2021年2月circRNA研究汇总-3（ 20210222-0228）

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计53篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

1、可靠研究环状RNA的最佳实践：陷阱和技巧

标题：Best practices to ensure robust investigation of circular RNAs: pitfalls and tips

杂志：EMBO Rep 影响因子： 7.497

通讯作者：Jeremy E Wilusz（宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院）

数千个真核基因的pre-mRNA进行非典型剪接，生成末端共价连接的环状RNA（circRNA）。大多数成熟的环状RNA均以低水平表达，但有些具有已知的生理功能比其相关的线性mRNA积累更高的水平。这些观察结果引起了人们对这类先前未被充分认识的RNA的极大兴趣，并促使人们开发研究它们的新实验方法，尤其是测量或调控环状RNA表达水平的方法。尽管如此，在设计实验和解释结果时，每种方法都有一定的局限性和潜在的陷阱。这篇综述中，作者提供实用的技巧和建议指南，用于对环状RNA进行可靠的鉴定、验证和功能表征。除了提高严谨性和可重复性的方法外，这些建议还应有助于使该领域更加清晰，尤其是环状RNA的功能以及这些转录本是否可以结合microRNA/蛋白质或充当翻译模板。

图注：circRNA是否发挥miRNA sponge功能？

2、CircRNA在癌症中的基本机制和临床潜力

标题：CircRNA in cancer: Fundamental mechanism and clinical potential

杂志：Cancer Lett. 影响因子： 7.36

通讯作者：单革（中国科学技术大学附属第一医院（安徽省立医院））

环状RNA（CircRNA）是一类单链非编码RNA，它们通过非规范的剪接或反向剪接事件形成环状构象。许多研究在各种癌症中观察到circRNA的异常表达，表明它们在肿瘤发生和肿瘤发展中的关键作用。最近，一些证据表明，许多circRNA通过不同的分子机制在不同程度上促进或抑制了癌症。在本文中，我们对circRNA的特征、类型、生物发生和功能进行了概述，并从未来的角度概述了一系列最新研究的circRNA及其在多种癌症类型中的功能机制。随着基于核酸的治疗工具的巨大进步，circRNA可以在未来的癌症治疗中作为靶标分子得到进一步探索。

3、透明细胞肾细胞癌中CircAGAP1通过吸附miR-15-5p促进肿瘤进展

标题：CircAGAP1 promotes tumor progression by sponging miR-15-5p in clear cell renal cell carcinoma

杂志：J Exp Clin Cancer Res. 影响因子：7.068

通讯作者：马春辉(上海交通大学附属第一人民医院);王培军（同济大学附属同济医院）

越来越多的证据表明，环状RNA（circRNA）作为新型的非编码RNA，在癌变和肿瘤进展中起着至关重要的作用。然而，人们很大程度上尚不清楚circRNA在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的功能和分子机制。该研究在临床样品、ccRCC细胞和体内动物模型中鉴定了circAGAP1的表达和功能。通过荧光原位杂交，RNA免疫沉淀和荧光素酶分析研究了circAGAP1的分子机制。结果显示，与相邻的非肿瘤组织相比，ccRCC组织中的circAGAP1（circ0058792）表达明显上调。此外，circAGAP1的表达与ccRCC患者的肿瘤大小、核分级和临床分期密切相关。机理研究表明，胞质circAGAP1在RNA诱导的沉默复合物中靶向miR-15-5p。另外，在ccRCC中miR-15-5p表达下调。萤光素酶报告基因检测结果表明，E2F转录因子3（E2F3）是miR-15-5p的靶标，而ccRCC中上调的E2F3表达与circAGAP1正相关。此外，在体外和体内，miR-15-5p模拟物可减轻circAGAP1的促肿瘤功能。我们的结果表明，circAGAP1通过刺激miR-15-5p发挥其作为致癌内源性RNA（ceRNA）的致癌功能，从而促进E2F3的表达。靶向circAGAP1可能是ccRCC中一种新的有吸引力的治疗策略。

