欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计30篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

 

 

1.EWSR1诱导的circNEIL3通过稳定IGF2BP3促进胶质瘤进展和外泌体介导的巨噬细胞免疫抑制极化

标题:EWSR1-induced circNEIL3 promotes glioma progression and exosome-mediated macrophage immunosuppressive polarization via stabilizing IGF2BP3

杂志:Mol Cancer

影响因子:27.401

通讯作者:李刚主任医师(山东大学齐鲁医院神经外科 )

背景:胶质瘤是最常见的原发性恶性脑肿瘤,具有高度免疫抑制的肿瘤微环境(TME),预后差。环状RNAs (Circular RNAs, circRNAs)是一种新发现的内源性非编码RNAs,具有高稳定性、丰度、保存性等特点,在各种肿瘤的病理生理过程和TME重构中发挥重要作用。

方法:通过CircRNA测序分析,探讨正常和胶质瘤组织中CircRNA的表达谱。一种新的环状RNA,即circNEIL3,在体外和体内均证实了其在胶质瘤发展中的生物学功能。机制上,进行了RNA下拉、质谱、RNA免疫沉淀(RIP)、荧光素酶报告和共免疫沉淀分析。

结果:作者发现circNEIL3可被EWS RNA结合蛋白1(EWSR1)环化,在胶质瘤组织中表达上调,并与胶质瘤恶性进展呈正相关。在功能上,作者证实了circNEIL3在体外和体内促进胶质瘤的肿瘤发生和致癌进展。在机制上,circNEIL3通过防止hector 4介导的泛素化,稳定IGF2BP3(胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白3)蛋白,这是一种已知的致癌蛋白。此外,circNEIL3过表达胶质瘤细胞驱动巨噬细胞浸润肿瘤微环境(TME)。最后,circNEIL3被hnRNPA2B1包装到外质体中,并传递到浸润性肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),使其通过稳定IGF2BP3而获得免疫抑制特性,进而促进胶质瘤进展。

结论:本研究揭示了circNEIL3在促进胶质瘤发生、恶性进展和巨噬细胞促肿瘤表型极化方面发挥不可忽视的多方面作用,提示circNEIL3是胶质瘤潜在的预后生物标志物和治疗靶点。

 

circNEIL3在胶质瘤发生和恶性进展中的作用机制

 

2. 通过碱基编辑环状外显子的反向剪接位点敲除环状RNA

标题:Knockout of circRNAs by base editing back-splice sites of circularized exons

杂志:Genome Biol

影响因子:13.583

通讯作者:杨力研究员(中国科学院上海营养与健康研究所)

许多环状RNAs(circRNAs)是由前体mRNA外显子的反向剪接产生的,通常与同源线性RNA共表达。目前缺乏circRNA特异性敲除的方法,这主要是由于基因型之间的序列重叠。在这里,作者使用碱基编辑器(BEs)来完成环状RNA的敲低。通过靶向参与反向剪接和规范剪接的剪接位点,BEs可以抑制环状和线性RNA。BEs主要针对环状RNA的生物生成,能够有效抑制环状RNA的产生,但不能抑制线性RNA的产生。由于数百个外显子主要是反向剪接产生环状RNA,这为功能研究中消耗环状RNA提供了一种有效的方法。

BE介导的反向剪接位点突变的circRNA敲除示意图

 

3. Circ_0000658基因下调可通过miR -498诱导HMGA2下调抑制膀胱癌中上皮-间质转化

标题:Circ_0000658 knockdown inhibits epithelial-mesenchymal transition in bladder cancer via miR-498-induced HMGA2 downregulation

杂志:J Exp Clin Cancer Res

影响因子:11.161

通讯作者:赵晓俊副主任医师和Yuxin Lin (苏州大学第一附属医院泌尿外科)

背景:上皮间充质转化(Epithelial-mesenchymal transition, EMT)与包括膀胱癌(膀胱癌,BCa)在内的多种恶性肿瘤的血管生成和致癌表型有关。环状RNAs (circRNAs)被认为是EMT的关键调控因子。本研究旨在阐明环状RNA_0000658 (circ_0000658)在BCa中可能的作用及其分子机制。

方法:检测circ_0000658、microRNA (miR)-498、高迁移率组AT-hook 2 (HMGA2)在BCa患者癌旁组织及人BCa细胞系(MGH-U3、T24、5637和SW780)中的表达。用一系列过表达质粒或shRNA质粒转导BCa细胞,明确circ_0000658和miR-498对BCa细胞的致瘤表型和EMT的作用。进一步,作者建立了BCa细胞异种移植裸鼠,验证了circ_0000658在体内对肿瘤生长的作用。

结果:Circ_0000658在BCa组织标本和细胞系中高表达,提示BCa患者预后不良。Circ_0000658竞争性地与miR-498结合,从而抑制miR-498的表达。同时,circ_0000658减弱miR-498与靶基因HMGA2的结合,上调HMGA2的表达。Circ_0000658的升高或miR-498的下调增强了BCa细胞的致癌表型和EMT,相应的β-catenin和E-cadherin的表达降低,N-cadherin、Slug、Snail、ZEB1和Twist的表达增加。抑制HMGA2可逆转circ_0000658过表达对体内肿瘤生长的影响。

结论:作者的研究揭示了circ_0000658通过miR-498/HMGA2轴在BCa中的促肿瘤作用。

BCa中circ_0000658的调控网络和功能机制图

 

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