欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计28篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.Circ-EIF6 encodes EIF6-224aa to promote TNBC progression via stabilizing MYH9 and activating Wnt/beta-catenin pathway
标题:Circ-EIF6编码EIF6-224aa,通过稳定MYH9和激活Wnt/ β -catenin通路促进TNBC进展
杂志:Mol Ther
影响因子:11.450
通讯作者:杨其峰主任医师(山东大学齐鲁医院乳腺外科)
CircRNAs的蛋白编码能力是近年来研究的热点,但具有蛋白编码功能的circRNAs在三阴性乳腺癌(TNBC)中的表达及作用尚不明确。通过对比来自临床样本和细胞系的circRNA测序数据,作者发现一个称为circ-EIF6的circRNA,它在TNBC患者中预测了较差的预后,并与临床病理特征相关。在功能上,作者发现circ-EIF6促进TNBC细胞在体内和体外的增殖和转移。在机制上,作者发现circ-EIF6包含一个675 nt的ORF,来自ATG的-150 bp序列作为一个内部核糖体进入位点(IRES),这是5′-cap-非依赖的编码RNA翻译起始所必需的。Circ-EIF6编码一个名为EIF6-224aa的新肽段,该肽段负责Circ-EIF6的致癌作用。通过特异性抗体检测EIF6-224aa在TNBC细胞和组织中的内源性表达。此外,EIF6-224aa与乳腺癌致癌基因MYH9直接相互作用,通过抑制泛素-蛋白酶体途径进而激活Wnt/ β -catenin途径降低MYH9降解。作者的研究为具有蛋白质编码作用的circRNAs提供了新的见解,并支持circ-EIF6/EIF6-224aa作为TNBC患者的一种新的有前景的预后和治疗靶点。
2. circMRPS35促进肝癌的恶性进展和顺铂耐药
标题:circMRPS35 promotes malignant progression and cisplatin resistance in hepatocellular carcinoma
杂志:Mol Ther
影响因子:11.450
通讯作者:李向东教授(中国农业大学生物科学学院农业生物技术国家重点实验室)
肝细胞癌(HCC)是世界范围内癌症相关死亡的主要原因之一。环状RNAs (circRNAs)是一类新型的非编码RNA,已被报道参与多种恶性肿瘤的病因学。然而,circRNAs参与HCC发病的潜在细胞机制仍不清楚。在这里,作者通过分析从公共肿瘤数据库中鉴定了一个功能性RNA – hsa_circ_0000384 (circMRPS35),作者进一步鉴定circMRPS35在35对HCC患者中高表达。功能上,体外抑制Huh-7和HCC-LM3细胞中circMRPS35的表达,可抑制其增殖、迁移、侵袭、克隆形成和细胞周期,在体内也可抑制肿瘤生长。机制上,如图1所示,circMRPS35吞噬microRNA-148a-3p (miR-148a)调节Syntaxin 3 (STX3)的表达,它调节磷酸酶和紧张素同源物(PTEN)的泛素化和降解。出乎意料的是,作者检测到circMRPS35编码的肽(circMRPS35-168aa),该肽明显被化疗药物诱导,促进了肝癌患者的顺铂耐药。这些结果表明circMRPS35可能是HCC进展中的一种新的中介物,并提高了作为HCC诊断和预后的新生物标志物以及作为HCC患者新的治疗靶点的潜力。
图1
3. Circ-GALNT16通过增强hnRNPK的泛素化修饰抑制结直肠癌进展
标题:Circ-GALNT16 restrains colorectal cancer progression by enhancing the SUMOylation of hnRNPK
杂志:J Exp Clin Cancer Res
影响因子:11.161
通讯作者:孙跃明主任医师和Junwei Tang(南京医科大学第一附属医院普外科,南京医科大学第一临床医学院)
背景:最近的研究调查了circRNAs在多种癌症进展中作为重要调节因子的作用。然而,circRNAs的生物学功能及其调控结直肠癌进展的潜在机制仍不清楚。
方法:利用基因芯片和qRT-PCR鉴定一种新的环状核糖核酸(circ-GALNT16)。为了研究circ-GALNT16在结直肠癌中的作用,进行了一系列体外和体内表型实验。采用FISH、RNA pulldown试验、RIP试验、高通量测序、co-IP和 ChIP技术研究circ-GALNT16在结直肠癌进展中的分子机制。
结果:Circ-GALNT16在结直肠癌中表达下调,与预后不良呈负相关。Circ-GALN T16抑制体内外结直肠癌细胞的增殖和转移能力。从机制上讲,circ-GALNT16可以与异源核核糖核蛋白K (hnRNPK)的KH3结构域结合,促进了hnRNPK的糖基化。此外,circ-GALNT16可以通过促进hnRNPK的合成来促进hnRNPK-p53复合物的形成。RNA测序鉴定Serpine1在转录水平上是circ-GALNT16的靶基因。拯救分析显示,circ-GALNT16通过抑制由SENP2介导的hnRNPK去泛素化修饰,然后调节hnRNPK-p53转录复合物的序列特异性DNA结合能力,来调节Serpine1的表达。