图注：CircAGAP1通过吸附miR-15-5p促进透明细胞肾细胞癌机制示意图

文献列表：

序号	主要内容	论文标题	杂志	IF	单位
1	可靠研究环状RNA的最佳实践：陷阱和技巧	Best practices to ensure robust investigation of circular RNAs: pitfalls and tips	EMBO Rep.Review	7.497	宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院等
2	CircRNA在癌症中的基本机制和临床潜力	CircRNA in cancer: Fundamental mechanism and clinical potential	Cancer Lett.	7.36	安徽省立医院等
3	透明细胞肾细胞癌中CircAGAP1通过吸附miR-15-5p促进肿瘤进展	CircAGAP1 promotes tumor progression by sponging miR-15-5p in clear cell renal cell carcinoma	J Exp Clin Cancer Res.	7.068	同济大学附属同济医院等
4	DEBKS：一种检测差异表达的环状RNA的工具	DEBKS: A Tool to Detect Differentially Expressed Circular RNA	Genomics Proteomics Bioinformatics.	7.051	北京大学医学部等
5	缺氧肿瘤来源的外泌体环形RNA SETDB1通过miR-7 / Sp1轴促进肺腺癌的侵袭性生长和EMT。	Hypoxic tumor-derived exosomal circular RNA SETDB1 promotes invasive growth and EMT via the miR-7/Sp1 axis in lung adenocarcinoma	Mol Ther Nucleic Acids.	7.032	上海市肺科医院等
6	hsa_circNFXL1_009调节肺动脉高压中的细胞凋亡，增殖，迁移和钾通道激活	hsa_circNFXL1_009 modulates apoptosis, proliferation, migration, and potassium channel activation in pulmonary hypertension	Mol Ther Nucleic Acids.	7.032	南开大学医学院等
7	circRNA在肿瘤自噬中的作用	Roles of circRNAs on tumor autophagy	Mol Ther Nucleic Acids.	7.032	郑州大学医学科学院等
8	环状RNA RBPMS通过miR-330-3p / RAI2调节抑制膀胱癌的进展	Circular RNA RBPMS inhibits bladder cancer progression via miR-330-3p/RAI2 regulation	Mol Ther Nucleic Acids.	7.032	上海华山医院等
9	环状RNA circPSD3通过调节miR-92b-3p / Smad7轴减轻肝纤维化	Circular RNA circPSD3 alleviates hepatic fibrogenesis by regulating the miR-92b-3p/Smad7 axis	Mol Ther Nucleic Acids.	7.032	安徽医科大学第一附属医院等
10	工程合成circRNA的高效反向剪接和翻译	Engineering highly efficient backsplicing and translation of synthetic circRNAs	Mol Ther Nucleic Acids.	7.032	杜克大学等
11	circFOXM1通过miR-1324调节MECP2促进肝癌细胞的索拉非尼耐药	circFOXM1 contributes to sorafenib resistance of hepatocellular carcinoma cells by regulating MECP2 via miR-1324	Mol Ther Nucleic Acids.	7.032	南方医科大学附属东莞医院等
12	circRNA hsa_circ_0018414吸附miR-6807-3p并上调DKK1抑制LUAD的进程	circRNA hsa_circ_0018414 inhibits the progression of LUAD by sponging miR-6807-3p and upregulating DKK1	Mol Ther Nucleic Acids.	7.032	宁波市第二医院等
13	环状RNA TRAPPC6B通过靶向microRNA‐874‐3p抑制细胞内结核分枝杆菌的生长，同时诱导巨噬细胞自噬	Circular RNA TRAPPC6B inhibits intracellular Mycobacterium tuberculosis growth while inducing autophagy in macrophages by targeting microRNA‐874‐3p	Clin Transl Immunol	6.464	广东医科大学检验医学研究所等
14	CircRAB11FIP1通过DSC1和miR-129促进卵巢癌的自噬流	CircRAB11FIP1 promoted autophagy flux of ovarian cancer through DSC1 and miR-129	Cell Death Dis.	6.304	重庆医科大学附属第二医院
