欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计18篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.环状RNAs帽独立的翻译蛋白及其在癌症中的作用
标题:Circular RNAs’ cap-independent translation protein and its roles in carcinomas
杂志:Mol Cancer
影响因子:27.400
通讯作者:王晓燕主任医师(南京医科大学附属宿迁市第一人民医院消化内科)和范钰主任医师(江苏大学附属人民医院肿瘤研究所)
背景:环状RNAs是一种共价闭合的RNA,在真核生物中广泛表达。CircRNA参与多种生理和病理过程,但其调控机制尚未完全阐明。如图1所示,随着RNA二代测序技术的发展和算法的改进,一些CircRNA被发现通过帽子非依赖机制编码蛋白质,并参与肿瘤发生和发展的重要过程。本文在综述CircRNAs的基础上,综述了其翻译机制和研究方法,并对近年来CircRNAs翻译在肿瘤学领域的研究进展进行了综述。此外,本文旨在通过CircRNAs的翻译为肿瘤的诊断和治疗提供新的思路。
图1
2.circHMGCS1–016通过分泌miR-1236-3p来调节肝内胆管癌中CD73和GAL-8的表达,从而重塑免疫环境
标题:circHMGCS1–016 reshapes immune environment by sponging miR-1236-3p to
regulate CD73 and GAL-8 expression in intrahepatic cholangiocarcinoma
杂志:J Exp Clin Cancer Res
影响因子:11.163
通讯作者:柏斗胜主任医师(扬州大学附属医院苏北人民医院),黄晓勇主治医师(复旦大学中山医院)和郭传勇教授(同济大学医学院附属上海市第十人民医院)
背景:越来越多的证据表明,CircRNAs可能是几种人类癌症进展中的重要调节因子,但CircRNAs在肝内胆管癌(ICC)中的作用和机制尚不清楚。
方法:RNA-seq用于评估4个ICC和肿瘤周围组织中差异表达的CircRNAs。定量RT-PCR和原位杂交用于确定circHMGCS1–016在ICC组织中的表达。通过体内实验进一步确定circHMGCS1–016的功能和机制。通过回顾性研究分析circHMGCS1–016的临床特征和预后意义。通过修改ICC细胞中的circRNA表达来评估circHMGCS1–016的功能。此外,通过circRNA沉淀、miRNA免疫沉淀、SILAC和荧光素酶报告分析探讨了ICC细胞中circHMGCS1–016的分子机制。
结果:作者通过RNA-seq鉴定出与癌周组织相比,ICC组织表达hsa_circ_0008621(circHMGCS1–016)高,并通过qRT-PCR和原位杂交进一步鉴定。此外,circHMGCS1–016的表达与ICC患者的生存和复发相关。通过调节circHMGCS1–016的表达,作者发现升高的circHMGCS1–016在体外和体内都促进了ICC的发育。通过SILAC和circRNA-pull down,作者证明circHMGCS1–016通过miR-1236-3p/CD73和GAL-8轴诱导ICC细胞侵袭并重塑肿瘤免疫微环境。在ICC组织中,作者发现高水平的circHMGCS1–016与CD73和GAL-8表达呈正相关,与CD8 T细胞浸润呈负相关,通过建立人源化小鼠肿瘤模型进一步验证了这一点。重要的是,作者发现肿瘤组织中circHMGCS1–016水平高的ICC患者与低水平circHMGCS1–016的ICC患者相比,从抗PD1治疗中获益较少。
结论:CircHMGCS1–016通过miR-12363p/CD73和GAL-8轴在ICC的发展和免疫耐受中起着重要作用。CircHMGCS1–016可作为PD1耐药ICC的一个新的潜在生物标记物和治疗靶点。
3.硫化氢暴露通过circRNA-17828/miR-6631-5p/DUSP6串扰对ROS产生的调节作用,诱导肉鸡气管焦亡
标题:Hydrogen sulfide exposure induces pyroptosis in the trachea of broilers via the regulatory effect of circRNA-17828/miR-6631-5p/DUSP6 crosstalk on ROS production
杂志:J Hazard Mater
影响因子:10.581
通讯作者:李术教授和徐世文教授(东北农业大学动物医学院)
