欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计39篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

1、环状RNA circIPO11通过Hedgehog信号传导驱动肝癌起始细胞自我更新

标题:Circular RNA circIPO11 drives self-renewal of liver cancer initiating cells via Hedgehog signaling

杂志:Mol Cancer

影响因子:27.401

通讯作者:范祖森教授,田勇教授和王艳英(中国科学院大学)

背景:肝细胞癌(HCC)因其高复发率和异质性而成为世界上最难治的肿瘤之一。肝癌起始细胞也称为肿瘤干细胞(CSCs),在抵抗典型治疗和高肿瘤起始潜能方面起着关键作用。然而,新的环状RNA(circRNA)circIPO11在维持肝癌起始细胞中的作用仍不清楚。

方法:用circRNA芯片从3例原发性肝癌标本中鉴定出在人和小鼠中高度保守的circRNA。通过Northern杂交、限制稀释异种移植分析、RNA纯化PCR分析(CHIP)分离染色质和HCC患者源性肿瘤细胞(PDC)模型进一步评估circIPO11的表达和功能。通过CRISPR/Cas9技术产生CircIpo11敲除(KO)小鼠。

结果:CircIPO11在肝癌组织和肝干细胞中高表达。CircIPO11是肝脏CSCs自我更新维持所必需的,以启动HCC的发展。如图1所示,通过NPdock网站预测自由能发现circIPO11和TOP1之间存在很强的作用关系。在机制上,circIPO11将TOP1招募到GLI1启动子以触发其转录,从而激活Hedgehog信号。此外,GLI1在肝癌组织和肝干细胞中也高表达,TOP1表达水平与肝癌患者的转移、复发和生存率呈正相关。此外,小鼠中的circIPO11基因敲除可抑制化学诱导的肝癌进展。

结论:我们的研究结果显示,circIPO11通过激活Hedgehog信号通路,驱动肝脏CSCs的自我更新,促进HCC的增殖。抗circIPO11的反义寡核苷酸(ASOs)与TOP1抑制剂喜树碱(CPT)联合发挥协同抗肿瘤作用。因此,circIPO11和Hedgehog信号通路可能为肝癌患者的治疗提供新的潜在靶点。

图 1

2、非编码RNAs将癌症中的代谢重编程与免疫微环境联系起来

标题:Noncoding RNAs link metabolic reprogramming to immune microenvironment in cancers

杂志:J Hematol Oncol

影响因子:17.388

通讯作者:林辉主任医师,梁岳龙副主任医师和Xiaoxiao Fan(浙江大学医学院邵逸夫医院普外科)

肿瘤细胞代谢模式的改变不仅满足自身的生长需求,而且通过多种机制形成免疫抑制微环境。如图2所示,非编码RNAs约占人类细胞转录输出的60%,并已被证明在发育和病理条件下调节许多细胞过程。考虑到基于基序识别模式的广泛作用机制,非编码RNAs可能作为连接代谢活动和免疫反应的枢纽。事实上,最近的研究表明,microRNAs、长非编码RNAs和circRNAs广泛参与肿瘤代谢重组、免疫细胞浸润和功能。因此,我们总结了非编码RNAs在肿瘤代谢和免疫微环境重塑中的作用的现有知识,特别是我们建立了TIMELnc手册,这是一本免费的公共手册,供研究人员基于生物信息学方法识别与肿瘤代谢和免疫细胞浸润同时相关的关键lncRNAs。

图 2

3、小环状干扰RNAs (sciRNAs)作为基因沉默的有效治疗平台

标题:Small circular interfering RNAs (sciRNAs) as a potent therapeutic platform for gene-silencing

杂志:Nucleic Acids Res

影响因子:16.973

通讯作者: Muthiah Manoharan, Ivan Zlatev(Alnylam Pharmaceuticals, Inc., Cambridge,)

为了通过RNA干扰(RNAi)途径实现有效的治疗性转录后基因沉默,小干扰RNAs (siRNAs)必须经过化学修饰。一些具有在代谢上稳定siRNAs潜力的超RNA结构已被评估其诱导基因沉默的能力,但所有这些结构都有局限性或尚未在治疗相关的背景下进行探索。共价闭合环状RNA转录本普遍存在于真核生物中,有潜力作为生物标志物和疾病靶点,环状RNA模拟物正在被探索用于治疗。本文报道了小环状干扰RNAs (sciRNAs)的合成和评估。为了合成sciRNAs,将三价n -乙酰半乳糖胺(GalNAc)配体功能化并使用“点击”化学环化的sense链退火成反义链。这一策略用于小环的合成,但也可以用于合成更大的环状RNA模拟物。我们在体内和体外评估了各种sciRNA设计。我们观察到在循环和脱靶效应被消除后,感觉链的代谢稳定性得到了改善。反义链的5 ‘ -(E)-乙烯基膦酸酯修饰导致GalNAc – sciRNAs在治疗相关剂量的体内有效。物理化学研究和基于核磁共振的结构分析,以及分子建模研究,阐明了这类具有部分双工特征的新型siRNAs与RNAi机制的相互作用。

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