15	CircRNA：消化系统肿瘤的诊断和治疗新目标	CircRNAs: a new target for the diagnosis and treatment of digestive system neoplasms	Cell Death Dis.Review	6.304	哈尔滨医科大学附属第一医院等
16	综述环状RNA及其对癌症作用的新见解	Review on circular RNAs and new insights into their roles in cancer	Comput Struct Biotechnol J.Review	6.018	南京中医药大学第三附属医院等
17	鉴定hsa_circ_0063425和hsa_circ_0056891作为2型糖尿病的检测新型生物标志物	Identification of circulating hsa_circ_0063425 and hsa_circ_0056891 as novel biomarkers for detection of type 2 diabetes	J Clin Endocrinol Metab.	5.399	首都医科大学宣武医院等
18	环状RNA_PDHX通过MiR-378a-3p促进前列腺癌的增殖和侵袭	Circular RNA_PDHX Promotes the Proliferation and Invasion of Prostate Cancer by Sponging MiR-378a-3p	Front Cell Dev Biol.	5.201	上海第九人民医院等
19	深入了解CircRNA的作用：人类恶性肿瘤的生物发生，表征，功能和临床影响	Insights Into the Role of CircRNAs: Biogenesis, Characterization, Functional, and Clinical Impact in Human Malignancies	Front Cell Dev Biol.Review	5.201	卡塔尔大学等
20	褪黑素通过circ_0003865吸附miR-3653-3p促进骨髓间充质干细胞成骨分化并防止骨质疏松症的发展	Melatonin promotes bone marrow mesenchymal stem cell osteogenic differentiation and prevents osteoporosis development through modulating circ_0003865 that sponges miR-3653-3p	Stem Cell Res Ther.	5.116	中山大学附属孙逸仙纪念医院等
21	环状RNA在肿瘤免疫学和免疫治疗中的潜在调控作用。	The Potential Regulatory Roles of Circular RNAs in Tumor Immunology and Immunotherapy	Front Immunol.Review	5.085	上海市第一人民医院等
22	前列腺癌中环状RNA的研究进展和特性：发现这一新兴且引人注目的领域	Advancement and properties of circular RNAs in prostate cancer: An emerging and compelling frontier for discovering	Int J Biol Sci.Review	4.858	安徽医科大学等
23	长的非编码RNA在胶质母细胞瘤病理生物学中的新兴作用	Emerging Role of Long Non-Coding RNAs in the Pathobiology of Glioblastoma	Front Oncol.Review	4.848	伊朗-沙希德·贝希什蒂大学
24	circRNA在肝癌免疫中的作用	The Roles of circRNAs in Liver Cancer Immunity	Front Oncol.Review	4.848	南方医科大学中西医结合医院等
25	社论：ncRNA在实体瘤预后中的作用：从实验室到临床应用	Editorial: The Role of ncRNAs in Solid Tumors Prognosis: From Laboratory to Clinical Utility	Front Oncol.	4.848	遵义医科大学第二附属医院等
26	hsa_circ_0002874的过表达通过调节miR-1273f / MDM2 / p53途径促进非小细胞肺癌对紫杉醇的耐药性	Overexpression of hsa_circ_0002874 promotes resistance of non-small cell lung cancer to paclitaxel by modulating miR-1273f/MDM2/p53 pathway	Aging (Albany NY).	4.831	苏州大学第二附属医院等
27	Hsa_circ_0038383介导的竞争性内源性RNA网络在复发性植入失败中的作用	Hsa_circ_0038383-mediated competitive endogenous RNA network in recurrent implantation failure	Aging (Albany NY).	4.831	烟台毓璜顶医院等
28	环状RNA在内脏器官纤维化中的作用	Role of circular RNAs in visceral organ fibrosis	Food Chem Toxicol.Review	4.679	西藏民族大学医学院等
