欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计41篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1.外泌体circLPAR1通过METTL3-eIF3h相互作用抑制BRD4,从而在结直肠癌诊断和肿瘤发生中发挥作用
标题:Exosomal circLPAR1 functions in colorectal cancer diagnosis and tumorigenesis through suppressing BRD4 via METTL3–eIF3h interaction
杂志:Mol Cancer
影响因子:27.401
通讯作者:王美林教授,杜牧龙副教授和刘凌翔副主任医师(南京医科大学)
背景:外泌体已成为多种癌症的重要生物标志物,并含有丰富的环状RNAs (circRNAs)。然而,外泌体环状RNAs用于诊断的潜力及其在结直肠癌(CRC)中的分子作用机制仍不清楚。
方法:CRC特异性外泌体环状RNA通过RNA测序、exoRBase数据库和组织芯片鉴定。在无癌对照组、癌前个体、CRC患者和其他类型癌症患者中评估血浆外泌体环状RNAs的诊断性能。相应的生物学功能主要通过circRNA下拉、蛋白质组学分析和RNA免疫沉淀等方法进行评估。
结果:CircLPAR1包裹在外泌体中,具有很高的稳定性和可检测性,其在血浆外泌体中的表达在CRC发展过程中显著降低,但在术后恢复。Exosomal circLPAR1结合常见的临床生物标志物CEA和CA19-9分析其表现,在CRC诊断中表现出癌特异性,并将其诊断效能提高到受试者工作特征曲线下的面积0.875。此外,circLPAR1在CRC组织中下调,并与总生存率相关。机制上,外泌体circLPAR1被CRC细胞内化,并抑制肿瘤生长,这可能是因为直接与eIF3h结合的外泌体circLPAR1特异性抑制了METTL3-eIF3h的相互作用,减少了癌基因BRD4的翻译。
结论:这项全面的研究强调血浆外泌体circLPAR1在CRC诊断中是一个有前途的预测因子,并描述了其在结直肠肿瘤发生中的生物学调节。本研究为临床早期诊断和疾病发展的发病机制提供了新的视角。
外泌体circLPAR1抑制结直肠癌机制
2. METTL14介导的circORC5的m6A修饰通过调节miR-30c-2-3p/AKT1S1轴抑制胃癌进展
标题:METTL14-mediated m6A modification of circORC5 suppresses gastric cancer progression by regulating miR-30c-2-3p/AKT1S1 axis
杂志:Mol Cancer
影响因子:27.401
通讯作者:张靖副主任医师和朱金水主任医师(上海交通大学附属第六人民医院消化内科)
背景:N6-methyladenosine (m6A) RNA甲基化和环状RNA (circRNAs)已被证明在包括胃癌(GC)在内的多种恶性肿瘤中发挥重要作用。然而,关于circRNAs的m6A修饰如何促进GC进展的知识很少。
方法:采用Western blot、免疫组化和公开数据集分析METTL14表达与胃癌患者临床病理特征及预后的关系。通过体外和体内功能实验研究METTL14在胃癌中的作用。此外,利用m6A-circRNAs转录组芯片鉴定mettl14介导的环状RNA的m6A修饰,并通过甲基化RNA免疫沉淀(Me-RIP)、RT-qPCR和GC细胞拯救实验进行验证。miR-30c-2-3p的circORC5海绵经荧光素酶基因报告和RNA免疫沉淀实验证实。利用荧光原位杂交技术评价circORC5在胃癌中的表达、定位及预后。通过RT-qPCR和Western blot检测METTL14和(或)circORC5对miR -30c-2-3p介导的AKT1S1和EIF4B的影响。
结果:作者发现METTL14在胃癌组织样本中表达下调,其低表达可作为胃癌患者生存不良的预后因素。体外和体内METTL14的异位表达显著抑制GC细胞的生长和侵袭,而下调METTL14则具有相反的作用。机制上,m6A-circRNA转录组芯片和Me-RIP鉴定出circORC5为METTL14的下游靶点。METTL14的沉默降低了circORC5的m6A水平,但增加了circORC5的表达。此外,circORC5可以海绵吸棉miR-30c-2-3p,逆转METTL14引起的miR-30c-2-3p上调和AKT1S1、EIF4B下调。此外,circORC5与miR-30c-2-3p呈负相关,表明在GC中生存较差。
结论:研究结果表明,METTL14介导的circORC5的m6A修饰通过调节miR-30c-2-3p/AKT1S1轴抑制胃癌进展。
GC中METTL14调控circORC5的作用机制
3. 食道鳞状细胞癌细胞核基因组来源的环状RNA circPUM1定位于线粒体并调节氧化磷酸化
标题:Nuclear genome-derived circular RNA circPUM1 localizes in mitochondria and regulates oxidative phosphorylation in esophageal squamous cell carcinoma
杂志:Signal Transduct Target Ther
影响因子:18.187
通讯作者:詹启敏院士(北京大学国际肿瘤研究所)
