欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计38篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、 尿液细胞外囊泡 circRNA 分类器用于前列腺特异性抗原 2-10 ng/mL 患者的高级别前列腺癌初始活检(Letter)
标题:A urine extracellular vesicle circRNA classifier for detection of high-grade prostate cancer in patients with prostate-specific antigen 2-10 ng/mL at initial biopsy
杂志:Mol Cancer.
影响因子:27.404
通讯作者:李辽源教授(中山大学附属第三医院)
本研究的目的是确定一种尿液细胞外囊泡环状 RNA (circRNA) 分类器,该分类器可以检测等级组 (GG) 2 或更高级别前列腺癌 (PCa)。为此,我们使用 RNA 测序从 11 名高级别前列腺癌患者和 11 名匹配的良性前列腺增生患者的尿细胞外囊泡中鉴定候选 circRNA。在训练队列(n = 263)中使用 ddPCR,我们构建了一个尿液细胞外囊泡 circRNA 分类器(Ccirc,包含 circPDLIM5、circSCAF8、circPLXDC2、circSCAMP1 和 circCCNT2),在两个独立的队列(n = 497, n = 505)。 Ccirc 在训练队列和验证队列中均显示出比两种标准护理风险计算器 (RC)(PCPT-RC 2.0 和 ERSPC-RC)更高的准确性。在所有三个队列中,这种新型尿液细胞外囊泡 circRNA 分类器加上 RC 在预测 ≥ GG2 PCa 方面比单独的 RC 在统计学上更具预测性。这种检测不需要预先收集直肠指检或特殊处理,是可重复的、无创的,并且可以作为基本临床工作流程的一部分轻松实施。
2、 基于网状杂交链反应的CircRNA特异性和灵敏检测
标题:Specific and sensitive detection of CircRNA based on netlike hybridization chain reaction
杂志:Biosens Bioelectron.
影响因子:10.613
通讯作者:朱曲波副教授(中南大学湘雅药学院)
环状RNA(circRNA)作为一类新的生物标志物,在癌症的发生发展中起着重要作用。然而,近年来检测方法的局限性严重制约了circRNA的相关研究。在这里,我们开发了一种基于恒温网状杂交链反应 (HCR) 的 circRNA 有效检测方法。它将逆转录-滚环扩增(RT-RCA)与精心设计的网状HCR相结合,实现双选择和双信号放大,可消除线性异构体的干扰。这种二维网状HCR由一个巧妙设计的触发链和两个发夹式fuel探针组成,可以在恒温下与含有多组重复的RT-RCA产物形成稳定的网络结构,从而产生增强的荧光信号。系统研究表明,优化后的网状 HCR 系统对含有多组重复序列的 DNA 链具有更高的检测效率,可检测低至 0.1 pM 的 circRNA,并且具有优异的选择性。通过使用人类肿瘤细胞系和组织,已经验证了基于网状HCR的方法可以在没有RNase R富集的情况下准确检测真实生物样品中的特定circRNA,为检测低丰度circRNA提供了一个简单而有用的平台。此外,所提出的策略也是检测一些含有重复序列的基因的潜在方法,如端粒 DNA、着丝粒 DNA 和核糖体 DNA (rDNA)。
3、 用于肝细胞癌诊断的超灵敏circRNA检测的集成电化学POCT平台
标题:An integrated electrochemical POCT platform for ultrasensitive circRNA detection towards hepatocellular carcinoma diagnosis
杂志:Biosens Bioelectron.