硫化氢(H2S)是一种可导致气管损伤的空气污染物。焦亡通过活性氧(ROS)的产生导致组织损伤。竞争性内源性RNAs(ceRNAs)螯合microRNA,降低其对其他转录本的抑制作用,从而影响ROS水平和焦亡。然而,H2S如何通过ceRNA轴调控焦亡尚不清楚。如图2所示,作者建立了42天H2S暴露的肉鸡模型,通过免疫组化和RNA测序来评估其焦亡程度,并获得ceRNA网络。作者检测了H2S诱导的焦体病,并通过双荧光素酶报告基因检测验证了circRNA-IGLL1-17828/miR-6631-5p/DUSP6轴。作者还检测了ROS水平和(Caspase1) Casp-1、白介素1β (IL-1β)和白介素1β (IL-18)等自燃指标的表达。miR-6631-5p敲低可降低H2S诱导的焦亡指标。过表达miR-6631-5p或DUSP6敲低可刺激ROS的产生并上调焦亡指标。N -乙酰-L-半胱氨酸(NAC)可降低miR-6631-5p诱导的焦灭指标和ROS水平。circRNA-IGLL1-17828作为DUSP6的ceRNA参与了分子间竞争。综上所述,circRNA-IGLL1-17828/miR-6631-5p/DUSP6串音通过产生ROS调控h2s诱导的肉鸡气管焦亡。这是首次揭示circRNAs相关ceRNAs对H2S诱导的焦亡的调控机制,为环境毒理学提供重要参考。
图 2
文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | IF | 单位 |
1 | 环状RNA的帽独立的翻译蛋白及其在癌症中的作用 | Circular RNAs’ cap-independent translation protein and its roles in carcinomas | Mol Cancer | 27.402 | 江苏大学附属人民医院,南京医科大学附属宿迁市第一人民医院 |
2 | circHMGCS1-016通过海绵吞噬miR-1236-3p来重塑免疫环境,调节肝内胆管癌中CD73和GAL-8的表达 | circHMGCS1-016 reshapes immune environment by sponging miR-1236-3p to regulate CD73 and GAL-8 expression in intrahepatic cholangiocarcinoma | J Exp Clin Cancer Res | 11.163 | 扬州大学附属医院苏北人民医院,同济大学医学院附属上海市第十人民医院 |
3 | 硫化氢暴露通过circRNA-17828/miR-6631-5p/DUSP6串扰对ROS产生的调节作用,诱导肉鸡气管焦亡 | Hydrogen sulfide exposure induces pyroptosis in the trachea of broilers via the regulatory effect of circRNA-17828/miR-6631-5p/DUSP6 crosstalk on ROS production | J Hazard Mater | 10.583 | 东北农业大学动物医学院 |
4 | CircRNA_0026344通过miR-21参与了卷烟诱导肺气肿肺泡上皮细胞的自噬和凋亡 | CircRNA_0026344 via miR-21 is involved in cigarette smoke-induced autophagy and apoptosis of alveolar epithelial cells in emphysema | Cell Biol Toxicol | 6.692 | 南京医科大学 |
5 | 外泌体circRNAs:大肠癌的新参与者 | Exosomal circRNAs: new players in colorectal cancer | Cancer Cell Int | 5.720 | 德黑兰医科大学药学院纳米技术研究中心 |
6 | 环状RNA ZNF609通过miR-378b/SLC2A1轴促进胶质瘤进展过程中的增殖和糖酵解 | Circular RNA ZNF609 enhances proliferation and glycolysis during glioma progression by miR-378b/SLC2A1 axis | Aging (Albany NY) | 5.684 | 沧州市中心医院神经外科 |
7 | 用于治疗性生物分子可控递送的多糖基水凝胶的研究进展 | Recent Progress on Polysaccharide-Based Hydrogels for Controlled Delivery of Therapeutic Biomolecules | ACS Biomater Sci Eng | 4.742 | Department of Chemistry, CICECO-Aveiro Institute of Materials, University of Aveiro 3810-193 Aveiro, Portugal |
