欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计41篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、CircPTPRA通过与IGF2BP1互作阻止了其对RNA N 6-甲基腺苷的识别从而抑制膀胱癌的进展
标题:CircPTPRA blocks the recognition of RNA N 6-methyladenosine through interacting with IGF2BP1 to suppress bladder cancer progression
杂志:Mol Cancer; 影响因子:15.302
通讯作者:章小平教授和蒋国松教授(武汉协和医院)
环状RNA(circRNA)已通过多种机制对膀胱癌(BC)的进展产生重大影响。在这项研究旨在鉴定调节IGM2BP1(关键的m6Areader蛋白)功能的新型circRNA,并探讨其在BC的调控机制和临床意义。方法学上,首先,研究IGF2BP1在BC中的临床作用。然后,进行RNA免疫沉淀测序(RIP-seq)分析,以鉴定BC细胞中与IGF2BP1相互作用的circRNA。在BC细胞系和动物异种移植研究中都研究了IGF2BP1和circPTPRA的整体生物学作用。随后,作者评估了circPTPRA对IGF2BP1的调控作用,并通过RNA测序筛选出其靶基因。最后,作者探讨了circPTPRA可能充当识别m6A的阻滞剂的潜在分子机制。研究结果证明,IGF2BP1在BC细胞的细胞质中主要与circPTPRA结合。 circPTPRA的异位表达消除了IGF2BP1诱导的BC细胞增殖、迁移和侵袭的促进作用。重要的是,circPTPRA通过与IGF2BP1相互作用下调了MYC和FSCN1表达。此外,IGF2BP1介导的m6A修饰的RNA的识别由于circPTPRA与IGF2BP1的KH域相互作用而部分受到干扰。这项研究确定外显子环状circPTPRA是一种新的肿瘤抑制因子,它通过内源性阻断IGF2BP1对m6A修饰的RNA的识别来抑制癌症的进展,表明circPTPRA可以作为BC患者的治疗靶标。文献解读请点击:Molecular Cancer | circPTPRA结合并抑制m6A Reader蛋白IGF2BP1
图注:circCPTPRA结合IGF2BP1的机制模型
2、Hsa_circ_0030042通过靶向eIF4A3调节异常自噬并保护动脉粥样硬化斑块稳定性
标题:Hsa_circ_0030042 regulates abnormal autophagy and protects atherosclerotic plaque stability by targeting eIF4A3
杂志:Theranostics. 影响因子:8.57
通讯作者: 张澄教授(山东大学齐鲁医院)
内皮细胞的异常自噬死亡对斑块结构有害,因为内皮损伤会促进病灶血栓形成。环状RNA(circRNA)作为新兴的功能性生物标志物,与多种疾病有关,包括心血管疾病。这项研究旨在确定hsa_circ_0030042在异常内皮细胞自噬和斑块稳定性中的作用。研究方法上,作者首先进行circRNA测序和qPCR,检测hsa_circ_0030042在冠心病(CHD)和人脐静脉内皮细胞(HUVEC)中的表达。 stubRFP-sensGFP-LC3腺病毒的转染,流式细胞术和电子显微镜技术用于鉴定hsa_circ_0030042在ox-LDL‒诱导的体外异常自噬中的作用。生物信息学分析、RNA免疫沉淀、免疫荧光分析和其他体外实验,阐明hsa_circ_0030042介导的自噬调节的基本机制。为了评估hsa_circ_0030042在动脉粥样硬化斑块和内皮功能中的作用,作者测量了颈动脉张力并进行了组织病理学和免疫组织化学分析。研究结果表明:hsa_circ_0030042在冠心病中显著下调,而在过表达时,它起内源性海绵吸附真核起始因子4A-III(eIF4A3)的作用,以抑制ox-LDL诱导的HUVEC异常自噬,并在体内维持噬斑稳定性。此外,hsa_circ_0030042通过海绵吸附eIF4A3并阻止其募集至beclin1和前叉箱O1(FOXO1)mRNA而影响自噬,而hsa_circ_0030042诱导的对beclin1和FOXO1的抑制作用可通过eIF4A3过表达或hsa_circ_0030042结合减少来抵消。在高脂饮食的ApoE-/-小鼠中,hsa_circ_0030042还改善了斑块稳定性并抵消了eIF4A3诱导的斑块不稳定性。这些结果证明了hsa_circ_0030042,eIF4A3,FOXO1和beclin1的新途径。因此,干预这些分子表达水平可能是抗冠心病的潜在治疗策略。
图注:hsa_circ_0030042定位细胞质并与eIF4A3结合
3、综述:癌症中的非编码RNA
标题:Non-coding RNA in cancer
杂志:Essays Biochem. 影响因子:6.966
通讯作者:卜鹏程研究员(中科院生物物理所)