影响因子:10.613
通讯作者:梁波、叶学松教授(浙江大学)和蔡秀军教授(浙江大学医学院附属邵逸夫医院)
肝细胞癌 (HCC) 是癌症相关死亡的第四大原因。 Circ-CDYL 是环状 RNA(circRNA)之一,被认为是 HCC 早期诊断的独立标志物。 circRNA 的即时检测 (POCT) 是必不可少的,并且对临床应用有很大的需求。在此,我们报告了一个集成电化学 POCT 平台,基于 AuNFs/PNA修饰的碳纤维微电极(CFME)检测 circRNA 。 PNA 用作识别元件,高度指定用于 circRNA 的反向剪接连接。 AuNFs 增加了 PNA 探针的活性位点,在超低水平上提高了目标捕获效率。该平台提供 10 fM 至 1 μM 的线性范围,检测限低至 3.29 fM。这种生物传感器对单碱基错配表现出高度的特异性,并且可以稳定长达 24 天。分析性能也已在人血清样品中得到验证,证明了其在 HCC 临床 POCT 应用中的潜在效用。
文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 尿液细胞外囊泡 circRNA 分类器用于前列腺特异性抗原 2-10 ng/mL 患者的高级别前列腺癌初始活检 | A urine extracellular vesicle circRNA classifier for detection of high-grade prostate cancer in patients with prostate-specific antigen 2-10 ng/mL at initial biopsy | Mol Cancer. | 27.404 | 中山大学附属第三医院等 |
2 | 2、基于网状杂交链反应的CircRNA特异性和灵敏检测 | Specific and sensitive detection of CircRNA based on netlike hybridization chain reaction | Biosens Bioelectron. | 10.613 | 中南大学湘雅药学院等 |
3 | 用于肝细胞癌诊断的超灵敏circRNA检测的集成电化学POCT平台 | An integrated electrochemical POCT platform for ultrasensitive circRNA detection towards hepatocellular carcinoma diagnosis | Biosens Bioelectron. | 10.613 | 浙江大学等 |
4 | 低氧外泌体HIF-1α-稳定circZNF91通过增强糖酵解促进常氧胰腺癌细胞的化疗抗性 | Hypoxic exosomal HIF-1α-stabilizing circZNF91 promotes chemoresistance of normoxic pancreatic cancer cells via enhancing glycolysis | Oncogene. | 9.861 | 武汉协和医院等 |
5 | 自噬相关的circRNA评估显示hsa_circ_0001747是前列腺癌患者生化复发的潜在有利预后因素 | Autophagy-related circRNA evaluation reveals hsa_circ_0001747 as a potential favorable prognostic factor for biochemical recurrence in patients with prostate cancer | Cell Death Dis. | 8.461 | 南方医科大学珠江医院等 |
6 | 高通量测序鉴定环状 RNA circUBE2K 通过调控 miR-516b-5p/ARHGAP5 轴介导 RhoA 相关膀胱癌表型 | High-throughput sequencing identified circular RNA circUBE2K mediating RhoA associated bladder cancer phenotype via regulation of miR-516b-5p/ARHGAP5 axis | Cell Death Dis. | 8.46 | 复旦大学等 |
7 | 一种新型内含子环状 RNA 通过吸收降解 CREBBP 和加速 IFN-β 产生的 microRNA 来拮抗流感病毒 | A Novel Intronic Circular RNA Antagonizes Influenza Virus by Absorbing a microRNA That Degrades CREBBP and Accelerating IFN-尾 Production | mBio. | 7.862 | 中国农业科学院等 |
8 | 肺癌中的环状 RNA:最新进展和未来展望 | Circular RNAs in Lung Cancer: Recent Advances and Future Perspectives | Front Oncol.Review | 6.241 | 中国医科大学附属盛京医院等 |
9 | 环状 RNA circ-MMP11 通过调节 miR-153-3p/ANLN 轴促进乳腺癌细胞的拉帕替尼耐药 | Circular RNA circ-MMP11 Contributes to Lapatinib Resistance of Breast Cancer Cells by Regulating the miR-153-3p/ANLN Axis | Front Oncol. | 6.241 | 淮安第一人民医院等 |
10 | 胃癌中表达异常的非编码RNA及其诊断价值 | Aberrant Non-Coding RNA Expressed in Gastric Cancer and Its Diagnostic Value | Front Oncol. | 6.241 | 上海市第一人民医院等 |
11 | 侵袭性伪足中的非编码 RNA:癌症转移的新见解 | Non-Coding RNAs in Invadopodia: New Insights Into Cancer Metastasis | Front Oncol.Review | 6.24 | 加拿大多伦多大学等 |
12 | 鉴定影响肝细胞癌中环状 RNA 表达的新型 RNA 结合蛋白 | Identification of Novel RNA Binding Proteins Influencing Circular RNA Expression in Hepatocellular Carcinoma | Int J Mol Sci. | 5.922 | 卢布尔雅那大学等 |