8 | 赤霉病菌在我国引起白芨叶斑病的首次报道 | First Report of Fusarium commune Causing Leaf Spot Disease on Bletilla striata in China | lant Dis | 4.430 | 广西民族大学 |
9 | Circ_CARM1通过调节抗苯并[a]芘-反式-7,8-二氢二醇-9,10-环氧化转化16HBE细胞中的CTNNBIP1来控制细胞迁移 | The Circ_CARM1 controls cell migration by regulating CTNNBIP1 in anti-benzo[a]pyrene-trans-7,8-dihydrodiol-9,10-epoxide-transformed 16HBE cells | Toxicol Lett | 4.371 | 广州医科大学化学致癌研究所 |
10 | CircSOS2通过靶向miR-543/FNDC3B轴调控增殖、细胞周期、凋亡、迁移、侵袭、糖酵解等,促进宫颈鳞癌的发生 | CircSOS2 promotes cervical squamous cell carcinoma by regulation of proliferation, cell cycle, apoptosis, migration, invasion, and glycolysis by targeting miR-543/FNDC3B axis | Arch Biochem Biophys | 4.010 | 威海中心医院妇产科 |
11 | 通过miR-361-3p/ABCC1轴鉴定circ_0058357在顺铂耐药的非小细胞肺癌细胞中作为调控因子 | Identification of circ_0058357 as a regulator in non-small cell lung cancer cells resistant to cisplatin by miR-361-3p/ABCC1 axis | Thorac Cancer | 3.500 | 郑州大学第一附属医院呼吸内科 |
12 | CircTUBGCP3与直肠癌的恶性进展有关 | CircTUBGCP3 Contributes to the Malignant Progression of Rectal Cancer | Dig Dis Sci | 3.192 | 天津大学医学工程与转化医学研究院 |
13 | 鸟嘌呤的长束驱动精胺存在下RNA G -四丛的聚集 | Long Tracts of Guanines Drive Aggregation of RNA G-Quadruplexes in the Presence of Spermine | Biochemistry | 3.163 | 宾夕法尼亚州立大学 |
14 | CircRNA MFACR在心肌梗死中上调,下调miR-125b,促进缺氧诱导的心肌细胞凋亡 | CircRNA MFACR is upregulated in myocardial infarction and downregulates miR-125b to promote cardiomyocyte apoptosis induced by hypoxia | J Cardiovasc Pharmacol | 3.101 | 宝鸡市第三人民医院心血管内科 |
15 | 血浆环状RNA hsa_circ_0001821是一种新的恶性肿瘤诊断生物标志物 | Plasma circular RNA hsa_circ_0001821 acts as a novel diagnostic biomarker for malignant tumors | J Clin Lab Anal | 2.353 | 宁波大学附属人民医院 |
16 | 法洛四联症中circRNA相关的ceRNA调控网络的构建和研究 | Construction and investigation of a circRNA-associated ceRNA regulatory network in Tetralogy of Fallot | BMC Cardiovasc Disord | 2.290 | 福建医科大学 |
17 | 硫化砷通过调控circRNA_ASAP2/Wnt/β-catenin通路抑制胃癌进展 | Arsenic sulfide inhibits the progression of gastric cancer through regulating the circRNA_ASAP2/Wnt/β-catenin pathway | Anticancer Drugs | 2.240 | 陆军医科大学西南医院药剂科,陆军医科大学新桥医院肾内科 |
18 | 利用总RNA-seq数据构建转录调控网络 | Construction of transcriptional regulatory networks using total RNA-seq data | STAR Protoc | Not Found | 汉诺威医学院 |