欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计31篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.肾脏疾病和癌症中的circRNAs
标题：Circular RNAs in kidney disease and cancer
杂志：Nature reviews | Nephrology
影响因子：28.313
通讯作者：Johan M Lorenzen（瑞士苏黎世大学附属医院肾内科）
CircRNAs是一类具有单链环状结构的内源性表达的调控核糖核酸。它们是通过反向剪接产生的，并且它们的表达可以被核糖核酸结合蛋白严格调节。细胞质环状核糖核酸可以作为抑制微小核糖核酸-靶相互作和蛋白质功能的分子海绵，或者作为通过滚环扩增有效产生肽的模板。它们还可以作为分子支架，增强酶-底物相互作用的反应动力学。在细胞核中，环状核糖核酸可能促进染色质修饰和促进基因表达。环状核糖核酸具有抗降解性，可以包装在细胞外囊泡中，在循环中运输。初步研究表明，circRNAs在肾脏疾病和相关心血管并发症中起作用。它们与高血压肾病、糖尿病肾病、肾小球疾病、急性肾损伤和肾脏同种异体移植排斥以及慢性肾病的微血管和大血管并发症(包括动脉粥样硬化性血管疾病)有关。此外，据报道，几种环状核糖核酸具有致癌或肿瘤抑制作用，或调节肾癌的耐药性。现有数据表明，circRNAs可能是肾脏疾病、心血管疾病和肾癌的有前途的诊断和/或预后生物标志物和潜在治疗靶点。
2.CircDIDO1通过编码一种新的DIDO1-529aa蛋白并调节PRDX2蛋白的稳定性来抑制胃癌进展
标题：CircDIDO1 inhibits gastric cancer progression by encoding a novel DIDO1-529aa protein and regulating PRDX2 protein stability
杂志：Mol Cancer
影响因子：27.401
通讯作者：张徐教授和许文荣教授（江苏大学医学院）
背景:circRNAs在癌症的发展和进展中发挥重要作用。本研究旨在鉴定胃癌(GC)中异常表达的circRNAs，揭示其在胃癌进展中的作用，为胃癌的诊断和治疗提供新的靶点。
方法:采用生物信息学方法鉴定hsa_circ_0061137 (circDIDO1)在胃癌中的异常表达。进行功能增加和功能丧失的研究，以检查circDIDO1在GC进展中的生物学作用。采用标记RNA亲和纯化、质谱、免疫荧光、共免疫沉淀和Western blot方法鉴定circRNAs相互作用和circRNAs编码的蛋白。通过RNA测序、qRT-PCR和Western blot分析circRNAs调控的下游靶基因和信号通路。采用小鼠肿瘤模型分析circDIDO1对胃癌生长和转移的影响。
结果：CircDIDO1转录自人DIDO1基因，由线性转录本2-6外显子反向剪接而成。circDIDO1在胃癌组织中下调，其低水平与肿瘤增大、远端转移和预后不良相关。CircDIDO1敲低可促进GC细胞增殖、迁移和侵袭，过表达则相反。CircDIDO1过表达抑制小鼠肿瘤模型中GC的生长和转移。如图1所示，机理上，circDIDO1编码一个新的529aa蛋白，该蛋白直接与PARP1相互作用并抑制其活性。CircDIDO1还特异性结合PRDX2，促进RBX1介导的PRDX2的泛素化和降解，导致其下游信号通路失活。
结论:CircDIDO1是一种新的circRNA，在胃癌中具有抑癌功能，可能成为胃癌的潜在预后生物标志物和治疗靶点。
图1
3.脑源circRNAs全长的纳米孔测序揭示了circRNAs特异的外显子使用、内含子保留和微外显子
标题：Nanopore sequencing of brain-derived full-length circRNAs reveals circRNA-specific exon usage, intron retention and microexons
杂志：Nat Commun
影响因子：14.919
通讯作者：Karim Rahimi 和Jørgen Kjems（丹麦奥尔胡斯大学）
circRNAs是一类共价连接的非编码核糖核酸，在多种细胞过程中发挥功能。它们的组成显示与线性mRNAs中发现的外显子的广泛重叠，使得很难使用短序列RNAs测序来描述它们的组成，特别是对于长序列和多外显子的circRNAs。如图2所示，作者使用circNick的长序列纳米孔测序(circNick-LRS)，分别表征了人类和小鼠大脑中总共18，266个和39，623个circRNAs。作者进一步开发了一种对circPanel进行靶向长序列测序的方法(circPanel-LRS)，消除了对先前circRNAs富集的需要，发现每个靶向位点平均有30个以上的环状核糖核酸亚型。作者的研究数据表明，circRNAs表现出大量的剪接，如优先出现在circRNAs中的新外显子、内含子保留和微剪接。作者提出，circRNAs中外显子使用的改变可能反映在没有翻译的情况下对无义衰退的抵抗。
图2
4.C9ORF72-ALS/FTD中环状重复内含子RNA的核输出和翻译
标题：Nuclear export and translation of circular repeat-containing intronic RNA in C9ORF72-ALS/FTD
杂志：Nat Commun
影响因子：14.919
