欢迎各位来到circRNA研究报道汇总栏目,本期从pubmed中检索收集新发布的circRNA文献共计73篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

1、肾细胞癌中的环状RNA:对肿瘤发生,诊断和治疗的意义。

 

标题:Circular RNAs in renal cell carcinoma: implications for tumorigenesis, diagnosis, and therapy.

杂志:Mol Cancer.Review

影响因子:15.302

通讯作者:王平(浙大一院);傅湘辉(华西医院);林伟强(浙江大学转化医学研究院)

 

肾细胞癌(RCC)是最常见的恶性肾脏肿瘤,发病率很高。环状RNA(circRNA)是具有广泛分布和多种细胞功能的非编码RNA。它们是高度稳定的,并具有器官和组织特异性的表达模式。CircRNA具有基本功能,如microRNA海绵,RNA结合蛋白和转录调节因子以及蛋白质翻译模板。最近的报道表明,circRNA在RCC中异常表达,并且是RCC癌变和进展的重要调节剂。此外,circRNAs已成为RCC诊断和预后的潜在生物标志物以及开发新疗法的靶标。但是,需要进一步的研究以更好地了解circRNA在RCC中的功能。在这篇综述中,作者总结并讨论了RCC相关circRNA的最新研究进展,重点关注其在RCC诊断和靶向治疗中的潜力方面。

图注:RCC相关的circRNAs的功能和参与信号通路。

 

2、TransCirc:基于多组学证据的可翻译环状RNA的交互式数据库。

 

标题:TransCirc: an interactive database for translatable circular RNAs based on multi-omics evidence.

杂志:Nucleic Acids Res.

影响因子:11.501

通讯作者:王泽峰研究员(中科院计算生物学重点实验室);张国庆(中国科学院上海营养与健康研究所)

 

TransCirc(https://www.biosino.org/transcirc/)是一个专门提供全面的证据来支持人环状RNA(circRNA)的翻译潜力的数据库。该数据库是通过整合各种直接和间接证据来预测每个circRNA和推定翻译产物的编码潜力而生成的。包括circRNA翻译的七种证据:(i)支持核糖体在circRNA上的核糖体/多核糖体结合证据;(ii)实验定位的在circRNA上翻译起始位点;(iii)circRNA上的核糖体内部进入位点;(iv)已发表circRNA中促进翻译起始的N-6-甲基腺苷修饰数据;(v)circRNA特异性开放阅读框的长度;(vi)来自机器学习预测的所有潜在开放阅读框的序列组成分数;(vii)质谱数据,可直接支持circRNA编码的跨反向剪接连接的肽段。TransCirc提供了用户友好的搜索/浏览界面,可以预测circRNA的翻译可能性。另外,TransCirc开发了几种灵活的工具来辅助数据的检索和分析。TransCirc可以作为研究circRNA和潜在circRNA编码肽的翻译能力的重要资源,并且可以扩展为将来包括新证据或其他物种。

 

图注:TransCirc网站首页

 

3、CircRNA EPHB4通过海绵吸附miR-637并上调SOX10来调节神经胶质瘤的干细胞特性和增殖。

 

标题:CircRNA EPHB4 modulates stem properties and proliferation of gliomas via sponging miR-637 and up-regulating SOX10.

杂志:Mol Oncol.

影响因子:6.574

通讯作者:刘景平(中南大学湘雅医院)

 

神经胶质瘤是最常见的原发性脑肿瘤类型。circEPHB4是衍生自受体酪氨酸激酶EPHB4的环状RNA。但是,尚未研究circEPHB4在神经胶质瘤和神经胶质瘤癌干细胞(CSCs)中的临床意义和特定作用。该研究中,研究者发现在神经胶质瘤组织和细胞系中,circEPHB4(hsa_circ_0081519)和SOX10被上调,而miR-637被下调。circEPHB4与SOX10一致地正相关,但与miR-637负相关。这些分子表达的改变与患者的整体存活率独立相关。CircEPHB4通过直接海绵吸附miR-637来上调SOX10和Nestin,从而刺激神经胶质瘤细胞的干性,增殖和糖酵解。功能上,在神经胶质瘤细胞中沉默circEPHB4或增加miR-637水平足以抑制体内异种移植瘤的生长。总之,circEPHB4/miR-637/SOX10/Nestin轴在控制神经胶质瘤细胞的干细胞特性,自我更新以及糖酵解中起着核心作用,并可预测神经胶质瘤患者的总体存活率。靶向该信号轴可能为恶性神经胶质瘤提供治疗策略。

 

图注:表达水平上,circEPHB4与SOX10正相关,但与miR-637负相关

参考文献列表

 

 

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