结论:如图2所示,Circ-GALNT16通过调节SENP2介导的hnRNPK-p53转录复合物的序列特异性DNA结合能力来抑制Serpine1的表达,从而抑制结直肠癌的进展,并可能作为结直肠癌的生物标志物和治疗靶点。
图 2
4.hsa_circ_0003222通过海绵miR-527加速非小细胞肺癌的干性和进展
标题:hsa_circ_0003222 accelerates stemness and progression of non-small cell lung cancer by sponging miR-527
杂志:Cell Death Dis
影响因子:8.462
通讯作者:张雪艳主治医师,韩宝惠主任医师和聂伟(上海交通大学附属上海胸科医院肺科)
CircRNAs和肿瘤干细胞(CSCs)之间的关系尚不确定。作者研究了CSCs、circRNA (hsa_circ_0003222)和免疫抑制剂在非小细胞肺癌进展和治疗耐药性中的综合影响。通过构建肺干细胞细胞系(LCSCs;PC9和A549)。从功能上说,hsa_circ_0003222的体外作用通过细胞克隆以及Transwell等试验来确定。建立用于体内分析的肿瘤转移异种移植模型和原位模型。作者发现hsa_circ_0003222在非小细胞肺癌组织和骨髓间充质干细胞中高表达。较高水平的hsa_circ_0003222与非小细胞肺癌患者的分期、转移和生存率相关。降低hsa_circ_0003222水平抑制肿瘤细胞的增殖、迁移、侵袭、干细胞样特性和化学抗性。从机制上说,hsa_circ_0003222的沉默通过减轻miR-527的海绵效应下调PHF21B及其下游β-catenin的表达。此外,沉默hsa_circ_0003222可减轻非小细胞肺癌对基于抗程序性细胞死亡配体-1 (PD-L1)治疗的体内耐药性。文章数据证明hsa_circ_0003222在非小细胞肺癌细胞干细胞样特性中的重要作用。使用circRNAs结合PD-L1疗法可能会减轻非小细胞肺癌的发病率和进展。
文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | Circ-EIF6编码EIF6-224aa,通过稳定MYH9和激活Wnt/ β -catenin通路促进TNBC进展 | Circ-EIF6 encodes EIF6-224aa to promote TNBC progression via stabilizing MYH9 and activating Wnt/beta-catenin pathway | Mol Ther | 11.450 | 山东大学齐鲁医院乳腺外科 |
2 | circMRPS35促进肝癌的恶性进展和顺铂耐药 | circMRPS35 promotes malignant progression and cisplatin resistance in hepatocellular carcinoma | Mol Ther | 11.450 | 中国农业大学生物科学学院 |
3 | Circ-GALNT16通过增强hnRNPK的泛素化修饰抑制结直肠癌进展 | Circ-GALNT16 restrains colorectal cancer progression by enhancing the SUMOylation of hnRNPK | J Exp Clin Cancer Res | 11.161 | 南京医科大学第一附属医院普外科,南京医科大学第一临床医学院 |
4 | hsa_circ_0003222通过海绵miR-527加速非小细胞肺癌的干细胞和进展 | hsa_circ_0003222 accelerates stemness and progression of non-small cell lung cancer by sponging miR-527 | Cell Death Dis | 8.462 | 上海交通大学附属上海胸科医院肺科 |
5 | 通过整合序列和表观遗传特征构建circRNA表达模式,表明H3K79me2可能参与了circRNA表达(更改作者单位) | Modeling circRNA expression pattern with integrated sequence and epigenetic features demonstrates the potential involvement of H3K79me2 in circRNA expression(Published Erratum) | Bioinformatics | 6.932 | 西安交通大学生命科学与技术学院生物医学信息工程教育部重点实验室,生物医学信息与基因组学中心 |
6 | 环状RNAs在角化细胞癌中的作用 | The Role of Circular RNAs in Keratinocyte Carcinomas | Cancers (Basel) | 6.633 | 鲁尔大学圣约瑟夫医院皮肤科 |