29	CircORC2通过调节miR-19a和神经降压素/胃动素的信号传导参与慢性便秘的发病机制	CircORC2 is involved in the pathogenesis of slow transit constipation via modulating the signalling of miR-19a and neurotensin/motilin	J Cell Mol Med.	4.486	天津大学医学工程与转化医学研究院等
30	环状RNA circ_0002137通过miR-433-3p / IGF1R轴调节骨肉瘤的进展	Circular RNA circ_0002137 regulated the progression of osteosarcoma through regulating miR-433-3p/ IGF1R axis	J Cell Mol Med.	4.486	南京医科大学附属第一医院等
31	环状RNA circEIF4G2通过miR-218加重糖尿病肾病的肾纤维化	Circular RNA circEIF4G2 aggravates renal fibrosis in diabetic nephropathy by sponging miR-218	J Cell Mol Med.	4.486	上海同仁医院等
32	CircMMP11通过miR-625-5p / ZEB2轴调节乳腺癌细胞的增殖，迁移，侵袭和凋亡	CircMMP11 regulates proliferation, migration, invasion, and apoptosis of breast cancer cells through miR-625-5p/ZEB2 axis	Cancer Cell Int.	4.175	天津市肿瘤医院等
33	下调环状RNA_0004674通过microRNA-377-3p / THBS1轴延迟口腔鳞状细胞癌的进展	Down-regulating circular RNA_0004674 delays the progression of oral squamous cell carcinoma through microRNA-377-3p/THBS1 axis	Life Sci.	3.647	郑州大学第一附属医院等
34	环形RNA Ttc3 / miR-148a / Rcan2轴对脓毒症致急性肾损伤大鼠炎症和氧化应激的影响	Effects of circular RNA Ttc3/miR-148a/Rcan2 axis on inflammation and oxidative stress in rats with acute kidney injury induced by sepsis	Life Sci.	3.647	郑州大学人民医院等
35	非编码RNA在三阴性乳腺癌中的研究进展	Progress of non-coding RNAs in triple-negative breast cancer	Life Sci.Review	3.647	西北工业大学生命科学学院等
36	circ_SMAD2通过靶向miR-1258 / RPN2信号通路调节大肠癌细胞的增殖	circ_SMAD2 regulate colorectal cancer cells proliferation through targeting miR-1258/RPN2 signaling pathway	J Cancer.	3.565	河南省人民医院等
37	失血性休克诱导的ALI / ARDS大鼠中mRNA，microRNA，lncRNA和circRNA的全基因组分布	Genome-wide landscape of mRNAs, microRNAs, lncRNAs, and circRNAs in hemorrhagic shock-induced ALI/ARDS in rats	J Trauma Acute Care Surg.	3.381	北京大学人民医院等
38	环状RNA circDNM3OS作为miR-145-5p海绵发挥作用，通过上调MORC2来促进胆管癌的生长和谷氨酰胺代谢	Circular RNA circDNM3OS Functions as a miR-145-5p Sponge to Accelerate Cholangiocarcinoma Growth and Glutamine Metabolism by Upregulating MORC2	Onco Targets Ther.	3.337	江西省肿瘤医院等
39	黄芩素通过circHIATAT / miR-19a-3p轴的调控，通过阻断AKT / mTOR途径抑制宫颈癌细胞的生长，细胞周期进程并促进细胞凋亡。	Baicalein Represses Cervical Cancer Cell Growth, Cell Cycle Progression and Promotes Apoptosis via Blocking AKT/mTOR Pathway by the Regulation of circHIAT1/miR-19a-3p Axis	Onco Targets Ther.	3.337	湖北随州医院等
40	社论：表观遗传学中RNA介导的过程；维持体内平衡的综合观点	Editorial: RNA-Mediated Processes in Epigenetics; an Integrative View in the Maintenance of Homeostasis	Front Genet.	3.258	巴西伯南布哥联邦大学等
41	circRNA参与急性心肌梗死发病机制的鉴定。	Identification of Regulatory circRNAs Involved in the Pathogenesis of Acute Myocardial Infarction	Front Genet.	3.258	上海东方医院等