环状RNAs(circRNAs)被证明在肿瘤的发生和发展中发挥重要作用。然而,定位于肿瘤细胞线粒体的核基因组来源环状RNAs的功能仍未明确。在这里,作者报道了circPUM1,一个来自核基因组PUM1前mRNAs后剪接的环状RNA,定位于线粒体。食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞系中circPUM1的表达水平与cocl2诱导的细胞内缺氧样条件下hf1 α的积累呈正相关。重要的是,circPUM1在ESCC细胞系中作为UQCRC1和UQCRC2相互作用的支架。circPUM1的敲除分别导致细胞内氧浓度降低、氧化磷酸化下调、线粒体膜电位降低、ROS生成增加和线粒体收缩。CircPUM1缺失可诱导线粒体复合体III功能障碍和caspase3的自发裂解。有趣的是,circPUM1的破坏导致细胞凋亡,从而引发ESCC细胞系的细胞死亡。因此,作者得出结论,circPUM1在维持线粒体复合体III的稳定性以增强ESCC细胞ATP生成的氧化磷酸化中发挥了关键作用,并进一步提出,ESCC细胞在细胞适应过程中利用了circPUM1。
CoCl2诱导的细胞内缺氧样微环境模型建立
文献列表
序号 | 主要内容 | 论文标题 | 杂志 | 影响因子 | 单位 |
1 | 外泌体circLPAR1通过METTL3-eIF3h相互作用抑制BRD4,从而在结直肠癌诊断和肿瘤发生中发挥作用 | Exosomal circLPAR1 functions in colorectal cancer diagnosis and tumorigenesis through suppressing BRD4 via METTL3-eIF3h interaction | Mol Cancer | 27.401 | 南京医科大学 |
2 | circORC5的修饰通过调节miR-30c-2-3p/AKT1S1轴来抑制胃癌进展 | METTL14-mediated m 6 A modification of circORC5 suppresses gastric cancer progression by regulating miR-30c-2-3p/AKT1S1 axis | Mol Cancer | 27.401 | 上海交通大学附属第六人民医院 |
3 | 胰腺癌中环状RNA ANAPC7通过PHLPP2-AKT-TGF-β信号轴抑制肿瘤生长和肌肉萎缩 | Circular RNA ANAPC7 inhibits tumor growth and muscle wasting via PHLPP2-AKT-TGF-β signaling axis in pancreatic cancer | Gastroenterology | 22.682 | 俄克拉荷马大学健康科学中心医学系 |
4 | 食道鳞状细胞癌细胞核基因组来源的环状RNA circPUM1定位于线粒体并调节氧化磷酸化 | Nuclear genome-derived circular RNA circPUM1 localizes in mitochondria and regulates oxidative phosphorylation in esophageal squamous cell carcinoma | Signal Transduct Target Ther | 18.187 | 北京大学,深圳湾实验室,中国医学科学院 |
5 | 环状RNAs的特异性表达和功能 | Specific expression and functions of circular RNAs | Cell Death Differ | 15.828 | 加拿大多伦多大学 |
6 | 拟南芥胞外液含有位于胞外囊泡外的sRNA-和环状RNA -蛋白复合物 | Arabidopsis apoplastic fluid contains sRNA- and circular RNA-protein complexes that are located outside extracellular vesicles | Plant Cell | 11.277 | 印第安纳大学,密苏里大学哥伦比亚分校 |
7 | 修正:CircRNA-DOPEY2通过抑制cpeb4介导的Mcl-1翻译增强食管癌细胞的化疗敏感性 | Correction to: CircRNA-DOPEY2 enhances the chemosensitivity of esophageal cancer cells by inhibiting CPEB4-mediated Mcl-1 translation | J Exp Clin Cancer Res | 11.161 | 同济大学附属同济医院 |
8 | GMNN2CD:基于变分推理和图马尔可夫神经网络识别环状RNA与疾病的关联 | GMNN2CD: Identification of circRNA-disease associations based on variational inference and graph markov neural networks | Bioinformatics | 6.937 | 电子科技大学哈尔滨工业大学 |
9 | 在乳腺癌中,环状RNA circ_IRAK3通过吸附miR-603上调KIF2A,从而促进肿瘤生长 | Circular RNA circ_IRAK3 contributes to tumor growth through upregulating KIF2A via adsorbing miR-603 in breast cancer | Cancer Cell Int | 5.722 | 郑州大学第一附属医院 |