通讯作者：Bin Wu和Shuying Sun（约翰霍普金斯大学）
C9ORF72基因的六核苷酸序列GGGGCC的重复序列是肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)最常见的遗传原因。该重复核苷酸序列通过核颗粒和重复序列相关的非AUG翻译产生的DPR蛋白介导毒性。然而，目前尚不清楚内含子如何定位重复序列被输出并翻译到细胞质中。作者使用单分子成像的方法来检查重复核苷酸序列的分子特征和空间动力学。如图3所示，证明了带有G-rich重复序列的剪接内含子由套索驱动环化而形成圆形。剪接的环状内含子代替前体mRNA作为翻译模板。NXF1-NXT1通路在环状内含子RNA的核输出和调节毒性DPR的产生过程中起着重要作用。本研究揭示了一种由重复序列介导的非特异性致病RNA，证明RNA空间定位对探究疾病病原学的重要性。
图3
文献列表
| 序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | 影响因子 | 单位 |
| 1 | 肾脏疾病和癌症中的circRNAs | Circular RNAs in kidney disease and cancer | Nat Rev Nephrol | 28.312 | 瑞士苏黎世大学附属医院肾内科 |
| 2 | CircDIDO1通过编码一种新的DIDO1-529aa蛋白并调节PRDX2蛋白的稳定性来抑制胃癌进展 | CircDIDO1 inhibits gastric cancer progression by encoding a novel DIDO1-529aa protein and regulating PRDX2 protein stability | Mol Cancer | 27.401 | 江苏大学医学院江苏省医学科学与检验医学重点实验室 |
| 3 | C9ORF72-ALS/FTD中环状重复内含子RNA的核输出和翻译 | Nuclear export and translation of circular repeat-containing intronic RNA in C9ORF72-ALS/FTD | Nat Commun | 14.919 | 约翰霍普金斯大学 |
| 4 | 脑源circRNAs全长的纳米孔测序揭示了circRNAs特异的外显子使用、内含子保留和微外显子 | Nanopore sequencing of brain-derived full-length circRNAs reveals circRNA-specific exon usage, intron retention and microexons | Nat Commun | 14.913 | 奥尔胡斯大学分子生物学和遗传学系 |
| 5 | 非编码RNAs与阿尔茨海默病发病机制的神经生物学的途径、机制和转化 | The neurobiology of non-coding RNAs and Alzheimer’s disease pathogenesis: Pathways, mechanisms and translational opportunities | Ageing Res Rev | 10.890 | 坦普尔大学刘易斯卡茨医学院阿尔茨海默氏症中心 |
| 6 | circASK1编码的一种新蛋白通过竞争性激活ASK1依赖的凋亡来改善肺腺癌中的吉非替尼耐药 | A novel protein encoded by circASK1 ameliorates gefitinib resistance in lung adenocarcinoma by competitively activating ASK1-dependent apoptosis | Cancer Lett | 8.670 | 同济大学医学院附属上海肺科医院胸外科 |
| 7 | 多发性硬化症:circRNA 谱揭示与b细胞功能的联系 | Multiple Sclerosis: circRNA Profile Defined Reveals Links to B-Cell Function | Neurol Neuroimmunol Neuroinflamm | 8.485 | 奥尔什丁瓦尔米亚玛祖里大学 |
| 8 | 在黑色素瘤中，环状RNA ZNF609通过调节miR-138-5p/SIRT7轴来驱动肿瘤进展 | Circular RNA ZNF609 drives tumor progression by regulating the miR-138-5p/SIRT7 axis in melanoma | Aging (Albany NY) | 5.682 | 四川省医学科学院四川省人民医院 |
| 9 | 外泌体来源的circRNAs作为胶质母细胞瘤的指纹 | Plasmatic exosome-derived circRNAs panel act as fingerprint for glioblastoma | Aging (Albany NY) | 5.680 | 海门市人民医院神经外科 |
| 10 | CircSMARCA5通过miR-181b-5p/miR-17-3p-TIMP3轴抑制前列腺癌的增殖、迁移和侵袭能力 | A circular RNA, circSMARCA5, inhibits prostate cancer proliferative, migrative, and invasive capabilities via the miR-181b-5p/miR-17-3p-TIMP3 axis | Aging (Albany NY) | 5.680 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院泌尿外科 |
