是circHIPK3的直接靶标,而UMSC-Exo通过释放circHIPK3来预防缺血性损伤,后者反过来调节miR-421,从而导致FOXO3a表达增加并抑制凋亡和释放IL-1β、IL-18。

 

图注:UMSC-EXo中的circHIPK3抑制炎性体诱导的骨骼肌细胞凋亡

 

2.Hsa_circ_0085576通过miR-498/YAP1轴促进透明细胞肾细胞癌的发生和转移。

标题:Hsa_circ_0085576 promotes clear cell renal cell carcinoma tumorigenesis and metastasis through the miR-498/YAP1 axis.

杂志:Aging (Albany NY). 5.515

通讯作者:纪志刚教授(北京协和医院)

越来越多的证据表明,环状RNA(circRNA)在各种癌症中起着重要的调节作用。然而,尚不清楚circRNA在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤发生和转移中起什么作用。在这项研究中,研究者使用生物信息学分析和一系列实验,表征了一种新型circRNA hsa_circ_0085576,其在ccRCC组织和细胞系中显著上调。高表达hsa_circ_0085576与肿瘤大小、临床分期、转移状态和较差的生存率显著相关。体外敲低hsa_circ_0085576可显著抑制ccRCC细胞的细胞增殖、迁移、侵袭和促进细胞凋亡。而hsa_circ_0085576的过表达具有相反的效果。此外,hsa_circ_0085576沉默在体内显著抑制了肿瘤的生长和转移,而hsa_circ_0085576的过表达在体内具有相反的作用。研究结果进一步表明,hsa_circ_0085576可以作为竞争性内源RNA与microRNA-498相互作用,从而减弱其对靶基因(YAP1)的抑制作用。最后,功能研究表明,在ccRCC细胞中,抑制hsa_circ_0085576可通过调节miR-498 / YAP1信号传导来抑制细胞生长和转移。基于这些发现,hsa_circ_0085576可能代表了ccRCC有价值的预后生物标志物和抑制肿瘤发生和转移的潜在治疗靶标。

 

图注:Hsa_circ_0085576通过YAP1信号通路促进ccRCC进展。

 

3.RNA携带的多种信息:日全食还是隧道尽头的光?

标题:Multiple information carried by RNAs: total eclipse or a light at the end of the tunnel?

杂志:RNA Biol. 5.477

通讯作者:Dr. Florent Hubé (巴黎大学)

大约15年前,研究者发现RNA不一定是编码的或非编码的,前体RNA可以产生不同类型的成熟RNA,这些发现跟RNA是否编码或长短没有必然联系。越来越多的研究都对RNA世界的这种二分类法(编码或非编码的、长或短)提出了挑战,但对RNA的传递信息多样性,在进一步的功能研究中还是很大程度上被忽略。该综述中,作者列举了相同RNA或由相同前体RNA产生的RNA在大多数生物体中的生物相关性最新案例,发现一个重要的结论即RNA的总体功能实际来自不同起源或不同功能的各种RNA之间的平衡来实现。所以当目标功能分子不是人们认知的那个分子时,此时考虑RNA分子的多样性对其下游功能研究显然至关重要。

 

图注:组成性或选择性剪接使蛋白质组和转录组的产物多样化

 

文献列表:

