欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计46篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、标题：NOVA2 regulates neural circRNA biogenesis
杂志：Nucleic Acids Res.
影响因子：11.502
通讯作者：Pedro Miura（内华达大学）
环状RNA（circRNA）在大脑中高度表达，并且在神经元分化过程中表达增加。在小鼠大脑发育中的circRNA的调节因素尚不清楚。NOVA1 和 NOVA2 属于(神经肿瘤腹侧抗原)蛋白家族是RNA结合蛋白，在选择性剪接中具有明确的作用。来自 RNA-seq 数据的 circRNA 分析表明，Nova2 敲除的胚胎皮层中 circRNA 全局水平降低，但 Nova1 敲除小鼠的胚胎皮层中则不会出现这种现象。对缺乏 NOVA2 的孤立抑制性和兴奋性皮层神经元的分析显示，circRNA 的减少更为显著，NOVA2 在增强 circRNA 生物发生方面的广泛作用。为了研究控制 circRNA 生物发生的 NOVA2 调节的顺式元件，我们基于 Efnb2 基因生成了一个反向剪接报告基因。我们发现当突变掉位于侧翼内含子的 YCAY 簇后，NOVA2 介导的 circEfnb2 反向剪接受到损害。 CLIP（交联免疫沉淀）和报告基因实验分析证明了 NOVA2 结合 circRNA 基因座的两个侧翼内含子的重要性。 NOVA2 是第一个被鉴定为可全局促进大脑发育中 circRNA 生物形成的 RNA 结合蛋白。
图注：NOVA2调控小鼠胚胎皮层中circRNA的生物生成。
2、circRHOBTB3通过调节HuR介导的PTBP1的mRNA稳定性在来抑制结直肠癌转移
标题：Circular RNA circRHOBTB3 represses metastasis by regulating the HuR-mediated mRNA stability of PTBP1 in colorectal cancer
杂志：Theranostics.
影响因子：8.577
通讯作者：徐建斌和宋章法（浙江大学邵逸夫医院）
背景：结直肠癌（CRC）的肿瘤转移是大多数患者死亡的主要原因，也是CRC综合治疗的主要难点。环状RNA（circRNA）影响实体瘤中的许多生物学功能。然而，它们在CRC转移中的机制仍不清楚。方法：通过RNA测序（RNA-seq）和实时定量PCR筛选CRC组织和邻近正常组织之间差异表达的circRNA。进行CCK-8、细胞迁移和划痕愈合试验以确定circRHOBTB3在细胞增殖和转移中的功能。RNA pulldown 和 RNA 免疫沉淀试验验证 circRHOBTB3 和 HuR（ELAVL1）蛋白之间的相互作用。进一步的 RNA-seq 和功能救援实验寻找下游目标。我们还进行了小鼠异种移植模型，以阐明 circRHOBTB3 对体内癌症转移的影响。结果：我们鉴定了在 CRC 组织和细胞系中显著下调的 circRHOBTB3。此外，较低的 circRHOBTB3 水平与晚期临床分期和更大的转移风险显著相关。 circRHOBTB3的过表达抑制了CRC肿瘤细胞的转移。从机制上讲，circRHOBTB3 与 HuR 结合，HuR 是 CRC 发展中普遍表达的功能性 RNA 结合蛋白 (RBP)，并促进 β-Trcp1 介导的 HuR 泛素化。通常，HuR 与靶标 mRNA 的 3’UTR 结合以增进其稳定，而 circRHOBTB3 和 HuR 之间的相互作用会降解 HuR 以降低下游靶标 PTBP1 的表达水平。此外，在体内过表达 circRHOBTB3 可抑制肺转移，并且这种效果可以被 PTBP1 过表达部分逆转。此外，CRC 细胞中，FUS 和 ADARB2 均可促进 circRHOBTB3 的转录。结论：我们的研究结果表明，circRHOBTB3 通过 HuR/PTBP1 轴对 CRC 侵袭性产生抑制作用。
图注：CircRHOBTB3通过HuR/PTBP1轴抑制CRC转移
3、设计环状 RNA 调节器促进特定环状 RNA 的产生
标题：Engineering circular RNA regulators to specifically promote circular RNA production
杂志：Theranostics. 影响因子：8.577
通讯作者：汪洋（大连医科大学附属第二医院）
背景：在哺乳动物转录组中发现了大量高丰度的环状RNA（circRNA），它们在基因调控中起着至关重要的作用，从而参与多种疾病的发展。然而，circRNA 的生物发生、调控，尤其是操纵仍然在很大程度上是未知的。方法：开发了工程 circRNA 调节器（ECRR）以促进 circRNA 生物发生。利用多个 circRNA 报告基因评估 ECRR 的调节作用。应用 RT-PCR、qRT-PCR、northern 印迹、蛋白免疫印迹和流式细胞术测评估人工 circRNA 调节器在存在或不存在 RNase R 处理的情况下对 circRNA 产生的效率。结果：我们通过将人类 Pumilio 1 基因的特异性 RNA 结合基序序列与功能域相结合可形成二聚化来设计 circRNA 调节器。我们应用这些工程调节器来促进外源 circRNA 报告基因 circGFP 的 circRNA 产生，从而刺激功能性 GFP 蛋白的产生。至关重要的是，这种调节是具有设计特异性的时间和剂量依赖性方式。此外，ECRRs 的应用还可以刺激另一个小报告基因 circScreen 的 circRNA 生物发生，表明 ECRRs 可以普遍用于促进外源报告基因的 circRNA 生成。最重要的是，ECRRs 也可用于特异性促进内源性 circRNAs circ10720 和 circBIRC6 的产生。结论：我们的方法允许创建工程调节器在体内靶向几乎任何前体 mRNA，为研究 circRNA 生物发生和操纵疾病相关的 circRNA 生产提供了一种新途径。
图注：ECRRs 促进内源性环状 RNA 的产生
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