7 | circRNAs及其在癌症中的调控作用 | CircRNAs and their regulatory roles in cancers | Mol Med | 6.354 | 南通大学附属医院检验科 |
8 | 通过RNase H1连接环状内含子RNA的降解和转录功能之间的关系 | Linking circular intronic RNA degradation and function in transcription by RNase H1 | Sci China Life Sci | 6.034 | 中国科学院大学杭州高等研究院生命科学学院 |
9 | 胶质瘤中参与STAT3通路的非编码RNAs | Noncoding RNAs involved in the STAT3 pathway in glioma | Cancer Cell Int | 5.722 | 南京医科大学无锡市人民医院神经外科 |
10 | Circ_RPPH1介导miR-146b-3p/E2F2通路抑制乳腺癌细胞生长和转移 | Mediation of circ_RPPH1 on miR-146b-3p/E2F2 pathway to hinder the growth and metastasis of breast carcinoma cells | Aging (Albany NY) | 5.683 | 山东第一医科大学附属第一医院 |
11 | 环状RNA 0025984通过miR-143-3p/TET1/ORP150通路改善缺血性中风损伤并保护星形胶质细胞 | Circular RNA 0025984 Ameliorates Ischemic Stroke Injury and Protects Astrocytes Through miR-143-3p/TET1/ORP150 Pathway | Mol Neurobiol | 5.592 | 南昌大学第一附属医院神经外科,首都医科大学附属北京天坛医院神经外科 |
12 | 环状RNA HECTD1通过miR-182-5p/HuR轴促进肠细胞自噬,减轻溃疡性结肠炎 | Circular RNA HECTD1 Mitigates Ulcerative Colitis by Promoting Enterocyte Autophagy Via miR-182-5p/HuR Axis | Inflamm Bowel Dis | 5.323 | 中南大学湘雅医院肿瘤科 |
13 | circRNA的特征及其作为黑色素瘤诊断工具的方法 | Characteristics of circRNA and its approach as diagnostic tool in melanoma | Expert Rev Mol Diagn | 5.222 | 伊朗德黑兰ACECR, Yara Institute医学激光研究中心光动力系 |
14 | Hsa_circ_0040809通过靶向miR-515-5p上调甲基转移酶DNMT1调控大肠癌的发展 | Hsa_circ_0040809 regulates colorectal cancer development by up-regulating methyltransferase DNMT1 via targeting miR-515-5p | J Gene Med | 4.561 | 安徽省芜湖市皖南医学院第一附属医院义积山医院病理科 |
15 | 撤回声明:心房颤动中circRNA-miRNA调控网络的综合分析 | Retraction Note: Integrative analysis of the circRNA-miRNA regulatory network in atrial fibrillation(Published Erratum) | Sci Rep | 4.373 | 江苏省泰州市人民医院心内科 |
16 | 紫花苜蓿(Medicago sativa L.)干旱和盐胁迫主基因和调控网络的泛转录组鉴定 | Pan-transcriptome identifying master genes and regulation network in response to drought and salt stresses in Alfalfa (Medicago sativa L.) | Sci Rep | 4.372 | 美国农业部-农业研究处 |
17 | 茶斑病菌侵染茶叶内源竞争性RNAs的序列与综合分析 | The Sequence and Integrated Analysis of Competing Endogenous RNAs Originating from Tea Leaves Infected by the Pathogen of Tea Leaf Spot, Didymella segeticola | Plant Dis | 4.343 | 贵州大学 |
18 | 外显子环状RNAs通过与相应的线性RNAs协同作用参与拟南芥对细菌和真菌病原体的免疫应答 | Exonic circular RNAs are involved in Arabidopsis immune response against bacterial and fungal pathogens by function synergistically with corresponding linear RNAs | Phytopathology | 4.021 | 南京农业大学植物保护学院植物病理学系 |