序号 主要内容 论文标题 杂志 影响因子 单位
1 干细胞衍生的外泌体可通过新的外泌体/circHIPK3/FOXO3a途径防止细胞焦亡并修复缺血性肌肉损伤。 Stem cell-derived exosomes prevent pyroptosis and repair ischemic muscle injury through a novel exosome/circHIPK3/ FOXO3a pathway. Theranostics. 8.063 苏州大学附属第一医院
2 Hsa_circ_0085576通过miR-498/YAP1轴促进透明细胞肾细胞癌的发生和转移。 Hsa_circ_0085576 promotes clear cell renal cell carcinoma tumorigenesis and metastasis through the miR-498/YAP1 axis. Aging (Albany NY). 5.515 北京协和医院
3 RNA携带的多种信息:日全食还是隧道尽头的光? Multiple information carried by RNAs: total eclipse or a light at the end of the tunnel? RNA Biol. 5.477 巴黎大学
4 脊髓性肌萎缩症中的RNA:靶向治疗的意义。 RNA in spinal muscular atrophy: therapeutic implications of targeting. Expert Opin Ther Targets. 4.621 爱荷华州立大学
5 具有集成序列和表观遗传学特征的circRNA表达模式建模证明了H3K79me2可能参与circRNA表达。 Modeling circRNA expression pattern with integrated sequence and epigenetic features demonstrates the potential involvement of H3K79me2 in circRNA expression. Bioinformatics. 4.531 西安交通大学生命科学与技术学院
6 精神分裂症患者血浆外泌体中环状RNA表达的变化。 The alterations of circular RNA expression in plasma exosomes from patients with schizophrenia. J Cell Physiol. 4.522 中山大学中山纪念医院
7 鉴定血清外泌体中的三种环状RNA作为中国人群非小细胞肺癌的诊断生物标志物。 Identification of three circular RNA cargoes in serum exosomes as diagnostic biomarkers of non-small-cell lung cancer in the Chinese population. J Mol Diagn. 4.426 广州呼吸疾病研究所
8 高温胁迫下涉及牛奶脂肪代谢的circRNA相关ceRNA网络的鉴定。 Identification of circRNA-Associated-ceRNA Networks Involved in Milk Fat Metabolism under Heat Stress. Int J Mol Sci. 4.183 华南农业大学动物科学学院
9 条件培养基人类羊膜来源的间充质干细胞Circ-100290通过miR-449a/eNOS和miR-449a/VEGFA轴促进血管生成 Circ-100290 Positively Regulates Angiogenesis Induced by Conditioned Medium of Human Amnion-Derived Mesenchymal Stem Cells Through miR-449a/eNOS and miR-449a/VEGFA Axes. Int J Biol Sci. 4.067 南京医科大学
10 PDGF-BB诱导的血管平滑肌细胞中CircRNA的差异表达和生物信息学分析。 Differential Expression and Bioinformatics Analysis of CircRNA in PDGF-BB-Induced Vascular Smooth Muscle Cells. Front Genet. 3.517 哈尔滨医科大学附属第二医院
11 胃肠道间质瘤中CircRNA-miRNA-mRNA调控网络的鉴定。 Identification of CircRNA-miRNA-mRNA Regulatory Network in Gastrointestinal Stromal Tumor. Front Genet. 3.517 中南大学湘雅二医院
12 全基因组分析的宿主编码环状RNA突显了它们在日本脑炎病毒引起的神经炎症反应中的潜在作用。 Genome-wide profiling of host-encoded circular RNAs highlights their potential role during the Japanese encephalitis virus-induced neuroinflammatory response. BMC Genomics. 3.501 华中农业大学
13 环状RNA circ_0000284通过miR-377-3p介导的PD-L1促进在非小细胞肺癌的进展中发挥致癌作用。 Circular RNA circ_0000284 plays an oncogenic role in the progression of non-small cell lung cancer through the miR-377-3p-mediated PD-L1 promotion. Cancer Cell Int. 3.439 山西白求恩医院
14 苦参碱通过调节circ_0027345/miR-345-5p/HOXD3轴抑制肝细胞癌的细胞生长、迁移、侵袭并促进自噬。 Matrine inhibits cell growth, migration, invasion and promotes autophagy in hepatocellular carcinoma by regulation of circ_0027345/miR-345-5p/HOXD3 axis. Cancer Cell Int. 3.439 浙江大学爱丁堡大学联合学院
15 血清来源的三个环RNA标记作为肝细胞癌的诊断生物标志物。 Serum-derived three-circRNA signature as a diagnostic biomarker for hepatocellular carcinoma. Cancer Cell Int. 3.439 中国医科大学附属盛京医院
16 人类生存运动神经元基因产生的环状RNA的特征。 Characteristics of circular RNAs generated by human Survival Motor Neuron genes. Cell Signal.Review 3.388 爱荷华州立大学
17 敲除circ_0003340可以诱导细胞凋亡,并通过miR-564/TPX2抑制食管癌细胞中的侵袭和增殖。 Knockdown of circ_0003340 induces cell apoptosis, inhibits invasion and proliferation through miR-564/TPX2 in esophageal cancer cells. Exp Cell Res. 3.329 郑州大学基础医学学院
18 环状RNA-hsa-circ-0000670通过microRNA-384/SIX4轴促进胃癌的进展。 Circular RNA-hsa-circ-0000670 promotes gastric cancer progression through the microRNA-384/SIX4 axis. Exp Cell Res. 3.329 中国医科大学附属第四医院
19 在无乳链球菌感染的尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)感染期间,单分子实时测序和RNA-seq揭示了调控网络中长非编码和环状RNA的作用。 Single molecule real-time sequencing and RNA-seq unravel the role of long non-coding and circular RNA in the regulatory network during Nile tilapia (Oreochromis niloticus) infection with Streptococcus agalactiae. Fish Shellfish Immunol. 3.298 广西水产科学研究院