人类基因组的转录产物中大多数为不编码蛋白质的RNA。这些非编码RNA(ncRNA)在调节各种癌症的发生和发展中起着至关重要的作用。在该综述中,作者主要关注ncRNA的功能、调控机制和治疗潜力的最新研究。约人类基因组中有75%被转录为RNA,而只有3%被转录为编码蛋白质的mRNA。根据长度,形状和位置,非编码RNA(ncRNA)已分为不同的类别。其中,microRNA(miRNA),长非编码RNA(lncRNA),环状RNA(circRNA)和PIWI相互作用RNA(piRNA)是在癌症中具有独特功能的四种主要ncRNA类型。 miRNAs是一种小RNA,长度为22-23个核苷酸(nt)。 miRNA与靶标mRNA中的互补序列结合,并导致RNA诱导的沉默复合物(RISC)降解目标mRNA。 piRNA首先在果蝇中被鉴定出,长度为24–30 nt。它主要存在于种系细胞中,并与PIWI家族蛋白结合,参与染色质的表观遗传调控。 LncRNA和circRNA的长度超过200 nt,但是lncRNA是线性的,而circRNA是环状的。 lncRNA和circRNA均可从外显子,内含子,基因间区域或5’/ 3′-非翻译区域转录并折叠成复杂的第二结构,从而促进它们与DNA,RNA和蛋白质的相互作用。 LncRNA和circRNA通过多种机制调节基因表达。它们可以充当miRNA诱饵来阻止目标mRNA降解。它们可以调节转录因子与启动子结合,从而调节靶基因的表达。它们还可以作为支架调节蛋白质之间的相互作用以及相关的下游信号传导途径。最近,一些研究表明lncRNA和circRNA参与了染色质的表观遗传调控,以调节基因表达。大量证据表明,ncRNA在人类恶性肿瘤中起着至关重要的作用。它们可以作为癌基因或抑制剂来调节癌症的发生和发展。许多ncRNA可以从癌细胞释放到血液或尿液中,并作为诊断标记或预后指标。
文献列表:
序号 |
主要内容 |
论文标题 |
杂志 |
IF |
单位 |
1 |
CircPTPRA通过与IGF2BP1互作阻止了其对RNA N 6-甲基腺苷的识别从而抑制膀胱癌的进展 |
CircPTPRA blocks the recognition of RNA N 6-methyladenosine through interacting with IGF2BP1 to suppress bladder cancer progression |
Mol Cancer |
15.302 |
武汉协和医院等 |
2 |
Hsa_circ_0030042通过靶向eIF4A3调节异常自噬并保护动脉粥样硬化斑块稳定性 |
Hsa_circ_0030042 regulates abnormal autophagy and protects atherosclerotic plaque stability by targeting eIF4A3 |
Theranostics. |
8.579 |
山东齐鲁医院等 |
3 |
综述:癌症中的非编码RNA |
Non-coding RNA in cancer |
Essays Biochem. |
6.966 |
中科院生物物理所等 |
4 |
环状RNAs作为外周血生物标志物在重大抑郁症诊断和治疗中的潜在临床价值 |
Potential clinical value of circular RNAs as peripheral biomarkers for the diagnosis and treatment of major depressive disorder |
EBioMedicine. |
5.736 |
东南大学等 |
5 |
脂肪来源的间充质干细胞的外泌体CircRNA_100395通miR-141-3p-LATS2轴抑制非小细胞肺癌的恶性转化 |
CircRNA_100395 Carried by Exosomes From Adipose-Derived Mesenchymal Stem Cells Inhibits the Malignant Transformation of Non-Small Cell Lung Carcinoma Through the miR-141-3p-LATS2 Axis |
Front Cell Dev Biol. |
5.201 |
杭州树兰医院等 |
6 |
CircRNA circ_0092314通过吸附miR-671上调S100P的表达诱导胰腺癌细胞的上皮-间质转化 |
CircRNA circ_0092314 Induces Epithelial-Mesenchymal Transition of Pancreatic Cancer Cells via Elevating the Expression of S100P by Sponging miR-671 |
Front Oncol. |
4.848 |
武汉同济医院等 |
7 |
环状RNA hsa_circ_0003288通过调节肝细胞癌中的hsa_circ_0003288 / miR-145 / PD-L1轴诱导EMT和侵袭 |
Circular RNA hsa_circ_0003288 induces EMT and invasion by regulating hsa_circ_0003288/miR-145/PD-L1 axis in hepatocellular carcinoma |
Cancer Cell Int. |
4.175 |
苏州大学附属第一医院等 |
8 |
非编码RNA在心肌缺血再灌注损伤的发生和发展中的作用 |
Roles of noncoding RNAs in the initiation and progression of myocardial ischemia聽reperfusion injury |
Epigenomics. |
4.112 |
北京安贞医院等 |
9 |
COVID-19感染的外周血中circRNA和lncRNA表达差异的研究 |
