RBP 结合预测

作为生命活动中最基本的功能元件，RBP 在 RNA 的生成、剪切、加工、转运等过程中发挥了重要功能。高通量测序往往通过 RIP-seq 或 CLIP-seq 来捕获 RBP 所结合的 RNA 分子，而生物信息学常常依赖于 RBP 结合结构域、序列结合 motif、二级结构、互作作用力等特征来分析 RBP 是否与某个 RNA 分子结合。

常用的数据库包括：

• starBase
• NPInter
• circInteractome

常用的在线工具包括

• RBPmap基于 motif
• catRAPID基于二级结构以及分子间作用力