| 11 | CircRNA的特征及其作为黑色素瘤诊断工具的方法 | Characteristics of CircRNA and its approach as diagnostic tool in melanoma | Expert Rev Mol Diagn | 5.221 | Department of Photodynamic, Medical Laser Research Center, Yara Institute |
| 12 | hsa_circ_0081343通过调控miR-210-5p/DLX3轴促进滋养层细胞迁移和侵袭，抑制滋养层细胞凋亡 | Circular RNA hsa_circ_0081343 promotes trophoblast cell migration and invasion and inhibits trophoblast apoptosis by regulating miR-210-5p/DLX3 axis | Reprod Biol Endocrinol | 5.212 | 南方医科大学南方医院 |
| 13 | CircTYW1作为microRNA-380的海绵，通过调节FGF9加速脊髓损伤后的神经恢复 | CircTYW1 serves as a sponge for microRNA-380 in accelerating neurological recovery following spinal cord injury via regulating FGF9 | Cell Cycle | 4.53 | 河南省洛阳市骨科医院 |
| 14 | CircTHBS1通过调控miR-139-5p/MFN2轴促进间质性膀胱炎的进展 | CircTHBS1 facilitates the progression of interstitial cystitis depending on the regulation of miR-139-5p/MFN2 axis | Drug Dev Res | 4.362 | 苏州大学第二附属医院泌尿外科 |
| 15 | Circ-ERBB2通过miR-136-5p/PDK4轴提高瓦伯格效应，促进三阴性乳腺癌生长 | CircRNA circ-ERBB2 elevates Warburg effect and facilitates triple-negative breast cancer growth by the miR-136-5p/PDK4 axis | Mol Cell Biol | 4.271 | 厦门大学附属福州第二医院 |
| 16 | 亚砷酸钠介导的circDHX34上调通过调控凋亡基因促进激素非依赖性乳腺癌细胞凋亡 | Sodium arsenite-mediated upregulation of circDHX34 promotes apoptosis in hormone-independent breast cancer cells by regulating apoptotic genes | Environ Sci Pollut Res Int | 4.22 | 昆明医科大学公共卫生学院 |
| 17 | CircTHBS1靶向miR-211/CCND2通路促进原发性腺性膀胱炎细胞增殖和迁移潜能 | Biosci Rep | Biosci Rep | 3.841 | 绵阳市中心医院泌尿科 |
| 18 | 综合分析circRNAs、miRNAs和mRNA，揭示其在OPLL 中对TGF-β和TNF-α信号通路的潜在作用 | The integrated analysis of circRNAs, miRNAs and mRNAs revealed the potential role in the TGF-β and TNF-α signaling pathways of OPLL | Mol Omics | 3.744 | 中山大学第五附属医院骨科 |
| 19 | circRNAs在神经发育和神经退行性疾病中的作用 | Role of circRNAs in neurodevelopment and neurodegenerative diseases | J Mol Neurosci | 3.441 | 温州医科大学基础医学院 |
| 20 | 胃癌细胞来源的外泌体可以通过诱导环状RNA circ_0004303的表达来调节间充质干细胞的生物学功能 | Gastric Cancer Cell-Derived Exosomes Can Regulate the Biological Functions of Mesenchymal Stem Cells by Inducing the Expression of Circular RNA circ_0004303 | Stem Cells Dev | 3.272 | 北京协和医学院基础医学院 |
| 21 | CircRNA_0043691海绵miR-873-3p促进胃癌转移 | CircRNA_0043691 sponges miR-873-3p to promote metastasis of gastric cancer | Mamm Genome | 2.95 | 浙江大学医学院绍兴医院 |