A study of differential circRNA and lncRNA expressions in COVID-19-infected peripheral blood |
Sci Rep. |
3.998 |
中山大学生命科学学院等 |
10 |
环状RNA在创伤后中枢神经系统中的作用的新见解。 |
New Insight of Circular RNAs’ Roles in Central Nervous System Post-Traumatic Injury |
Front Neurosci. |
3.707 |
浙江大学附属邵逸夫医院等 |
11 |
环状RNA circ_HECTD1通过miR-27a-3p / FSTL1轴调节脑梗死后的细胞损伤 |
Circular RNA circ_HECTD1 regulates cell injury after cerebral infarction by miR-27a-3p/FSTL1 axis |
Cell Cycle. |
3.699 |
河南中医药大学附属第一医院等 |
12 |
Scutellaria barbata D.Don和白花蛇舌草(Willd)Roxb粗提物通过调节circRNA表达来抑制与乙型肝炎病毒相关的肝细胞癌的生长 |
Scutellaria barbata D.Don and Oldenlandia diffusa (Willd.) Roxb crude extracts inhibit hepatitis-B-virus-associated hepatocellular carcinoma growth through regulating circRNA expression |
J Ethnopharmacol. |
3.69 |
上海岳阳中西医结合医院等 |
13 |
环状RNA hsa_circ_0000700通过miR-1229促进食管鳞状细胞癌中的细胞增殖和迁移 |
Circular RNA hsa_circ_0000700 promotes cell proliferation and migration in Esophageal Squamous Cell Carcinoma by sponging miR-1229 |
J Cancer. |
3.565 |
浙江肿瘤医院等 |
14 |
CircRNAs是炎症性肠病及其相关结直肠癌的有前途的生物标志物 |
CircRNAs as promising biomarkers of inflammatory bowel disease and its associated-colorectal cancer |
Am J Transl Res. |
3.375 |
江苏大学医学院等 |
15 |
CircATP5SL通过靶向miR-873-5p调节IGF1R促进婴儿血管瘤的进展 |
CircATP5SL promotes infantile haemangiomas progression via IGF1R regulation by targeting miR-873-5p |
Am J Transl Res. |
3.375 |
宁波大学医学院附属医院等 |
16 |
circNFATC3 / miR-23b-3p轴调控的RAI14促进胃癌细胞的生长和侵袭。 |
RAI14 Regulated by circNFATC3/miR-23b-3p axis Facilitates Cell Growth and Invasion in Gastric Cancer |
Cell Transplant. |
3.341 |
天津医科大学总医院等 |
17 |
冰山一角:CircRNA在癌症糖酵解中的作用 |
Tip of the Iceberg: Roles of CircRNAs in Cancer Glycolysis |
Onco Targets Ther.Review |
3.337 |
四川大学华西口腔医院等 |
18 |
环状RNA hsa-circ-000881通过miR-665 / PRICKLE2轴体外抑制肺腺癌的进展 |
Circular RNA hsa-circ-000881 suppresses the progression of lung adenocarcinoma in vitro via a miR-665/PRICKLE2 axis |
Ann Transl Med. |
3.297 |
山东大学齐鲁医院等 |
19 |
circ-RANBP9在喉癌中的下调及其临床意义 |
Downregulation of circ-RANBP9 in laryngeal cancer and its clinical significance |
Ann Transl Med. |
3.297 |
中国医科大学附属第一医院等 |
20 |
Atractylon治疗通过调节卵白蛋白诱发的哮喘小鼠模型中的mmu_circ_0000981 / miR-211-5p / TGFBR2轴来减轻肺纤维化 |
Atractylon Treatment Attenuates Pulmonary Fibrosis via Regulation of the mmu_circ_0000981/miR-211-5p/TGFBR2 Axis in an Ovalbumin-Induced Asthma Mouse Model |