10 | Hsa_circ_0003945通过介导miR-34c-5p/LGR4/β-catenin轴活性促进肝细胞癌的进展 | Hsa_circ_0003945 promotes progression of hepatocellular carcinoma by mediating miR-34c-5p/LGR4/β-catenin axis activity | J Cell Mol Med | 5.310 | 复旦大学附属中山医院 |
11 | Circ-AFAP1通过Circ-AFAP1/miR-374b-3p/VEGFA信号轴促进透明细胞肾细胞癌的生长和血管生成 | Circ-AFAP1 promote clear cell renal cell carcinoma growth and angiogenesis by the Circ-AFAP1/miR-374b-3p/VEGFA signaling axis | Cell Death Discov | 5.241 | 复旦大学 |
12 | 通过海绵miR-423-5p降低多囊卵巢综合征中MTM1的表达,下调Circ_FURIN可减轻睾酮诱导的人卵巢颗粒样肿瘤细胞紊乱 | Circ_FURIN knockdown assuages Testosterone-induced human ovarian granulosa-like tumor cell disorders by sponging miR-423-5p to reduce MTM1 expression in polycystic ovary syndrome | Reprod Biol Endocrinol | 5.211 | 徐州医科大学附属淮安市第二人民医院,淮安市人民医院妇产科 |
13 | circPTPN4通过miR-499-3p/NAMPT轴调控肌生成 | circPTPN4 regulates myogenesis via the miR-499-3p/NAMPT axis | J Anim Sci Biotechnol | 5.032 | 华南农业大学动物科学学院 |
14 | CircPAG1与miR-211-5p相互作用,促进E2F3表达,抑制高糖诱导的糖尿病性白内障细胞凋亡和氧化应激 | CircPAG1 interacts with miR-211-5p to promote the E2F3 expression and inhibit the high glucose-induced cell apoptosis and oxidative stress in diabetic cataract | Cell Cycle | 4.534 | 云南省第一人民医院眼科 |
15 | 大白菜花药发育相关ceRNA网络的全转录组分析及构建 | Whole-transcriptome analysis and construction of an anther development-related ceRNA network in Chinese cabbage (Brassica campestris L. ssp. pekinensis) | Sci Rep | 4.379 | 沈阳农业大学设施园艺教育部重点实验室 |
16 | BORIS介导的环状RNAs生成诱导炎症 | BORIS-mediated generation of circular RNAs induces inflammation | Transl Oncol | 4.243 | 杭州医学院检验医学与生物工程学院 |
17 | 在宫颈癌中,CircCDK17敲除通过棉球miR-1294下调YWHAZ的表达,从而抑制肿瘤进展和细胞糖酵解 | CircCDK17 knockdown inhibits tumor progression and cell glycolysis by downregulaing YWHAZ expression through sponging miR-1294 in cervical cancer | J Ovarian Res | 4.234 | 河南省人民医院妇产科,郑州大学人民医院,河南大学临床医学院 |
18 | 茶树叶斑病病原菌拟盘多毛孢侵染过程中竞争内源RNAs和MicroRNAs的分析 | Analysis of Competing Endogenous RNAs and MicroRNAs in Tea (Camellia sinensis) Leaves During Infection by the Leaf Spot Pathogen, Pestalotiopsis trachicarpicola | Mol Plant Microbe Interact | 4.171 | 贵州大学 |
19 | 糖尿病心肌病细胞外非编码RNAs的生物学功能和临床前景:最新综述 | Biological Functions and Clinical Prospects of Extracellular Non-Coding RNAs in Diabetic Cardiomyopathy: an Updated Review | J Cardiovasc Transl Res | 4.132 | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
20 | 细胞外环状RNAs作为介导缺血心肌损伤和心肌重构细胞串扰的新型第一信使 | Extracellular Circular RNAs Act as Novel First Messengers Mediating Cell Cross-Talk in Ischemic Cardiac Injury and Myocardial Remodeling | J Cardiovasc Transl Res | 4.132 | 青岛大学附属医院,青岛大学基础医学院 |
