欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计52篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、CircMAP3K5充当MicroRNA-22-3p海绵，通过TET2介导的SMC分化减少内膜增生。
标题：Circular RNA CircMAP3K5 Acts as a MicroRNA-22-3p Sponge to Promote Resolution of Intimal Hyperplasia via TET2-Mediated SMC Differentiation.
杂志：Circulation
影响因子：23.603
通讯作者：邓伟豪（广州市妇女儿童医疗中心儿科研究所）
CircRNA通过隔离特定的microRNA（miRNA）来调节基因表达，环状RNA（CircRNA）的异常表达会导致多种人类疾病。在这项研究中，研究者调查了CircMAP3K5是否可以充当竞争性内源性miR-22-3p海绵并调节新生内膜增生。作者在用或不用PDGF处理的人冠状动脉平滑肌细胞（HCASMC）中利用全基因组RNA测序技术绘制CircRNA表达谱图。通过对患有扩张型心肌病（DCM）或冠心病（CHD）的患者进行尸检，评估了人冠状动脉中环状MAP3K5（CircMAP3K5）的表达水平。在AAV9介导的CircMAP3K5转染的小鼠中进一步研究了CircMAP3K5在内膜增生中的作用。使用SMC特异性Tet2基因敲除小鼠和整体miR-22-3p基因敲除小鼠，通过股动脉导线损伤小鼠模型描述CircMAP3K5减弱新生内膜增生的机制。研究结果表明，PDGF-BB处理可显著降低HCASMC中CircMAP3K5的表达。冠心病患者患病动脉（PDGF-BB升高）和股动脉导线损伤小鼠模型中证实了CircMAP3K5在体内下调。慢病毒介导的CircMAP3K5过表达抑制HCASMC的增殖。体内AAV9介导的CircMAP3K5转染可特异性抑制股动脉导线损伤小鼠动脉中的SMC增殖，从而减少新生内膜的形成。使用萤光素酶报告基因和RNApulldown实验，发现CircMAP3K5可吸附miR-22-3p，进而抑制TET2的表达。体外和体内结果均表明，miR-22-3p的缺失导致了CircMAP3K5对VSMC的抗增殖作用。在SMC特异的Tet2基因敲除小鼠中，Tet2的缺失消除了CircMAP3K5介导的对VSMC的抗增殖作用。该研究结论确定CircMAP3K5是TET2介导的VSMC分化的主要调节因子。靶向CircMAP3K5/miR-22-3p/TET2轴可能为与内膜增生相关的疾病（包括再狭窄和动脉粥样硬化）提供潜在的治疗策略。
2、Lnc2Cancer 3.0：基于RNA-seq和scRNA-seq数据的实验支持lncRNA/circRNA癌症关联数据库更新。
标题：Lnc2Cancer 3.0: an updated resource for experimentally supported lncRNA/circRNA cancer associations and web tools based on RNA-seq and scRNA-seq data.
杂志：Nucleic Acids Res
影响因子：11.501
通讯作者：智慧、宁尚伟和张云鹏（哈尔滨医科大学生物信息学院）
Lnc2Cancer 3.0数据库：主要整理包含了有关实验支持的长非编码RNA（ lncRNA和环状RNA（circRNA）与人类癌症相关的全面数据。此次数据库更新还介绍了用于通过高通量RNA测序（RNA-seq）和单细胞RNA-seq（scRNA-seq）分析lncRNA表达的Web工具。Lnc2Cancer 3.0更新新功能包括：（i）与以前版本相比，增加了与癌症相关的lncRNA条目。当前版本包括9254个lncRNA-癌症关联，2659个lncRNA和216个癌症亚型。（ii）新增加了1049个实验支持的circRNA-癌症关联，其中包括743个circRNA和70个癌症亚型。（iii）实验支持的与癌症相关的lncRNA和circRNA的调控机制，包括microRNA，转录因子（TF），遗传变异，甲基化和增强子。（iv）追加实验支持的与癌症相关的lncRNA和circRNA的生物学功能，包括细胞生长，凋亡，自噬，上皮间充质转化（EMT），免疫力和编码能力。（v）包括与癌症相关的lncRNA和circRNA在转移，复发，循环，耐药性和预后方面的实验支持的临床相关性。此外，还开发了两个灵活的在线工具，包括RNA-seq和scRNA-seq网络工具，可以对癌症中的lncRNA进行快速且可定制的分析和可视化。总之，Lnc2Cancer 3.0是阐明lncRNA，circRNA和癌症之间关联的宝贵资源。
网址：http://www.bio-bigdata.net/lnc2cancer
http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/lnc2cancer（复制链接网页打开）
图注：Lnc2Cancer 3.0数据库资源结构示意图
3、LincSNP 3.0：连接功能变体与人类长链非编码RNA，环状RNA及其调控元件的数据库更新。
标题：LincSNP 3.0: an updated database for linking functional variants to human long non-coding RNAs, circular RNAs and their regulatory elements.
杂志：Nucleic Acids Res.
影响因子：11.501
通讯作者：李霞、张云鹏和宁尚伟（哈尔滨医科大学生物信息学院）
LincSNP 3.0数据库旨在记录和注释人类长非编码RNA（lncRNA）和环状RNA（circRNA）中与疾病或表型相关的变异或调控元件。LincSNP 3.0此次更新包括：（i）收录更多类型的突变，包括单核苷酸多态性（SNP），连锁不平衡SNP（LD SNP），体细胞突变和RNA编辑位点；（ii）增加了更多的调控元件，包括转录因子结合位点（TFBS），增强子，DNase I超敏位点（DHS），拓扑相关结构域（TAD），足迹、甲基化和染色质开放区域；（iii）囊括了circRNA，调控元件和变体之间的关联；（iv）手动收集了更多实验支持的突变-lncRNA/circRNA-疾病/表型关联；（v）lncRNA、circRNA、SNP、体细胞突变和RNA编辑位点的来源已更新。此外，开发了四个在线工具，包括基因组浏览器，突变映射器，Circos绘图仪和功能注释，以检索，可视化和分析数据。总的来说，LincSNP 3.0提供了疾病中功能变异、调节元件、lncRNA和circRNA之间的关联，是用于研究疾病中lncRNA和circRNA的功能和机制重要的且不断更新的资源。
网址：http://bioinfo.hrbmu.edu.cn/LincSNP
图注：LincSNP 3.0数据库包含的资源和工具
参考文献列表