| 22 | Circ_0087862通过海绵吞噬miR-142-3p和上调BACH1表达促进结直肠癌的进展 | Circ_0087862 promotes the progression of colorectal cancer by sponging miR-142-3p and up-regulating BACH1 expression | Kaohsiung J Med Sci | 2.744 | 贵州省人民医院消化内科 |
| 23 | Circ_0011385通过竞争性结合miR-149-5p和上调SOX4表达促进宫颈癌进展 | Circular RNA circ_0011385 promotes cervical cancer progression through competitively binding to miR-149-5p and up-regulating SOX4 expression | Kaohsiung J Med Sci | 2.742 | 烟台毓璜顶医院 |
| 24 | Circ_KIAA1199通过靶向miR-34c-5p抑制MSI1降解，驱动结直肠癌恶性细胞行为和肿瘤生长 | Circ_KIAA1199 inhibits MSI1 degradation by targeting miR-34c-5p to drive the malignant cell behaviors and tumor growth of colorectal cancer | Anticancer Drugs | 2.248 | 聊城市人民医院普外科 |
| 25 | Circ_0085495基因敲低可通过miR-873-5p/整合素β1轴降低乳腺癌中的阿霉素耐药 | Circ_0085495 knockdown reduces adriamycin resistance in breast cancer through miR-873-5p/integrin β1 axis | Anticancer Drugs | 2.248 | 蚌埠医学院第一附属医院肿瘤科 |
| 26 | CircFOXM1沉默通过调节miR-515-5p/ADAM10轴抑制前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭 | CircFOXM1 silencing represses cell proliferation, migration and invasion by regulating miR-515-5p/ADAM10 axis in prostate cancer | Anticancer Drugs | 2.248 | 武汉第四医院泌尿外科 |
| 27 | 下调circ-SFMBT2通过靶向miR-885-3p/CHD7通路阻断胃癌的发生发展 | Downregulation of circ-SFMBT2 blocks the development of gastric cancer by targeting the miR-885-3p/CHD7 pathway | Anticancer Drugs | 2.248 | 兰州市第一人民医院肿瘤科 |
| 28 | Circ-RNF121通过调控miR-646/SOX4轴促进非小细胞肺癌细胞对顺铂(DDP)的耐药 | Circular RNA circ-RNF121 contributes to cisplatin (DDP) resistance of non-small-cell lung cancer cells by regulating the miR-646/SOX4 axis | Anticancer Drugs | 2.248 | 临沂市金锣医院肿瘤科 |
| 29 | irc_0008450通过miR-338-3p/SMAD5轴调控CDDP耐药鼻咽癌细胞的增殖、迁移、侵袭、凋亡和化疗敏感性 | Circular RNA circ_0008450 regulates the proliferation, migration, invasion, apoptosis and chemosensitivity of CDDP-resistant nasopharyngeal carcinoma cells by the miR-338-3p/SMAD5 axis | Anticancer Drugs | 2.248 | 荆州市第一人民医院耳鼻喉科 |
| 30 | Circ-CCT3通过调节miR-223-3p/BRD4轴促进多发性骨髓瘤中的硼替佐米耐药 | Circular RNA circ-CCT3 promotes bortezomib resistance in multiple myeloma via modulating miR-223-3p/BRD4 axis | Anticancer Drugs | 2.248 | 广州医科大学附属第一医院血液科 |
| 31 | hsa_circ_0002874在胃癌患者外周血中的表达及其诊断价值 | Diagnostic Value of Circular RNA hsa_circ_0002874 Expression in Peripheral Blood of Patients with Gastric Cancer | Lab Med | 1.525 | 南通大学附属医院 |