21 | 环状RNA_0061,587与1型神经纤维瘤病的肿瘤发生有关 | Circular RNA_0061,587 is associated with the tumorigenesis of neurofibromatosis type 1 | Neurochem Int | 3.921 | 西安交通大学第一附属医院整形美容颌面外科 |
22 | 通过海绵吸附miR-330-5p降低ROCK2表达,下调circRNA Paralemmin 2可改善脂多糖诱导的小鼠肺上皮细胞损伤 | Knockdown of circRNA Paralemmin 2 Ameliorates Lipopolysaccharide-induced Murine Lung Epithelial Cell Injury by Sponging miR-330-5p to Reduce ROCK2 Expression | Immunol Invest | 3.657 | 南京大学医学院金陵医院急诊科 |
23 | Circ_0008365通过调节miR-324-5p/BMPR2/NF-κB信号轴,抑制il -1β处理的骨关节炎软骨细胞的凋亡、炎症和细胞外基质降解 | Circ_0008365 Suppresses Apoptosis, Inflammation and Extracellular Matrix Degradation of IL-1β-treated Chondrocytes in Osteoarthritis by Regulating miR-324-5p/BMPR2/NF-κB Signaling Axis | Immunol Invest | 3.657 | 枣庄矿业集团天南医院骨科 |
24 | circ_0002360通过靶向miR-6751-3p调控ZNF300的表达,促进肺癌细胞对顺铂的耐药和恶性行为 | Cisplatin resistance and malignant behaviors of lung cancer cells are promoted by circ_0002360 via targeting miR-6751-3p to regulate the expression of ZNF300 | Thorac Cancer | 3.500 | 永州市中心医院 |
25 | Circ_0010235通过调节miR-636/PDL1轴促进肺癌的发展和免疫逃逸 | Circ_0010235 facilitates lung cancer development and immune escape by regulating miR-636/PDL1 axis | Thorac Cancer | 3.500 | 惠州市中心人民医院胸外科 |
26 | Circ_0001955通过诱骗miR-1299正向调控GLUT1在乳腺癌中发挥致癌作用 | Circ_0001955 plays a carcinogenic role in breast cancer via positively regulating GLUT1 via decoying miR-1299 | Thorac Cancer | 3.500 | 武汉大学人民医院乳腺甲状腺外科 |
27 | 血小板富集物在储存期间的全转录组分析 | Whole transcriptome analysis of platelet concentrates during storage | Blood Transfus | 3.443 | 上海交通大学医学院瑞金医院 |
28 | CircRNA PVT1通过miR-24-3p/KLF8轴促进骨肉瘤细胞的增殖和化疗耐药性 | CircRNA PVT1 promotes proliferation and chemoresistance of osteosarcoma cells via the miR-24-3p/KLF8 axis | Int J Clin Oncol | 3.402 | 暨南大学附属广州红十字医院骨科 |
29 | Hsa_circ_0005729提高诊断甲状旁腺癌的准确性 | Hsa_circ_0005729 enhances accuracy in diagnosing parathyroid carcinoma | Endocr Connect | 3.335 | 首都医科大学附属北京朝阳医院 |
30 | 干扰circ-GNB4可通过circ-GNB4/miR-23c/EGR1通路调节高糖诱导的人系膜细胞的增殖、ECM积累、炎症和氧化应激,从而减轻系膜细胞的损伤 | Disrupting circ-GNB4 mitigates high glucose-induced human mesangial cells injury by regulating the proliferation, ECM accumulation, inflammation and oxidative stress through circ-GNB4/miR-23c/EGR1 pathway | J Cardiovasc Pharmacol | 3.105 | 烟台玉皇顶医院肾脏病科 |
31 | 环状RNAs:精子发生缺陷和男性不育的新生物标志物 | Circular RNAs: Novel Biomarkers in Spermatogenesis Defects and Male Infertility | Reprod Sci | 3.060 | Shahid Beheshti医学科学大学医学院医学遗传学系 |