42	Circ_0020123通过海绵化miR-142-3p增加ZFX表达以促进非小细胞肺癌的进展	Circ_0020123 Increases ZFX Expression to Facilitate Non-Small Cell Lung Cancer Progression by Sponging miR-142-3p	Cancer Manag Res.	2.886	福建医科大学等
43	环状RNA：子宫内膜癌的有前途的生物标志物	Circular RNAs: A Promising Biomarker for Endometrial Cancer	Cancer Manag Res.Review	2.886	南京医科大学附属杭州医院等
44	CircGDI2通过miR-454-3p / FOXF2轴调节OSCC的增殖，迁移，侵袭和凋亡	CircGDI2 Regulates the Proliferation, Migration, Invasion and Apoptosis of OSCC via miR-454-3p/FOXF2 Axis	Cancer Manag Res.	2.886	河南省人民医院等
45	CircRNA circYY1通过吸附miR-769-3p调控乳腺癌中YY1的表达调节细胞糖酵解和致癌表型	CircRNA circYY1 (hsa_circ_0101187) Modulates Cell Glycolysis and Malignancy Through Regulating YY1 Expression by Sponging miR-769-3p in Breast Cancer	Cancer Manag Res.	2.886	北京大学肿瘤医院等
46	CircHIPK3通过调节miR-326 / miR-487a-3p / SIRT1减轻对人肾小管上皮HK-2细胞的高糖毒性	CircHIPK3 Alleviates High Glucose Toxicity to Human Renal Tubular Epithelial HK-2 Cells Through Regulation of miR-326/miR-487a-3p/SIRT1	Diabetes Metab Syndr Obes.	2.842	蚌埠医学院第一附属医院等
47	大肠癌中，敲低circRAD23B通过miR-1205 / TRIM44轴发挥抗肿瘤作用	Knockdown of circRAD23B Exerts Antitumor Response in Colorectal Cancer via the Regulation of miR-1205/TRIM44 axis	Dig Dis Sci.	2.751	山东潍坊市第二人民医院等
48	癌症患者环状RNA circ-ITCH表达的预后和临床病理意义：荟萃分析	Prognostic and Clinicopathological Significance of Circular RNA circ-ITCH Expression in Cancer Patients: A Meta-analysis	Biomed Res Int.Review	2.276	吉林大学第一医院等
49	沉默环状RNA circPDE5A通过靶向miR-362-5p / NOL4L轴抑制神经母细胞瘤的进展	Silencing of circular RNA circPDE5A suppresses neuroblastoma progression by targeting the miR-362-5p/NOL4L axis	Int J Neurosci.	2.107	福建医科大学附属第二医院等
50	极低频磁场作用下人胃腺癌和人正常成纤维细胞系中NOTCH1基因及其调控circRNA，hsa_circ_0005986表达模式的变化	Changes in NOTCH1 gene and its regulatory circRNA, hsa_circ_0005986 expression pattern in human gastric adenocarcinoma and human normal fibroblast cell line following the exposure to extremely low frequency magnetic field	Electromagn Biol Med.	1.82	伊朗伊斯兰阿萨德大学等
51	人原发性多颅内动脉瘤中环状RNA表达谱	Circular RNA expression profile in human primary multiple intracranial aneurysm	Exp Ther Med.	1.785	福建龙岩市第一医院等
52	晶状体上皮细胞中ERCC6调控的circRNA-miRNA-mRNA网络综合分析	Profiling and integrated analysis of the ERCC6-regulated circRNA-miRNA-mRNA network in lens epithelial cells	Curr Eye Res.	1.754	南通大学附属医院等
53	更正：一种由环状RNA circPPP1R12A编码的新型蛋白质，可通过Hippo-YAP信号促进结肠癌的发病和转移	Correction to: A novel protein encoded by a circular RNA circPPP1R12A promotes tumor pathogenesis and metastasis of colon cancer via Hippo-YAP signaling	Mol Cancer.	15.302	苏州大学细胞治疗研究院等

2021年2月circRNA研究汇总-3（ 20210222-0228）

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