19 | CircTHBS1靶向miR-211/CCND2通路促进原发性腺性膀胱炎细胞增殖和迁移潜能 | CircTHBS1 targeting miR-211/CCND2 pathway to promote cell proliferation and migration potential in primary cystitis glandularis cells | Biosci Rep | 3.841 | 绵阳市中心医院泌尿科 |
20 | 异丙酚通过circ-PABPN1/miR-638/SRSF1轴抑制结直肠癌的发展 | Propofol suppresses colorectal cancer development by the circ-PABPN1/miR-638/SRSF1 axis | Anal Biochem | 3.362 | 东营市人民医院麻醉科 |
21 | Hsa_circ_0001020作为胃癌筛查和预后的潜在生物标志物 | Hsa_circ_0001020 Serves as a Potential Biomarker for Gastric Cancer Screening and Prognosis | Dig Dis Sci | 3.19 | 宁波大学医学院附属医院消化内科 |
22 | Circ_FBLN1通过调节let-7i-5p/FZD4轴和Wnt/β-catenin通路促进人骨髓间充质干细胞增殖和成骨分化 | Circ_FBLN1 promotes the proliferation and osteogenic differentiation of human bone marrow-derived mesenchymal stem cells by regulating let-7i-5p/FZD4 axis and Wnt/β-catenin pathway | J Bioenerg Biomembr | 2.943 | 北京中医药大学第四医院骨科 |
23 | Circ_RASGEF1B通过靶向MicroRNA-146a-5p/Pdk1轴促进脓毒症急性肾损伤细胞模型中LPS诱导的凋亡和炎症反应 | Circ_RASGEF1B Promotes LPS-Induced Apoptosis and Inflammatory Response by Targeting MicroRNA-146a-5p/Pdk1 Axis in Septic Acute Kidney Injury Cell Model | Nephron | 2.841 | 山西省人民医院重症监护室 |
24 | 糖尿病创面愈合中的非编码RNAs和RNA结合蛋白 | Noncoding RNAs and RNA-binding proteins in diabetic wound healing | Bioorg Med Chem Lett | 2.824 | 沈阳药科大学中药学院 |
25 | Circ-Sirt1抑制人类风湿性关节炎成纤维细胞样滑膜细胞增殖,诱导凋亡,并改善炎症 | Circ-Sirt1 inhibits proliferation, induces apoptosis, and ameliorates inflammation in human rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes | Autoimmunity | 2.814 | 临沂市兰陵县人民医院关节外科 |
26 | 氧化应激诱导的仔猪肠道circRNAs表达谱特征 | Characteristics of circRNAs expression profiles in the piglets intestine induced by oxidative stress | Genes Genomics | 1.834 | 山东农业大学动物科技学院 |
27 | CircRNA (circ_0008057)通过miR-370/PLk1信号通路促进尿毒症血清介导的血管平滑肌细胞增殖和迁移 | CircRNA (circ_0008057) promotes uremic serum-mediated proliferation and migration of vascular smooth muscle cells via miR-370/PLk1 signaling pathway | J Biol Regul Homeost Agents | 1.712 | 东营胜利医院 |
28 | circRNA介导的竞争性内源RNA网络在膀胱尿路上皮癌发展中的鉴定 | Identification of circRNA-mediated competing endogenous RNA network in the development of bladder urothelial carcinoma | J Biol Regul Homeost Agents | 1.712 | 浙江大学医学院邵逸夫爵士医院肿瘤内科 |