Inflammation. |
3.212 |
上海市浦东新区公利医院等 |
21 |
外泌体传递的circ-CARD6通过miR-31 / FGF7轴促进后发性白内障的发展 |
Exosome-transmitted circ-CARD6 facilitates posterior capsule opacification development by miR-31/FGF7 axis |
Exp Eye Res. |
3.011 |
郑州大学第一附属医院等 |
22 |
缺氧下雄激素受体的缺失通过激活circ-LNPEP / miR-532-3p / RAB9A信号促进HCC侵袭和转移 |
Loss of androgen receptor promotes HCC invasion and metastasis via activating circ-LNPEP/miR-532-3p/RAB9A signal under hypoxia |
Biochem Biophys Res Commun. |
2.985 |
中南大学湘雅医院等 |
23 |
Circ_0001806通过miR-1182 / NOVA2轴促进NSCLC细胞的增殖,迁移和侵袭 |
Circ_0001806 Promotes the Proliferation, Migration and Invasion of NSCLC Cells Through miR-1182/NOVA2 Axis |
Cancer Manag Res. |
2.886 |
烟台业达医院等 |
24 |
CircRNA circ-OGDH(hsa_circ_0003340)充当ceRNA来通过miR-615-5p / PDX1轴调节谷氨酰胺代谢和食管鳞状细胞癌进展 |
CircRNA circ-OGDH (hsa_circ_0003340) Acts as a ceRNA to Regulate Glutamine Metabolism and Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression by the miR-615-5p/PDX1 Axis |
Cancer Manag Res. |
2.886 |
承德医学院附属医院等 |
25 |
Circ-OSBPL2通过靶向miR-193a-5p / BRD4轴促进与吸烟慢性阻塞性肺疾病 |
Circ-OSBPL2 Contributes to Smoke-Related Chronic Obstructive Pulmonary Disease by Targeting miR-193a-5p/BRD4 Axis |
Int J Chron Obstruct Pulmon Dis. |
2.772 |
连云港市第一人民医院等 |
26 |
中国固始鸡腹部脂肪组织发育过程中circRNA的特征和表达谱 |
Characteristics and expression profiles of circRNAs during abdominal adipose tissue development in Chinese Gushi chickens |
PLoS One. |
2.74 |
河南农业大学等 |
27 |
terrestrial slug Limax valentianus中枢神经系统中内毒素基因转录本的鉴定和分类 |
Identification and classification of innexin gene transcripts in the central nervous system of the terrestrial slug Limax valentianus |
PLoS One. |
2.74 |
日本德岛文理大学等 |
28 |
环状RNA circZNF292调节H(2)O(2)诱导的人晶状体上皮HLE-B3细胞损伤,依赖miR-222-3p / E2F3轴的调控 |
Circular RNA circZNF292 regulates H(2) O(2) -induced injury in human lens epithelial HLE-B3 cells depending on the regulation of the miR-222-3p/E2F3 axis |
Cell Biol Int. |
2.571 |
潍坊眼科医院等 |
29 |
circRNA_100395海绵吸附miR-142-3p通过靶向PI3K / AKT轴上调以抑制胃癌的进展 |
Upregulation of circRNA_100395 sponges miR-142-3p to inhibit gastric cancer progression by targeting the PI3K/AKT axis |
Oncol Lett. |
2.311 |
台州市人民医院等 |
30 |
circCCDC66通过miR-211-5p / PDK4轴促进甲状腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力以及糖酵解 |
circCCDC66 promotes thyroid cancer cell proliferation, migratory and invasive abilities and glycolysis through the miR-211-5p/PDK4 axis |
Oncol Lett. |