20 环状RNA hsa_circ_0131242通过使hsa-miR-2682海绵化促进三阴性乳腺癌的进展。 Circular RNA hsa_circ_0131242 Promotes Triple-Negative Breast Cancer Progression by Sponging hsa-miR-2682. Onco Targets Ther. 3.046 中国医科大学附属肿瘤医院
21 CircHIPK3海绵吸附miR-338-3p促进前列腺癌细胞的G2/M转化。 CircHIPK3 Facilitates the G2/M Transition in Prostate Cancer Cells by Sponging miR-338-3p. Onco Targets Ther. 3.046 重庆医科大学附属第一医院
22 环状RNA Gprc5a海绵吸附miR-1283激活YAP1/TEAD1信号通路来促进HCC进程。 Circular RNA Gprc5a Promotes HCC Progression by Activating YAP1/TEAD1 Signalling Pathway by Sponging miR-1283. Onco Targets Ther. 3.046 广州医科大学附属第五医院
23 组合的circRNAs作为区分乳头状甲状腺癌的诊断工具。 A Combination of circRNAs as a Diagnostic Tool for Discrimination of Papillary Thyroid Cancer. Onco Targets Ther. 3.046 安徽医科大学附属合肥医院
24 非酒精性脂肪肝疾病中遗传学和表观遗传学研究目的。 Genetics and epigenetics purpose in non-alcoholic fatty liver disease. Expert Rev Gastroenterol Hepatol. 2.991 墨西哥Médica Sur Clinic & Foundation
25 环状RNA circ_0003645沉默可通过oxLDL诱导的内皮细胞中的NF-kβ途径减轻炎症和凋亡。 Circular RNA circ_0003645 silencing alleviates inflammation and apoptosis via the NF-kβpathway in endothelial cells induced by oxLDL. Gene. 2.638 徐州医科大学附属医院
26 circPUM1通过吸附miR-760促进多囊卵巢综合征的进展。 circPUM1 promotes polycystic ovary syndrome progression by sponging to miR-760. Gene. 2.638 淮安市第二人民医院
27 上调的环状RNA hsa_circ_0008433通过miRNA调节子宫内膜异位症的发病机制。 Upregulated Circular RNA hsa_circ_0008433 Regulates Pathogenesis in Endometriosis Via miRNA. Reprod Sci. 2.559 中山大学附属第一医院
28 环形RNA FUNDC1改善了具有高风险的急性缺血性中风患者中风相关感染的预测。 Circular RNA FUNDC1 improves prediction of stroke associated infection in acute ischemic stroke patients with high risk. Biosci Rep. 2.535 东南大学医学院附属中大医院
29 Hsa_circ_0003732通过miR-545/CCNA2轴促进骨肉瘤细胞增殖。 Hsa_circ_0003732 promotes osteosarcoma cells proliferation via miR-545/CCNA2 axis. Biosci Rep. 2.535 安徽医科大学附属第一医院
30 Circ-APBB1IP作为一种预后性生物标志物,通过ERK1/2信号通路促进透明细胞肾细胞癌的进展。 Circ-APBB1IP as a Prognostic Biomarker Promotes Clear Cell Renal Cell Carcinoma Progression Through The ERK1/2 Signaling Pathway. Int J Med Sci. 2.333 广东医科大学附属医院
31 hsa_circRNA_102958的上调指示预后不良,并通过miR-1205/SH2D3A轴促进卵巢癌进展。 Upregulation of hsa_circRNA_102958 Indicates Poor Prognosis and Promotes Ovarian Cancer Progression Through miR-1205/SH2D3A Axis. Cancer Manag Res. 2.243 哈尔滨医科大学附属第二医院
32 hsa_circ_0008285通过靶向miR-211-5p/SOX4轴促进宫颈癌的进展。 hsa_circ_0008285 Facilitates the Progression of Cervical Cancer by Targeting miR-211-5p/SOX4 Axis. Cancer Manag Res. 2.243 洛阳市中心医院
33 circMTO1过表达通过miR-9-5p/NOX4轴对肝癌细胞增殖和凋亡调控作用的机制。 Mechanism of the Regulatory Effect of Overexpression of circMTO1 on Proliferation and Apoptosis of Hepatoma Cells via miR-9-5p/NOX4 Axis. Cancer Manag Res. 2.243 荆州中心医院
34 circRNA在膀胱癌中的生物发生,功能和作用。 The Biogenesis, Functions, and Roles of circRNAs in Bladder Cancer. Cancer Manag Res.Review 2.243 杭州市第一人民医院
35 circRNA MYLK通过上调RHEB和激活mTOR信号来促进宫颈癌。 circRNA MYLK Accelerates Cervical Cancer via Up-Regulation of RHEB and Activation of mTOR Signaling. Cancer Manag Res. 2.243 同济大学附属东方医院
36 环状痴呆大鼠血管中环状RNA的表达。 Expression of Circular RNAs in the Vascular Dementia Rats. Neurosci Lett. 2.173 赣州市人民医院
37 Hsa_Circ_0007841通过上调ABCG2增强多发性骨髓瘤化疗的抵抗力。 Hsa_Circ_0007841 Enhances Multiple Myeloma Chemotherapy Resistance Through Upregulating ABCG2. Technol Cancer Res Treat. 1.481 荆门市第一人民医院
38 Mmu-circRNA_016901对骨髓间充质干细胞放射敏感性的影响 [Effect of Mmu-circRNA_016901 on the Radiosensitivity of Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells]. Zhongguo Shi Yan Xue Ye Xue Za Zhi 中南大学附属湘雅第三医院
39 环状RNA-UBXN7在肝细胞癌中促进增殖,迁移和抑制细胞凋亡 [Circular RNA-UBXN7 promotes proliferation, migration and suppresses apoptosis in hepatocellular cancer]. Zhonghua Gan Zang Bing Za Zhi 郑州大学第一附属医院

 

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