32 | Circ_0072008是胰管腺癌的一个癌基因,通过调节miR-545-3p/SLC7A11轴参与肿瘤细胞恶性进展和糖酵解 | Circ_0072008, an oncogene in pancreatic ductal adenocarcinoma, contributes to tumour cell malignant progression and glycolysis by regulating miR-545-3p/SLC7A11 axis | Autoimmunity | 2.815 | 滕州市中心人民医院重症监护室 |
33 | Circ_0016347通过miR-661/IL6R轴调节骨肉瘤细胞的增殖、迁移、侵袭、细胞周期和凋亡 | Circ_0016347 modulates proliferation, migration, invasion, cell cycle, and apoptosis of osteosarcoma cells via the miR-661/IL6R axis | Autoimmunity | 2.815 | 天津市协和医学中心脊柱外科 |
34 | 生物信息学分析构建基于胃癌组织和血浆中差异共表达环状RNA的环状RNA- miRNA – mRNA网络 | Construction of a circRNA-miRNA-mRNA network based on differentially co-expressed circular RNA in gastric cancer tissue and plasma by bioinformatics analysis | World J Surg Oncol | 2.754 | 南京医科大学附属常州第二人民医院消化内科 |
35 | 淫蒿素升高的circ_0000190通过靶向miR-301a抑制多发性骨髓瘤的恶性进展 | Icaritin-elevated circ_0000190 suppresses the malignant progression of multiple myeloma by targeting miR-301a | Kaohsiung J Med Sci | 2.744 | 吉林大学第二医院 |
36 | Circ_0067934通过microRNA-545-3p/PPA1轴降低JNK磷酸化,增强卵巢癌的肿瘤发生和顺铂耐药 | Circ_0067934 reduces JNK phosphorylation through a microRNA-545-3p/PPA1 axis to enhance tumorigenesis and cisplatin resistance in ovarian cancer | Immunopharmacol Immunotoxicol | 2.730 | 淄博市中心医院病理科 |
37 | CircSLC16A12缺失通过介导miR-140-3p/FGF2轴在糖尿病视网膜病变中抑制高糖诱导的视网膜微血管内皮细胞功能障碍 | CircSLC16A12 absence inhibits high glucose-induced dysfunction in retinal microvascular endothelial cells through mediating miR-140-3p/FGF2 axis in diabetic retinopathy | Curr Eye Res | 2.424 | 哈尔滨眼科医院眼科 |
38 | 环状RNA hsa_circ_0003416在儿童先天性心脏病肺动脉高压中的表达及临床意义 | Expression and clinical significance of circular RNA hsa_circ_0003416 in pediatric pulmonary arterial hypertension associated with congenital heart disease | J Clin Lab Anal | 2.352 | 广西医科大学第一附属医院儿科 |
39 | Circ_0061140通过海绵吸除miR-361-5p介导RAB1A水平参与卵巢癌细胞的恶性进展 | Circ_0061140 Contributes to the Malignant Progression in Ovarian Cancer Cells by Mediating the RAB1A Level Through Sponging miR-361-5p | Biochem Genet | 1.890 | 湖北医科大学人民医院肿瘤科 |
40 | 与腰痛相关的退行性疾病中差异表达的环状RNAs:环状RNAs作为生物标志物的潜力 | Differentially Expressed Circular RNAs in Degenerative Diseases Related to Low Back Pain: Potential of Circular RNAs as Biomarkers | Genet Test Mol Biomarkers | 1.795 | 京畿大学(首尔校区)替代医学研究生院替代医学系 |
41 | Prkra突变改变胚胎外耳发育过程中circRNA的表达 | Prkra Mutation Alters circRNA Expression During Embryonic External Ear Development | J Craniofac Surg | 1.046 | 中国医学科学院北京协和医学院整形外科医院 |