13 | 环状RNA在鱼类中的作用及其作为生物标志物的潜在应用 | Function of Circular RNAs in Fish and Their Potential Application as Biomarkers | Int J Mol Sci.Review | 5.921 | 诺德大学等 |
14 | CircFBXL5通过调节miR-216b/HMGA2轴促进乳腺癌5-FU耐药 | CircFBXL5 promotes the 5-FU resistance of breast cancer via modulating miR-216b/HMGA2 axis | Cancer Cell Int. | 5.724 | 郑州大学第一附属医院等 |
15 | 环状 RNA Circ_0067934 通过 miR-545-3p/SLC7A11 信号途径减弱甲状腺癌细胞的铁死亡 | Circular RNA Circ_0067934 Attenuates Ferroptosis of Thyroid Cancer Cells by miR-545-3p/SLC7A11 Signaling | Front Endocrinol (Lausanne). | 5.552 | 齐齐哈尔市第一医院等 |
16 | Hsa_circ_0000520过表达通过miR-1296增加CDK2表达促进宫颈癌细胞增殖 | Hsa_circ_0000520 overexpression increases CDK2 expression via miR-1296 to facilitate cervical cancer cell proliferation | J Transl Med. | 5.534 | 苏州科技城医院等 |
17 | 单克隆 EL4 细胞系中Zbtb1 基因敲除的 MicroRNA 和 circRNA 表达分析 | MicroRNA and circRNA Expression Analysis in a Zbtb1 Gene Knockout Monoclonal EL4 Cell Line | Front Cell Infect Microbiol. | 5.29 | 吉林农业大学等 |
18 | 环状 RNA circSETD3 通过吸附 miR-641 上调 PTEN 阻碍膀胱癌中的细胞生长、迁移和干细胞特性 | Circular RNA circSETD3 hampers cell growth, migration, and stem cell properties in bladder cancer through sponging miR-641 to upregulate PTEN | Cell Cycle. | 4.533 | 成都中医药大学附属医院等 |
19 | 环状RNA MAT2B通过吸附miR-431促进非小细胞肺癌细胞的迁移、侵袭和上皮间质转化 | Circular RNA MAT2B promotes migration, invasion and epithelial-mesenchymal transition of non-small cell lung cancer cells by sponging miR-431 | Cell Cycle. | 4.533 | 成都中医药大学附属医院等 |
20 | ceRNA网络的构建和综合分析以揭示肺腺癌的潜在预后生物标志物 | Construction and comprehensive analysis of a ceRNA network to reveal potential prognostic biomarkers for lung adenocarcinoma | BMC Cancer. | 4.43 | 安徽医科大学第一附属医院等 |
21 | 环状非编码 RNA hsa_circ_0005986 作为肝细胞癌的预后生物标志物 | Circular noncoding RNA hsa_circ_0005986 as a prognostic biomarker for hepatocellular carcinoma | Sci Rep. | 4.37 | 韩国庆北国立大学医学院等 |
22 | Circ-SHPRH 在癌症中的新兴作用 | The Emerging Role of Circ-SHPRH in Cancer | Onco Targets Ther.Review | 4.143 | 吉林大学白求恩医学院等 |
23 | circHIPK3的沉默通过靶向miR-1286调节HK2使紫杉醇抗性乳腺癌细胞对化疗敏感 | Silencing of circHIPK3 Sensitizes Paclitaxel-Resistant Breast Cancer Cells to Chemotherapy by Regulating HK2 Through Targeting miR-1286 | Cancer Manag Res. | 3.983 | 赣州市人民医院等 |
24 | 大脑健康和疾病中的非编码 RNA 串扰 | Noncoding RNA crosstalk in brain health and diseases | Neurochem Int. | 3.921 | 美国威斯康星大学等 |
25 | 性染色体来源的尿液外泌体环状RNA与IgA肾病患者临床病理特征的性别相关风险差异相关 | Urinary exosomal circular RNAs of sex chromosome origin are associated with gender-related risk differences of clinicopathological features in patients with IgA nephropathy | J Nephrol. | 3.903 | 吉林大学第二医院等 |
26 | 环状RNA TADA2A通过调节miR-638/KIAA0101信号促进非小细胞肺癌增殖和迁移 | Circular RNA TADA2A promotes proliferation and migration via modulating of miR638/KIAA0101 signal in nonsmall cell lung cancer | Oncol Rep. | 3.901 | 辽宁省肿瘤医院等 |
