欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计30篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、CRISPR-Cas13系统筛选功能性环状RNA。
标题：Screening for functional circular RNAs using the CRISPR-Cas13 system.
杂志：Nat Methods；影响因子：30.822
通讯作者：李劲松、杨力和陈玲玲教授（上海科技大学生命科学与技术学院）
环状RNA（circRNA），是一类由3’和5’末端序列反向剪接形成共价连接的环形RNA分子。由于circRNA序列与同源线性RNA分子外显子共享序列，因此目前缺乏能有效区分circRNA和同源线性RNA分子的方法。CircRNA的具体功能机制知之甚少。陈玲玲、杨力、李劲松教授团队研究开发了CRISPR–RfxCas13d技术，该技术的gRNA可靶向circRNA的反向剪接位点（BSJ），能有效区分circRNA与线性mRNA。该研究进一步构建了基于CRISPR–RfxCas13d的慢病毒文库。研究团队通过病毒文库筛选到一组对细胞生长非常重要的circRNA，其中，circFAM120A通过阻止FAM120A的mRNA与翻译抑制剂IGF2BP2的结合，促进FAM120A表达，在体内和体外增强细胞增殖，起到癌基因的作用。该研究还发现了circMan1a2在小鼠胚胎植入前的发育中具有调节潜力。总之，该CRISPR-RfxCas13d文库技术可在个体和大规模水平上筛选和发现功能性circRNA，是circRNA功能研究的强有力工具。
图注：RfxCas13d/BSJ-gRNA文库构建及人类细胞增殖功能性circRNA筛选
2、环状RNA和RNA结合蛋白互作的转录组表达谱研究揭示了对环状RNA生成和癌症途径表达的影响。
标题：Transcriptome-wide profiles of circular RNA and RNA-binding protein interactions reveal effects on circular RNA biogenesis and cancer pathway expression.
杂志：Genome Med；影响因子：10.675
通讯作者：Trine Line Hauge Okholm和Jakob Skou Pedersen（丹麦奥尔胡斯大学）
环状RNA（circRNA）分子稳定性高，通常高表达的circRNA转录物具有调控其他RNA的潜力。一些circRNA还可与RNA结合蛋白（RBP）结合。然而，人们对不同生物学背景下的这些相互作用分布和功能所知甚少。该研究对ENCODE细胞系HepG2和K562中的circRNA-RBP相互作用进行了广泛的筛选。高通量测序技术检测了样品中circRNA，并使用150个RBP结合位点的大量eCLIP数据分析circRNA-RBP相互作用。研究者进一步通过RNA免疫沉淀实验和敲低后进行RNA-Seq分析，对最感兴趣的的特定circRNA和RBP的相互作用进行功能表征。研究结果展示了在HepG2和K562细胞中的circRNA-RBP相互作用全景图。其中，KHSRP结合位点富含在circRNA的侧翼内含子，并且敲低KHSRP影响circRNA生物形成。特定单个circRNA-RBP相互作用结果表明，circCDYL，在膀胱癌中具有临床和功能意义的高度表达的circRNA，几乎完全覆盖GRWD1结合位点，并且敲低circCDYL抵消了敲低GRWD1的影响。此外，研究者证实了circCDYL和RBPs在膀胱癌细胞中的相互作用，并证明敲低circCDYL会影响癌症的特征并扰乱关键癌症基因（例如TP53）的表达，circCDYL水平升高与膀胱癌患者的整体生存率相关。该研究结论表明特定细胞类型的circRNA-RBP相互作用可能在转录组范围对肿瘤发生中起重要的调节作用。
3、circYap通过与原肌球蛋白4和γ–肌动蛋白的结合减少肌动蛋白的聚合反应来减轻心脏纤维化。
标题：YAP circular RNA, circYap, attenuates cardiac fibrosis via binding with tropomyosin-4 and gamma-actin decreasing actin polymerization.
杂志：Mol Ther；影响因子：8.986
通讯作者：杨柏华教授（加拿大多伦多大学）和王晟（广东省人民医院）
心脏纤维化是心脏肥大的常见病理特征。这项研究调查了环状RNA ——circYap在调节心脏纤维化及其潜在机制中的新功能。通过环状RNA高通量测序，研究者发现15种已报到的circYap亚型中有3种在9个人类心脏组织中表达，其中亚型hsa_circ_0002320表达最高。患有心肌肥大的患者心脏中这种同工型circYap的水平显著降低。在压力超负荷小鼠模型中，主动脉弓缩窄(transverse aortic constriction，TAC)小鼠模型心脏中circYap的水平降低。注射circYap质粒后，TAC小鼠的心脏纤维化减弱，心脏功能随心脏circYap水平的升高而改善。 心肌细胞和小鼠心脏组织中的circYap确定与Tropomyosin-4（TMP4）和γ-肌动蛋白（ACTG）结合。这种结合增强了ACTG的TPM4相互作用，从而导致肌动蛋白聚合反应的抑制和随后的纤维化。总体而言，该研究发现了一种可以在心脏纤维化过程中调节心脏重构的新型分子，并提示了环状RNA将来用于心脏治疗的新功能。文献详细解读请点击Molecular Therapy | circYAP结合蛋白调控功能心肌纤维化
图注：circYAP调控心肌纤维化的作用机制
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