2.311 |
青岛市市立医院等 |
31 |
Circ-E2F3作为miR-204-5p的ceRNA,通过调节ROCK1的表达来促进视网膜母细胞瘤的增殖、转移和凋亡抑制 |
Circ-E2F3 acts as a ceRNA for miR-204-5p to promote proliferation, metastasis and apoptosis inhibition in retinoblastoma by regulating ROCK1 expression |
Exp Mol Pathol. |
2.28 |
柳州市人民医院等 |
32 |
子痫前期患者脐带血外泌体中环状RNA的差异表达谱 |
Differential circular RNA expression profiles in umbilical cord blood exosomes from preeclampsia patients |
BMC Pregnancy Childbirth. |
2.239 |
无锡市儿童医院等 |
33 |
环状RNA-HIPK3通过调节microRNA-328-3p / STAT3轴来调节人肺动脉内皮细胞的功能和血管的生长 |
Circular RNA-HIPK3 regulates human pulmonary artery endothelial cells function and vessel growth by regulating microRNA-328-3p/STAT3 axis |
Pulm Circ. |
2.205 |
福州儿童医院等 |
34 |
Hsa-circRNA-G004213通过调节肝癌中的miR-513b-5p / PRPF39来提高顺铂敏感性。 |
Hsa-circRNA-G004213 promotes cisplatin sensitivity by regulating miR-513b-5p/PRPF39 in liver cancer. |
Mol Med Rep. |
2.1 |
成都医学院第一附属医院等 |
35 |
Hsa_circ_0072309抑制胶质母细胞瘤的增殖和侵袭 |
Hsa_circ_0072309 inhibits proliferation and invasion of glioblastoma |
Pathol Res Pract. |
2.05 |
武汉大学人民医院等 |
36 |
肺血栓栓塞的微阵列表达谱和环状RNA调控网络分析 |
Microarray Expression Profile and Analysis of Circular RNA Regulatory Network in Pulmonary Thromboembolism |
Int J Gen Med. |
1.927 |
北京六合医院等 |
37 |
miRNA、lncRNA和circRNA在椎间盘退变发展中的作用(综述) |
The role of miRNA, lncRNA and circRNA in the development of intervertebral disk degeneration (Review) |
Exp Ther Med.Review |
1.785 |
大连医科大学附属第一医院等 |
38 |
Circ_0116061通过调节miR-200b-3p / SMURF2轴来调节骨关节炎软骨细胞的增殖、凋亡和炎症 |
Circ_0116061 regulated the proliferation, apoptosis, and inflammation of osteoarthritis chondrocytes through regulating the miR-200b-3p/SMURF2 axis |
J Orthop Surg Res. |
1.777 |
山东滕州市中心人民医院 |
39 |
circ-PSD3通过调节miR-7-5p / METTL7B轴促进甲状腺乳头状癌细胞的增殖和侵袭 |
circ-PSD3 promoted proliferation and invasion of papillary thyroid cancer cells via regulating the miR-7-5p/METTL7B axis |
J Recept Signal Transduct Res. |
1.466 |
云南肿瘤医院等 |
40 |
环状RNA_0000190及其靶标microRNA-767-5p失调,与多发性骨髓瘤患者的风险分层以及预后有关 |
Circular RNA_0000190 and its target microRNA-767-5p are dysregulated, and they are related to risk stratification as well as prognosis in multiple myeloma patients |
Ir J Med Sci. |
1.1 |
荆门市第一人民医院等 |
41 |
表达环形ncRNA诱饵的酵母细胞中Nab3的cDNA(CRAC)的交联和分析数据 |
Data from crosslinking and analysis of cDNAs (CRAC) of Nab3 in yeast cells expressing a circular ncRNA decoy |
Data Brief |
0 |
巴黎大学等 |