27 | circExp 数据库:癌症中人类 circRNA 表达的在线转录组平台 | circExp database: an online transcriptome platform for human circRNA expressions in cancers | Database (Oxford). | 3.451 | 北京大学生命科学学院等 |
28 | 葡萄糖剥夺诱导的人髓核细胞变性中差异表达的circRNA的综合概况分析 | Comprehensive Profile Analysis of Differentially Expressed circRNAs in Glucose Deprivation-Induced Human Nucleus Pulposus Cell Degeneration | Biomed Res Int. | 3.413 | 同济大学医学院等 |
29 | 在 16HBE 细胞中Circ-RBMS1 敲低通过 miR-197-3p 上调 FBXO11 减轻 CSE 诱导的细胞凋亡、炎症和氧化应激 | Circ-RBMS1 Knockdown Alleviates CSE-Induced Apoptosis, Inflammation and Oxidative Stress via Up-Regulating FBXO11 Through miR-197-3p in 16HBE Cells | Int J Chron Obstruct Pulmon Dis. | 3.352 | 成都军区昆明总医院等 |
30 | circFAT1/microRNA-525-5p/spindle和动粒相关复合亚基1(SKA1)轴通过激活notch和Wnt信号通路调节乳腺癌的奥沙利铂耐药性 | Circular RNA FAT atypical cadherin 1 (circFAT1)/microRNA-525-5p/spindle and kinetochore-associated complex subunit 1 (SKA1) axis regulates oxaliplatin resistance in breast cancer by activating the notch and Wnt signaling pathway | Bioengineered. | 3.263 | 常州市第二人民医院等 |
31 | 环状RNA circRNA_0082835通过吸附 miRNA-429促进原发性黑色素瘤的进展和淋巴转移 | Circular RNA circRNA_0082835 promotes progression and lymphatic metastasis of primary melanoma by sponging microRNA miRNA-429 | Bioengineered. | 3.263 | 江苏省人民医院等 |
32 | 环状 RNA hsa_circ_0033144 (CircBCL11B) 通过 miR-579/LASP1 轴调节口腔鳞状细胞癌进展 | Circular RNA hsa_circ_0033144 (CircBCL11B) regulates oral squamous cell carcinoma progression via the miR-579/LASP1 axis | Bioengineered. | 3.263 | 梅州市人民医院等 |
33 | CircFADS2在骨关节炎中下调并通过调节miR-195-5p甲基化抑制LPS诱导的软骨细胞凋亡 | CircFADS2 is downregulated in osteoarthritis and suppresses LPS-induced apoptosis of chondrocytes by regulating miR-195-5p methylation | Arch Gerontol Geriatr. | 3.251 | 西南医科大学附属医院等 |
34 | 循环环状 RNA (hsa_circ_0013587) 水平升高可作为胰腺癌的新型生物标志物 | Increased levels of circulating circular RNA (hsa_circ_0013587) may serve as a novel biomarker for pancreatic cancer | Biomark Med. | 2.852 | 宁波大学医学院附属医院等 |
35 | Circ_0000317/microRNA-520g/HOXD10轴对结直肠癌生物学特性的影响 | Circ_0000317/microRNA-520g/HOXD10 axis affects the biological characteristics of colorectal cancer | Kaohsiung J Med Sci. | 2.741 | 中国科学院大学华美医院等 |
36 | 致癌circDHTKD1通过上调miR-326介导的GAB1在体外和体内促进口腔鳞状细胞癌的肿瘤生长和转移 | Oncogenic circDHTKD1 promotes tumor growth and metastasis of oral squamous cell carcinoma in vitro and in vivo via upregulating miR-326-mediated GAB1 | Braz J Med Biol Res. | 2.594 | 海南医学院第二附属医院等 |
37 | Hsa_circRNA_102682在与肌酐呈负相关的糖尿病高同型半胱氨酸血症中的低表达与TGF-β和CTGF相关 | Lower expression of Hsa_circRNA_102682 in diabetic hyperhomocysteinemia negatively related to creatinemia is associated with TGF-尾 and CTGF | J Clin Lab Anal. | 2.353 | 宁波大学医学院等 |
38 | 环状RNA circβ-catenin通过编码肽加重非小细胞肺癌的恶性表型 | Circular RNA circβ-catenin aggravates the malignant phenotype of non-small-cell lung cancer via encoding a peptide | J Clin Lab Anal. | 2.353 | 宁波大学医学院等 |